logo

Genes within 1Mb (chr6:131826265:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 762943 sc-eQTL 6.06e-01 0.0385 0.0745 0.184 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 -575210 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0572 0.109 0.184 B L1
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 5.56e-01 0.0242 0.041 0.184 B L1
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 4.55e-01 0.0611 0.0817 0.184 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 4.15e-01 0.0629 0.077 0.184 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 8.09e-01 0.0113 0.0466 0.184 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 2.84e-01 0.104 0.0966 0.184 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 2.95e-01 0.103 0.0979 0.184 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -305623 sc-eQTL 1.26e-02 0.16 0.0635 0.184 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 762943 sc-eQTL 3.37e-01 -0.093 0.0966 0.184 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0639 0.0788 0.184 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0169 0.0627 0.184 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 8.32e-02 -0.118 0.0679 0.184 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0566 0.0463 0.184 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 3.51e-01 0.0784 0.0839 0.184 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00556 0.0941 0.184 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0361 0.0777 0.184 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 7.32e-01 0.0262 0.0766 0.184 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 2.14e-01 0.113 0.0904 0.184 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 2.45e-01 -0.036 0.0309 0.184 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 7.14e-01 0.032 0.0872 0.184 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 2.00e-01 0.12 0.0934 0.184 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 762943 sc-eQTL 2.82e-01 0.0873 0.0809 0.18 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 7.17e-01 -0.026 0.0716 0.18 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -908500 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0943 0.0886 0.18 DC L1
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 8.08e-02 -0.182 0.104 0.18 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -887790 sc-eQTL 2.28e-01 0.116 0.0956 0.18 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 5.98e-01 0.0541 0.103 0.18 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 2.22e-02 0.131 0.0568 0.18 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 2.75e-01 0.112 0.102 0.18 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0117 0.0911 0.18 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 762943 sc-eQTL 4.04e-01 0.0752 0.0901 0.184 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 3.15e-01 0.054 0.0536 0.184 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -908500 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0597 0.0922 0.184 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 1.69e-01 -0.12 0.0873 0.184 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -887790 sc-eQTL 6.31e-01 0.0477 0.0992 0.184 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 1.93e-01 0.0911 0.0698 0.184 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 6.60e-01 0.0185 0.042 0.184 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 8.45e-01 0.017 0.087 0.184 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00211 0.0831 0.184 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 1.68e-01 0.11 0.0797 0.182 NK L1
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 8.20e-01 0.0166 0.0732 0.182 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 8.09e-01 0.0241 0.0996 0.182 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 9.83e-02 -0.068 0.041 0.182 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 1.56e-02 -0.211 0.0864 0.182 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 762943 sc-eQTL 1.11e-01 0.142 0.0887 0.184 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00247 0.0808 0.184 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0444 0.101 0.184 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0845 0.0975 0.184 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 4.70e-01 -0.028 0.0387 0.184 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0449 0.0881 0.184 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 7.69e-01 0.0312 0.106 0.184 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 762943 sc-eQTL 9.75e-01 -0.0032 0.103 0.176 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -575210 sc-eQTL 7.21e-01 0.0418 0.117 0.176 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 8.64e-01 0.0188 0.11 0.176 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 9.74e-01 0.00401 0.122 0.176 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 2.38e-01 0.138 0.116 0.176 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 9.97e-01 0.000231 0.0625 0.176 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0376 0.121 0.176 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 2.64e-01 0.122 0.109 0.176 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -305623 sc-eQTL 2.81e-01 0.113 0.104 0.176 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 762943 sc-eQTL 7.38e-01 0.0349 0.105 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -575210 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00761 0.101 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 8.97e-01 -0.00859 0.0662 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 4.63e-01 -0.074 0.101 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 6.99e-01 0.0386 0.0996 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 7.31e-01 -0.021 0.061 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 1.48e-01 0.148 0.102 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 2.94e-02 0.238 0.109 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -305623 sc-eQTL 9.97e-01 0.000345 0.0934 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 762943 sc-eQTL 4.13e-01 0.0801 0.0978 0.183 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -575210 sc-eQTL 7.49e-01 0.0326 0.102 0.183 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 9.83e-01 0.00173 0.0797 0.183 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0874 0.102 0.183 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 8.51e-01 0.0196 0.104 0.183 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 8.44e-01 -0.00991 0.0502 0.183 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0281 0.107 0.183 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0666 0.105 0.183 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -305623 sc-eQTL 6.87e-01 0.0394 0.0976 0.183 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 762943 sc-eQTL 2.66e-01 0.0919 0.0824 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -575210 sc-eQTL 3.93e-01 -0.096 0.112 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 2.16e-01 0.0607 0.0489 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 3.18e-01 0.0878 0.0878 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 9.06e-01 0.0113 0.0954 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 2.22e-01 0.0662 0.0541 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 6.69e-01 0.0471 0.11 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 9.47e-01 0.00702 0.105 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -305623 sc-eQTL 6.27e-01 0.0337 0.0694 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 762943 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0114 0.0931 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -575210 sc-eQTL 3.09e-01 -0.107 0.105 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0119 0.0574 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 2.63e-01 0.119 0.106 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 1.98e-01 0.136 0.105 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 7.72e-01 0.0162 0.0558 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 6.89e-01 0.0447 0.111 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 1.27e-01 0.162 0.106 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -305623 sc-eQTL 1.99e-01 0.0947 0.0736 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 762943 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00371 0.0859 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0916 0.106 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 1.61e-01 0.154 0.11 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 4.71e-01 0.077 0.107 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 8.55e-01 -0.00903 0.0494 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 5.50e-01 0.0632 0.105 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0188 0.0995 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 762943 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0855 0.1 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0503 0.0853 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0575 0.0728 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 1.09e-01 -0.127 0.0786 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0371 0.0513 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 2.75e-01 0.104 0.095 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 9.27e-01 -0.009 0.0988 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 762943 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0238 0.102 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0745 0.0931 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0647 0.0783 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000856 0.0919 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00455 0.0476 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 8.79e-02 0.155 0.0903 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 1.37e-01 -0.164 0.11 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 762943 sc-eQTL 6.78e-01 0.0449 0.108 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0937 0.108 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 8.12e-03 0.261 0.0978 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 9.39e-01 0.00797 0.104 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0315 0.0425 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0204 0.109 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 1.06e-01 0.171 0.105 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 9.38e-01 -0.007 0.0892 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 2.94e-01 0.0958 0.0911 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 7.06e-03 0.271 0.0996 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 8.82e-01 -0.00806 0.0542 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 1.17e-01 -0.16 0.102 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 3.55e-01 0.0972 0.105 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 9.57e-01 0.0058 0.109 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 8.19e-02 -0.152 0.0867 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0268 0.0937 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 8.68e-01 0.00892 0.0537 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 6.34e-01 0.047 0.0986 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 2.11e-01 0.135 0.107 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 2.56e-01 -0.122 0.107 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 2.79e-01 0.117 0.108 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0149 0.107 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 3.40e-01 0.0497 0.052 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 1.90e-01 0.152 0.116 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 9.48e-01 0.00748 0.114 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 6.13e-01 0.0572 0.113 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 4.21e-01 0.0876 0.109 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 1.81e-01 0.15 0.112 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 9.49e-01 0.0039 0.0605 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 1.98e-01 -0.142 0.11 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0133 0.114 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 762943 sc-eQTL 1.33e-01 0.15 0.099 0.182 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 9.31e-01 0.00892 0.104 0.182 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 2.58e-01 -0.123 0.108 0.182 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0549 0.105 0.182 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0219 0.0518 0.182 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 4.06e-01 -0.089 0.107 0.182 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 9.02e-01 0.0134 0.109 0.182 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 9.07e-01 0.0125 0.106 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 4.79e-01 0.0795 0.112 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 4.98e-02 -0.211 0.107 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 6.92e-01 0.0238 0.06 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0394 0.109 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 4.72e-01 0.0616 0.0855 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 3.83e-01 0.0768 0.0878 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 4.06e-01 0.089 0.107 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0538 0.0423 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 1.12e-01 -0.148 0.0928 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 1.67e-01 0.145 0.105 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 8.91e-01 0.0146 0.106 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 2.19e-01 0.131 0.106 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 8.07e-02 -0.0866 0.0493 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 7.59e-01 0.0339 0.11 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 1.79e-01 0.125 0.0928 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0771 0.0962 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 3.82e-01 0.0917 0.105 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0319 0.0568 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 4.98e-02 -0.19 0.0964 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 762943 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0356 0.156 0.178 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 -575210 sc-eQTL 3.55e-01 0.12 0.129 0.178 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 9.48e-01 0.00713 0.108 0.178 PB L2
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 1.29e-01 0.223 0.146 0.178 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 4.27e-01 0.105 0.132 0.178 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 9.88e-01 0.00112 0.0751 0.178 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 2.87e-01 0.153 0.143 0.178 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 2.92e-01 -0.148 0.14 0.178 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -305623 sc-eQTL 7.24e-01 0.0328 0.0925 0.178 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 762943 sc-eQTL 4.90e-01 0.0654 0.0946 0.183 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 3.97e-01 0.0829 0.0977 0.183 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 8.27e-01 0.024 0.11 0.183 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 7.39e-01 0.0351 0.105 0.183 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 9.50e-01 0.00249 0.0397 0.183 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 9.62e-01 0.00446 0.0944 0.183 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0328 0.103 0.183 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 762943 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0415 0.104 0.184 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 7.13e-01 0.0382 0.104 0.184 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0707 0.106 0.184 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 1.70e-01 -0.12 0.0868 0.184 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 4.05e-01 0.0321 0.0385 0.184 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0701 0.0918 0.184 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 9.24e-01 0.0104 0.109 0.184 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 762943 sc-eQTL 1.98e-01 0.12 0.0931 0.18 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0996 0.0928 0.18 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -908500 sc-eQTL 1.07e-01 -0.149 0.0918 0.18 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 3.88e-01 -0.104 0.12 0.18 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -887790 sc-eQTL 5.11e-01 0.0715 0.109 0.18 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 8.88e-01 -0.015 0.106 0.18 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 1.02e-01 0.0852 0.0519 0.18 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 5.63e-02 0.222 0.116 0.18 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0265 0.104 0.18 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 762943 sc-eQTL 6.49e-01 0.0447 0.0983 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0133 0.0692 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -908500 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0487 0.0977 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 1.93e-01 -0.126 0.0963 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -887790 sc-eQTL 6.29e-01 0.0478 0.0986 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 3.63e-01 0.0717 0.0787 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 2.51e-01 0.0503 0.0437 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 9.49e-01 0.00608 0.0941 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 5.71e-01 0.0479 0.0844 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 762943 sc-eQTL 2.36e-02 0.23 0.101 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 4.98e-02 0.146 0.074 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -908500 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000603 0.0932 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0255 0.101 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -887790 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0177 0.101 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 3.08e-01 0.0675 0.0661 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 5.71e-02 0.0905 0.0473 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0119 0.0991 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 1.79e-01 -0.119 0.088 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 762943 sc-eQTL 9.33e-01 0.00985 0.116 0.185 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 8.39e-01 0.0248 0.122 0.185 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00736 0.131 0.185 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0857 0.134 0.185 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 5.30e-01 0.0322 0.0512 0.185 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 4.51e-01 -0.103 0.136 0.185 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 1.39e-01 0.196 0.132 0.185 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 762943 sc-eQTL 9.50e-01 0.00644 0.104 0.18 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 4.99e-01 -0.068 0.1 0.18 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -908500 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0204 0.102 0.18 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 7.37e-01 0.0375 0.112 0.18 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -887790 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0195 0.1 0.18 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0565 0.102 0.18 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 3.70e-01 0.0398 0.0443 0.18 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 1.06e-01 -0.176 0.108 0.18 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 3.23e-01 0.107 0.108 0.18 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 762943 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0865 0.0972 0.181 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0489 0.0741 0.181 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -908500 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0453 0.105 0.181 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 7.11e-01 0.0394 0.106 0.181 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -887790 sc-eQTL 6.57e-01 0.0462 0.104 0.181 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 6.66e-01 0.0432 0.0999 0.181 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0449 0.05 0.181 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 6.44e-01 0.0475 0.103 0.181 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0694 0.0884 0.181 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 762943 sc-eQTL 6.79e-01 0.0473 0.114 0.195 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0279 0.0823 0.195 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -908500 sc-eQTL 1.97e-01 0.107 0.0824 0.195 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 1.54e-01 -0.164 0.115 0.195 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -887790 sc-eQTL 8.16e-01 0.0197 0.0843 0.195 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 8.86e-01 0.0145 0.1 0.195 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 8.21e-01 0.0157 0.0691 0.195 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 3.98e-01 0.0798 0.0941 0.195 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0442 0.102 0.195 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 762943 sc-eQTL 3.25e-01 0.0924 0.0936 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -575210 sc-eQTL 7.00e-01 0.041 0.106 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0178 0.0602 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 2.68e-01 -0.102 0.0919 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 7.55e-01 0.0298 0.0953 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 9.40e-01 0.00406 0.0543 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 2.37e-01 0.111 0.0934 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 7.24e-02 0.179 0.0989 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -305623 sc-eQTL 3.35e-01 0.0927 0.0959 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 762943 sc-eQTL 7.61e-01 0.024 0.0788 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -575210 sc-eQTL 2.10e-01 -0.142 0.113 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 3.55e-01 0.0429 0.0463 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 2.02e-01 0.111 0.0868 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 6.68e-01 0.0387 0.0901 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 5.22e-01 0.035 0.0545 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 3.21e-01 0.109 0.11 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 2.62e-01 0.115 0.103 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -305623 sc-eQTL 1.90e-01 0.0856 0.0651 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 762943 sc-eQTL 2.23e-01 0.115 0.0938 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 2.67e-01 0.0642 0.0577 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -908500 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0337 0.0944 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 1.29e-01 -0.137 0.0902 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -887790 sc-eQTL 6.50e-01 0.0447 0.0984 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 1.95e-01 0.0843 0.0648 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 1.62e-01 0.0623 0.0444 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 7.19e-01 0.0321 0.089 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0055 0.0794 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 762943 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0832 0.0988 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0665 0.0701 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -908500 sc-eQTL 2.48e-01 -0.119 0.103 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 9.73e-01 0.00347 0.101 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -887790 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00571 0.102 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 9.90e-01 0.00125 0.0966 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0309 0.0409 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 2.11e-01 -0.129 0.103 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -987074 sc-eQTL 6.90e-01 0.0397 0.0995 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -686933 sc-eQTL 1.27e-01 0.123 0.0801 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 198023 sc-eQTL 7.15e-01 0.0286 0.0782 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -937194 sc-eQTL 3.91e-01 0.0875 0.102 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -988304 sc-eQTL 1.48e-01 -0.0601 0.0414 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 690798 sc-eQTL 1.03e-02 -0.22 0.0849 0.181 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 -686933 eQTL 0.0404 -0.044 0.0214 0.0 0.0 0.166
ENSG00000112282 MED23 198023 eQTL 0.0261 -0.0501 0.0225 0.0 0.0 0.166
ENSG00000112306 RPS12 -988304 eQTL 0.0229 -0.0185 0.00813 0.00147 0.0 0.166
ENSG00000154269 ENPP3 197823 eQTL 0.00181 0.103 0.0329 0.00162 0.0 0.166
ENSG00000234484 AL032821.1 -926410 eQTL 0.274 0.046 0.0421 0.00222 0.0 0.166

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079819 \N 762943 1.32e-06 9.19e-07 2.87e-07 1.11e-06 1.96e-07 4.9e-07 1.48e-06 3.49e-07 1.27e-06 4.78e-07 2.1e-06 7.53e-07 3.5e-06 3.95e-07 3.34e-07 9.51e-07 7.68e-07 1.06e-06 5.99e-07 4.65e-07 7.6e-07 1.96e-06 1.11e-06 6.54e-07 2.31e-06 3.79e-07 6.19e-07 5.65e-07 1.39e-06 1.3e-06 7.8e-07 5.06e-08 2.24e-07 5.61e-07 5.69e-07 5.3e-07 6.08e-07 1.61e-07 3.89e-07 1.92e-07 1.91e-07 3.17e-06 4.96e-07 1.89e-07 2.03e-07 3.67e-07 7.89e-08 2.18e-07 2.74e-07
ENSG00000112306 RPS12 -988304 1.2e-06 6.78e-07 2.93e-07 3.44e-07 1.07e-07 3.41e-07 1.13e-06 1.76e-07 8.32e-07 2.77e-07 1.39e-06 5.57e-07 2.63e-06 2.76e-07 5.62e-07 7e-07 3.24e-07 5.47e-07 5.72e-07 1.78e-07 3.99e-07 1.6e-06 8.26e-07 3.29e-07 1.86e-06 2.64e-07 3.68e-07 2.98e-07 7.69e-07 1.22e-06 5.39e-07 6.31e-08 8.37e-08 6.53e-07 4.25e-07 4.32e-07 2.14e-07 1.11e-07 1.24e-07 1.63e-08 8.15e-08 2.12e-06 2.46e-07 1.3e-07 8.24e-08 3.02e-07 7.52e-08 6.08e-08 9.42e-08
ENSG00000154269 ENPP3 197823 7.89e-06 9.31e-06 2.36e-06 4.85e-06 1.84e-06 3.82e-06 1.17e-05 1.29e-06 6.51e-06 4.81e-06 1.2e-05 5.16e-06 1.81e-05 3.96e-06 3.17e-06 6.54e-06 4.17e-06 6.32e-06 2.98e-06 2.57e-06 6.11e-06 1.06e-05 9.05e-06 3.36e-06 1.3e-05 3.73e-06 4.46e-06 2.61e-06 1.06e-05 8.58e-06 4.94e-06 5.83e-07 1.22e-06 3.24e-06 3.64e-06 2.77e-06 1.83e-06 1.9e-06 1.57e-06 9.98e-07 1.01e-06 1.71e-05 2.48e-06 2.81e-07 7.74e-07 2.36e-06 1.05e-06 1e-06 8.61e-07