logo

Genes within 1Mb (chr6:131562650:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 499328 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0311 0.0966 0.109 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 -838825 sc-eQTL 3.77e-01 -0.124 0.141 0.109 B L1
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0343 0.0531 0.109 B L1
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 2.78e-01 0.115 0.106 0.109 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0469 0.125 0.109 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -569238 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0333 0.0834 0.109 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 499328 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0414 0.126 0.109 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00854 0.103 0.109 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 4.16e-01 0.0662 0.0812 0.109 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0874 0.109 0.109 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0328 0.102 0.109 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 4.07e-01 0.0836 0.101 0.109 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 3.02e-01 0.118 0.115 0.109 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 499328 sc-eQTL 2.55e-01 0.122 0.107 0.101 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 7.25e-02 0.17 0.0941 0.101 DC L1
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 4.24e-01 -0.11 0.138 0.101 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 8.33e-02 -0.235 0.135 0.101 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 499328 sc-eQTL 1.76e-01 -0.156 0.115 0.109 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0198 0.0689 0.109 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0319 0.112 0.109 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 8.63e-01 0.0193 0.111 0.109 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 9.25e-01 0.00972 0.103 0.109 NK L1
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 6.17e-01 0.0471 0.0939 0.109 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 9.46e-01 0.00766 0.112 0.109 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 499328 sc-eQTL 5.46e-01 0.0687 0.114 0.109 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 7.49e-02 -0.183 0.102 0.109 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 4.02e-01 0.108 0.128 0.109 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 7.52e-01 0.0355 0.112 0.109 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 499328 sc-eQTL 8.72e-01 0.0205 0.127 0.107 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -838825 sc-eQTL 5.61e-01 0.0841 0.144 0.107 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0271 0.135 0.107 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 4.09e-01 0.124 0.15 0.107 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 7.22e-01 0.0533 0.149 0.107 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -569238 sc-eQTL 3.02e-01 -0.133 0.129 0.107 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 499328 sc-eQTL 1.26e-02 -0.336 0.134 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -838825 sc-eQTL 1.10e-02 -0.332 0.129 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 2.32e-01 0.103 0.0856 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 2.73e-01 0.143 0.13 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 7.13e-01 0.0489 0.133 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -569238 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0851 0.121 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 499328 sc-eQTL 1.91e-01 0.163 0.124 0.108 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -838825 sc-eQTL 1.07e-01 -0.208 0.128 0.108 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0981 0.101 0.108 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 3.84e-01 0.114 0.13 0.108 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 1.57e-02 -0.326 0.134 0.108 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -569238 sc-eQTL 2.99e-01 -0.129 0.124 0.108 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 499328 sc-eQTL 1.95e-01 -0.139 0.107 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -838825 sc-eQTL 2.25e-01 -0.176 0.145 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 8.69e-01 0.0105 0.0636 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 2.77e-01 0.124 0.114 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 8.80e-01 0.0216 0.143 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -569238 sc-eQTL 9.85e-01 0.00174 0.0898 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 499328 sc-eQTL 6.40e-02 0.227 0.122 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -838825 sc-eQTL 6.32e-01 0.0668 0.139 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0458 0.0758 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 4.36e-01 0.109 0.14 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0313 0.147 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -569238 sc-eQTL 2.15e-01 -0.121 0.0972 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 499328 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0176 0.114 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 4.81e-01 0.0991 0.14 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 3.38e-02 0.309 0.145 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 7.58e-01 0.0432 0.14 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 499328 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0485 0.131 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0395 0.111 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0406 0.0947 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0817 0.124 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 499328 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0379 0.133 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 7.36e-01 0.041 0.121 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 7.37e-02 0.182 0.101 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 3.79e-01 -0.104 0.118 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 499328 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0324 0.138 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 1.24e-01 0.212 0.137 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 4.89e-01 -0.088 0.127 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 2.78e-02 0.306 0.138 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0548 0.116 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 4.30e-01 0.0941 0.119 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 5.04e-01 0.0891 0.133 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 7.31e-02 -0.249 0.138 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0649 0.112 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 6.60e-01 0.0558 0.127 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 2.55e-01 0.153 0.134 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 3.25e-01 0.132 0.134 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 2.08e-01 0.182 0.144 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 2.86e-01 0.155 0.145 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 2.28e-01 0.169 0.14 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0884 0.143 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 499328 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0443 0.129 0.11 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 4.70e-02 -0.266 0.133 0.11 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 9.29e-01 0.0126 0.141 0.11 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0305 0.139 0.11 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 8.85e-01 0.0198 0.137 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 3.70e-01 0.13 0.145 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 1.60e-01 0.198 0.14 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0538 0.109 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 3.72e-01 -0.1 0.112 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0644 0.119 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 7.95e-02 0.244 0.138 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 8.31e-01 0.03 0.141 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 4.91e-01 0.101 0.146 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 2.62e-01 0.137 0.121 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 4.27e-01 0.1 0.126 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 9.23e-02 0.213 0.126 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 499328 sc-eQTL 5.31e-01 -0.103 0.163 0.126 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 -838825 sc-eQTL 3.40e-01 -0.13 0.135 0.126 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 8.12e-01 0.0271 0.114 0.126 PB L2
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 4.73e-01 -0.111 0.154 0.126 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 1.76e-01 0.203 0.149 0.126 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -569238 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0671 0.0968 0.126 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 499328 sc-eQTL 6.22e-01 0.0598 0.121 0.109 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0455 0.125 0.109 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 3.81e-01 0.123 0.14 0.109 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 3.57e-01 0.111 0.12 0.109 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 499328 sc-eQTL 4.35e-01 0.104 0.133 0.109 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 1.95e-01 0.173 0.133 0.109 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0664 0.137 0.109 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 5.00e-01 -0.08 0.118 0.109 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 499328 sc-eQTL 2.73e-01 0.134 0.122 0.1 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 1.10e-01 0.194 0.121 0.1 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 4.02e-01 -0.132 0.156 0.1 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 4.71e-01 -0.11 0.152 0.1 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 499328 sc-eQTL 1.60e-01 -0.175 0.124 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 1.59e-01 -0.123 0.0872 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0414 0.122 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 3.59e-01 -0.109 0.119 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 499328 sc-eQTL 9.29e-02 -0.217 0.129 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 1.93e-01 0.123 0.0945 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 7.68e-01 0.038 0.129 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 9.60e-01 0.00625 0.126 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 499328 sc-eQTL 1.58e-02 0.406 0.166 0.091 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 9.78e-01 0.00499 0.178 0.091 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 3.03e-01 0.197 0.19 0.091 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0164 0.199 0.091 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 499328 sc-eQTL 6.95e-01 0.0526 0.134 0.109 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 5.24e-01 0.0829 0.13 0.109 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 8.93e-01 0.0195 0.144 0.109 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 7.99e-01 0.0359 0.141 0.109 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 499328 sc-eQTL 2.94e-01 -0.135 0.129 0.104 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0704 0.0982 0.104 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 4.55e-01 -0.105 0.14 0.104 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 7.30e-01 -0.047 0.136 0.104 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 499328 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0903 0.155 0.105 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 5.42e-01 -0.068 0.111 0.105 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00327 0.156 0.105 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0709 0.128 0.105 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 499328 sc-eQTL 2.72e-01 -0.133 0.121 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -838825 sc-eQTL 6.08e-02 -0.257 0.136 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 7.60e-01 0.0237 0.0777 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 2.73e-02 0.261 0.118 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 3.03e-01 -0.125 0.121 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -569238 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0686 0.124 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 499328 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0264 0.101 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -838825 sc-eQTL 3.89e-01 -0.125 0.144 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0143 0.0594 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 2.02e-01 0.142 0.111 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 8.46e-01 0.0272 0.141 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -569238 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0629 0.0835 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 499328 sc-eQTL 1.92e-02 -0.279 0.118 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000683 0.0737 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 9.77e-01 0.00329 0.115 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 8.48e-01 0.0218 0.113 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 499328 sc-eQTL 5.43e-01 0.0776 0.127 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0253 0.0904 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 3.09e-01 -0.132 0.129 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0609 0.133 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -950548 sc-eQTL 5.56e-01 0.0608 0.103 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -65592 sc-eQTL 8.96e-01 0.0131 0.1 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 427183 sc-eQTL 6.72e-01 0.0468 0.11 0.108 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112282 MED23 -65592 eQTL 0.0493 0.0474 0.0241 0.0 0.0 0.128
ENSG00000118520 ARG1 -10494 eQTL 0.0402 0.0547 0.0266 0.0 0.0 0.128

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina