logo

Genes within 1Mb (chr6:131031741:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 -31581 sc-eQTL 8.81e-03 -0.234 0.0886 0.13 B L1
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 1.83e-01 0.132 0.0984 0.13 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 3.57e-03 0.338 0.115 0.13 B L1
ENSG00000164483 SAMD3 666316 sc-eQTL 5.52e-01 0.0613 0.103 0.13 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 -31581 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0194 0.117 0.13 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 9.72e-01 0.00272 0.076 0.13 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 1.01e-05 0.441 0.0974 0.13 CD4T L1
ENSG00000164483 SAMD3 666316 sc-eQTL 1.90e-01 -0.117 0.0889 0.13 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 3.95e-01 0.0808 0.0948 0.13 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 1.38e-04 0.406 0.104 0.13 CD8T L1
ENSG00000164483 SAMD3 666316 sc-eQTL 2.11e-02 -0.114 0.049 0.13 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 -31581 sc-eQTL 9.58e-02 0.172 0.103 0.128 DC L1
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 6.82e-01 0.0546 0.133 0.128 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 4.10e-02 0.266 0.129 0.128 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 -31581 sc-eQTL 8.13e-01 0.0259 0.109 0.13 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 4.63e-01 0.0781 0.106 0.13 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 4.63e-02 0.21 0.105 0.13 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 4.34e-01 0.0702 0.0896 0.131 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 1.29e-04 0.404 0.104 0.131 NK L1
ENSG00000164483 SAMD3 666316 sc-eQTL 7.79e-01 0.0168 0.0599 0.131 NK L1
ENSG00000227678 AL355581.1 885562 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0127 0.122 0.131 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 -31581 sc-eQTL 3.56e-01 -0.102 0.11 0.13 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0878 0.124 0.13 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 2.67e-01 0.121 0.108 0.13 Other_T L1
ENSG00000164483 SAMD3 666316 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0222 0.058 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 -31581 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0469 0.119 0.128 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 7.71e-02 0.247 0.139 0.128 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 6.27e-01 0.0679 0.14 0.128 B_Activated L2
ENSG00000164483 SAMD3 666316 sc-eQTL 6.65e-03 0.256 0.0933 0.128 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 -31581 sc-eQTL 4.61e-01 0.0924 0.125 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0559 0.121 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 4.54e-01 0.0919 0.122 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000164483 SAMD3 666316 sc-eQTL 9.19e-01 0.0105 0.103 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 -31581 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0651 0.118 0.131 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 4.86e-01 0.0865 0.124 0.131 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 3.39e-03 0.375 0.127 0.131 B_Memory L2
ENSG00000164483 SAMD3 666316 sc-eQTL 1.26e-01 0.18 0.117 0.131 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 -31581 sc-eQTL 4.60e-02 -0.2 0.0995 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 4.16e-01 0.0869 0.107 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 9.96e-02 0.22 0.133 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000164483 SAMD3 666316 sc-eQTL 7.62e-01 0.0316 0.105 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 -31581 sc-eQTL 7.01e-03 -0.311 0.114 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 8.80e-03 0.345 0.13 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 1.25e-01 0.213 0.139 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000164483 SAMD3 666316 sc-eQTL 1.81e-01 -0.121 0.09 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 -31581 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0846 0.112 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 9.71e-01 0.00517 0.144 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 1.76e-01 0.187 0.137 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000164483 SAMD3 666316 sc-eQTL 6.95e-02 0.164 0.09 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 -31581 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0658 0.122 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0272 0.0882 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 1.40e-04 0.432 0.111 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000164483 SAMD3 666316 sc-eQTL 8.04e-02 -0.185 0.105 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 -31581 sc-eQTL 6.53e-01 0.0559 0.124 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 5.67e-01 0.0548 0.0954 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 2.99e-03 0.326 0.109 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000164483 SAMD3 666316 sc-eQTL 1.02e-01 -0.165 0.1 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 -31581 sc-eQTL 9.99e-01 0.000139 0.131 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 3.42e-01 0.115 0.12 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 8.68e-03 0.346 0.13 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000164483 SAMD3 666316 sc-eQTL 2.05e-01 0.107 0.0841 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 6.46e-01 0.055 0.12 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 2.25e-01 0.162 0.133 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000164483 SAMD3 666316 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0104 0.0851 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 7.91e-01 0.0285 0.107 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 4.24e-03 0.344 0.119 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000164483 SAMD3 666316 sc-eQTL 5.96e-03 -0.294 0.106 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 3.09e-01 0.138 0.135 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 1.13e-01 0.231 0.145 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000164483 SAMD3 666316 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0225 0.124 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 8.14e-01 0.0328 0.139 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 2.83e-02 0.308 0.14 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000164483 SAMD3 666316 sc-eQTL 6.42e-01 -0.047 0.101 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 -31581 sc-eQTL 6.47e-01 -0.057 0.124 0.126 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0266 0.135 0.126 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 5.49e-02 0.256 0.133 0.126 MAIT L2
