Genes within 1Mb (chr12:99587698:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 6.58e-01 0.0389 0.0878 0.235 B L1
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 3.38e-01 0.0624 0.0651 0.235 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 8.68e-02 -0.127 0.0739 0.235 B L1
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 1.95e-01 0.0967 0.0744 0.235 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0678 0.074 0.235 B L1
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 3.06e-01 0.0779 0.076 0.235 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0127 0.0663 0.235 CD4T L1
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 4.26e-01 0.0636 0.0798 0.235 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0605 0.0616 0.235 CD4T L1
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0534 0.0617 0.235 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0434 0.0526 0.235 CD4T L1
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0577 0.0863 0.235 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00365 0.0739 0.235 CD8T L1
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 7.23e-01 0.0231 0.0653 0.235 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 9.49e-01 0.00466 0.0731 0.235 CD8T L1
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0169 0.0723 0.235 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 1.12e-01 -0.109 0.0681 0.235 CD8T L1
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 1.70e-01 -0.134 0.097 0.235 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 2.48e-01 -0.111 0.0955 0.23 DC L1
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 7.22e-01 0.0237 0.0668 0.23 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 4.27e-01 0.0735 0.0923 0.23 DC L1
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0893 0.0746 0.23 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 4.89e-01 0.0709 0.102 0.23 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 -985985 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0123 0.0952 0.23 DC L1
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 5.24e-01 0.0633 0.0991 0.23 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 7.61e-01 0.0257 0.0845 0.235 Mono L1
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 6.48e-01 0.025 0.0546 0.235 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 2.71e-01 0.0764 0.0693 0.235 Mono L1
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00489 0.0511 0.235 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 7.32e-01 0.0249 0.0724 0.235 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 -985985 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00136 0.0678 0.235 Mono L1
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 6.83e-01 0.0279 0.0682 0.235 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0186 0.078 0.234 NK L1
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 6.33e-01 0.042 0.0878 0.234 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0342 0.0643 0.234 NK L1
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 2.19e-01 -0.0952 0.0772 0.234 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 3.51e-01 0.0617 0.0661 0.234 NK L1
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000872 0.0807 0.234 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 1.65e-01 -0.13 0.0936 0.235 Other_T L1
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 5.04e-01 -0.05 0.0746 0.235 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 8.30e-01 0.0192 0.0893 0.235 Other_T L1
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 2.31e-01 -0.108 0.09 0.235 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0803 0.0821 0.235 Other_T L1
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 1.87e-01 0.103 0.0775 0.235 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 8.75e-01 0.0183 0.116 0.245 B_Activated L2
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 1.53e-01 0.163 0.114 0.245 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 7.01e-01 0.0477 0.124 0.245 B_Activated L2
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 1.07e-02 -0.299 0.116 0.245 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 2.48e-01 -0.134 0.116 0.245 B_Activated L2
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 1.65e-01 -0.164 0.118 0.245 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 3.48e-01 0.0941 0.1 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 5.48e-01 0.0556 0.0926 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 2.20e-01 -0.131 0.107 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 4.44e-02 0.194 0.0962 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 1.32e-01 -0.132 0.0871 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 7.10e-01 0.0362 0.0971 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 2.67e-01 -0.12 0.108 0.231 B_Memory L2
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0115 0.0918 0.231 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 1.01e-01 0.17 0.103 0.231 B_Memory L2
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0489 0.106 0.231 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 8.46e-01 0.0183 0.0944 0.231 B_Memory L2
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 9.09e-01 0.0121 0.105 0.231 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 5.79e-01 0.0525 0.0944 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 4.44e-01 0.0615 0.0802 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 4.74e-02 -0.179 0.0896 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 4.04e-01 0.0784 0.0938 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0177 0.0855 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 6.42e-01 0.0462 0.0992 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 3.56e-01 0.0991 0.107 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 1.35e-01 0.15 0.1 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0874 0.103 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 4.21e-02 0.199 0.0975 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0987 0.1 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 5.16e-01 0.0628 0.0966 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 8.10e-01 0.0256 0.106 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 2.36e-01 -0.12 0.101 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00413 0.105 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 9.17e-01 0.0107 0.103 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0584 0.104 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 7.13e-01 0.0375 0.102 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 8.34e-01 0.0159 0.0755 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 1.77e-01 0.105 0.0772 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0527 0.0712 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0615 