logo

Genes within 1Mb (chr12:99680392:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 3.42e-01 -0.106 0.111 0.13 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 3.26e-01 0.093 0.0945 0.13 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 1.96e-01 -0.122 0.094 0.13 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 1.06e-01 -0.137 0.0841 0.13 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00884 0.0788 0.13 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00713 0.0674 0.13 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0253 0.0949 0.13 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0785 0.0937 0.13 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 1.98e-01 -0.113 0.0876 0.13 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 2.76e-01 -0.136 0.124 0.131 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 9.19e-01 0.0122 0.12 0.131 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 9.59e-01 0.00689 0.133 0.131 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 -893291 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0452 0.124 0.131 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 7.68e-01 0.0321 0.109 0.13 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 6.91e-01 0.0355 0.0893 0.13 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 4.76e-01 0.0664 0.093 0.13 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 -893291 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0138 0.0871 0.13 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0292 0.101 0.129 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 6.82e-01 0.034 0.083 0.129 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 6.11e-02 0.159 0.0847 0.129 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 4.91e-02 -0.235 0.119 0.13 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 4.89e-02 -0.223 0.113 0.13 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 6.82e-01 -0.043 0.105 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 4.17e-01 0.118 0.144 0.138 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 7.05e-01 0.0587 0.155 0.138 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 3.76e-01 -0.129 0.145 0.138 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 2.28e-02 -0.29 0.127 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 2.42e-01 0.16 0.136 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0432 0.112 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0529 0.136 0.131 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 4.68e-01 0.0954 0.131 0.131 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00299 0.119 0.131 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 3.30e-01 -0.117 0.12 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 2.04e-01 0.146 0.115 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 2.24e-01 -0.133 0.109 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 1.63e-01 0.189 0.135 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 6.70e-01 0.0554 0.13 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00797 0.127 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 2.13e-01 -0.168 0.135 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0875 0.134 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 7.90e-01 0.0353 0.132 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 8.37e-02 -0.169 0.0974 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0268 0.0925 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 3.97e-01 0.0695 0.082 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 7.84e-01 0.0285 0.104 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 2.52e-01 0.125 0.109 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0247 0.0927 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0923 0.12 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 8.47e-01 0.023 0.119 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 4.01e-01 -0.102 0.121 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 9.79e-01 0.00285 0.109 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 2.30e-01 -0.134 0.111 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0128 0.11 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0922 0.108 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00475 0.116 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 2.83e-01 -0.111 0.103 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 2.95e-01 0.134 0.128 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 3.04e-01 0.141 0.137 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0687 0.136 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 9.29e-01 0.012 0.134 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0993 0.144 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00917 0.147 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 4.14e-02 -0.271 0.132 0.13 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0108 0.124 0.13 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0189 0.116 0.13 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 2.80e-02 -0.294 0.133 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0546 0.129 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0679 0.13 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0191 0.119 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0138 0.101 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 1.37e-01 0.159 0.106 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0576 0.141 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 4.19e-01 0.115 0.142 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0477 0.145 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 7.90e-01 0.0315 0.118 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00574 0.11 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 3.22e-01 0.103 0.103 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 8.39e-02 -0.288 0.165 0.144 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 1.87e-01 -0.212 0.16 0.144 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 4.14e-01 -0.14 0.171 0.144 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0845 0.134 0.133 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 1.10e-01 -0.212 0.132 0.133 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 6.46e-01 0.0598 0.13 0.133 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 9.70e-01 0.00464 0.124 0.13 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 1.60e-01 -0.178 0.126 0.13 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0542 0.12 0.13 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 9.10e-01 0.0147 0.13 0.124 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 7.39e-01 0.0458 0.137 0.124 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 2.60e-01 -0.147 0.13 0.124 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 -893291 sc-eQTL 2.33e-01 -0.154 0.129 0.124 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0579 0.111 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0209 0.0894 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 4.32e-01 0.0852 0.108 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 -893291 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0191 0.0945 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 1.12e-01 0.199 0.125 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 2.71e-01 0.13 0.117 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0743 0.119 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 -893291 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0188 0.118 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 3.69e-01 -0.153 0.17 0.121 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 3.96e-01 -0.146 0.171 0.121 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 4.81e-01 -0.123 0.173 0.121 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 4.00e-01 0.114 0.135 0.124 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 5.22e-01 0.0885 0.138 0.124 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0814 0.137 0.124 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 -893291 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0246 0.127 0.124 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 6.16e-01 0.0657 0.131 0.122 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 5.96e-01 0.0688 0.13 0.122 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 1.19e-01 0.209 0.133 0.122 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 -893291 sc-eQTL 5.82e-01 0.0629 0.114 0.122 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 8.64e-02 -0.268 0.156 0.11 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0791 0.151 0.11 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0887 0.165 0.11 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 -893291 sc-eQTL 5.94e-02 0.251 0.132 0.11 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 9.92e-02 -0.209 0.126 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 2.86e-02 0.277 0.125 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 8.86e-01 0.0143 0.0994 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 8.42e-01 0.024 0.12 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 2.54e-01 0.124 0.109 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 2.80e-01 -0.116 0.107 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 7.51e-01 0.0343 0.108 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 8.47e-01 0.0166 0.0856 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 5.64e-01 0.0556 0.0962 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 -893291 sc-eQTL 9.17e-01 0.0096 0.0924 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 7.13e-01 0.0473 0.129 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 4.30e-01 0.0952 0.12 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 5.24e-01 0.0761 0.119 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 -893291 sc-eQTL 6.47e-01 0.0527 0.115 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 sc-eQTL 6.84e-01 0.0425 0.104 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 sc-eQTL 8.95e-01 0.0116 0.0874 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 -586748 sc-eQTL 5.47e-02 0.169 0.0877 0.127 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000075089 ACTR6 -518730 eQTL 0.00754 -0.0606 0.0226 0.0 0.0 0.129
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -462482 eQTL 2.53e-02 0.0269 0.012 0.0 0.0 0.129

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina