logo

Genes within 1Mb (chr6:131406056:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 342734 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0299 0.0771 0.16 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 -995419 sc-eQTL 5.46e-02 0.216 0.112 0.16 B L1
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0112 0.0847 0.16 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 1.03e-01 0.163 0.0996 0.16 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -725832 sc-eQTL 7.08e-01 0.025 0.0666 0.16 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 342734 sc-eQTL 1.11e-01 0.161 0.101 0.16 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 2.60e-01 0.0739 0.0655 0.16 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 4.86e-03 -0.246 0.0865 0.16 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 1.55e-01 -0.115 0.0805 0.16 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0748 0.0919 0.16 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 342734 sc-eQTL 1.17e-01 -0.132 0.0839 0.16 DC L1
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0907 0.108 0.16 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 2.19e-01 -0.131 0.106 0.16 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 342734 sc-eQTL 1.47e-02 -0.228 0.0925 0.16 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 6.49e-02 0.168 0.0904 0.16 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 9.15e-01 0.00967 0.0905 0.16 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0132 0.0775 0.161 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0128 0.0927 0.161 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 342734 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0148 0.0923 0.16 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 4.73e-01 0.0749 0.104 0.16 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 1.03e-01 -0.149 0.0906 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 342734 sc-eQTL 1.26e-01 0.154 0.1 0.166 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -995419 sc-eQTL 8.23e-01 0.0257 0.114 0.166 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 1.03e-01 0.193 0.118 0.166 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 5.39e-02 -0.228 0.117 0.166 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -725832 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0286 0.102 0.166 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 342734 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0978 0.109 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -995419 sc-eQTL 5.09e-01 0.0698 0.105 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0478 0.105 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 3.98e-01 0.0903 0.107 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -725832 sc-eQTL 3.59e-02 -0.204 0.0966 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 342734 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0234 0.102 0.155 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -995419 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00557 0.106 0.155 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0419 0.107 0.155 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0701 0.112 0.155 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -725832 sc-eQTL 2.74e-01 -0.112 0.102 0.155 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 342734 sc-eQTL 2.22e-01 -0.105 0.0859 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -995419 sc-eQTL 8.36e-01 0.0244 0.117 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 6.28e-02 -0.17 0.091 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 7.41e-02 0.205 0.114 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -725832 sc-eQTL 5.91e-01 0.0389 0.0723 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 342734 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0155 0.0987 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -995419 sc-eQTL 7.13e-02 0.201 0.111 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 1.80e-01 0.151 0.112 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 5.01e-01 0.0796 0.118 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -725832 sc-eQTL 9.55e-01 0.00439 0.0784 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 342734 sc-eQTL 5.93e-01 -0.048 0.0897 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 3.32e-01 0.112 0.115 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 1.48e-01 0.159 0.11 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 342734 sc-eQTL 1.71e-01 0.144 0.105 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 5.90e-01 0.0411 0.0761 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 1.27e-03 -0.317 0.0971 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 342734 sc-eQTL 4.94e-01 0.0747 0.109 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 5.96e-01 0.0445 0.0838 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 1.70e-02 -0.231 0.096 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 342734 sc-eQTL 2.09e-01 0.142 0.113 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 1.49e-01 0.15 0.104 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 4.96e-02 0.224 0.113 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 4.54e-01 0.0717 0.0956 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0327 0.107 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 1.95e-01 -0.118 0.0911 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 1.34e-01 -0.154 0.103 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0246 0.111 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0241 0.119 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 2.44e-01 0.129 0.111 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 9.01e-01 0.014 0.113 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 342734 sc-eQTL 9.88e-01 0.00154 0.102 0.162 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 2.22e-01 0.136 0.111 0.162 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 1.94e-01 -0.143 0.11 0.162 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0954 0.119 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0676 0.116 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 6.81e-01 -0.038 0.0924 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 4.32e-01 0.0771 0.098 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 3.44e-01 0.105 0.111 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 6.39e-01 0.0541 0.115 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 3.07e-01 0.104 0.101 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0192 0.102 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 342734 sc-eQTL 4.63e-01 0.105 0.143 0.152 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 -995419 sc-eQTL 4.44e-01 0.0912 0.119 0.152 PB L2
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 7.81e-01 0.0377 0.135 0.152 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 3.23e-01 -0.13 0.131 0.152 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -725832 sc-eQTL 9.10e-01 0.00966 0.0849 0.152 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 342734 sc-eQTL 5.63e-01 0.0559 0.0967 0.161 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 6.85e-01 0.0457 0.112 0.161 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 4.87e-01 0.0672 0.0964 0.161 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 342734 sc-eQTL 6.24e-01 0.0541 0.11 0.16 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0213 0.114 0.16 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 6.36e-02 -0.181 0.0971 0.16 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 342734 sc-eQTL 2.22e-01 -0.116 0.0948 0.161 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 8.03e-01 0.0306 0.122 0.161 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000707 0.119 0.161 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 342734 sc-eQTL 1.61e-02 -0.242 0.0999 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 1.98e-01 0.128 0.0991 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 6.80e-01 0.04 0.0969 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 342734 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0798 0.105 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 5.52e-01 0.0622 0.105 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 9.01e-01 0.0128 0.102 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 342734 sc-eQTL 2.38e-02 -0.27 0.118 0.167 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 7.40e-02 -0.241 0.134 0.167 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 9.40e-02 -0.236 0.14 0.167 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 342734 sc-eQTL 1.95e-01 -0.142 0.109 0.162 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 3.09e-01 0.12 0.118 0.162 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 3.71e-01 0.103 0.115 0.162 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 342734 sc-eQTL 2.61e-01 -0.115 0.102 0.161 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 2.89e-01 0.118 0.111 0.161 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 5.33e-01 0.0674 0.108 0.161 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 342734 sc-eQTL 7.34e-01 -0.043 0.126 0.155 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 3.56e-01 -0.118 0.127 0.155 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0112 0.104 0.155 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 342734 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0194 0.0984 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -995419 sc-eQTL 7.07e-01 0.042 0.111 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 2.48e-01 0.112 0.0964 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0302 0.0983 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -725832 sc-eQTL 1.36e-01 -0.15 0.1 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 342734 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0615 0.0817 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -995419 sc-eQTL 2.21e-01 0.144 0.117 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 6.59e-01 -0.04 0.0905 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 5.79e-02 0.216 0.113 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -725832 sc-eQTL 5.20e-01 0.0437 0.0678 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 342734 sc-eQTL 2.30e-02 -0.22 0.096 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 1.54e-01 0.133 0.0932 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 7.65e-01 0.0275 0.0919 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 342734 sc-eQTL 6.59e-02 -0.195 0.105 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 1.99e-01 0.139 0.108 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 7.94e-01 0.029 0.111 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -222186 sc-eQTL 9.07e-01 0.00965 0.0823 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 270589 sc-eQTL 6.62e-01 0.0398 0.0908 0.162 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000118507 \N 270589 1.59e-06 1.84e-06 2.71e-07 1.18e-06 4.72e-07 6.68e-07 1.31e-06 5.98e-07 1.75e-06 6.56e-07 1.86e-06 1.29e-06 2.68e-06 5.23e-07 4.8e-07 1.27e-06 1.12e-06 1.36e-06 5.76e-07 1.07e-06 7.78e-07 1.92e-06 1.54e-06 9.8e-07 2.39e-06 1.2e-06 1.13e-06 1.26e-06 1.72e-06 1.4e-06 7.9e-07 2.51e-07 4.59e-07 9.68e-07 8.29e-07 7.09e-07 7.01e-07 3.37e-07 6.93e-07 3.97e-07 2.08e-07 2.17e-06 3.55e-07 1.66e-07 3.21e-07 3.26e-07 4.03e-07 1.97e-07 1.58e-07