0.0739 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 1.82e-01 -0.0844 0.063 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0947 0.0836 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 1.09e-01 -0.131 0.0812 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 3.72e-01 0.0683 0.0764 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 8.73e-02 -0.147 0.0853 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0683 0.0858 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 8.49e-01 0.0139 0.0729 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 2.25e-01 0.119 0.0976 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 7.20e-01 0.0345 0.0962 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 4.17e-02 0.19 0.0925 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00565 0.0953 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 6.03e-01 0.0523 0.1 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 1.00e-01 -0.159 0.0962 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 6.41e-01 0.0512 0.11 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 3.23e-01 0.0833 0.0841 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 7.19e-01 0.0325 0.0901 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 7.10e-01 0.0321 0.0863 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 4.56e-01 0.07 0.0939 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 9.76e-02 -0.141 0.0846 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 8.97e-01 -0.013 0.101 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0718 0.0848 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 3.18e-01 0.0854 0.0852 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 9.71e-01 0.00334 0.0911 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00318 0.1 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0644 0.081 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 3.07e-01 -0.106 0.103 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 3.43e-01 0.0941 0.0991 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 3.67e-01 0.0969 0.107 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0722 0.106 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 7.18e-01 0.037 0.102 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0236 0.105 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0504 0.104 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 6.34e-01 0.0493 0.103 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 4.55e-01 0.0709 0.0947 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 3.37e-01 -0.107 0.111 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 7.06e-01 -0.042 0.111 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 3.45e-01 -0.107 0.113 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0439 0.111 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0177 0.103 0.238 MAIT L2
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0224 0.0994 0.238 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0992 0.0953 0.238 MAIT L2
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 2.68e-01 -0.104 0.0934 0.238 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0246 0.0897 0.238 MAIT L2
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 1.79e-01 0.13 0.0963 0.238 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0442 0.102 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0895 0.0918 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0259 0.0973 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 3.10e-01 -0.106 0.104 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 2.83e-01 0.105 0.0976 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0616 0.0969 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 5.48e-01 0.0556 0.0922 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 2.17e-01 0.116 0.0935 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0225 0.0788 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 9.07e-01 0.0101 0.0859 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 6.33e-01 0.0398 0.0832 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 3.28e-01 0.0881 0.0898 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 8.10e-01 0.025 0.103 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00363 0.0983 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0737 0.104 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 4.22e-02 -0.207 0.101 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0486 0.107 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 1.77e-01 -0.14 0.103 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0623 0.0914 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 8.85e-01 0.0141 0.0974 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 6.95e-01 0.0334 0.0851 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 4.01e-01 0.0778 0.0925 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 2.77e-01 0.087 0.0799 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000691 0.0988 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 5.28e-01 0.0877 0.138 0.248 PB L2
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 7.95e-01 0.0194 0.0745 0.248 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0821 0.133 0.248 PB L2
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 9.05e-01 0.0157 0.132 0.248 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0945 0.142 0.248 PB L2
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 4.87e-01 0.0686 0.0983 0.248 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0606 0.106 0.233 Pro_T L2
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0183 0.0653 0.233 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 1.95e-01 0.137 0.105 0.233 Pro_T L2
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 1.47e-01 -0.156 0.107 0.233 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 1.28e-01 -0.156 0.102 0.233 Pro_T L2
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0537 0.0757 0.233 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 4.49e-01 0.0766 0.101 0.235 Treg L2
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0219 0.102 0.235 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 2.50e-01 -0.119 0.103 0.235 Treg L2
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0432 0.109 0.235 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00997 0.098 0.235 Treg L2
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 4.31e-01 -0.083 0.105 0.235 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 8.96e-01 0.0131 0.101 0.234 cDC L2
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 8.36e-01 0.0165 0.0796 0.234 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 3.33e-01 0.102 0.105 0.234 cDC L2
