Genes within 1Mb (chr12:99471247:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0205 0.0831 0.263 B L1
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0663 0.0616 0.263 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 3.84e-01 0.0615 0.0704 0.263 B L1
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 4.70e-01 0.0381 0.0526 0.263 B L1
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 1.37e-01 -0.105 0.0704 0.263 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0626 0.0701 0.263 B L1
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 1.81e-01 0.0963 0.0718 0.263 B L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 6.50e-01 0.0301 0.0663 0.263 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0182 0.0627 0.263 CD4T L1
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 3.49e-01 0.0708 0.0754 0.263 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 6.42e-02 -0.108 0.0579 0.263 CD4T L1
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0367 0.0604 0.263 CD4T L1
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 3.26e-01 0.0574 0.0583 0.263 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 2.19e-01 -0.0613 0.0497 0.263 CD4T L1
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 7.39e-01 0.0272 0.0817 0.263 CD4T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 1.36e-01 -0.0891 0.0595 0.263 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 7.64e-01 0.0212 0.0705 0.263 CD8T L1
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 3.55e-01 0.0577 0.0622 0.263 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 8.67e-01 0.0117 0.0698 0.263 CD8T L1
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00469 0.0571 0.263 CD8T L1
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0788 0.0689 0.263 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0367 0.0653 0.263 CD8T L1
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 7.38e-01 0.0311 0.0931 0.263 CD8T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0452 0.0671 0.263 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 1.11e-01 -0.146 0.0913 0.27 DC L1
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 7.55e-01 0.02 0.064 0.27 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 2.43e-02 -0.199 0.0875 0.27 DC L1
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00665 0.0865 0.27 DC L1
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 1.67e-01 -0.099 0.0714 0.27 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00781 0.0983 0.27 DC L1
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 1.39e-01 0.141 0.0946 0.27 DC L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 1.28e-01 -0.125 0.0821 0.27 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 1.78e-01 0.111 0.0821 0.263 Mono L1
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 4.05e-01 0.0445 0.0533 0.263 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 3.58e-01 0.0624 0.0677 0.263 Mono L1
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 8.80e-02 0.11 0.0641 0.263 Mono L1
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 7.79e-02 0.0878 0.0496 0.263 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0664 0.0706 0.263 Mono L1
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 2.65e-01 0.0743 0.0665 0.263 Mono L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 3.34e-01 0.0663 0.0684 0.263 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0121 0.0763 0.262 NK L1
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0073 0.0859 0.262 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0571 0.0628 0.262 NK L1
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0873 0.0724 0.262 NK L1
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 7.89e-01 0.0202 0.0757 0.262 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 5.43e-01 0.0394 0.0647 0.262 NK L1
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 5.91e-01 0.0424 0.0788 0.262 NK L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0204 0.0758 0.262 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 2.46e-01 -0.103 0.0886 0.263 Other_T L1
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0196 0.0705 0.263 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 5.36e-02 -0.162 0.0836 0.263 Other_T L1
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 9.59e-01 0.00217 0.0418 0.263 Other_T L1
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 9.24e-01 0.00819 0.0853 0.263 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0633 0.0776 0.263 Other_T L1
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 4.71e-01 0.053 0.0734 0.263 Other_T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 4.04e-01 0.0499 0.0597 0.263 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 4.11e-01 0.0928 0.113 0.25 B_Activated L2
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 7.62e-01 0.0337 0.111 0.25 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 8.75e-01 0.0191 0.121 0.25 B_Activated L2
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 3.41e-02 -0.217 0.102 0.25 B_Activated L2
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 6.22e-02 0.213 0.114 0.25 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0769 0.113 0.25 B_Activated L2
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00821 0.115 0.25 B_Activated L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 3.30e-01 0.0995 0.102 0.25 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0211 0.0952 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 1.35e-01 -0.131 0.0876 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 2.96e-01 0.106 0.101 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0109 0.0717 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 4.18e-03 -0.262 0.0905 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0432 0.0832 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 3.22e-01 0.0915 0.0921 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 2.46e-01 0.0966 0.0831 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 5.37e-01 0.0633 0.102 0.265 B_Memory L2
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 4.99e-01 0.0589 0.087 0.265 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 4.14e-01 0.0807 0.0985 0.265 B_Memory L2
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 1.40e-01 0.129 0.0874 0.265 B_Memory L2
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0747 0.101 0.265 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0279 0.0894 0.265 B_Memory L2
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 3.46e-01 0.0942 0.0997 0.265 B_Memory L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 4.98e-01 0.0642 0.0945 0.265 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00824 0.0899 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0662 0.0763 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 5.93e-01 0.0461 0.086 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 8.40e-01 -0.012 0.0594 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 1.48e-01 -0.129 0.089 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 7.73e-01 0.0235 0.0814 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 2.22e-01 0.115 0.0941 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0173 0.0842 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 9.29e-02 -0.172 0.102 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0676 0.096 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 4.85e-01 0.0685 0.098 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 1.38e-01 0.12 0.0807 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 6.34e-01 0.0448 0.0939 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 4.23e-01 0.0768 0.0957 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 8.64e-01 0.0158 0.0923 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 2.54e-01 0.101 0.0883 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0639 0.102 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0901 0.0972 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 2.95e-01 -0.106 0.101 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 6.43e-03 0.252 0.0915 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 3.15e-01 0.1 0.0995 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 4.20e-01 0.0809 0.1 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 5.17e-01 0.0637 0.0981 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 4.38e-01 0.08 0.103 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0129 0.0727 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 4.62e-01 0.055 0.0745 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0695 0.0684 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 8.88e-01 0.00947 0.0674 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 6.29e-01 0.0344 0.0711 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 9.83e-01 0.0013 0.0608 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 8.06e-01 0.0198 0.0807 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 1.26e-01 -0.108 0.0705 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 6.99e-01 -0.03 0.0773 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 3.13e-01 0.0731 0.0722 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 1.19e-01 -0.127 0.0808 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 1.40e-01 -0.0968 0.0653 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 6.54e-02 0.149 0.0807 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 1.85e-01 -0.0914 0.0687 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 3.19e-01 0.0924 0.0925 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0127 0.0703 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 2.72e-01 0.0987 0.0897 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 5.84e-01 0.0479 0.0873 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 6.11e-01 0.0453 0.089 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0824 0.0824 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 2.02e-01 -0.119 0.0934 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0772 0.0904 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00759 0.103 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0943 0.0881 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0336 0.0806 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0119 0.0862 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0987 0.0823 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0398 0.0805 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0996 0.0896 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0443 0.0814 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 8.63e-01 0.0166 0.0962 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 9.14e-01 0.00962 0.0887 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 3.88e-01 0.0697 0.0806 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 3.79e-01 0.0714 0.081 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 4.78e-01 0.0615 0.0865 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0589 0.0772 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 2.34e-01 0.113 0.0947 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 1.78e-01 -0.104 0.0767 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 7.87e-01 0.0266 0.0983 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0389 0.0811 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 7.57e-01 0.029 0.0937 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 3.90e-01 0.0872 0.101 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0236 0.1 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0176 0.0848 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 2.13e-01 -0.12 0.0962 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 4.68e-01 0.0722 0.0992 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0296 0.0981 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0165 0.0985 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 4.71e-02 -0.192 0.0962 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 6.04e-01 0.0463 0.0891 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 2.67e-01 0.116 0.104 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 7.23e-01 0.0324 0.0913 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0789 0.104 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 9.49e-01 0.00679 0.106 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 4.01e-01 0.0875 0.104 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0764 0.0973 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 1.42e-01 -0.147 0.0998 0.264 MAIT L2
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 3.02e-01 0.0997 0.0964 0.264 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 2.17e-01 -0.115 0.0926 0.264 MAIT L2
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 7.43e-01 0.0303 0.0923 0.264 MAIT L2
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 8.07e-01 0.0222 0.0911 0.264 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 2.92e-01 -0.092 0.087 0.264 MAIT L2
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 7.11e-01 0.0349 0.094 0.264 MAIT L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00298 0.0968 0.264 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0694 0.0996 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00612 0.0904 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 5.20e-01 0.0615 0.0955 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0902 0.092 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 2.97e-01 0.107 0.102 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 2.40e-01 0.113 0.0958 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0802 0.0951 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0798 0.103 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0196 0.0909 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0197 0.0923 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0945 0.0773 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0578 0.0805 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 8.40e-01 0.0171 0.0845 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 8.54e-01 0.0151 0.0819 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 5.54e-01 0.0524 0.0885 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 6.21e-01 0.0443 0.0895 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 1.30e-02 0.248 0.099 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 7.57e-01 0.0295 0.0955 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0894 0.101 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 4.43e-01 -0.077 0.1 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 6.60e-01 0.044 0.0996 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 8.20e-01 0.0237 0.104 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0203 0.101 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00712 0.0947 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 2.40e-01 -0.104 0.0887 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 5.15e-01 0.0617 0.0946 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0669 0.0827 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 7.40e-02 -0.146 0.0814 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 7.63e-01 0.0272 0.0901 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 4.62e-01 0.0574 0.0778 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 3.28e-01 0.0939 0.0959 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0205 0.0929 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 3.17e-01 -0.144 0.143 0.241 PB L2
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 1.54e-01 -0.11 0.0763 0.241 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 6.18e-01 -0.069 0.138 0.241 PB L2
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 6.11e-02 -0.272 0.144 0.241 PB L2
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0654 0.136 0.241 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 5.18e-01 -0.095 0.147 0.241 PB L2
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 2.41e-01 0.119 0.101 0.241 PB L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0975 0.135 0.241 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0979 0.0988 0.263 Pro_T L2
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 2.62e-01 0.0686 0.061 0.263 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0443 0.0987 0.263 Pro_T L2
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 1.28e-01 -0.0769 0.0503 0.263 Pro_T L2
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 5.67e-01 0.058 0.101 0.263 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 6.54e-01 0.0432 0.0964 0.263 Pro_T L2
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 5.20e-01 0.0457 0.0709 0.263 Pro_T L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0137 0.0782 0.263 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 4.78e-01 0.0658 0.0926 0.263 Treg L2
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 8.09e-01 0.0226 0.0933 0.263 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0841 0.0948 0.263 Treg L2
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0965 0.081 0.263 Treg L2
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0397 0.1 0.263 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 2.30e-01 -0.108 0.0895 0.263 Treg L2
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 1.51e-01 -0.139 0.0962 0.263 Treg L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0173 0.0869 0.263 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 6.82e-02 -0.176 0.0959 0.263 cDC L2
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 5.07e-01 0.0508 0.0765 0.263 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 1.79e-01 -0.137 0.101 0.263 cDC L2
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0324 0.0954 0.263 cDC L2
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0923 0.0756 0.263 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 2.19e-01 -0.119 0.0966 0.263 cDC L2
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 2.00e-01 0.125 0.0971 0.263 cDC L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 8.81e-02 -0.164 0.0956 0.263 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0686 0.0836 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 3.47e-01 0.047 0.0499 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 8.46e-01 -0.013 0.0673 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 2.32e-01 0.0841 0.0702 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 2.10e-01 0.0676 0.0537 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0401 0.0816 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 7.46e-01 0.0237 0.0731 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 5.65e-01 0.0457 0.0792 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 1.42e-02 0.229 0.0928 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 1.92e-02 0.134 0.0568 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 1.64e-01 0.123 0.088 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 1.07e-01 0.123 0.0762 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 2.49e-01 0.0789 0.0683 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0981 0.0892 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 3.38e-01 0.0802 0.0835 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00663 0.0819 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0723 0.116 0.291 gdT L2
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 6.52e-01 0.0478 0.106 0.291 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 2.51e-03 -0.349 0.114 0.291 gdT L2
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 2.25e-01 -0.136 0.111 0.291 gdT L2
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00555 0.12 0.291 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 2.81e-01 -0.128 0.118 0.291 gdT L2
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 4.67e-01 0.0854 0.117 0.291 gdT L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0776 0.113 0.291 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 1.16e-01 0.157 0.0995 0.264 intMono L2
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 5.79e-01 0.0393 0.0707 0.264 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0688 0.102 0.264 intMono L2
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 6.53e-01 0.0369 0.0818 0.264 intMono L2
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0383 0.0797 0.264 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 5.92e-01 0.0544 0.101 0.264 intMono L2
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 3.75e-02 0.182 0.087 0.264 intMono L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0187 0.0997 0.264 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 2.48e-01 0.108 0.0934 0.26 ncMono L2
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 1.21e-01 0.122 0.0784 0.26 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 5.35e-02 0.179 0.092 0.26 ncMono L2
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 4.19e-01 0.049 0.0604 0.26 ncMono L2
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 2.66e-01 0.0834 0.0748 0.26 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0419 0.0961 0.26 ncMono L2
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 1.81e-01 0.121 0.0899 0.26 ncMono L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 7.97e-01 0.0204 0.0793 0.26 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00166 0.102 0.266 pDC L2
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 7.70e-01 0.0237 0.0809 0.266 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 2.61e-01 -0.11 0.098 0.266 pDC L2
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 2.45e-01 -0.12 0.103 0.266 pDC L2
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 1.68e-01 -0.132 0.0953 0.266 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0369 0.107 0.266 pDC L2
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 5.47e-02 0.209 0.108 0.266 pDC L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00789 0.0896 0.266 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 4.97e-01 0.0647 0.095 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0848 0.0872 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 2.27e-01 0.115 0.0945 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00695 0.0658 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 1.17e-01 -0.138 0.0877 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 4.84e-01 -0.052 0.0742 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 2.82e-01 0.101 0.0935 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 1.31e-01 0.112 0.0737 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 3.60e-01 -0.082 0.0893 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0954 0.075 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 7.27e-01 0.0284 0.0812 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 3.14e-01 0.0614 0.0608 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0931 0.0853 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 8.54e-01 0.0148 0.0801 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 2.95e-01 0.0911 0.0868 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 8.34e-01 0.0162 0.0771 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 4.04e-01 0.0682 0.0815 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 1.59e-01 0.0711 0.0503 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 6.86e-01 0.0262 0.0647 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 1.46e-01 0.101 0.069 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 8.12e-02 0.0945 0.054 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 3.43e-01 -0.069 0.0726 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 4.29e-01 0.0541 0.0683 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 5.70e-01 0.0406 0.0713 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 9.94e-02 0.159 0.0962 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 1.58e-01 0.097 0.0685 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 5.02e-01 0.0609 0.0906 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 2.87e-01 0.05 0.0468 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0341 0.0645 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00655 0.0898 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 2.45e-02 0.189 0.0834 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 8.31e-01 0.0155 0.0726 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 -727875 sc-eQTL 8.36e-01 0.0163 0.0786 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 877656 sc-eQTL 9.30e-01 0.00759 0.0859 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L -671627 sc-eQTL 1.42e-01 -0.0967 0.0657 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO 955735 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0728 0.0747 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 826106 sc-eQTL 9.09e-01 0.00868 0.0763 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 -795893 sc-eQTL 5.46e-01 0.0404 0.0668 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP 826134 sc-eQTL 4.33e-01 0.0639 0.0813 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 954825 sc-eQTL 9.05e-01 0.0092 0.0769 0.259 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000245017 \N 967392 2.74e-07 1.25e-07 4.08e-08 1.82e-07 9.25e-08 1e-07 1.49e-07 5.4e-08 1.45e-07 4.94e-08 1.57e-07 8.68e-08 1.45e-07 6.76e-08 6.02e-08 7.53e-08 3.93e-08 1.26e-07 5.39e-08 4.04e-08 1.08e-07 1.28e-07 1.39e-07 3.49e-08 1.46e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.65e-08 1.09e-07 1.07e-07 9.7e-08 3.87e-08 3.35e-08 8.44e-08 7.66e-08 3.95e-08 5.01e-08 9.23e-08 6.55e-08 3.77e-08 5.13e-08 1.33e-07 4.52e-08 2.79e-08 5.59e-08 1.83e-08 1.19e-07 3.92e-09 4.81e-08
ENSG00000257489 \N -728536 2.95e-07 1.42e-07 5.82e-08 2.05e-07 9.82e-08 8.21e-08 1.99e-07 5.68e-08 1.66e-07 7.6e-08 1.63e-07 1.23e-07 2.05e-07 8.13e-08 5.43e-08 8.08e-08 4.31e-08 1.64e-07 6.92e-08 5.07e-08 1.27e-07 1.42e-07 1.62e-07 3.07e-08 1.98e-07 1.31e-07 1.17e-07 1.04e-07 1.34e-07 1.07e-07 1.09e-07 3.99e-08 3.13e-08 9.52e-08 3.07e-08 3.22e-08 5.8e-08 9.03e-08 6.42e-08 3.67e-08 5.65e-08 1.5e-07 5.27e-08 1.55e-08 3.4e-08 1.8e-08 1e-07 1.89e-09 4.8e-08