logo

Genes within 1Mb (chr12:99539290:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 2.26e-01 0.148 0.121 0.111 B L1
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0317 0.0905 0.111 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 2.51e-02 0.23 0.102 0.111 B L1
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0643 0.104 0.111 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 1.34e-01 -0.154 0.102 0.111 B L1
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 8.56e-01 0.0192 0.106 0.111 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 6.17e-01 -0.046 0.0919 0.111 CD4T L1
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 3.35e-01 -0.107 0.111 0.111 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0495 0.0856 0.111 CD4T L1
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 4.67e-01 0.0624 0.0857 0.111 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 9.97e-01 0.000231 0.0732 0.111 CD4T L1
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 9.87e-02 0.198 0.119 0.111 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 1.44e-01 -0.149 0.102 0.111 CD8T L1
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0597 0.0903 0.111 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 8.49e-02 -0.174 0.101 0.111 CD8T L1
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 1.74e-01 0.136 0.0998 0.111 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 3.18e-02 -0.203 0.0938 0.111 CD8T L1
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 1.30e-01 0.204 0.134 0.111 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 8.74e-01 0.0209 0.131 0.115 DC L1
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0785 0.0914 0.115 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 6.22e-01 0.0625 0.127 0.115 DC L1
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 7.53e-01 0.0323 0.103 0.115 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 8.15e-01 0.0329 0.14 0.115 DC L1
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0882 0.136 0.115 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0565 0.12 0.111 Mono L1
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0416 0.0779 0.111 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 8.18e-01 0.0229 0.0991 0.111 Mono L1
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 9.46e-02 -0.122 0.0724 0.111 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 2.14e-01 -0.128 0.103 0.111 Mono L1
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 7.84e-01 0.0267 0.0974 0.111 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 2.51e-01 0.125 0.108 0.112 NK L1
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 3.42e-01 -0.116 0.122 0.112 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 9.95e-01 -0.0006 0.0896 0.112 NK L1
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 6.56e-01 -0.048 0.108 0.112 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 1.25e-01 0.141 0.0917 0.112 NK L1
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 2.08e-01 0.141 0.112 0.112 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 6.48e-01 0.0597 0.131 0.111 Other_T L1
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 1.10e-01 -0.166 0.103 0.111 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 5.53e-01 0.0737 0.124 0.111 Other_T L1
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 1.14e-01 0.198 0.125 0.111 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 2.19e-01 -0.141 0.114 0.111 Other_T L1
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 2.21e-01 0.132 0.108 0.111 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 5.27e-02 0.3 0.154 0.117 B_Activated L2
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 4.09e-02 -0.312 0.151 0.117 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 4.88e-01 -0.115 0.166 0.117 B_Activated L2
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 5.34e-01 0.0984 0.158 0.117 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 8.09e-01 0.0377 0.156 0.117 B_Activated L2
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 1.12e-01 0.252 0.158 0.117 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 9.58e-01 0.00728 0.137 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 2.67e-01 -0.14 0.126 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 2.49e-02 0.325 0.144 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 3.84e-01 -0.115 0.132 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 3.34e-01 -0.115 0.119 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0756 0.132 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 1.38e-01 0.219 0.147 0.112 B_Memory L2
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0422 0.126 0.112 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 1.75e-01 0.193 0.142 0.112 B_Memory L2
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0189 0.146 0.112 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0263 0.129 0.112 B_Memory L2
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 4.26e-01 -0.115 0.144 0.112 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 2.41e-01 -0.152 0.129 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0316 0.11 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 1.11e-01 0.197 0.123 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0756 0.129 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 1.11e-01 -0.186 0.116 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 4.51e-01 0.103 0.136 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 5.11e-02 0.284 0.145 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 9.46e-03 -0.353 0.135 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 4.63e-01 0.103 0.14 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0944 0.134 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0163 0.137 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0873 0.131 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00512 0.146 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 1.85e-01 0.184 0.138 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 8.90e-01 0.0202 0.145 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 3.97e-02 -0.292 0.141 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 4.30e-01 -0.113 0.143 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 5.17e-01 0.0909 0.14 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 2.95e-01 -0.111 0.105 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 2.56e-01 -0.123 0.108 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0196 0.0998 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 3.51e-01 0.0965 0.103 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 4.08e-01 0.0733 0.0884 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 1.25e-02 0.291 0.116 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 9.72e-01 0.00394 0.114 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 7.29e-02 -0.191 0.106 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0194 0.12 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 3.41e-01 0.114 0.12 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 8.93e-01 0.0137 0.102 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0433 0.137 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 4.17e-01 0.108 0.133 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0528 0.129 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0753 0.132 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0524 0.139 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 2.61e-01 -0.151 0.134 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 9.32e-01 0.013 0.152 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00138 0.116 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 1.48e-01 -0.179 0.124 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 6.80e-01 0.0492 0.119 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 5.34e-01 0.0805 0.129 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 1.14e-01 -0.185 0.117 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 3.71e-01 0.124 0.138 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 1.72e-01 -0.163 0.119 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0384 0.12 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 1.77e-01 -0.172 0.127 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 6.83e-01 0.0573 0.14 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 1.33e-02 -0.28 0.112 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 1.93e-01 0.189 0.144 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 4.28e-01 -0.11 0.138 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 5.17e-02 -0.291 0.149 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 2.45e-01 -0.172 0.148 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 7.64e-01 0.0429 0.143 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 2.52e-01 -0.168 0.146 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 5.47e-01 0.0876 0.145 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0882 0.139 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 3.03e-01 -0.131 0.127 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 4.72e-01 -0.107 0.149 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 5.07e-01 0.0992 0.149 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 8.77e-01 0.0235 0.152 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 5.52e-01 0.0887 0.149 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0983 0.142 0.11 MAIT L2
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 2.56e-02 -0.305 0.135 0.11 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 9.22e-01 0.013 0.132 0.11 MAIT L2
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 9.34e-01 0.0106 0.129 0.11 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 4.29e-01 -0.098 0.124 0.11 MAIT L2
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 5.17e-01 0.0865 0.133 0.11 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0775 0.14 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 2.84e-01 -0.136 0.127 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0819 0.134 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 1.53e-01 0.207 0.144 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 1.07e-01 0.217 0.134 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 6.39e-01 -0.063 0.134 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 2.57e-01 0.145 0.127 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 1.64e-01 -0.18 0.129 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 6.72e-01 0.0462 0.109 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 9.81e-02 -0.196 0.118 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 5.85e-01 0.0629 0.115 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 9.99e-02 0.204 0.124 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 4.22e-01 0.12 0.149 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0368 0.142 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 3.10e-01 0.153 0.15 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 9.08e-01 -0.017 0.148 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 1.27e-01 -0.235 0.153 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 3.73e-01 -0.133 0.149 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 7.45e-01 0.0418 0.128 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 3.79e-01 -0.12 0.136 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0322 0.119 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0562 0.13 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 3.32e-02 0.238 0.111 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 7.70e-01 0.0405 0.138 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 9.84e-01 0.0039 0.189 0.115 PB L2
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0351 0.102 0.115 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 6.78e-01 0.0759 0.182 0.115 PB L2
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 4.41e-01 0.139 0.179 0.115 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 1.58e-01 -0.273 0.192 0.115 PB L2
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0951 0.134 0.115 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 2.26e-01 0.175 0.144 0.113 Pro_T L2
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0717 0.089 0.113 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 7.25e-01 0.0506 0.144 0.113 Pro_T L2
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 3.32e-01 0.143 0.147 0.113 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 4.69e-01 0.102 0.14 0.113 Pro_T L2
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 2.07e-01 0.13 0.103 0.113 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 2.90e-01 0.144 0.136 0.111 Treg L2
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0443 0.137 0.111 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 1.12e-01 -0.221 0.139 0.111 Treg L2
