logo

Genes within 1Mb (chr6:131817147:CAT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 753825 sc-eQTL 9.75e-01 0.00358 0.112 0.075 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 -584328 sc-eQTL 9.08e-01 0.0189 0.164 0.075 B L1
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0482 0.0618 0.075 B L1
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 5.90e-01 0.0666 0.123 0.075 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 3.12e-01 -0.118 0.116 0.075 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 2.81e-01 0.0758 0.0701 0.075 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 2.40e-01 0.172 0.146 0.075 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0712 0.148 0.075 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -314741 sc-eQTL 7.43e-02 0.173 0.0964 0.075 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 753825 sc-eQTL 8.55e-01 0.0276 0.151 0.075 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0661 0.123 0.075 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 6.63e-01 0.0425 0.0974 0.075 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000253 0.106 0.075 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00755 0.0723 0.075 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 7.03e-01 0.0499 0.131 0.075 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 9.91e-01 0.00167 0.146 0.075 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0761 0.12 0.075 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 3.10e-01 -0.121 0.118 0.075 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 8.99e-02 -0.238 0.14 0.075 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0124 0.0481 0.075 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 3.28e-02 0.287 0.134 0.075 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 6.15e-01 0.0733 0.145 0.075 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 753825 sc-eQTL 5.87e-01 -0.069 0.127 0.072 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 9.49e-01 0.00712 0.112 0.072 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -917618 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00534 0.139 0.072 DC L1
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 1.01e-01 -0.267 0.162 0.072 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -896908 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0721 0.15 0.072 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 6.36e-01 0.0761 0.16 0.072 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 2.10e-01 0.113 0.0896 0.072 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00109 0.16 0.072 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 5.72e-01 0.0805 0.142 0.072 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 753825 sc-eQTL 7.70e-02 -0.243 0.137 0.075 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 6.96e-01 0.0321 0.0821 0.075 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -917618 sc-eQTL 2.82e-01 0.152 0.141 0.075 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 2.36e-01 0.159 0.133 0.075 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -896908 sc-eQTL 1.20e-01 -0.235 0.151 0.075 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 2.74e-01 -0.117 0.107 0.075 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 5.59e-01 0.0375 0.0641 0.075 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 4.01e-01 0.112 0.133 0.075 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0223 0.127 0.075 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 2.38e-01 -0.146 0.123 0.075 NK L1
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 1.30e-01 -0.171 0.113 0.075 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 1.63e-01 0.215 0.153 0.075 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 3.76e-01 0.0565 0.0637 0.075 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 3.46e-01 0.128 0.135 0.075 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 753825 sc-eQTL 6.23e-01 0.067 0.136 0.075 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 4.42e-02 -0.247 0.122 0.075 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0576 0.154 0.075 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 2.30e-02 0.337 0.147 0.075 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 5.55e-01 0.0349 0.059 0.075 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 5.40e-02 0.258 0.133 0.075 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 4.08e-01 0.134 0.162 0.075 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 753825 sc-eQTL 6.35e-01 0.0748 0.157 0.066 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -584328 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0229 0.178 0.066 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 3.11e-01 -0.17 0.167 0.066 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 9.71e-01 0.00667 0.185 0.066 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 5.95e-01 0.0949 0.178 0.066 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00138 0.0954 0.066 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 7.96e-01 0.048 0.185 0.066 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 9.22e-01 0.0164 0.167 0.066 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -314741 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0834 0.159 0.066 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 753825 sc-eQTL 3.90e-01 -0.138 0.161 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -584328 sc-eQTL 7.45e-01 0.0506 0.156 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 1.43e-01 -0.149 0.101 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 6.28e-01 0.0751 0.155 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 1.51e-01 0.22 0.153 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 2.80e-01 0.102 0.0937 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 1.77e-01 0.212 0.157 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 2.25e-01 -0.205 0.169 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -314741 sc-eQTL 6.73e-01 0.0608 0.144 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 753825 sc-eQTL 7.93e-01 0.039 0.148 0.073 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -584328 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0633 0.154 0.073 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 6.79e-01 -0.05 0.121 0.073 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 6.86e-02 0.282 0.154 0.073 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 8.62e-01 0.0274 0.158 0.073 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 1.39e-01 0.112 0.0757 0.073 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 2.82e-01 0.174 0.162 0.073 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 4.50e-01 -0.12 0.159 0.073 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -314741 sc-eQTL 4.12e-01 -0.122 0.148 0.073 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 753825 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0566 0.127 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -584328 sc-eQTL 5.98e-01 0.0909 0.172 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 1.98e-01 -0.097 0.0751 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 7.91e-01 0.0359 0.135 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0619 0.146 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 1.94e-01 0.108 0.083 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 9.86e-01 0.00288 0.169 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 5.31e-01 0.101 0.161 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -314741 sc-eQTL 1.53e-01 0.152 0.106 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 753825 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0091 0.146 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -584328 sc-eQTL 7.15e-01 0.0608 0.166 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 9.32e-01 0.00774 0.0904 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 4.80e-01 0.118 0.167 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 1.85e-01 -0.22 0.165 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 1.18e-01 0.137 0.0874 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 1.65e-01 0.244 0.175 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0107 0.168 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -314741 sc-eQTL 7.99e-01 0.0296 0.116 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 753825 sc-eQTL 9.35e-01 0.0116 0.142 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 2.75e-01 0.191 0.174 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 8.03e-01 0.0455 0.182 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 1.70e-01 0.242 0.176 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0498 0.0814 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0974 0.174 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 1.93e-01 -0.214 0.164 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 753825 sc-eQTL 8.35e-01 0.0324 0.155 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 4.05e-01 -0.11 0.132 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 1.11e-01 0.179 0.112 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00485 0.122 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0678 0.0792 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00889 0.147 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0127 0.153 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 753825 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00671 0.159 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 9.88e-01 0.00222 0.146 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 9.98e-01 0.000373 0.122 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0197 0.143 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 8.62e-01 -0.013 0.0744 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 7.85e-01 0.0388 0.142 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0752 0.172 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 753825 sc-eQTL 1.37e-01 -0.248 0.166 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0625 0.167 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 3.73e-03 -0.442 0.151 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 6.25e-01 0.0785 0.16 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 8.80e-01 0.00994 0.0658 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 1.68e-01 0.233 0.168 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 8.92e-01 0.0223 0.163 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 9.34e-01 0.0114 0.138 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 1.03e-01 -0.23 0.141 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 3.65e-01 -0.142 0.157 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0746 0.0839 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 4.86e-01 0.111 0.158 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 1.57e-01 -0.23 0.162 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 2.02e-01 -0.214 0.167 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 3.93e-01 0.115 0.135 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 2.14e-01 -0.18 0.144 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0604 0.0827 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 2.99e-02 0.329 0.151 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 9.79e-01 0.00439 0.166 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 1.01e-01 0.283 0.172 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 5.05e-01 -0.116 0.173 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 9.30e-01 0.0151 0.172 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 1.47e-01 -0.121 0.0833 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 6.07e-01 -0.096 0.186 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 1.49e-01 0.265 0.182 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 1.06e-01 -0.273 0.168 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0903 0.163 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 8.43e-01 0.0334 0.168 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 1.76e-01 0.122 0.0901 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 3.18e-01 0.165 0.165 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0702 0.171 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 753825 sc-eQTL 9.71e-01 0.00589 0.16 0.076 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0782 0.167 0.076 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0685 0.174 0.076 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 4.51e-02 0.338 0.168 0.076 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 9.68e-01 -0.0034 0.0834 0.076 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 1.86e-01 0.228 0.171 0.076 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 2.86e-01 0.187 0.174 0.076 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 4.06e-01 -0.146 0.176 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 9.22e-02 0.313 