logo

Genes within 1Mb (chr6:131832852:TGGAGGCTGAA:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 769530 sc-eQTL 2.84e-01 0.0853 0.0794 0.165 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 -568623 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0551 0.116 0.165 B L1
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0159 0.0438 0.165 B L1
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 5.75e-01 0.049 0.0872 0.165 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 4.22e-01 0.0662 0.0822 0.165 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 4.13e-01 0.0407 0.0497 0.165 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 9.58e-02 0.172 0.103 0.165 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 1.32e-01 0.157 0.104 0.165 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -299036 sc-eQTL 3.13e-01 0.0693 0.0686 0.165 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 769530 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0778 0.104 0.165 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0631 0.085 0.165 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0211 0.0675 0.165 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0744 0.0735 0.165 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0219 0.0501 0.165 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 2.51e-01 0.104 0.0903 0.165 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0153 0.101 0.165 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0747 0.0837 0.165 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0715 0.0825 0.165 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 2.92e-01 0.103 0.0977 0.165 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0197 0.0334 0.165 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 3.39e-01 0.0899 0.0939 0.165 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 1.60e-01 0.142 0.101 0.165 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 769530 sc-eQTL 1.98e-02 0.203 0.0863 0.162 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0264 0.0772 0.162 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -901913 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0687 0.0957 0.162 DC L1
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 2.54e-01 -0.128 0.112 0.162 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -881203 sc-eQTL 6.07e-01 0.0533 0.103 0.162 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 8.59e-01 0.0196 0.111 0.162 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 1.93e-01 0.0806 0.0618 0.162 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 1.63e-01 0.154 0.11 0.162 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 9.15e-01 0.0104 0.0982 0.162 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 769530 sc-eQTL 6.92e-01 0.0381 0.0961 0.165 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 9.15e-01 0.00614 0.0573 0.165 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -901913 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0736 0.0982 0.165 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0934 0.0932 0.165 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -881203 sc-eQTL 9.87e-01 0.00173 0.106 0.165 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 2.53e-01 0.0853 0.0744 0.165 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 8.68e-01 0.00747 0.0447 0.165 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0653 0.0926 0.165 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000773 0.0885 0.165 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 5.48e-01 0.0519 0.0862 0.163 NK L1
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 2.96e-01 0.0824 0.0787 0.163 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 3.53e-01 0.0998 0.107 0.163 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0113 0.0444 0.163 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 2.24e-01 -0.115 0.0941 0.163 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 769530 sc-eQTL 2.15e-01 0.12 0.0963 0.165 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 3.36e-01 0.0842 0.0873 0.165 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0456 0.109 0.165 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 3.41e-01 -0.101 0.106 0.165 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0238 0.0419 0.165 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 7.10e-01 0.0355 0.0954 0.165 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 6.84e-01 0.0468 0.115 0.165 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 769530 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0135 0.11 0.158 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -568623 sc-eQTL 9.72e-01 0.00443 0.124 0.158 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 2.94e-01 0.122 0.116 0.158 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 9.15e-01 0.0138 0.129 0.158 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 4.62e-01 0.0915 0.124 0.158 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0593 0.0664 0.158 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 9.95e-01 0.000882 0.129 0.158 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 3.90e-01 0.1 0.116 0.158 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -299036 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0271 0.111 0.158 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 769530 sc-eQTL 7.36e-01 0.038 0.112 0.165 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -568623 sc-eQTL 8.41e-01 0.0219 0.109 0.165 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 1.71e-01 -0.0973 0.0708 0.165 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0639 0.108 0.165 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 6.87e-01 0.0432 0.107 0.165 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00347 0.0656 0.165 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 5.24e-01 0.0701 0.11 0.165 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 2.62e-02 0.261 0.117 0.165 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -299036 sc-eQTL 7.53e-01 0.0316 0.1 0.165 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 769530 sc-eQTL 6.36e-01 0.0509 0.107 0.164 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -568623 sc-eQTL 9.23e-01 0.0108 0.111 0.164 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0224 0.0873 0.164 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0582 0.112 0.164 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 4.64e-01 0.0836 0.114 0.164 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0338 0.055 0.164 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 2.34e-01 -0.139 0.117 0.164 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 7.32e-01 0.0394 0.115 0.164 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -299036 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0513 0.107 0.164 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 769530 sc-eQTL 3.79e-02 0.185 0.0884 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -568623 sc-eQTL 3.41e-01 -0.116 0.121 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 4.80e-01 0.0375 0.053 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 2.49e-01 0.11 0.0948 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 5.07e-01 0.0685 0.103 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 7.30e-02 0.105 0.0582 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 5.14e-02 0.231 0.118 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 5.17e-01 0.0735 0.113 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -299036 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00158 0.075 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 769530 sc-eQTL 8.32e-01 0.0214 0.101 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -568623 sc-eQTL 1.24e-01 -0.175 0.113 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 1.76e-01 -0.084 0.0619 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 5.19e-01 0.0741 0.115 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 6.25e-01 0.0558 0.114 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 5.01e-01 0.0406 0.0603 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 7.08e-01 0.0452 0.121 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 1.58e-01 0.163 0.115 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -299036 sc-eQTL 3.94e-01 0.0681 0.0797 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 769530 sc-eQTL 4.93e-01 0.0635 0.0925 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 2.96e-01 -0.119 0.114 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 1.48e-01 0.172 0.118 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0779 0.115 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 5.15e-01 0.0347 0.0532 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 4.49e-01 0.0861 0.114 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 7.24e-01 -0.038 0.107 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 769530 sc-eQTL 1.91e-01 -0.141 0.108 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0327 0.0917 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0486 0.0782 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 5.10e-01 -0.056 0.0849 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 9.93e-01 0.000492 0.0551 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 2.11e-01 0.128 0.102 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 9.90e-01 -0.0013 0.106 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 769530 sc-eQTL 9.18e-01 0.0115 0.111 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0972 0.101 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 2.75e-01 -0.093 0.085 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0697 0.0998 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00533 0.0518 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 1.59e-01 0.139 0.0985 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 1.15e-01 -0.189 0.119 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 769530 sc-eQTL 3.64e-01 0.107 0.118 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 1.83e-01 -0.157 0.118 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 4.38e-02 0.218 0.108 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 5.66e-01 0.0651 0.113 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0176 0.0465 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 7.92e-01 0.0315 0.119 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 1.14e-01 0.182 0.115 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0796 0.0954 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 7.11e-01 0.0363 0.0979 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 1.04e-02 0.276 0.107 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0227 0.0581 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0663 0.109 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 4.54e-01 0.0844 0.112 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 7.82e-01 0.0324 0.117 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 1.30e-03 -0.299 0.0917 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0748 0.101 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 5.72e-01 0.0326 0.0577 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 2.67e-01 0.118 0.106 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 1.01e-01 0.19 0.115 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 3.67e-01 -0.104 0.115 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 8.09e-02 0.202 0.115 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 7.94e-01 0.0299 0.115 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 2.55e-01 0.0636 0.0557 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 2.49e-01 0.143 0.124 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 8.81e-01 0.0184 0.122 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 8.97e-01 0.0159 0.122 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 3.78e-01 0.103 0.117 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 3.67e-01 0.11 0.121 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0349 0.0652 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0525 0.119 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 5.86e-01 0.0673 0.123 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 769530 sc-eQTL 6.72e-01 0.0456 0.108 0.162 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 6.84e-01 0.0457 0.112 0.162 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 2.63e-01 -0.131 0.117 0.162 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 5.93e-01 -0.061 0.114 0.162 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0186 0.0561 0.162 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0622 0.116 0.162 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0254 0.118 0.162 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0438 0.115 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0178 0.122 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 2.66e-01 -0.13 0.117 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 1.70e-01 0.0894 0.0649 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 4.45e-01 0.0903 0.118 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0119 0.0926 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 1.77e-01 0.128 0.0948 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 2.30e-01 0.139 0.115 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00383 0.046 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 3.04e-01 -0.104 0.101 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 4.61e-01 0.0839 0.114 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 6.85e-01 0.0466 0.115 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 2.32e-01 0.138 0.115 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0384 0.0535 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 4.66e-01 0.0868 0.119 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 3.41e-01 0.0954 0.1 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00772 0.104 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 2.30e-01 0.135 0.112 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 6.78e-01 0.0254 0.0611 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0629 0.105 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 769530 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0231 0.162 0.156 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 -568623 sc-eQTL 9.84e-01 0.00266 0.135 0.156 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00872 0.113 0.156 PB L2
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 7.83e-01 0.0422 0.153 0.156 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 3.55e-01 0.127 0.137 0.156 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 9.04e-01 0.00947 0.0781 0.156 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0141 0.149 0.156 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 4.16e-01 -0.119 0.146 0.156 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -299036 sc-eQTL 4.68e-01 -0.07 0.096 0.156 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 769530 sc-eQTL 1.57e-01 0.144 0.102 0.165 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 3.23e-01 0.104 0.105 0.165 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0227 0.119 0.165 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 6.64e-02 0.207 0.112 0.165 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 3.15e-01 0.043 0.0427 0.165 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 4.68e-01 0.0739 0.102 0.165 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 8.95e-01 0.0147 0.111 0.165 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 769530 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000568 0.112 0.165 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0234 0.112 0.165 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0948 0.115 0.165 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 1.09e-01 -0.151 0.0937 0.165 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 6.11e-01 0.0212 0.0417 0.165 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 8.52e-01 0.0185 0.0993 0.165 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 9.23e-01 0.0115 0.118 0.165 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 769530 sc-eQTL 4.98e-02 0.193 0.0979 0.163 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0234 0.0984 0.163 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -901913 sc-eQTL 2.35e-02 -0.22 0.0964 0.163 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0284 0.127 0.163 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -881203 sc-eQTL 2.87e-01 0.122 0.115 0.163 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0441 0.112 0.163 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 1.12e-01 0.0877 0.0549 0.163 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 9.67e-02 0.204 0.122 0.163 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 6.87e-01 0.0442 0.109 0.163 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 769530 sc-eQTL 5.23e-01 0.0675 0.105 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0607 0.0741 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -901913 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0528 0.105 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0107 0.104 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -881203 sc-eQTL 8.71e-01 0.0172 0.106 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 2.26e-01 0.102 0.0843 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 4.16e-01 0.0382 0.0469 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0883 0.101 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 4.83e-01 0.0636 0.0906 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 769530 sc-eQTL 4.46e-01 0.0836 0.11 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 1.13e-01 0.127 0.0799 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -901913 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0285 0.1 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 2.04e-01 -0.138 0.109 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -881203 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00743 0.109 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 4.01e-01 0.06 0.0713 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 3.41e-01 0.0489 0.0513 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0191 0.107 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0998 0.0949 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 769530 sc-eQTL 6.09e-01 0.0631 0.123 0.164 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 8.65e-01 0.022 0.129 0.164 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 7.68e-01 -0.041 0.139 0.164 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 1.54e-01 -0.203 0.142 0.164 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 6.43e-01 0.0253 0.0544 0.164 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 7.64e-01 0.0434 0.145 0.164 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 7.13e-02 0.253 0.139 0.164 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 769530 sc-eQTL 4.60e-01 0.0816 0.11 0.164 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 2.75e-01 -0.117 0.107 0.164 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -901913 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000561 0.108 0.164 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 6.71e-01 0.0505 0.119 0.164 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -881203 sc-eQTL 4.54e-01 0.0801 0.107 0.164 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0314 0.109 0.164 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 8.76e-01 0.0074 0.0473 0.164 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 2.59e-01 -0.131 0.116 0.164 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 8.22e-01 0.026 0.115 0.164 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 769530 sc-eQTL 8.32e-01 0.0223 0.105 0.161 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0463 0.0801 0.161 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -901913 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0417 0.113 0.161 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0195 0.115 0.161 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -881203 sc-eQTL 1.29e-01 -0.17 0.112 0.161 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0494 0.108 0.161 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0097 0.0541 0.161 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 9.54e-01 0.00642 0.111 0.161 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 1.80e-01 -0.128 0.0952 0.161 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 769530 sc-eQTL 1.93e-01 0.162 0.124 0.167 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 8.87e-01 0.0128 0.0899 0.167 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -901913 sc-eQTL 1.16e-01 0.142 0.0898 0.167 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0612 0.126 0.167 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -881203 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000966 0.0921 0.167 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 5.56e-01 0.0647 0.11 0.167 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 4.76e-01 0.0538 0.0754 0.167 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 3.18e-01 0.103 0.103 0.167 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 5.18e-01 0.0723 0.112 0.167 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 769530 sc-eQTL 4.92e-01 0.0699 0.101 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -568623 sc-eQTL 5.03e-01 0.0771 0.115 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0427 0.0652 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0863 0.0996 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 5.46e-01 0.0623 0.103 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0267 0.0588 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 9.50e-01 0.00631 0.101 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 4.65e-02 0.214 0.107 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -299036 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0403 0.104 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 769530 sc-eQTL 1.73e-01 0.115 0.0843 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -568623 sc-eQTL 1.06e-01 -0.196 0.121 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0118 0.0499 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 2.43e-01 0.109 0.0934 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 5.75e-01 0.0543 0.0968 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 1.93e-01 0.0762 0.0584 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 8.84e-02 0.201 0.117 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 1.14e-01 0.174 0.11 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -299036 sc-eQTL 6.20e-01 0.0348 0.0702 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 769530 sc-eQTL 6.58e-01 0.0447 0.101 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 7.40e-01 0.0206 0.062 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -901913 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0607 0.101 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0948 0.0969 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -881203 sc-eQTL 7.71e-01 0.0307 0.105 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 1.76e-01 0.0941 0.0694 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 4.51e-01 0.036 0.0477 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0451 0.0953 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 7.66e-01 0.0253 0.085 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 769530 sc-eQTL 7.42e-01 0.0351 0.106 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0609 0.0755 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -901913 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0823 0.111 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0239 0.108 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -881203 sc-eQTL 1.71e-01 -0.151 0.11 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0745 0.104 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0102 0.0441 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 2.71e-01 -0.122 0.111 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -980487 sc-eQTL 8.96e-01 -0.014 0.107 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -680346 sc-eQTL 4.48e-01 0.066 0.0868 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 204610 sc-eQTL 1.59e-01 0.119 0.084 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -930607 sc-eQTL 1.65e-01 0.152 0.11 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -981717 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00238 0.0449 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 697385 sc-eQTL 1.64e-01 -0.13 0.0927 0.162 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112282 MED23 204610 eQTL 0.00105 -0.0742 0.0226 0.00568 0.00197 0.166
ENSG00000118507 AKAP7 697385 eQTL 0.0253 -0.0631 0.0282 0.0 0.0 0.166
ENSG00000154269 ENPP3 204410 eQTL 0.00137 0.106 0.0332 0.00222 0.0 0.166
ENSG00000234484 AL032821.1 -919823 eQTL 0.329 0.0414 0.0424 0.00122 0.0 0.166

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000154269 ENPP3 204410 3.44e-05 2.79e-05 6.69e-05 8.36e-06 2.48e-06 8.57e-06 1.91e-05 1.36e-06 1.25e-05 5.48e-06 1.8e-05 4.99e-06 2.44e-05 5.92e-06 5.09e-06 7.43e-06 7.91e-06 6.55e-06 2.6e-06 4.11e-06 7.03e-06 1.35e-05 1.9e-05 3.58e-06 3.39e-05 4.33e-06 7.43e-06 7.72e-06 1.56e-05 1.22e-05 7.4e-06 4.17e-07 1.43e-06 3.99e-06 9.01e-06 2.88e-06 1.75e-06 2.79e-06 1.34e-06 3.81e-07 1.14e-06 3.56e-05 2.66e-06 2.52e-07 7.6e-07 2.15e-06 1.29e-06 6.85e-07 4.56e-07