logo

Genes within 1Mb (chr6:131201932:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 138610 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0367 0.0745 0.229 B L1
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 5.60e-01 0.0477 0.0817 0.229 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0191 0.0968 0.229 B L1
ENSG00000164483 SAMD3 836507 sc-eQTL 1.54e-01 -0.121 0.0848 0.229 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -929956 sc-eQTL 9.43e-01 0.0046 0.0644 0.229 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 138610 sc-eQTL 1.05e-01 0.156 0.0957 0.229 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 8.16e-01 0.0146 0.0624 0.229 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 3.80e-15 -0.613 0.0723 0.229 CD4T L1
ENSG00000164483 SAMD3 836507 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0427 0.0732 0.229 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0814 0.0762 0.229 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 9.13e-06 -0.378 0.0831 0.229 CD8T L1
ENSG00000164483 SAMD3 836507 sc-eQTL 6.99e-02 -0.0722 0.0396 0.229 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 138610 sc-eQTL 1.48e-01 -0.118 0.0811 0.23 DC L1
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0812 0.105 0.23 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 2.13e-03 -0.313 0.101 0.23 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 138610 sc-eQTL 8.29e-02 -0.158 0.0908 0.229 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 5.75e-01 0.0498 0.0888 0.229 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 4.07e-02 -0.18 0.0873 0.229 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 6.36e-01 0.0347 0.0732 0.23 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0685 0.0876 0.23 NK L1
ENSG00000164483 SAMD3 836507 sc-eQTL 3.26e-02 -0.104 0.0484 0.23 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 138610 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0328 0.0897 0.229 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0731 0.101 0.229 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 4.01e-02 -0.181 0.0877 0.229 Other_T L1
ENSG00000164483 SAMD3 836507 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0249 0.0473 0.229 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 138610 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0522 0.0962 0.237 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 6.47e-01 0.0521 0.113 0.237 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0539 0.113 0.237 B_Activated L2
ENSG00000164483 SAMD3 836507 sc-eQTL 2.26e-01 0.0935 0.0769 0.237 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -929956 sc-eQTL 4.08e-01 0.0808 0.0974 0.237 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 138610 sc-eQTL 1.36e-01 -0.158 0.105 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 7.72e-01 0.0297 0.102 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0127 0.104 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000164483 SAMD3 836507 sc-eQTL 9.16e-01 0.00918 0.0873 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -929956 sc-eQTL 3.58e-02 -0.198 0.0937 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 138610 sc-eQTL 2.23e-01 -0.118 0.0964 0.228 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 3.74e-02 -0.21 0.1 0.228 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 3.55e-01 0.0977 0.105 0.228 B_Memory L2
ENSG00000164483 SAMD3 836507 sc-eQTL 1.68e-01 -0.133 0.0957 0.228 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -929956 sc-eQTL 4.35e-01 0.0754 0.0963 0.228 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 138610 sc-eQTL 2.08e-01 0.105 0.0833 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 6.06e-01 0.0459 0.0889 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 9.07e-01 0.013 0.111 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000164483 SAMD3 836507 sc-eQTL 8.90e-01 0.012 0.087 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -929956 sc-eQTL 9.59e-01 0.00359 0.0702 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 138610 sc-eQTL 5.59e-01 0.0551 0.0941 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 8.39e-01 0.0218 0.107 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00912 0.113 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000164483 SAMD3 836507 sc-eQTL 1.01e-01 -0.12 0.0728 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -929956 sc-eQTL 4.25e-01 0.0597 0.0747 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 138610 sc-eQTL 7.97e-01 0.0227 0.0878 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 8.29e-01 0.0244 0.113 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 8.47e-01 0.0208 0.108 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000164483 SAMD3 836507 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0386 0.0709 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 138610 sc-eQTL 1.06e-01 0.16 0.0986 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0076 0.0719 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 2.35e-13 -0.648 0.0828 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000164483 SAMD3 836507 sc-eQTL 1.83e-01 -0.115 0.0862 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 138610 sc-eQTL 7.00e-01 0.0398 0.103 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 1.64e-01 0.11 0.079 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 7.45e-06 -0.403 0.0878 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000164483 SAMD3 836507 sc-eQTL 9.28e-01 0.00756 0.0839 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 138610 sc-eQTL 2.09e-01 0.136 0.108 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0796 0.0994 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 3.22e-01 -0.108 0.109 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000164483 SAMD3 836507 sc-eQTL 3.76e-01 0.0617 0.0695 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 3.17e-01 0.0916 0.0912 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 1.30e-01 -0.154 0.102 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000164483 SAMD3 836507 sc-eQTL 5.64e-02 -0.124 0.0645 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 1.79e-01 -0.116 0.0859 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 9.43e-06 -0.422 0.093 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000164483 SAMD3 836507 sc-eQTL 2.65e-02 -0.191 0.0854 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 2.59e-01 -0.12 0.106 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 8.25e-02 -0.197 0.113 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000164483 SAMD3 836507 sc-eQTL 8.93e-02 -0.164 0.0962 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 9.08e-01 0.0127 0.11 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 3.62e-01 0.102 0.112 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000164483 SAMD3 836507 sc-eQTL 1.94e-01 -0.104 0.0797 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 138610 sc-eQTL 7.61e-01 -0.03 0.0988 0.232 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 4.27e-01 0.0856 0.108 0.232 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 1.37e-02 -0.261 0.105 0.232 MAIT L2
ENSG00000164483 SAMD3 836507 sc-eQTL 7.48e-01 0.0204 0.0635 0.232 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0548 0.115 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 1.07e-01 -0.179 0.111 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000164483 SAMD3 836507 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0194 0.0884 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 5.32e-01 -0.055 0.0879 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 7.90e-01 0.0249 0.0934 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000164483 SAMD3 836507 sc-eQTL 1.63e-01 -0.0711 0.0508 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 2.38e-01 0.124 0.105 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 5.01e-01 0.0734 0.109 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000164483 SAMD3 836507 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0314 0.0897 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 2.22e-02 0.22 0.0957 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0653 0.0977 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000164483 SAMD3 836507 sc-eQTL 4.75e-02 -0.121 0.0605 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 138610 sc-eQTL 8.96e-01 0.0179 0.137 0.237 PB L2
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0988 0.129 0.237 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 1.15e-01 -0.198 0.125 0.237 PB L2
ENSG00000164483 SAMD3 836507 sc-eQTL 4.96e-02 -0.233 0.118 0.237 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -929956 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0228 0.0814 0.237 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 138610 sc-eQTL 1.76e-01 0.13 0.0956 0.228 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 2.81e-01 0.12 0.111 0.228 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 7.51e-02 0.17 0.0951 0.228 Pro_T L2
ENSG00000164483 SAMD3 836507 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0319 0.0618 0.228 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 138610 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0177 0.104 0.229 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0266 0.107 0.229 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 6.59e-06 -0.408 0.0882 0.229 Treg L2
ENSG00000164483 SAMD3 836507 sc-eQTL 9.44e-01 0.00628 0.0891 0.229 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 138610 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0232 0.0932 0.227 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 5.67e-01 0.0686 0.12 0.227 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 4.13e-03 -0.33 0.114 0.227 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 138610 sc-eQTL 1.38e-01 -0.148 0.0993 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 2.88e-01 0.104 0.0978 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 9.01e-02 -0.162 0.0949 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 138610 sc-eQTL 5.65e-02 -0.196 0.102 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0651 0.102 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 6.16e-02 -0.186 0.0992 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 138610 sc-eQTL 1.58e-02 -0.277 0.113 0.233 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 3.19e-03 -0.378 0.126 0.233 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 2.19e-01 -0.167 0.135 0.233 gdT L2
ENSG00000164483 SAMD3 836507 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0933 0.103 0.233 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 138610 sc-eQTL 8.70e-01 0.0172 0.105 0.231 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 4.05e-01 0.0941 0.113 0.231 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0666 0.11 0.231 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 138610 sc-eQTL 5.29e-03 -0.271 0.0962 0.224 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 4.84e-01 0.0749 0.107 0.224 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 2.80e-01 -0.112 0.103 0.224 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 138610 sc-eQTL 2.88e-02 -0.275 0.125 0.223 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 2.59e-02 -0.283 0.126 0.223 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0333 0.104 0.223 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 138610 sc-eQTL 1.31e-01 -0.143 0.0943 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0141 0.0931 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 9.10e-01 0.0108 0.0946 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164483 SAMD3 836507 sc-eQTL 7.15e-02 -0.17 0.0937 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -929956 sc-eQTL 7.32e-01 0.0332 0.0971 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 138610 sc-eQTL 2.46e-01 0.0917 0.0789 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 2.88e-01 0.093 0.0873 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0192 0.11 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164483 SAMD3 836507 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0602 0.0946 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -929956 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0176 0.0656 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 138610 sc-eQTL 5.99e-02 -0.18 0.0953 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 8.04e-01 0.0229 0.0925 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 5.23e-02 -0.176 0.09 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 138610 sc-eQTL 2.64e-01 -0.113 0.101 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 4.56e-01 0.0769 0.103 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 1.43e-01 -0.155 0.105 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -426310 sc-eQTL 6.18e-01 0.039 0.0781 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 66465 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0181 0.0861 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164483 SAMD3 836507 sc-eQTL 2.98e-02 -0.101 0.0463 0.231 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112282 MED23 -426310 eQTL 0.00817 -0.052 0.0196 0.0 0.0 0.242
ENSG00000118507 AKAP7 66465 eQTL 0.0343 -0.0518 0.0244 0.0 0.0 0.242
ENSG00000118523 CCN2 -749440 pQTL 0.0314 -0.0534 0.0248 0.0 0.0 0.238
ENSG00000154269 ENPP3 -426510 eQTL 0.0262 0.0643 0.0289 0.0 0.0 0.242

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000154269 ENPP3 -426510 3.27e-07 1.1e-07 3.65e-08 1.78e-07 9.91e-08 9.05e-08 1.41e-07 5.24e-08 1.37e-07 4.24e-08 1.63e-07 7.58e-08 1.27e-07 6.07e-08 5.55e-08 7.17e-08 5.12e-08 1.14e-07 5.2e-08 3.74e-08 1.03e-07 1.26e-07 1.26e-07 4.67e-08 1.31e-07 1.09e-07 1.12e-07 8.71e-08 1.02e-07 1.09e-07 9.75e-08 3.95e-08 2.74e-08 8.65e-08 9.27e-08 4.12e-08 5.64e-08 9.2e-08 8.55e-08 3.12e-08 3.8e-08 1.35e-07 4.19e-08 0.0 1.09e-07 1.84e-08 1.34e-07 4.82e-09 4.61e-08