0.185 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 5.72e-01 0.101 0.179 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 4.00e-01 0.084 0.0995 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00308 0.181 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 2.60e-01 -0.15 0.132 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0596 0.136 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 2.30e-01 0.199 0.165 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 6.26e-01 0.0321 0.0658 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 5.88e-01 0.0785 0.145 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 3.89e-01 -0.147 0.17 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 2.81e-04 -0.617 0.167 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 3.21e-01 0.172 0.172 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 9.99e-01 6.82e-05 0.0805 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 2.15e-01 0.222 0.178 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 2.72e-01 0.159 0.145 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 3.71e-01 -0.134 0.15 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 2.89e-01 0.173 0.163 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0067 0.0885 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 4.52e-02 0.302 0.15 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 753825 sc-eQTL 2.32e-01 -0.225 0.187 0.093 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 -584328 sc-eQTL 2.06e-01 -0.198 0.155 0.093 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 2.23e-01 -0.159 0.13 0.093 PB L2
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 9.33e-01 -0.015 0.178 0.093 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 9.19e-01 0.0163 0.16 0.093 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0467 0.0906 0.093 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 1.04e-01 0.28 0.171 0.093 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0445 0.17 0.093 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -314741 sc-eQTL 4.12e-01 0.0918 0.111 0.093 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 753825 sc-eQTL 5.64e-01 0.0835 0.144 0.074 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 3.26e-01 -0.147 0.149 0.074 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0222 0.168 0.074 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 7.60e-02 0.283 0.159 0.074 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 1.92e-01 0.079 0.0603 0.074 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 5.21e-01 0.0925 0.144 0.074 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0515 0.157 0.074 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 753825 sc-eQTL 1.74e-01 0.218 0.16 0.075 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 1.41e-01 0.236 0.16 0.075 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0206 0.165 0.075 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0578 0.135 0.075 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 4.58e-01 0.0443 0.0596 0.075 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 7.45e-01 0.0463 0.142 0.075 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 6.39e-01 0.0792 0.169 0.075 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 753825 sc-eQTL 9.34e-01 0.0121 0.145 0.066 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0817 0.145 0.066 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -917618 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0238 0.144 0.066 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 2.12e-01 -0.233 0.186 0.066 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -896908 sc-eQTL 8.75e-02 -0.288 0.168 0.066 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0204 0.165 0.066 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 2.56e-01 0.0922 0.081 0.066 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 6.72e-01 0.0769 0.181 0.066 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 6.55e-01 -0.072 0.161 0.066 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 753825 sc-eQTL 4.47e-01 -0.113 0.149 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 9.23e-01 0.0101 0.105 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -917618 sc-eQTL 1.18e-01 0.231 0.147 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 9.25e-01 0.0138 0.146 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -896908 sc-eQTL 4.63e-01 -0.11 0.149 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0383 0.119 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 4.70e-01 0.048 0.0662 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 3.13e-01 0.144 0.142 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 6.67e-01 0.055 0.128 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 753825 sc-eQTL 6.56e-03 -0.417 0.152 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 7.26e-01 0.0397 0.113 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -917618 sc-eQTL 2.58e-01 0.16 0.141 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 4.05e-01 0.128 0.153 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -896908 sc-eQTL 1.58e-01 -0.216 0.153 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0559 0.1 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 1.49e-01 0.104 0.072 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 2.14e-01 0.186 0.15 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 9.85e-01 0.00253 0.134 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 753825 sc-eQTL 3.94e-01 -0.159 0.186 0.067 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 9.88e-02 -0.321 0.193 0.067 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0351 0.209 0.067 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 4.61e-02 0.428 0.213 0.067 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 6.83e-01 0.0336 0.0821 0.067 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 1.66e-01 0.302 0.217 0.067 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 8.53e-01 0.0393 0.212 0.067 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 753825 sc-eQTL 3.76e-01 -0.142 0.16 0.076 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0947 0.155 0.076 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -917618 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0709 0.157 0.076 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 7.12e-02 0.31 0.171 0.076 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -896908 sc-eQTL 8.97e-01 -0.02 0.155 0.076 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 4.51e-01 -0.119 0.157 0.076 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 2.32e-01 0.082 0.0683 0.076 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 7.55e-01 0.0526 0.168 0.076 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0849 0.167 0.076 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 753825 sc-eQTL 3.27e-01 -0.151 0.154 0.072 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 2.66e-01 -0.131 0.117 0.072 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -917618 sc-eQTL 1.46e-01 -0.241 0.165 0.072 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 5.30e-01 0.106 0.168 0.072 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -896908 sc-eQTL 1.40e-01 -0.243 0.164 0.072 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 1.95e-01 -0.205 0.158 0.072 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000374 0.0794 0.072 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00391 0.163 0.072 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0426 0.14 0.072 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 753825 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0245 0.188 0.068 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0941 0.135 0.068 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -917618 sc-eQTL 3.44e-01 0.129 0.136 0.068 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0695 0.19 0.068 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -896908 sc-eQTL 7.53e-01 0.0437 0.138 0.068 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0308 0.165 0.068 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0082 0.114 0.068 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 7.07e-01 0.0583 0.155 0.068 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0329 0.168 0.068 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 753825 sc-eQTL 7.57e-01 0.0448 0.145 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -584328 sc-eQTL 9.66e-01 -0.007 0.164 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 1.20e-01 -0.145 0.0925 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 1.53e-01 0.203 0.142 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 3.22e-01 0.146 0.147 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 1.61e-01 0.117 0.0835 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 6.26e-02 0.269 0.144 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 4.08e-02 -0.314 0.152 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -314741 sc-eQTL 3.23e-01 0.147 0.148 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 753825 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00885 0.12 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -584328 sc-eQTL 8.21e-01 0.0389 0.172 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0317 0.0704 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 5.21e-01 0.085 0.132 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 1.67e-01 -0.189 0.136 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 2.10e-01 0.104 0.0825 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 5.22e-01 0.107 0.167 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 7.82e-01 0.0432 0.156 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -314741 sc-eQTL 1.67e-01 0.137 0.0987 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 753825 sc-eQTL 3.48e-02 -0.301 0.142 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 7.09e-01 0.0329 0.0881 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -917618 sc-eQTL 1.56e-01 0.204 0.143 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 6.16e-01 0.0693 0.138 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -896908 sc-eQTL 1.78e-01 -0.202 0.149 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 2.40e-01 -0.116 0.0987 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 2.55e-01 0.0773 0.0677 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 3.93e-01 0.116 0.135 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000109 0.121 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 753825 sc-eQTL 7.71e-01 0.0441 0.151 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0533 0.107 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -917618 sc-eQTL 4.83e-01 -0.111 0.158 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 1.12e-01 0.244 0.153 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -896908 sc-eQTL 4.74e-01 -0.112 0.157 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 2.90e-01 -0.156 0.147 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 3.80e-01 0.0551 0.0626 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 9.40e-01 0.0119 0.158 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -996192 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0926 0.152 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -696051 sc-eQTL 3.53e-01 -0.115 0.124 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 188905 sc-eQTL 2.87e-02 -0.263 0.119 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -946312 sc-eQTL 1.54e-01 0.224 0.157 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -997422 sc-eQTL 6.88e-01 0.0258 0.0642 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 681680 sc-eQTL 3.37e-01 0.128 0.133 0.075 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 -584328 eQTL 0.0466 0.109 0.0548 0.0 0.0 0.08
ENSG00000112299 VNN1 -896908 eQTL 0.032 -0.085 0.0396 0.0 0.0 0.08
ENSG00000112303 VNN2 -946312 eQTL 0.0162 0.0569 0.0236 0.00166 0.0 0.08

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112282 \N 188905 1.55e-06 2.64e-06 2.89e-07 1.27e-06 9.33e-08 8.18e-07 1.32e-06 5.72e-07 1.75e-06 6.18e-07 1.69e-05 1.39e-06 5.41e-06 9.45e-07 3.84e-07 9.54e-07 7.96e-07 2.04e-06 2.56e-07 1.3e-07 7.74e-07 3.9e-06 1.35e-06 3.27e-07 2.67e-06 2.01e-07 6.88e-07 3.9e-07 1.63e-06 1.21e-06 4.24e-06 3.72e-08 4.76e-08 1.75e-07 5.2e-07 1.55e-07 5.58e-08 9.3e-08 6.3e-08 3.54e-08 3.16e-08 5.2e-05 3.19e-08 1.97e-08 3.4e-08 7.7e-08 7.8e-08 4.26e-09 4.74e-08
ENSG00000112306 \N -997422 2.66e-07 1.1e-07 3.34e-08 1.7e-07 1.03e-07 9.3e-08 1.42e-07 5.49e-08 1.41e-07 4.23e-08 4.13e-07 8.03e-08 1.52e-07 6.21e-08 4.89e-08 7.89e-08 5.15e-08 1.14e-07 4.91e-08 2.93e-08 1.05e-07 1.27e-07 1.3e-07 5.19e-08 1.29e-07 1.03e-07 1.11e-07 8.49e-08 9.97e-08 1.09e-07 1.14e-07 3.29e-08 2.6e-08 8e-08 9.41e-08 4.23e-08 4.01e-08 8e-08 8.44e-08 3.96e-08 2.71e-08 4.02e-07 4.33e-08 0.0 1.15e-07 1.8e-08 1.47e-07 4.96e-09 4.72e-08