logo

Genes within 1Mb (chr6:131136155:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 72833 sc-eQTL 9.63e-01 0.00617 0.134 0.06 B L1
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 1.92e-01 -0.192 0.147 0.06 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 3.29e-01 0.17 0.174 0.06 B L1
ENSG00000164483 SAMD3 770730 sc-eQTL 4.01e-01 0.129 0.153 0.06 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -995733 sc-eQTL 2.00e-01 0.148 0.115 0.06 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 72833 sc-eQTL 3.60e-01 -0.16 0.175 0.06 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 9.59e-02 -0.189 0.113 0.06 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 5.49e-01 0.0912 0.152 0.06 CD4T L1
ENSG00000164483 SAMD3 770730 sc-eQTL 8.93e-01 0.0179 0.133 0.06 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 6.11e-02 -0.263 0.139 0.06 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 8.56e-01 -0.029 0.16 0.06 CD8T L1
ENSG00000164483 SAMD3 770730 sc-eQTL 3.62e-01 -0.067 0.0733 0.06 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 72833 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0324 0.149 0.061 DC L1
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 8.27e-01 0.0418 0.191 0.061 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 1.07e-01 0.303 0.187 0.061 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 72833 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0173 0.166 0.06 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 5.64e-02 -0.307 0.16 0.06 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 8.14e-01 0.0378 0.16 0.06 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0603 0.132 0.06 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 3.80e-01 0.139 0.158 0.06 NK L1
ENSG00000164483 SAMD3 770730 sc-eQTL 7.76e-01 0.0252 0.0882 0.06 NK L1
ENSG00000227678 AL355581.1 989976 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0494 0.18 0.06 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 72833 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0858 0.163 0.06 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 5.34e-01 -0.114 0.184 0.06 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 7.98e-01 0.0412 0.161 0.06 Other_T L1
ENSG00000164483 SAMD3 770730 sc-eQTL 7.10e-01 0.0319 0.0858 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 72833 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00902 0.174 0.064 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 1.55e-01 -0.291 0.204 0.064 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 3.52e-01 0.19 0.204 0.064 B_Activated L2
ENSG00000164483 SAMD3 770730 sc-eQTL 8.11e-02 0.243 0.138 0.064 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -995733 sc-eQTL 8.92e-01 0.024 0.176 0.064 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 72833 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0435 0.187 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 2.55e-01 -0.205 0.179 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0454 0.183 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000164483 SAMD3 770730 sc-eQTL 5.94e-01 0.0821 0.154 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -995733 sc-eQTL 7.60e-01 -0.051 0.167 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 72833 sc-eQTL 8.27e-01 0.0378 0.173 0.06 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 2.02e-01 -0.231 0.18 0.06 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 5.94e-01 0.1 0.188 0.06 B_Memory L2
ENSG00000164483 SAMD3 770730 sc-eQTL 3.56e-01 0.159 0.171 0.06 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -995733 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0384 0.172 0.06 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 72833 sc-eQTL 7.55e-01 0.0469 0.15 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 3.52e-01 0.149 0.159 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 3.44e-01 0.189 0.199 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000164483 SAMD3 770730 sc-eQTL 4.00e-01 -0.131 0.156 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -995733 sc-eQTL 1.23e-01 0.194 0.125 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 72833 sc-eQTL 1.43e-01 0.243 0.166 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 3.77e-01 -0.168 0.19 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 1.35e-01 0.298 0.199 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000164483 SAMD3 770730 sc-eQTL 2.13e-01 0.161 0.129 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -995733 sc-eQTL 4.38e-01 0.103 0.132 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 72833 sc-eQTL 7.19e-01 -0.058 0.161 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 5.71e-01 -0.117 0.206 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 5.24e-01 0.126 0.198 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000164483 SAMD3 770730 sc-eQTL 2.04e-01 0.165 0.13 