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 8.60e-01 0.026 0.147 0.111 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 2.31e-01 -0.158 0.132 0.111 Treg L2
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 8.42e-01 0.0284 0.142 0.111 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 8.73e-01 0.0217 0.135 0.115 cDC L2
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0275 0.107 0.115 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 9.12e-01 0.0157 0.142 0.115 cDC L2
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 5.07e-01 0.0704 0.106 0.115 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 8.09e-01 0.0329 0.136 0.115 cDC L2
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0428 0.136 0.115 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 7.49e-02 -0.218 0.122 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0899 0.0731 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 8.30e-01 0.0212 0.0986 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0673 0.079 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 1.90e-01 -0.157 0.119 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 6.91e-01 0.0427 0.107 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 1.41e-01 0.2 0.136 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0428 0.0832 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00365 0.128 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 9.60e-02 -0.165 0.0985 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 1.66e-01 -0.179 0.129 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 8.85e-01 0.0176 0.121 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 2.65e-01 -0.186 0.166 0.115 gdT L2
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00203 0.151 0.115 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 5.99e-01 0.0884 0.168 0.115 gdT L2
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 1.44e-01 0.25 0.171 0.115 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0922 0.169 0.115 gdT L2
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 3.52e-01 0.156 0.167 0.115 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0204 0.146 0.113 intMono L2
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0874 0.103 0.113 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 4.50e-01 0.112 0.148 0.113 intMono L2
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 1.78e-01 -0.156 0.116 0.113 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 6.74e-01 0.0625 0.148 0.113 intMono L2
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 3.56e-01 0.119 0.128 0.113 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 2.06e-01 0.178 0.14 0.111 ncMono L2
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 7.11e-01 0.0438 0.118 0.111 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 3.18e-01 -0.139 0.139 0.111 ncMono L2
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0371 0.113 0.111 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 1.40e-01 -0.212 0.143 0.111 ncMono L2
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 3.25e-01 -0.133 0.135 0.111 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 4.34e-01 0.125 0.159 0.102 pDC L2
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0617 0.126 0.102 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 9.27e-02 0.258 0.152 0.102 pDC L2
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 1.95e-01 0.194 0.149 0.102 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 3.72e-01 -0.149 0.167 0.102 pDC L2
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0788 0.171 0.102 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 3.34e-01 0.133 0.137 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 1.87e-01 -0.166 0.126 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 4.47e-03 0.386 0.134 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 5.46e-01 -0.077 0.127 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0366 0.107 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0847 0.135 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 5.32e-01 0.0814 0.13 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0702 0.109 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 1.28e-01 0.18 0.117 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 5.90e-01 -0.067 0.124 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 1.88e-01 -0.153 0.116 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 7.03e-01 0.0484 0.126 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0759 0.119 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 4.26e-01 -0.059 0.074 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 9.91e-01 0.00103 0.0948 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 1.82e-01 -0.106 0.0793 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 1.41e-01 -0.156 0.106 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 6.27e-01 0.0488 0.1 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 3.64e-01 0.127 0.14 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 7.17e-01 0.0362 0.0997 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0238 0.131 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 1.23e-01 -0.144 0.093 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0492 0.13 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0617 0.122 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 -659832 sc-eQTL 1.47e-01 0.163 0.112 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 945699 sc-eQTL 1.12e-01 -0.195 0.123 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -603584 sc-eQTL 9.29e-01 0.00845 0.0949 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 894149 sc-eQTL 1.33e-01 -0.165 0.109 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 -727850 sc-eQTL 3.32e-01 0.0932 0.0959 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP 894177 sc-eQTL 2.86e-01 0.125 0.117 0.112 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000185046 \N -445364 8.48e-07 5.7e-07 1.2e-07 3.81e-07 9.61e-08 2.16e-07 5.65e-07 1.56e-07 5.02e-07 2.82e-07 7.44e-07 4.24e-07 8.16e-07 1.48e-07 2.96e-07 2.89e-07 3.63e-07 4.2e-07 2.65e-07 1.86e-07 2.35e-07 4.14e-07 3.69e-07 2.19e-07 8.09e-07 2.7e-07 3.37e-07 3.18e-07 4.13e-07 6.19e-07 2.93e-07 5.93e-08 4.57e-08 1.64e-07 3.52e-07 1.48e-07 1.02e-07 1.06e-07 6.41e-08 2.26e-08 1.15e-07 5.29e-07 4.18e-08 1.93e-08 1.69e-07 1.5e-08 1.27e-07 3.01e-08 6.36e-08