logo

Genes within 1Mb (chr6:131834711:TTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCA:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 771389 sc-eQTL 8.46e-02 0.141 0.0812 0.141 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 -566764 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00431 0.119 0.141 B L1
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0138 0.045 0.141 B L1
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 6.95e-01 0.0353 0.0897 0.141 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 1.30e-01 0.128 0.0841 0.141 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 3.48e-01 0.048 0.051 0.141 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 6.53e-02 0.195 0.105 0.141 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 4.81e-02 0.212 0.107 0.141 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -297177 sc-eQTL 2.71e-01 0.0776 0.0704 0.141 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 771389 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0822 0.106 0.141 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0512 0.0869 0.141 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 7.75e-01 0.0197 0.069 0.141 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0781 0.0751 0.141 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 5.25e-01 0.0326 0.0512 0.141 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 2.36e-01 0.11 0.0923 0.141 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 7.09e-01 0.0387 0.104 0.141 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0859 0.0852 0.141 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0957 0.0838 0.141 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 3.90e-01 0.0858 0.0995 0.141 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 7.17e-01 0.0123 0.034 0.141 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 2.83e-01 0.103 0.0955 0.141 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 3.94e-01 0.0879 0.103 0.141 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 771389 sc-eQTL 2.03e-02 0.206 0.0882 0.137 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0594 0.0788 0.137 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -900054 sc-eQTL 9.52e-01 0.00589 0.0979 0.137 DC L1
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0712 0.115 0.137 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -879344 sc-eQTL 2.96e-01 0.11 0.105 0.137 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 7.70e-01 0.033 0.113 0.137 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 3.17e-01 0.0635 0.0632 0.137 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 4.38e-01 0.0877 0.113 0.137 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0259 0.1 0.137 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 771389 sc-eQTL 4.76e-01 0.0698 0.0977 0.141 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0115 0.0583 0.141 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -900054 sc-eQTL 9.19e-01 0.0102 0.1 0.141 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0768 0.0949 0.141 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -879344 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0271 0.108 0.141 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 1.87e-01 0.1 0.0757 0.141 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 8.86e-01 -0.00652 0.0455 0.141 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0721 0.0942 0.141 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 9.75e-01 0.0028 0.0901 0.141 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 5.97e-01 0.0465 0.0877 0.139 NK L1
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 3.00e-01 0.0832 0.0801 0.139 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 5.19e-01 0.0705 0.109 0.139 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 7.82e-01 0.0125 0.0452 0.139 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0217 0.0961 0.139 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 771389 sc-eQTL 2.07e-01 0.125 0.0983 0.141 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 8.73e-01 0.0143 0.0893 0.141 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0498 0.111 0.141 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0666 0.108 0.141 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 8.56e-01 0.00779 0.0428 0.141 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0289 0.0974 0.141 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 4.61e-01 0.0865 0.117 0.141 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 771389 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0424 0.11 0.14 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -566764 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0342 0.125 0.14 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 1.78e-01 0.158 0.117 0.14 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0696 0.13 0.14 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 5.88e-01 0.0678 0.125 0.14 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0524 0.0669 0.14 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 8.97e-01 0.0169 0.13 0.14 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 4.06e-01 0.0976 0.117 0.14 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -297177 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0146 0.112 0.14 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 771389 sc-eQTL 1.65e-01 0.159 0.114 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -566764 sc-eQTL 5.25e-01 0.0705 0.111 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0859 0.0722 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0416 0.11 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 6.14e-01 0.0551 0.109 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 8.06e-01 0.0165 0.0668 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 8.23e-01 0.0251 0.112 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 2.68e-03 0.358 0.118 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -297177 sc-eQTL 8.53e-01 0.019 0.102 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 771389 sc-eQTL 4.87e-01 0.0754 0.108 0.14 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -566764 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0319 0.112 0.14 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 6.92e-01 -0.035 0.0882 0.14 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0242 0.114 0.14 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 2.97e-01 0.12 0.115 0.14 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0357 0.0556 0.14 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 4.94e-01 -0.081 0.118 0.14 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0193 0.116 0.14 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -297177 sc-eQTL 8.98e-01 0.0139 0.108 0.14 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 771389 sc-eQTL 1.82e-02 0.213 0.0894 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -566764 sc-eQTL 9.63e-01 0.00577 0.123 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 2.86e-01 0.0574 0.0537 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 4.79e-01 0.0683 0.0963 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 1.45e-01 0.152 0.104 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 6.81e-02 0.108 0.0591 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 6.08e-02 0.226 0.12 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 7.05e-01 0.0435 0.115 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -297177 sc-eQTL 8.67e-01 0.0128 0.0761 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 771389 sc-eQTL 2.47e-01 0.118 0.102 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -566764 sc-eQTL 1.83e-01 -0.154 0.115 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 1.94e-01 -0.0817 0.0627 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 6.43e-01 0.054 0.116 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 3.76e-01 0.102 0.115 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 4.92e-01 0.0421 0.0612 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 4.07e-01 0.102 0.122 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 7.07e-02 0.211 0.116 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -297177 sc-eQTL 2.98e-01 0.0842 0.0808 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 771389 sc-eQTL 5.44e-01 0.057 0.0938 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 2.36e-01 -0.137 0.115 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 1.99e-01 0.155 0.12 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0731 0.117 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 5.02e-01 0.0362 0.0539 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 4.46e-01 0.0879 0.115 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 6.26e-01 -0.053 0.109 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 771389 sc-eQTL 2.40e-01 -0.13 0.11 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0424 0.0938 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00115 0.0801 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0524 0.0869 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 1.38e-01 0.0835 0.0561 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 2.62e-01 0.118 0.104 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 8.62e-01 0.0189 0.109 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 771389 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0215 0.113 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 3.84e-01 -0.09 0.103 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0546 0.0868 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0595 0.102 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 7.86e-01 0.0144 0.0528 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 7.35e-02 0.18 0.1 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 3.59e-01 -0.112 0.122 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 771389 sc-eQTL 5.12e-01 0.0791 0.12 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0942 0.12 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 1.00e-02 0.284 0.109 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 6.25e-01 0.0566 0.116 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 9.23e-01 0.00462 0.0475 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 5.92e-01 0.0655 0.122 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 1.53e-01 0.168 0.117 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0282 0.0971 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 7.44e-01 0.0326 0.0996 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 1.84e-02 0.259 0.109 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0083 0.0591 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0516 0.111 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 4.66e-01 0.0835 0.114 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 8.11e-01 0.0285 0.119 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 2.07e-04 -0.35 0.0926 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0608 0.103 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 6.25e-02 0.109 0.0583 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 2.75e-01 0.118 0.108 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 1.46e-01 0.171 0.117 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 2.46e-01 -0.136 0.117 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 1.24e-02 0.292 0.116 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 6.39e-01 0.0546 0.116 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 2.41e-01 0.0663 0.0564 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 6.88e-01 0.0507 0.126 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 9.01e-01 0.0155 0.124 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0642 0.125 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 4.54e-01 0.0902 0.12 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 5.13e-01 0.0814 0.124 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 9.93e-01 0.00055 0.0669 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00815 0.122 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 7.07e-01 0.0476 0.126 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 771389 sc-eQTL 6.81e-01 0.0452 0.11 0.139 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00746 0.114 0.139 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 2.54e-01 -0.136 0.119 0.139 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 4.70e-01 -0.084 0.116 0.139 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 7.20e-01 0.0205 0.0572 0.139 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 2.81e-01 -0.127 0.118 0.139 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 9.83e-01 0.00259 0.12 0.139 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 8.77e-01 -0.018 0.117 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 6.82e-01 0.0506 0.123 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 9.15e-02 -0.2 0.118 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 8.63e-02 0.113 0.0656 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 4.46e-01 0.0914 0.12 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0369 0.0944 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 2.56e-01 0.11 0.0967 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 1.26e-01 0.18 0.117 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 8.22e-01 0.0105 0.0469 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 8.16e-01 -0.024 0.103 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 7.10e-01 0.0431 0.116 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00134 0.117 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 4.07e-01 0.0972 0.117 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 9.13e-01 0.00594 0.0545 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 3.37e-01 0.116 0.121 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 2.55e-01 0.116 0.102 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 9.85e-01 0.00197 0.106 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 4.51e-01 0.0867 0.115 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 3.74e-01 0.0554 0.0622 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 9.78e-01 -0.0029 0.107 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 771389 sc-eQTL 5.27e-01 -0.104 0.164 0.144 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 -566764 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0115 0.136 0.144 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0343 0.114 0.144 PB L2
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0197 0.155 0.144 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 4.02e-01 0.117 0.139 0.144 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 1.00e+00 1.17e-05 0.0789 0.144 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00792 0.151 0.144 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0387 0.148 0.144 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -297177 sc-eQTL 2.90e-01 -0.103 0.0967 0.144 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 771389 sc-eQTL 1.16e-01 0.164 0.104 0.141 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 4.24e-01 0.0865 0.108 0.141 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 6.92e-01 0.0481 0.122 0.141 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 3.00e-01 0.12 0.116 0.141 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 2.18e-01 0.054 0.0437 0.141 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 3.61e-01 0.0952 0.104 0.141 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 4.08e-01 0.094 0.113 0.141 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 771389 sc-eQTL 9.38e-01 0.00895 0.114 0.141 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0286 0.114 0.141 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0955 0.117 0.141 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0942 0.096 0.141 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 1.95e-01 0.0551 0.0424 0.141 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 8.21e-01 0.023 0.101 0.141 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 7.87e-01 0.0325 0.12 0.141 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 771389 sc-eQTL 1.98e-02 0.232 0.0986 0.139 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0644 0.0995 0.139 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -900054 sc-eQTL 1.34e-01 -0.148 0.0983 0.139 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 6.58e-01 0.0571 0.129 0.139 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -879344 sc-eQTL 1.50e-01 0.167 0.116 0.139 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 9.74e-01 0.00364 0.113 0.139 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 5.13e-01 0.0366 0.0559 0.139 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 4.65e-01 0.0914 0.125 0.139 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 9.52e-01 0.00664 0.111 0.139 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 771389 sc-eQTL 1.70e-01 0.148 0.107 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0186 0.0757 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -900054 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0116 0.107 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 9.50e-01 0.00668 0.106 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -879344 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0323 0.108 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 1.69e-01 0.119 0.086 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 4.98e-01 0.0325 0.0479 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0976 0.103 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 3.98e-01 0.0783 0.0924 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 771389 sc-eQTL 3.21e-01 0.111 0.112 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 4.76e-01 0.0586 0.0819 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -900054 sc-eQTL 4.66e-01 0.0747 0.102 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0797 0.111 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -879344 sc-eQTL 9.65e-01 0.00484 0.111 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 5.22e-01 0.0467 0.0728 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 6.19e-01 0.0261 0.0524 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0451 0.109 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0839 0.0969 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 771389 sc-eQTL 6.54e-01 0.0558 0.124 0.139 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0755 0.13 0.139 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0616 0.139 0.139 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0507 0.144 0.139 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 3.79e-01 0.0482 0.0547 0.139 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 8.82e-01 0.0217 0.146 0.139 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 3.20e-01 0.141 0.141 0.139 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 771389 sc-eQTL 9.09e-01 0.0129 0.113 0.14 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 2.23e-01 -0.133 0.109 0.14 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -900054 sc-eQTL 6.24e-01 0.0543 0.111 0.14 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0187 0.121 0.14 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -879344 sc-eQTL 1.77e-01 0.148 0.109 0.14 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 8.57e-01 0.02 0.111 0.14 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0128 0.0483 0.14 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 1.36e-01 -0.177 0.118 0.14 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 6.51e-01 0.0534 0.118 0.14 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 771389 sc-eQTL 5.96e-01 0.0566 0.107 0.136 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 6.86e-02 -0.148 0.0807 0.136 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -900054 sc-eQTL 5.84e-01 -0.063 0.115 0.136 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0302 0.116 0.136 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -879344 sc-eQTL 1.54e-01 -0.162 0.113 0.136 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0196 0.11 0.136 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 8.67e-01 0.0092 0.055 0.136 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 4.92e-01 0.0775 0.113 0.136 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 1.06e-01 -0.156 0.0965 0.136 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 771389 sc-eQTL 5.42e-01 0.0781 0.128 0.138 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00724 0.0921 0.138 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -900054 sc-eQTL 1.56e-02 0.222 0.0909 0.138 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0572 0.129 0.138 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -879344 sc-eQTL 6.21e-01 0.0467 0.0943 0.138 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 5.64e-01 0.0648 0.112 0.138 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 3.30e-01 0.0753 0.0771 0.138 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 2.36e-01 0.125 0.105 0.138 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 9.36e-01 0.00918 0.115 0.138 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 771389 sc-eQTL 1.49e-01 0.149 0.103 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -566764 sc-eQTL 7.00e-01 0.0454 0.117 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0471 0.0664 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0733 0.102 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 5.56e-01 0.0619 0.105 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0339 0.0599 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0219 0.103 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 1.85e-02 0.258 0.109 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -297177 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0252 0.106 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 771389 sc-eQTL 2.87e-02 0.187 0.0849 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -566764 sc-eQTL 4.01e-01 -0.104 0.123 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 8.83e-01 -0.00744 0.0506 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 5.31e-01 0.0595 0.0949 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 1.29e-01 0.149 0.0976 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 1.60e-01 0.0833 0.0591 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 4.25e-02 0.242 0.118 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 1.08e-01 0.18 0.111 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -297177 sc-eQTL 4.90e-01 0.0492 0.0711 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 771389 sc-eQTL 2.55e-01 0.117 0.102 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 7.29e-01 0.0219 0.0632 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -900054 sc-eQTL 8.65e-01 0.0176 0.103 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0481 0.099 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -879344 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00273 0.107 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 1.66e-01 0.0983 0.0707 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 6.80e-01 0.0201 0.0487 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0666 0.0971 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 6.71e-01 0.0368 0.0866 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 771389 sc-eQTL 9.04e-01 0.0131 0.109 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 1.27e-01 -0.117 0.0766 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -900054 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0685 0.113 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0617 0.11 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -879344 sc-eQTL 2.17e-01 -0.139 0.112 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0211 0.106 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 7.23e-01 -0.016 0.0449 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 2.72e-01 -0.124 0.113 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -978628 sc-eQTL 8.83e-01 -0.016 0.109 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -678487 sc-eQTL 5.23e-01 0.0566 0.0884 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 206469 sc-eQTL 1.95e-01 0.111 0.0856 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -928748 sc-eQTL 2.16e-01 0.138 0.112 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -979858 sc-eQTL 6.80e-01 0.0189 0.0457 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 699244 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0511 0.0948 0.14 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112282 MED23 206469 eQTL 0.00761 -0.0669 0.025 0.00101 0.0 0.129
ENSG00000154269 ENPP3 206269 eQTL 0.0103 0.0946 0.0368 0.0014 0.0 0.129

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina