logo

Genes within 1Mb (chr6:131296142:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 232820 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0716 0.0756 0.22 B L1
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 5.24e-01 0.0531 0.0831 0.22 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00108 0.0984 0.22 B L1
ENSG00000164483 SAMD3 930717 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0967 0.0864 0.22 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -835746 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0228 0.0655 0.22 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 232820 sc-eQTL 1.83e-01 0.13 0.0975 0.22 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 5.61e-01 0.0369 0.0634 0.22 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 3.53e-11 -0.536 0.0767 0.22 CD4T L1
ENSG00000164483 SAMD3 930717 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0454 0.0744 0.22 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0677 0.0779 0.22 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 8.95e-05 -0.342 0.0857 0.22 CD8T L1
ENSG00000164483 SAMD3 930717 sc-eQTL 9.81e-02 -0.0673 0.0405 0.22 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 232820 sc-eQTL 2.26e-01 -0.101 0.0828 0.221 DC L1
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0267 0.107 0.221 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 1.45e-03 -0.331 0.102 0.221 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 232820 sc-eQTL 6.80e-02 -0.17 0.0925 0.22 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 8.40e-01 0.0183 0.0906 0.22 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 5.40e-03 -0.248 0.0883 0.22 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 2.96e-01 0.078 0.0745 0.221 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 5.69e-01 -0.051 0.0893 0.221 NK L1
ENSG00000164483 SAMD3 930717 sc-eQTL 4.06e-02 -0.102 0.0494 0.221 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 232820 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0337 0.0915 0.22 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0459 0.103 0.22 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 1.50e-01 -0.13 0.09 0.22 Other_T L1
ENSG00000164483 SAMD3 930717 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0181 0.0483 0.22 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 232820 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0485 0.0979 0.232 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 7.63e-01 0.0349 0.115 0.232 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 8.76e-01 0.018 0.115 0.232 B_Activated L2
ENSG00000164483 SAMD3 930717 sc-eQTL 6.62e-01 0.0344 0.0785 0.232 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -835746 sc-eQTL 4.75e-01 0.0709 0.0991 0.232 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232820 sc-eQTL 1.13e-01 -0.17 0.107 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 7.17e-01 0.0375 0.103 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0304 0.105 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000164483 SAMD3 930717 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0533 0.0882 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -835746 sc-eQTL 2.21e-02 -0.218 0.0946 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232820 sc-eQTL 1.12e-01 -0.157 0.0984 0.22 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 1.18e-01 -0.162 0.103 0.22 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 2.66e-01 0.12 0.108 0.22 B_Memory L2
ENSG00000164483 SAMD3 930717 sc-eQTL 2.63e-01 -0.11 0.0981 0.22 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -835746 sc-eQTL 4.59e-01 0.0731 0.0985 0.22 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232820 sc-eQTL 3.35e-01 0.0823 0.0852 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 5.29e-01 0.0572 0.0908 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 8.70e-01 0.0187 0.114 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000164483 SAMD3 930717 sc-eQTL 8.28e-01 0.0193 0.0889 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -835746 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0717 0.0715 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232820 sc-eQTL 4.61e-01 0.0705 0.0955 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 8.59e-01 0.0194 0.109 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 9.20e-01 0.0115 0.115 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000164483 SAMD3 930717 sc-eQTL 1.41e-01 -0.109 0.0739 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -835746 sc-eQTL 4.85e-01 0.053 0.0758 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232820 sc-eQTL 9.88e-01 0.00132 0.09 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 3.65e-01 0.105 0.115 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 9.39e-01 0.00844 0.111 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000164483 SAMD3 930717 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0514 0.0726 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232820 sc-eQTL 1.65e-01 0.14 0.101 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 6.94e-01 0.0289 0.0734 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 3.49e-10 -0.576 0.0874 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000164483 SAMD3 930717 sc-eQTL 2.40e-01 -0.104 0.0881 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232820 sc-eQTL 8.60e-01 0.0185 0.105 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 1.43e-01 0.118 0.0802 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 1.30e-04 -0.352 0.0903 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000164483 SAMD3 930717 sc-eQTL 7.06e-01 0.0321 0.0852 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232820 sc-eQTL 1.92e-01 0.143 0.11 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 2.81e-01 -0.109 0.101 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0908 0.111 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000164483 SAMD3 930717 sc-eQTL 7.10e-02 0.128 0.0704 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 2.00e-01 0.119 0.093 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 1.79e-01 -0.14 0.104 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000164483 SAMD3 930717 sc-eQTL 7.07e-02 -0.12 0.0659 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 1.39e-01 -0.13 0.0876 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 1.54e-04 -0.37 0.0961 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000164483 SAMD3 930717 sc-eQTL 7.88e-02 -0.155 0.0875 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 3.03e-01 -0.111 0.107 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 1.08e-01 -0.185 0.115 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000164483 SAMD3 930717 sc-eQTL 1.07e-01 -0.159 0.098 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0277 0.113 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 3.29e-01 0.112 0.115 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000164483 SAMD3 930717 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0738 0.0822 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232820 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0899 0.1 0.223 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 6.40e-01 0.0512 0.109 0.223 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 4.37e-02 -0.217 0.107 0.223 MAIT L2
ENSG00000164483 SAMD3 930717 sc-eQTL 9.73e-01 0.00222 0.0644 0.223 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0173 0.118 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 1.81e-01 -0.152 0.114 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000164483 SAMD3 930717 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0505 0.0902 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0319 0.0896 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 7.58e-01 0.0294 0.0951 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000164483 SAMD3 930717 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0532 0.0518 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 3.47e-01 0.101 0.108 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 1.98e-01 0.144 0.111 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000164483 SAMD3 930717 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0109 0.092 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 1.03e-02 0.252 0.0972 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 8.02e-01 -0.025 0.0997 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000164483 SAMD3 930717 sc-eQTL 8.36e-02 -0.108 0.0618 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232820 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0244 0.141 0.233 PB L2
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0584 0.133 0.233 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 1.34e-01 -0.194 0.129 0.233 PB L2
ENSG00000164483 SAMD3 930717 sc-eQTL 6.52e-02 -0.226 0.121 0.233 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -835746 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0524 0.0837 0.233 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232820 sc-eQTL 1.55e-01 0.137 0.0963 0.22 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 1.64e-01 0.156 0.112 0.22 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 7.92e-02 0.169 0.0958 0.22 Pro_T L2
ENSG00000164483 SAMD3 930717 sc-eQTL 7.85e-01 -0.017 0.0623 0.22 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232820 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0512 0.106 0.22 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 4.20e-01 -0.088 0.109 0.22 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 3.40e-04 -0.332 0.0912 0.22 Treg L2
ENSG00000164483 SAMD3 930717 sc-eQTL 9.14e-01 0.00977 0.0906 0.22 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232820 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0334 0.0938 0.22 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 4.21e-01 0.0972 0.12 0.22 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 3.83e-03 -0.335 0.114 0.22 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232820 sc-eQTL 1.03e-01 -0.166 0.101 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 7.40e-01 0.0333 0.1 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 2.51e-02 -0.217 0.0964 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232820 sc-eQTL 9.07e-02 -0.178 0.105 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0806 0.104 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 8.27e-03 -0.268 0.101 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232820 sc-eQTL 3.45e-02 -0.248 0.116 0.221 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 1.29e-02 -0.326 0.13 0.221 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 4.35e-01 -0.108 0.138 0.221 gdT L2
ENSG00000164483 SAMD3 930717 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0665 0.105 0.221 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232820 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0294 0.108 0.222 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 1.89e-01 0.152 0.115 0.222 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0509 0.113 0.222 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232820 sc-eQTL 1.11e-02 -0.254 0.0989 0.217 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 2.09e-01 0.138 0.109 0.217 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 2.92e-01 -0.112 0.106 0.217 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232820 sc-eQTL 4.02e-02 -0.265 0.128 0.218 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 1.19e-01 -0.204 0.13 0.218 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0596 0.107 0.218 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 232820 sc-eQTL 1.40e-01 -0.142 0.096 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00792 0.0948 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 8.50e-01 0.0182 0.0964 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164483 SAMD3 930717 sc-eQTL 9.37e-02 -0.161 0.0955 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -835746 sc-eQTL 8.92e-01 0.0135 0.0989 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 232820 sc-eQTL 3.53e-01 0.075 0.0806 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 2.90e-01 0.0946 0.0891 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 9.70e-01 0.00426 0.113 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164483 SAMD3 930717 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0472 0.0966 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -835746 sc-eQTL 3.55e-01 -0.062 0.0669 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 232820 sc-eQTL 4.62e-02 -0.195 0.097 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0345 0.0943 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 7.01e-03 -0.248 0.091 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 232820 sc-eQTL 3.14e-01 -0.105 0.104 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 2.04e-01 0.134 0.105 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 1.20e-01 -0.168 0.108 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -332100 sc-eQTL 3.76e-01 0.0705 0.0794 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 160675 sc-eQTL 9.19e-01 0.00892 0.0878 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164483 SAMD3 930717 sc-eQTL 6.51e-02 -0.0879 0.0474 0.222 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112282 MED23 -332100 eQTL 0.0223 -0.0444 0.0194 0.0 0.0 0.245
ENSG00000118507 AKAP7 160675 eQTL 0.0289 -0.0529 0.0242 0.0 0.0 0.245

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079819 \N 232820 1.2e-05 1.43e-05 2.44e-06 8.87e-06 2.3e-06 5.82e-06 1.64e-05 2.14e-06 1.37e-05 5.92e-06 1.54e-05 6.79e-06 2.06e-05 4.54e-06 4.19e-06 9e-06 7.55e-06 1.09e-05 3.55e-06 3.24e-06 7e-06 1.27e-05 1.22e-05 3.66e-06 2.21e-05 4.45e-06 7.16e-06 5.2e-06 1.47e-05 1.06e-05 8.79e-06 9.55e-07 1.31e-06 3.85e-06 5.59e-06 3.41e-06 1.84e-06 2.4e-06 2.26e-06 1.69e-06 1.12e-06 1.67e-05 2.35e-06 2.52e-07 8.44e-07 2.35e-06 1.93e-06 1.18e-06 6.33e-07