logo

Genes within 1Mb (chr6:131196452:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 133130 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0446 0.0763 0.22 B L1
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 5.80e-01 0.0464 0.0837 0.22 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0183 0.0991 0.22 B L1
ENSG00000164483 SAMD3 831027 sc-eQTL 1.97e-01 -0.112 0.0869 0.22 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -935436 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0206 0.0659 0.22 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 133130 sc-eQTL 5.38e-02 0.189 0.0976 0.22 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 8.65e-01 0.0108 0.0638 0.22 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 8.12e-15 -0.62 0.0742 0.22 CD4T L1
ENSG00000164483 SAMD3 831027 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0455 0.0748 0.22 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0498 0.0781 0.22 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 7.52e-06 -0.39 0.0849 0.22 CD8T L1
ENSG00000164483 SAMD3 831027 sc-eQTL 8.67e-02 -0.0698 0.0406 0.22 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 133130 sc-eQTL 1.04e-01 -0.135 0.0828 0.221 DC L1
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 3.13e-01 -0.108 0.107 0.221 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 5.15e-04 -0.361 0.102 0.221 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 133130 sc-eQTL 6.36e-02 -0.173 0.0926 0.22 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 5.70e-01 0.0515 0.0906 0.22 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 2.64e-02 -0.199 0.089 0.22 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 3.89e-01 0.0646 0.075 0.221 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 3.44e-01 -0.085 0.0897 0.221 NK L1
ENSG00000164483 SAMD3 831027 sc-eQTL 2.61e-02 -0.111 0.0496 0.221 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 133130 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0242 0.0916 0.22 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0703 0.103 0.22 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 4.38e-02 -0.182 0.0896 0.22 Other_T L1
ENSG00000164483 SAMD3 831027 sc-eQTL 6.64e-01 -0.021 0.0483 0.22 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 133130 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0427 0.099 0.23 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 5.20e-01 0.0753 0.117 0.23 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0391 0.116 0.23 B_Activated L2
ENSG00000164483 SAMD3 831027 sc-eQTL 7.96e-01 0.0205 0.0795 0.23 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -935436 sc-eQTL 3.83e-01 0.0877 0.1 0.23 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 133130 sc-eQTL 1.43e-01 -0.158 0.108 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 7.05e-01 0.0396 0.104 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 8.88e-01 -0.015 0.106 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000164483 SAMD3 831027 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0186 0.0892 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -935436 sc-eQTL 2.89e-02 -0.21 0.0957 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 133130 sc-eQTL 1.73e-01 -0.135 0.0986 0.22 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 3.50e-02 -0.218 0.103 0.22 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 4.67e-01 0.0788 0.108 0.22 B_Memory L2
ENSG00000164483 SAMD3 831027 sc-eQTL 2.13e-01 -0.123 0.0982 0.22 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -935436 sc-eQTL 4.56e-01 0.0737 0.0986 0.22 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 133130 sc-eQTL 2.55e-01 0.0976 0.0855 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 6.78e-01 0.0379 0.0912 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00534 0.114 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000164483 SAMD3 831027 sc-eQTL 7.03e-01 0.0341 0.0892 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -935436 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0348 0.0719 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 133130 sc-eQTL 4.86e-01 0.0672 0.0963 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 9.24e-01 0.0105 0.11 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 8.29e-01 -0.025 0.116 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000164483 SAMD3 831027 sc-eQTL 8.53e-02 -0.129 0.0744 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -935436 sc-eQTL 4.49e-01 0.0579 0.0764 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 133130 sc-eQTL 7.64e-01 0.0271 0.0903 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 6.35e-01 0.055 0.116 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 7.58e-01 0.0343 0.111 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000164483 SAMD3 831027 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0403 0.0729 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 133130 sc-eQTL 5.92e-02 0.191 0.101 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0132 0.0736 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 6.34e-13 -0.653 0.0852 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000164483 SAMD3 831027 sc-eQTL 1.77e-01 -0.12 0.0883 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 133130 sc-eQTL 7.99e-01 0.0269 0.105 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 2.04e-01 0.103 0.0806 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 1.88e-05 -0.394 0.0899 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000164483 SAMD3 831027 sc-eQTL 8.87e-01 0.0122 0.0856 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 133130 sc-eQTL 8.94e-02 0.187 0.11 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0573 0.102 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 2.22e-01 -0.136 0.112 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000164483 SAMD3 831027 sc-eQTL 3.52e-01 0.0664 0.0711 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 1.47e-01 0.135 0.093 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 9.78e-02 -0.173 0.104 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000164483 SAMD3 831027 sc-eQTL 9.73e-02 -0.11 0.0661 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 1.85e-01 -0.117 0.0878 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 1.61e-05 -0.421 0.0953 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000164483 SAMD3 831027 sc-eQTL 3.06e-02 -0.19 0.0873 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 2.22e-01 -0.132 0.108 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 5.46e-02 -0.223 0.115 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000164483 SAMD3 831027 sc-eQTL 1.42e-01 -0.145 0.0985 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 7.52e-01 0.0352 0.112 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 3.25e-01 0.112 0.113 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000164483 SAMD3 831027 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0894 0.0808 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 133130 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0675 0.101 0.223 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 3.12e-01 0.112 0.11 0.223 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 1.57e-02 -0.262 0.108 0.223 MAIT L2
ENSG00000164483 SAMD3 831027 sc-eQTL 8.89e-01 0.00914 0.0651 0.223 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0457 0.118 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 8.97e-02 -0.194 0.114 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000164483 SAMD3 831027 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0125 0.0906 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0352 0.0902 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00448 0.0958 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000164483 SAMD3 831027 sc-eQTL 1.94e-01 -0.0679 0.0521 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 1.90e-01 0.142 0.108 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 4.22e-01 0.0902 0.112 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000164483 SAMD3 831027 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0162 0.0924 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 1.12e-02 0.25 0.0977 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0522 0.1 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000164483 SAMD3 831027 sc-eQTL 4.55e-02 -0.125 0.062 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 133130 sc-eQTL 6.53e-01 0.0645 0.143 0.226 PB L2
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 3.60e-01 -0.123 0.134 0.226 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 1.61e-01 -0.183 0.13 0.226 PB L2
ENSG00000164483 SAMD3 831027 sc-eQTL 5.40e-02 -0.238 0.122 0.226 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -935436 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0604 0.0846 0.226 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 133130 sc-eQTL 8.58e-02 0.168 0.0974 0.22 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 2.56e-01 0.129 0.114 0.22 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 8.63e-02 0.167 0.0972 0.22 Pro_T L2
ENSG00000164483 SAMD3 831027 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0306 0.0632 0.22 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 133130 sc-eQTL 8.48e-01 0.0204 0.107 0.22 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0414 0.11 0.22 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 6.96e-06 -0.416 0.0902 0.22 Treg L2
ENSG00000164483 SAMD3 831027 sc-eQTL 8.86e-01 0.013 0.0911 0.22 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 133130 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0582 0.0946 0.22 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 9.29e-01 0.0108 0.122 0.22 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 1.30e-03 -0.375 0.115 0.22 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 133130 sc-eQTL 1.70e-01 -0.14 0.102 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 4.19e-01 0.0811 0.1 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 9.89e-02 -0.161 0.097 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 133130 sc-eQTL 4.92e-02 -0.206 0.104 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0528 0.104 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 2.62e-02 -0.226 0.101 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 133130 sc-eQTL 1.59e-02 -0.278 0.114 0.227 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 3.11e-03 -0.381 0.127 0.227 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 2.91e-01 -0.144 0.136 0.227 gdT L2
ENSG00000164483 SAMD3 831027 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0795 0.103 0.227 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 133130 sc-eQTL 8.04e-01 0.0266 0.107 0.222 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 3.00e-01 0.119 0.115 0.222 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0451 0.112 0.222 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 133130 sc-eQTL 1.83e-03 -0.31 0.0982 0.217 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 2.66e-01 0.122 0.109 0.217 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 2.63e-01 -0.119 0.106 0.217 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 133130 sc-eQTL 3.18e-02 -0.273 0.126 0.215 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 5.64e-02 -0.246 0.128 0.215 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0323 0.106 0.215 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 133130 sc-eQTL 1.48e-01 -0.14 0.0964 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00698 0.0952 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 9.14e-01 0.0104 0.0968 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164483 SAMD3 831027 sc-eQTL 6.37e-02 -0.179 0.0958 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -935436 sc-eQTL 7.96e-01 0.0257 0.0993 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 133130 sc-eQTL 3.21e-01 0.0805 0.0809 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 3.58e-01 0.0825 0.0895 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0371 0.113 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164483 SAMD3 831027 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0511 0.097 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -935436 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0423 0.0672 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 133130 sc-eQTL 5.37e-02 -0.188 0.097 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 9.06e-01 0.0111 0.0943 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 3.07e-02 -0.199 0.0915 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 133130 sc-eQTL 2.13e-01 -0.13 0.104 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 2.66e-01 0.118 0.106 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 1.67e-01 -0.15 0.108 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -431790 sc-eQTL 4.35e-01 0.0626 0.08 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 60985 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0246 0.0883 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164483 SAMD3 831027 sc-eQTL 3.23e-02 -0.102 0.0475 0.222 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112282 MED23 -431790 eQTL 0.00661 -0.0537 0.0197 0.0 0.0 0.239
ENSG00000118523 CCN2 -754920 pQTL 0.0243 -0.0563 0.025 0.0 0.0 0.234
ENSG00000154269 ENPP3 -431990 eQTL 0.0407 0.0595 0.029 0.0 0.0 0.239

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000154269 ENPP3 -431990 2.96e-06 2.53e-06 2.29e-07 1.8e-06 4.8e-07 7.11e-07 1.3e-06 5.61e-07 1.73e-06 7.61e-07 2.11e-06 1.05e-06 3.25e-06 1.04e-06 6.98e-07 1.04e-06 1.27e-06 2.16e-06 7.13e-07 1.22e-06 1.44e-06 2.35e-06 1.6e-06 1.01e-06 2.51e-06 1.1e-06 1.17e-06 1.39e-06 1.73e-06 1.51e-06 7.67e-07 2.87e-07 2.79e-07 1.24e-06 1.35e-06 6.07e-07 9.08e-07 3.48e-07 1.16e-06 2.03e-07 3.67e-07 2.32e-06 3.74e-07 1.83e-07 3.97e-07 3.28e-07 3.78e-07 4.88e-08 1.18e-07