ENSG00000164483 SAMD3 666316 sc-eQTL 6.78e-01 0.0332 0.0798 0.126 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 3.29e-01 -0.134 0.137 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 5.63e-01 0.0768 0.133 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000164483 SAMD3 666316 sc-eQTL 3.94e-01 0.0898 0.105 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000227678 AL355581.1 885562 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0723 0.122 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 1.91e-01 0.14 0.107 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 1.43e-01 0.167 0.114 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000164483 SAMD3 666316 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0196 0.0623 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000227678 AL355581.1 885562 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0187 0.126 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0127 0.133 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 3.07e-02 0.296 0.136 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000164483 SAMD3 666316 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0808 0.113 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000227678 AL355581.1 885562 sc-eQTL 6.21e-01 0.0621 0.125 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 2.45e-01 0.139 0.119 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 7.39e-04 0.401 0.117 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000164483 SAMD3 666316 sc-eQTL 8.17e-01 0.0174 0.0752 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000227678 AL355581.1 885562 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0372 0.13 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 -31581 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0802 0.157 0.156 PB L2
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 2.77e-01 -0.161 0.147 0.156 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 4.71e-01 -0.104 0.144 0.156 PB L2
ENSG00000164483 SAMD3 666316 sc-eQTL 9.51e-01 0.00845 0.137 0.156 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 -31581 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0563 0.117 0.13 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 7.75e-02 -0.24 0.135 0.13 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 2.11e-01 -0.146 0.117 0.13 Pro_T L2
ENSG00000164483 SAMD3 666316 sc-eQTL 2.18e-01 -0.093 0.0753 0.13 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 -31581 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0763 0.126 0.13 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 6.39e-01 0.061 0.13 0.13 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 6.58e-03 0.302 0.11 0.13 Treg L2
ENSG00000164483 SAMD3 666316 sc-eQTL 6.26e-01 0.0525 0.108 0.13 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 -31581 sc-eQTL 2.63e-01 0.13 0.116 0.122 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 7.65e-01 0.0446 0.149 0.122 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 2.29e-01 0.174 0.144 0.122 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 -31581 sc-eQTL 8.89e-01 0.0166 0.118 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 6.88e-02 0.211 0.116 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 4.30e-03 0.321 0.111 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 -31581 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0625 0.124 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 1.75e-01 -0.167 0.123 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 6.13e-01 0.0613 0.121 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 -31581 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0723 0.142 0.124 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 1.27e-01 0.243 0.158 0.124 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 1.15e-01 0.261 0.165 0.124 gdT L2
ENSG00000164483 SAMD3 666316 sc-eQTL 9.76e-01 0.00378 0.126 0.124 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 -31581 sc-eQTL 5.36e-01 0.0772 0.125 0.129 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0308 0.134 0.129 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 2.75e-01 0.143 0.131 0.129 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 -31581 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00646 0.12 0.133 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 1.12e-01 -0.208 0.13 0.133 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 5.26e-01 0.0807 0.127 0.133 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 -31581 sc-eQTL 9.83e-02 0.246 0.148 0.136 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 7.10e-01 0.0561 0.151 0.136 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 9.61e-02 0.204 0.122 0.136 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 -31581 sc-eQTL 6.89e-01 0.0456 0.114 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 8.66e-01 -0.019 0.112 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 8.59e-03 0.297 0.112 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164483 SAMD3 666316 sc-eQTL 6.84e-02 0.207 0.113 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 -31581 sc-eQTL 1.72e-03 -0.295 0.0928 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 5.52e-02 0.201 0.104 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 3.10e-02 0.284 0.131 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164483 SAMD3 666316 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0188 0.114 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 -31581 sc-eQTL 8.02e-01 0.0284 0.113 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 3.19e-01 0.109 0.109 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 4.95e-02 0.21 0.106 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 -31581 sc-eQTL 5.79e-01 0.0664 0.119 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0184 0.122 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 1.61e-01 0.175 0.124 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 -596501 sc-eQTL 1.46e-01 0.139 0.0955 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 sc-eQTL 2.75e-04 0.38 0.103 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164483 SAMD3 666316 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00702 0.0576 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000227678 AL355581.1 885562 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00808 0.124 0.129 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 eQTL 9.17e-11 0.182 0.0277 0.0 0.0 0.149
ENSG00000118523 CCN2 -919631 pQTL 0.0361 0.061 0.0291 0.0 0.0 0.148
ENSG00000154269 ENPP3 -596701 eQTL 0.0236 -0.0758 0.0334 0.0 0.0 0.149

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000118507 AKAP7 -103726 4.54e-06 5.52e-06 7.32e-07 3.21e-06 1.62e-06 1.64e-06 5.92e-06 1.1e-06 4.98e-06 2.85e-06 6.38e-06 3.33e-06 7.51e-06 1.76e-06 1.11e-06 3.81e-06 1.9e-06 3.81e-06 1.49e-06 1.21e-06 2.77e-06 4.98e-06 4.62e-06 1.71e-06 8.24e-06 2.01e-06 2.31e-06 1.55e-06 4.46e-06 4.67e-06 2.68e-06 4.18e-07 5.4e-07 1.6e-06 2.06e-06 1.13e-06 9.76e-07 4.36e-07 8.6e-07 5.02e-07 7.46e-07 6.52e-06 4.37e-07 1.66e-07 6.22e-07 1.13e-06 1.13e-06 6.3e-07 4.23e-07