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 1.42e-01 -0.115 0.0784 0.234 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 5.11e-01 0.0664 0.101 0.234 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 -985985 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0363 0.0996 0.234 cDC L2
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0246 0.101 0.234 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 1.53e-01 0.124 0.0862 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0319 0.0517 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 3.22e-01 0.069 0.0694 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 5.19e-01 -0.036 0.0558 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 2.31e-01 0.101 0.0842 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 -985985 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0392 0.0735 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 3.99e-01 0.0638 0.0755 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 9.44e-01 0.00681 0.0966 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 9.20e-01 0.00592 0.059 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 3.14e-01 0.0913 0.0905 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 2.20e-01 0.0862 0.0701 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 8.29e-01 0.0198 0.0918 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 -985985 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0277 0.0909 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 4.12e-01 0.0705 0.0858 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0922 0.122 0.252 gdT L2
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00676 0.111 0.252 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0672 0.123 0.252 gdT L2
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 7.97e-01 0.0324 0.126 0.252 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 7.95e-01 0.0323 0.124 0.252 gdT L2
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 8.62e-01 0.0214 0.123 0.252 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 9.95e-02 -0.17 0.103 0.236 intMono L2
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 1.00e+00 3.69e-05 0.073 0.236 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0278 0.105 0.236 intMono L2
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0325 0.0822 0.236 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 3.15e-01 -0.105 0.104 0.236 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 -985985 sc-eQTL 6.52e-02 0.178 0.0959 0.236 intMono L2
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00407 0.0907 0.236 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0319 0.097 0.238 ncMono L2
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 2.84e-01 0.0874 0.0815 0.238 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 7.21e-01 0.0344 0.0962 0.238 ncMono L2
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0334 0.0777 0.238 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00353 0.0996 0.238 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 -985985 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0211 0.0848 0.238 ncMono L2
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 1.90e-01 -0.123 0.0931 0.238 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 3.38e-02 -0.224 0.104 0.243 pDC L2
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 8.01e-01 0.0212 0.0841 0.243 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 5.01e-01 0.0689 0.102 0.243 pDC L2
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 2.29e-01 -0.12 0.0992 0.243 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 8.44e-01 0.0219 0.111 0.243 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 -985985 sc-eQTL 7.71e-01 0.0263 0.0901 0.243 pDC L2
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 3.64e-01 0.103 0.113 0.243 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00568 0.0985 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 5.70e-01 0.0515 0.0904 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0294 0.0982 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 8.21e-01 0.0207 0.0913 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0881 0.0767 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0253 0.0971 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 3.64e-01 0.0853 0.0938 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 3.11e-01 0.0802 0.0789 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 4.14e-02 -0.173 0.0845 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 4.23e-02 0.182 0.0889 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0512 0.0841 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 2.86e-01 0.0974 0.0912 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 2.51e-01 0.0965 0.0838 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0253 0.052 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 1.77e-01 0.0899 0.0663 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 9.08e-01 -0.00648 0.056 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 3.94e-01 0.0638 0.0747 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 -985985 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0776 0.0717 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 4.04e-01 0.0589 0.0703 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 1.36e-01 -0.147 0.0982 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 6.05e-01 0.0363 0.0701 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 8.54e-01 0.0171 0.0925 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 8.66e-01 0.0111 0.0658 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0655 0.0914 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 -985985 sc-eQTL 1.66e-01 0.122 0.0878 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0641 0.0859 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 -611424 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0147 0.0805 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 994107 sc-eQTL 4.28e-01 0.0697 0.0878 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -555176 sc-eQTL 6.36e-01 -0.032 0.0676 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 942557 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0702 0.0779 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 -679442 sc-eQTL 3.15e-01 0.0688 0.0683 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP 942585 sc-eQTL 7.50e-01 0.0266 0.0834 0.235 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000280088 \N -446376 7.76e-07 4e-07 1.05e-07 3.19e-07 9.82e-08 1.64e-07 4.68e-07 1.03e-07 3.82e-07 2.14e-07 4.97e-07 3.5e-07 6.47e-07 1.1e-07 1.71e-07 2e-07 1.85e-07 3.44e-07 1.62e-07 1.28e-07 1.91e-07 3.15e-07 3.07e-07 1.29e-07 6.02e-07 2.46e-07 2.22e-07 2.19e-07 2.84e-07 4.1e-07 2.43e-07 7.59e-08 5.77e-08 1.39e-07 2.61e-07 8.17e-08 9.9e-08 6.78e-08 4.37e-08 5.25e-08 8.68e-08 3.85e-07 1.6e-08 1.14e-08 9.79e-08 1.75e-08 8.75e-08 3.25e-09 5.71e-08