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 72833 sc-eQTL 3.82e-01 -0.159 0.182 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 1.89e-01 -0.173 0.132 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 8.55e-01 0.0317 0.173 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000164483 SAMD3 770730 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0171 0.159 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 72833 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0819 0.186 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 3.56e-01 -0.132 0.143 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 6.90e-01 0.0662 0.166 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000164483 SAMD3 770730 sc-eQTL 4.84e-01 0.106 0.151 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 72833 sc-eQTL 5.94e-01 0.104 0.194 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 8.96e-01 0.0234 0.179 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 1.88e-01 0.259 0.196 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000164483 SAMD3 770730 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0933 0.125 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 3.62e-01 -0.157 0.171 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0441 0.192 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000164483 SAMD3 770730 sc-eQTL 1.94e-01 -0.159 0.122 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 5.26e-01 -0.1 0.158 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 2.21e-01 0.218 0.178 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000164483 SAMD3 770730 sc-eQTL 2.60e-01 0.178 0.158 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0372 0.208 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 3.02e-03 -0.655 0.218 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000164483 SAMD3 770730 sc-eQTL 1.29e-02 -0.47 0.187 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 1.04e-01 -0.321 0.196 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 8.37e-01 0.0415 0.201 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000164483 SAMD3 770730 sc-eQTL 2.39e-01 -0.169 0.143 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 72833 sc-eQTL 6.86e-01 -0.073 0.18 0.058 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 9.00e-01 0.0246 0.197 0.058 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 4.99e-01 0.131 0.194 0.058 MAIT L2
ENSG00000164483 SAMD3 770730 sc-eQTL 8.14e-01 0.0274 0.116 0.058 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 3.50e-01 0.187 0.199 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 4.24e-01 0.155 0.193 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000164483 SAMD3 770730 sc-eQTL 2.66e-01 -0.17 0.153 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000227678 AL355581.1 989976 sc-eQTL 4.30e-03 -0.503 0.174 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0173 0.159 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 1.04e-01 0.273 0.167 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000164483 SAMD3 770730 sc-eQTL 9.47e-01 0.00608 0.0919 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000227678 AL355581.1 989976 sc-eQTL 3.04e-01 -0.191 0.185 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 1.27e-01 -0.292 0.191 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 2.03e-01 -0.253 0.198 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000164483 SAMD3 770730 sc-eQTL 4.23e-01 0.131 0.163 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000227678 AL355581.1 989976 sc-eQTL 7.66e-01 0.0539 0.181 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0588 0.172 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 2.57e-01 -0.196 0.173 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000164483 SAMD3 770730 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0239 0.108 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000227678 AL355581.1 989976 sc-eQTL 1.85e-01 0.248 0.186 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 72833 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0537 0.261 0.056 PB L2
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 3.73e-01 -0.22 0.246 0.056 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 7.00e-01 0.0925 0.24 0.056 PB L2
ENSG00000164483 SAMD3 770730 sc-eQTL 3.43e-01 -0.216 0.227 0.056 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -995733 sc-eQTL 1.61e-01 -0.217 0.154 0.056 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 72833 sc-eQTL 5.72e-01 0.0965 0.171 0.059 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 5.44e-01 -0.121 0.198 0.059 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0763 0.17 0.059 Pro_T L2
ENSG00000164483 SAMD3 770730 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0245 0.11 0.059 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 72833 sc-eQTL 3.58e-01 -0.177 0.192 0.06 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 6.05e-01 -0.102 0.197 0.06 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 6.69e-01 0.0729 0.17 0.06 Treg L2
ENSG00000164483 SAMD3 770730 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0318 0.164 0.06 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 72833 sc-eQTL 2.02e-01 0.218 0.171 0.059 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 3.98e-01 0.186 0.22 0.059 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 7.39e-02 0.381 0.212 0.059 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 72833 sc-eQTL 5.73e-01 -0.1 0.178 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 2.01e-01 -0.224 0.174 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00588 0.17 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 72833 sc-eQTL 7.90e-01 0.0499 0.187 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 1.07e-01 -0.298 0.184 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0411 0.182 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 72833 sc-eQTL 1.44e-01 -0.312 0.213 0.064 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 5.05e-01 0.161 0.24 0.064 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 5.33e-01 0.157 0.251 0.064 gdT L2
ENSG00000164483 SAMD3 770730 sc-eQTL 4.34e-01 -0.15 0.191 0.064 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 72833 sc-eQTL 4.38e-01 0.151 0.194 0.058 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 4.59e-02 -0.415 0.207 0.058 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 4.72e-01 -0.147 0.204 0.058 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 72833 sc-eQTL 7.56e-01 0.0555 0.179 0.059 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 4.20e-01 -0.157 0.194 0.059 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 8.72e-02 -0.322 0.187 0.059 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 72833 sc-eQTL 1.69e-01 -0.311 0.225 0.059 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0157 0.229 0.059 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0774 0.186 0.059 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 72833 sc-eQTL 7.02e-01 -0.065 0.17 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 2.62e-02 -0.369 0.165 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0238 0.169 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164483 SAMD3 770730 sc-eQTL 1.44e-01 0.247 0.168 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -995733 sc-eQTL 4.48e-01 0.132 0.174 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 72833 sc-eQTL 5.19e-01 0.0914 0.141 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0476 0.156 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 9.04e-02 0.333 0.196 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164483 SAMD3 770730 sc-eQTL 6.42e-01 0.0787 0.169 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -995733 sc-eQTL 1.60e-01 0.165 0.117 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 72833 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0797 0.171 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 6.63e-02 -0.302 0.164 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 7.49e-01 0.052 0.162 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 72833 sc-eQTL 8.70e-01 0.03 0.183 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 1.70e-01 -0.254 0.185 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 4.49e-01 -0.144 0.19 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -492087 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0892 0.141 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 688 sc-eQTL 8.51e-01 0.0293 0.156 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164483 SAMD3 770730 sc-eQTL 8.56e-01 0.0153 0.0847 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000227678 AL355581.1 989976 sc-eQTL 9.46e-01 0.0123 0.183 0.06 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000118507 AKAP7 688 eQTL 0.00666 0.11 0.0404 0.0 0.0 0.0692
ENSG00000118520 ARG1 -436989 eQTL 0.012 -0.0905 0.036 0.0 0.0 0.0692

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000118507 AKAP7 688 0.000182 0.000207 5.09e-05 0.000106 7.78e-05 0.000102 0.000274 7.33e-05 0.000274 0.000171 0.000342 0.000147 0.00031 0.000122 6.77e-05 0.000216 0.000131 0.000203 8.93e-05 7.6e-05 0.000171 0.000273 0.000206 9.16e-05 0.000305 0.00012 0.000167 0.000138 0.0002 0.000174 0.000183 3.15e-05 4.23e-05 6.14e-05 8.6e-05 5.96e-05 3.67e-05 3.89e-05 5.44e-05 3.82e-05 2.3e-05 0.000232 3.55e-05 7.21e-06 4.02e-05 4.56e-05 4.26e-05 2.72e-05 2.26e-05
ENSG00000118520 ARG1 -436989 4.26e-06 2.12e-06 2.73e-07 1.25e-06 2.71e-07 7.88e-07 2.08e-06 3.52e-07 1.74e-06 5.19e-07 1.96e-06 1.25e-06 3.23e-06 9.31e-07 5.04e-07 1.15e-06 1.02e-06 1.44e-06 5.4e-07 6.16e-07 1.14e-06 2.82e-06 1.61e-06 6.44e-07 2.39e-06 4.27e-07 1e-06 1.07e-06 1.76e-06 1.79e-06 7.58e-07 7.32e-08 3.44e-07 1.82e-06 9.03e-07 4.44e-07 5.1e-07 4.9e-07 9.59e-07 2.04e-07 2.74e-07 2.11e-06 4.6e-07 1.93e-07 1.58e-07 2.35e-07 7.88e-07 8.48e-08 9.5e-08