logo

Genes within 1Mb (chr6:131295794:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 232472 sc-eQTL 1.75e-01 -0.116 0.0855 0.16 B L1
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 2.10e-01 0.118 0.0938 0.16 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 6.78e-01 0.0463 0.111 0.16 B L1
ENSG00000164483 SAMD3 930369 sc-eQTL 6.93e-01 0.0387 0.0981 0.16 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -836094 sc-eQTL 6.69e-01 0.0317 0.0741 0.16 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 232472 sc-eQTL 7.69e-01 0.0331 0.112 0.16 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00405 0.0727 0.16 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 1.31e-02 0.241 0.0962 0.16 CD4T L1
ENSG00000164483 SAMD3 930369 sc-eQTL 5.63e-01 0.0494 0.0853 0.16 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 7.69e-01 0.0263 0.0894 0.16 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 9.53e-02 0.169 0.101 0.16 CD8T L1
ENSG00000164483 SAMD3 930369 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0562 0.0466 0.16 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 232472 sc-eQTL 7.01e-01 0.037 0.0961 0.16 DC L1
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0964 0.123 0.16 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 1.03e-02 0.309 0.119 0.16 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 232472 sc-eQTL 8.44e-01 0.0207 0.105 0.16 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0407 0.102 0.16 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 7.22e-03 0.271 0.1 0.16 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0533 0.0867 0.161 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 5.87e-03 0.284 0.102 0.161 NK L1
ENSG00000164483 SAMD3 930369 sc-eQTL 6.40e-01 0.0271 0.0579 0.161 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 232472 sc-eQTL 2.08e-01 -0.135 0.107 0.16 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 4.57e-01 -0.09 0.121 0.16 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 7.46e-02 0.188 0.105 0.16 Other_T L1
ENSG00000164483 SAMD3 930369 sc-eQTL 5.37e-01 0.0349 0.0564 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 232472 sc-eQTL 2.93e-01 -0.12 0.114 0.163 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0608 0.135 0.163 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 5.73e-01 0.0761 0.135 0.163 B_Activated L2
ENSG00000164483 SAMD3 930369 sc-eQTL 2.25e-01 0.111 0.0916 0.163 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -836094 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0746 0.116 0.163 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232472 sc-eQTL 9.15e-02 0.203 0.12 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 1.54e-01 -0.165 0.115 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 9.62e-01 0.00555 0.118 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000164483 SAMD3 930369 sc-eQTL 2.60e-01 0.112 0.0989 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -836094 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0128 0.108 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232472 sc-eQTL 6.08e-02 -0.212 0.113 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 2.07e-01 0.15 0.118 0.162 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 7.73e-01 0.0357 0.124 0.162 B_Memory L2
ENSG00000164483 SAMD3 930369 sc-eQTL 1.31e-01 0.17 0.112 0.162 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -836094 sc-eQTL 7.76e-01 0.0323 0.113 0.162 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232472 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0817 0.0961 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 5.18e-01 0.0662 0.102 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 7.36e-01 0.0432 0.128 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000164483 SAMD3 930369 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00464 0.1 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -836094 sc-eQTL 1.70e-01 0.111 0.0804 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232472 sc-eQTL 4.80e-02 -0.216 0.108 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 6.91e-03 0.335 0.123 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 5.76e-01 0.0734 0.131 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000164483 SAMD3 930369 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0648 0.085 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -836094 sc-eQTL 7.44e-01 0.0284 0.0869 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232472 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0815 0.103 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 1.24e-01 -0.204 0.132 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0329 0.127 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000164483 SAMD3 930369 sc-eQTL 8.21e-02 0.145 0.0831 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232472 sc-eQTL 2.23e-01 -0.141 0.116 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0364 0.0842 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 3.43e-02 0.232 0.109 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000164483 SAMD3 930369 sc-eQTL 9.66e-01 0.00435 0.101 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232472 sc-eQTL 7.28e-02 0.212 0.118 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 3.24e-01 0.0899 0.0909 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 1.37e-01 0.157 0.105 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000164483 SAMD3 930369 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0356 0.0964 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232472 sc-eQTL 9.02e-01 0.0156 0.126 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 1.16e-01 0.183 0.116 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 2.80e-03 0.379 0.125 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000164483 SAMD3 930369 sc-eQTL 3.09e-01 0.0828 0.0812 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 1.61e-01 -0.155 0.11 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00643 0.124 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000164483 SAMD3 930369 sc-eQTL 2.50e-01 0.0907 0.0786 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 3.86e-01 0.0891 0.102 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 6.42e-02 0.214 0.115 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000164483 SAMD3 930369 sc-eQTL 7.92e-02 -0.18 0.102 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 6.00e-01 0.0678 0.129 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0399 0.138 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000164483 SAMD3 930369 sc-eQTL 5.06e-01 0.0786 0.118 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0473 0.13 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0398 0.132 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000164483 SAMD3 930369 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0969 0.0944 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232472 sc-eQTL 1.21e-01 -0.179 0.115 0.16 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 6.64e-01 0.0547 0.126 0.16 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 5.21e-02 0.241 0.123 0.16 MAIT L2
ENSG00000164483 SAMD3 930369 sc-eQTL 6.65e-01 0.0322 0.0743 0.16 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 3.43e-01 -0.124 0.131 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 2.23e-01 0.155 0.127 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000164483 SAMD3 930369 sc-eQTL 2.21e-02 0.229 0.0994 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 8.63e-01 0.0179 0.103 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 2.58e-01 0.124 0.11 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000164483 SAMD3 930369 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0584 0.0599 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 1.88e-01 -0.171 0.13 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0167 0.135 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000164483 SAMD3 930369 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0194 0.111 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 4.15e-01 0.0932 0.114 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 5.09e-02 0.225 0.114 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000164483 SAMD3 930369 sc-eQTL 3.99e-01 0.0608 0.072 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232472 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00158 0.168 0.185 PB L2
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 2.43e-01 -0.184 0.157 0.185 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0918 0.154 0.185 PB L2
ENSG00000164483 SAMD3 930369 sc-eQTL 6.52e-01 0.066 0.146 0.185 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -836094 sc-eQTL 2.59e-01 0.112 0.0988 0.185 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232472 sc-eQTL 2.01e-01 -0.145 0.113 0.161 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 9.86e-02 -0.217 0.131 0.161 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00437 0.113 0.161 Pro_T L2
ENSG00000164483 SAMD3 930369 sc-eQTL 5.39e-01 0.0448 0.0729 0.161 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232472 sc-eQTL 8.64e-01 0.0208 0.121 0.16 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 9.54e-01 0.00722 0.125 0.16 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 1.05e-01 0.174 0.107 0.16 Treg L2
ENSG00000164483 SAMD3 930369 sc-eQTL 5.68e-01 0.0591 0.103 0.16 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232472 sc-eQTL 9.58e-01 0.00583 0.11 0.159 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 5.00e-01 0.0953 0.141 0.159 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 5.84e-02 0.258 0.136 0.159 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232472 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0143 0.115 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 3.94e-01 0.096 0.112 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 2.46e-03 0.329 0.107 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232472 sc-eQTL 9.21e-01 0.0118 0.119 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0679 0.118 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 7.22e-02 0.207 0.114 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232472 sc-eQTL 9.73e-01 0.00458 0.137 0.152 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 9.69e-01 0.00607 0.153 0.152 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 4.62e-01 0.118 0.16 0.152 gdT L2
ENSG00000164483 SAMD3 930369 sc-eQTL 1.65e-01 0.169 0.121 0.152 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232472 sc-eQTL 3.35e-01 0.117 0.12 0.16 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 5.56e-01 0.0765 0.13 0.16 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 1.14e-02 0.319 0.125 0.16 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232472 sc-eQTL 8.05e-01 0.0285 0.115 0.165 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 5.39e-02 -0.241 0.124 0.165 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 9.89e-01 0.00173 0.122 0.165 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 232472 sc-eQTL 2.96e-01 0.151 0.144 0.158 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 1.41e-01 -0.215 0.145 0.158 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 3.24e-01 0.118 0.119 0.158 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 232472 sc-eQTL 7.96e-01 0.0284 0.11 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0981 0.108 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 8.54e-01 0.0202 0.11 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164483 SAMD3 930369 sc-eQTL 1.41e-01 0.161 0.109 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -836094 sc-eQTL 9.66e-01 0.00483 0.112 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 232472 sc-eQTL 1.55e-01 -0.129 0.0905 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 4.27e-02 0.203 0.0996 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 4.59e-01 0.0938 0.127 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164483 SAMD3 930369 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0142 0.109 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -836094 sc-eQTL 3.88e-01 0.0652 0.0753 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 232472 sc-eQTL 9.17e-01 0.0115 0.109 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 8.52e-01 0.0196 0.105 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 1.25e-02 0.257 0.102 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 232472 sc-eQTL 4.96e-01 0.0783 0.115 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0117 0.117 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 1.82e-01 0.16 0.119 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -332448 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00156 0.0927 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 160327 sc-eQTL 1.50e-02 0.247 0.101 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164483 SAMD3 930369 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0109 0.0556 0.159 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079819 EPB41L2 232472 eQTL 0.0334 0.0629 0.0295 0.0 0.0 0.146
ENSG00000118507 AKAP7 160327 eQTL 4.05e-09 0.169 0.0285 0.0 0.0 0.146
ENSG00000154269 ENPP3 -332648 eQTL 0.0173 -0.0814 0.0341 0.0 0.0 0.146

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000118507 AKAP7 160327 2.02e-05 2.43e-05 3.46e-06 1.17e-05 3.23e-06 9.07e-06 2.91e-05 3.51e-06 2.03e-05 9.15e-06 2.71e-05 1.07e-05 3.24e-05 9.56e-06 5.23e-06 1.22e-05 1.2e-05 1.7e-05 4.82e-06 4.75e-06 9.45e-06 2.19e-05 2.05e-05 5.74e-06 3.13e-05 5.73e-06 8.81e-06 8.99e-06 2.03e-05 1.63e-05 1.29e-05 1.61e-06 1.96e-06 4.95e-06 9.01e-06 4.46e-06 2.31e-06 2.73e-06 3.24e-06 2.38e-06 1.69e-06 2.28e-05 2.83e-06 3.59e-07 1.95e-06 2.87e-06 3.11e-06 1.48e-06 1.23e-06