logo

Genes within 1Mb (chr12:99674406:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 3.42e-01 -0.106 0.111 0.13 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 3.26e-01 0.093 0.0945 0.13 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 1.96e-01 -0.122 0.094 0.13 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 1.06e-01 -0.137 0.0841 0.13 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00884 0.0788 0.13 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00713 0.0674 0.13 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0253 0.0949 0.13 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0785 0.0937 0.13 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 1.98e-01 -0.113 0.0876 0.13 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 2.76e-01 -0.136 0.124 0.131 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 9.19e-01 0.0122 0.12 0.131 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 9.59e-01 0.00689 0.133 0.131 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 -899277 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0452 0.124 0.131 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 7.68e-01 0.0321 0.109 0.13 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 6.91e-01 0.0355 0.0893 0.13 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 4.76e-01 0.0664 0.093 0.13 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 -899277 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0138 0.0871 0.13 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0292 0.101 0.129 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 6.82e-01 0.034 0.083 0.129 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 6.11e-02 0.159 0.0847 0.129 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 4.91e-02 -0.235 0.119 0.13 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 4.89e-02 -0.223 0.113 0.13 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 6.82e-01 -0.043 0.105 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 4.17e-01 0.118 0.144 0.138 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 7.05e-01 0.0587 0.155 0.138 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 3.76e-01 -0.129 0.145 0.138 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 2.28e-02 -0.29 0.127 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 2.42e-01 0.16 0.136 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0432 0.112 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0529 0.136 0.131 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 4.68e-01 0.0954 0.131 0.131 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00299 0.119 0.131 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 3.30e-01 -0.117 0.12 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 2.04e-01 0.146 0.115 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 2.24e-01 -0.133 0.109 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 1.63e-01 0.189 0.135 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 6.70e-01 0.0554 0.13 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00797 0.127 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 2.13e-01 -0.168 0.135 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0875 0.134 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 7.90e-01 0.0353 0.132 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 8.37e-02 -0.169 0.0974 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0268 0.0925 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 3.97e-01 0.0695 0.082 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 7.84e-01 0.0285 0.104 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 2.52e-01 0.125 0.109 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0247 0.0927 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0923 0.12 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 8.47e-01 0.023 0.119 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 4.01e-01 -0.102 0.121 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 9.79e-01 0.00285 0.109 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 2.30e-01 -0.134 0.111 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0128 0.11 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0922 0.108 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00475 0.116 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 2.83e-01 -0.111 0.103 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 2.95e-01 0.134 0.128 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 3.04e-01 0.141 0.137 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0687 0.136 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 9.29e-01 0.012 0.134 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0993 0.144 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00917 0.147 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 4.14e-02 -0.271 0.132 0.13 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0108 0.124 0.13 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0189 0.116 0.13 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 2.80e-02 -0.294 0.133 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0546 0.129 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0679 0.13 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0191 0.119 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0138 0.101 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 1.37e-01 0.159 0.106 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0576 0.141 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 4.19e-01 0.115 0.142 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0477 0.145 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 7.90e-01 0.0315 0.118 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00574 0.11 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 3.22e-01 0.103 0.103 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 8.39e-02 -0.288 0.165 0.144 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 1.87e-01 -0.212 0.16 0.144 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 4.14e-01 -0.14 0.171 0.144 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0845 0.134 0.133 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 1.10e-01 -0.212 0.132 0.133 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 6.46e-01 0.0598 0.13 0.133 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 9.70e-01 0.00464 0.124 0.13 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 1.60e-01 -0.178 0.126 0.13 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0542 0.12 0.13 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 9.10e-01 0.0147 0.13 0.124 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 7.39e-01 0.0458 0.137 0.124 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 2.60e-01 -0.147 0.13 0.124 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 -899277 sc-eQTL 2.33e-01 -0.154 0.129 0.124 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0579 0.111 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0209 0.0894 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 4.32e-01 0.0852 0.108 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 -899277 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0191 0.0945 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 1.12e-01 0.199 0.125 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 2.71e-01 0.13 0.117 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0743 0.119 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 -899277 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0188 0.118 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 3.69e-01 -0.153 0.17 0.121 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 3.96e-01 -0.146 0.171 0.121 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 4.81e-01 -0.123 0.173 0.121 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 4.00e-01 0.114 0.135 0.124 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 5.22e-01 0.0885 0.138 0.124 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0814 0.137 0.124 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 -899277 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0246 0.127 0.124 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 6.16e-01 0.0657 0.131 0.122 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 5.96e-01 0.0688 0.13 0.122 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 1.19e-01 0.209 0.133 0.122 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 -899277 sc-eQTL 5.82e-01 0.0629 0.114 0.122 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 8.64e-02 -0.268 0.156 0.11 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0791 0.151 0.11 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0887 0.165 0.11 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 -899277 sc-eQTL 5.94e-02 0.251 0.132 0.11 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 9.92e-02 -0.209 0.126 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 2.86e-02 0.277 0.125 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 8.86e-01 0.0143 0.0994 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 8.42e-01 0.024 0.12 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 2.54e-01 0.124 0.109 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 2.80e-01 -0.116 0.107 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 7.51e-01 0.0343 0.108 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 8.47e-01 0.0166 0.0856 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 5.64e-01 0.0556 0.0962 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 -899277 sc-eQTL 9.17e-01 0.0096 0.0924 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 7.13e-01 0.0473 0.129 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 4.30e-01 0.0952 0.12 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 5.24e-01 0.0761 0.119 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 -899277 sc-eQTL 6.47e-01 0.0527 0.115 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 sc-eQTL 6.84e-01 0.0425 0.104 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 sc-eQTL 8.95e-01 0.0116 0.0874 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 -592734 sc-eQTL 5.47e-02 0.169 0.0877 0.127 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000075089 ACTR6 -524716 eQTL 0.00828 -0.0591 0.0223 0.0 0.0 0.132
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -468468 eQTL 2.11e-02 0.0273 0.0118 0.0 0.0 0.132

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina