logo

Genes within 1Mb (chr12:97896018:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0816 0.0883 0.115 B L1
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 9.67e-01 0.00312 0.0755 0.115 B L1
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0144 0.101 0.115 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0749 0.127 0.115 B L1
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 6.81e-01 0.0425 0.103 0.115 B L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0212 0.095 0.115 B L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00476 0.106 0.115 CD4T L1
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 8.50e-01 0.016 0.0845 0.115 CD4T L1
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 7.60e-01 0.025 0.0818 0.115 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 9.50e-02 0.154 0.0919 0.115 CD4T L1
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 9.77e-01 0.00332 0.114 0.115 CD4T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 4.01e-02 0.171 0.0828 0.115 CD4T L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0772 0.0861 0.115 CD8T L1
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0757 0.0788 0.115 CD8T L1
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 1.90e-01 -0.125 0.0952 0.115 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00613 0.104 0.115 CD8T L1
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 1.85e-01 0.171 0.128 0.115 CD8T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00586 0.093 0.115 CD8T L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 1.43e-01 -0.13 0.0886 0.115 DC L1
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 4.77e-01 0.0857 0.12 0.115 DC L1
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 1.36e-01 -0.149 0.0994 0.115 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 2.49e-01 0.156 0.135 0.115 DC L1
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 4.53e-01 0.0993 0.132 0.115 DC L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 1.87e-01 0.151 0.114 0.115 DC L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0668 0.073 0.115 Mono L1
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 8.88e-01 0.0125 0.0885 0.115 Mono L1
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0641 0.0683 0.115 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 1.17e-01 0.195 0.124 0.115 Mono L1
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00782 0.0914 0.115 Mono L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 8.29e-01 0.0203 0.094 0.115 Mono L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 7.56e-01 0.0365 0.117 0.116 NK L1
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 7.74e-01 0.0285 0.0993 0.116 NK L1
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 4.47e-02 0.207 0.103 0.116 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 4.79e-01 0.0795 0.112 0.116 NK L1
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0799 0.108 0.116 NK L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 7.97e-01 0.0268 0.104 0.116 NK L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0202 0.1 0.115 Other_T L1
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 4.35e-01 0.0463 0.0592 0.115 Other_T L1
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 9.56e-01 0.00666 0.121 0.115 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 1.78e-01 -0.176 0.13 0.115 Other_T L1
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0697 0.104 0.115 Other_T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0951 0.0846 0.115 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0127 0.145 0.133 B_Activated L2
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 9.87e-02 0.221 0.133 0.133 B_Activated L2
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 9.37e-01 0.0119 0.15 0.133 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 6.06e-01 0.0741 0.143 0.133 B_Activated L2
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 2.65e-01 0.168 0.15 0.133 B_Activated L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 7.95e-01 0.0345 0.133 0.133 B_Activated L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 9.10e-01 0.014 0.124 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 1.39e-01 -0.15 0.101 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 3.94e-01 -0.111 0.13 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 3.48e-01 0.132 0.14 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 3.08e-01 -0.133 0.13 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 2.44e-01 0.137 0.117 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 3.59e-01 -0.112 0.122 0.114 B_Memory L2
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0452 0.123 0.114 B_Memory L2
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 3.02e-01 -0.146 0.141 0.114 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0323 0.142 0.114 B_Memory L2
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 3.34e-01 0.135 0.139 0.114 B_Memory L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0617 0.132 0.114 B_Memory L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 6.59e-01 -0.047 0.106 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 8.95e-01 0.011 0.0828 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0717 0.125 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 2.23e-01 -0.167 0.136 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0208 0.132 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00324 0.117 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 9.68e-01 0.00536 0.131 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 4.02e-01 0.0931 0.111 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 2.45e-01 0.149 0.128 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 6.41e-01 0.068 0.145 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 4.12e-01 0.104 0.126 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 1.95e-01 0.157 0.121 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 3.28e-01 0.128 0.131 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 3.79e-01 -0.111 0.125 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0166 0.134 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 8.10e-01 0.0349 0.145 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 5.41e-01 -0.081 0.132 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 8.24e-01 0.0309 0.139 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 4.69e-01 -0.075 0.103 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 9.56e-01 0.00522 0.0934 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 9.48e-01 0.00645 0.0987 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 1.03e-01 0.164 0.0999 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0414 0.112 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 3.60e-02 0.205 0.0973 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 7.52e-01 0.032 0.101 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 9.15e-01 0.00981 0.0917 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 1.91e-01 0.148 0.113 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 9.11e-02 0.195 0.115 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 3.76e-01 0.115 0.129 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 5.17e-01 0.0638 0.0982 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0119 0.124 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 4.84e-01 0.0818 0.117 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 5.58e-01 0.0778 0.133 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 3.19e-01 0.137 0.137 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0484 0.145 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 5.32e-01 0.0783 0.125 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0807 0.12 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 8.87e-01 -0.016 0.113 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 3.86e-01 -0.109 0.126 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0346 0.125 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 5.71e-01 0.0763 0.134 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0253 0.124 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0892 0.113 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0302 0.108 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 3.42e-01 -0.126 0.132 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 4.35e-01 0.0939 0.12 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 4.68e-01 0.0995 0.137 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0895 0.113 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 1.08e-02 -0.36 0.14 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0338 0.119 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0639 0.135 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 2.82e-01 -0.146 0.136 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 2.20e-01 0.169 0.137 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 2.14e-01 0.171 0.137 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 8.69e-01 0.0202 0.122 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 7.11e-01 0.0464 0.125 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 1.27e-01 -0.219 0.143 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 7.21e-01 0.052 0.145 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 4.49e-01 0.108 0.143 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0372 0.134 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 8.85e-02 -0.226 0.132 0.117 MAIT L2
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 2.80e-01 -0.138 0.127 0.117 MAIT L2
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0442 0.126 0.117 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 2.28e-01 -0.165 0.136 0.117 MAIT L2
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 5.42e-01 0.0792 0.13 0.117 MAIT L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 3.10e-01 -0.136 0.133 0.117 MAIT L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 3.86e-01 -0.108 0.125 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 2.82e-01 -0.137 0.127 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0494 0.142 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 9.80e-01 0.00347 0.142 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 8.85e-01 0.019 0.132 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 2.57e-01 -0.162 0.143 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 4.42e-01 0.097 0.126 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 4.39e-01 0.0852 0.11 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 5.58e-02 0.22 0.114 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 7.82e-01 0.0352 0.127 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0603 0.121 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 6.61e-01 0.0536 0.122 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 6.57e-01 0.0614 0.138 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 1.60e-01 0.204 0.144 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 3.28e-01 0.141 0.144 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 4.06e-02 -0.286 0.139 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 5.69e-01 0.0832 0.146 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 3.51e-01 -0.128 0.137 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0731 0.133 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 4.26e-01 0.0918 0.115 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 4.99e-01 0.0856 0.126 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 4.44e-01 0.103 0.135 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 9.75e-01 -0.0042 0.135 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 1.79e-01 0.175 0.13 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 5.36e-01 -0.057 0.0919 0.119 PB L2
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 5.73e-02 0.33 0.172 0.119 PB L2
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000169 0.163 0.119 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 8.75e-01 0.0285 0.18 0.119 PB L2
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00589 0.122 0.119 PB L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 7.49e-02 0.287 0.16 0.119 PB L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0949 0.0877 0.115 Pro_T L2
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000769 0.0726 0.115 Pro_T L2
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00327 0.145 0.115 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0888 0.13 0.115 Pro_T L2
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 7.97e-01 0.0263 0.102 0.115 Pro_T L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 1.69e-01 -0.155 0.112 0.115 Pro_T L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0457 0.131 0.115 Treg L2
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 7.73e-01 0.0329 0.114 0.115 Treg L2
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 8.43e-02 -0.242 0.139 0.115 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 4.77e-01 0.101 0.141 0.115 Treg L2
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 6.18e-01 0.0676 0.135 0.115 Treg L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 4.08e-01 0.101 0.122 0.115 Treg L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 2.06e-01 -0.133 0.105 0.117 cDC L2
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 3.16e-01 0.132 0.131 0.117 cDC L2
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 4.80e-02 -0.206 0.103 0.117 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 4.13e-01 0.117 0.142 0.117 cDC L2
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 2.89e-01 0.142 0.134 0.117 cDC L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 1.11e-01 0.211 0.132 0.117 cDC L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 4.07e-02 -0.142 0.069 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0236 0.0981 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0847 0.0748 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 8.43e-01 0.0266 0.134 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 6.89e-01 0.0407 0.102 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 4.54e-01 0.0828 0.11 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 9.96e-01 0.000431 0.0789 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 4.47e-01 0.08 0.105 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0515 0.0939 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 4.71e-04 0.491 0.138 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0688 0.115 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 6.25e-01 -0.055 0.112 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 4.90e-01 -0.115 0.167 0.094 gdT L2
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 1.16e-02 0.442 0.173 0.094 gdT L2
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 5.58e-01 0.111 0.189 0.094 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0181 0.188 0.094 gdT L2
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 7.15e-01 0.0678 0.185 0.094 gdT L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 4.37e-01 0.139 0.179 0.094 gdT L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 6.46e-02 -0.181 0.0976 0.116 intMono L2
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 8.98e-01 0.0146 0.114 0.116 intMono L2
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0146 0.111 0.116 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 8.81e-02 -0.233 0.136 0.116 intMono L2
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 3.96e-01 -0.104 0.122 0.116 intMono L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0846 0.139 0.116 intMono L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 1.74e-01 -0.152 0.111 0.115 ncMono L2
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 1.46e-01 0.125 0.0855 0.115 ncMono L2
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0756 0.106 0.115 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 4.92e-01 -0.085 0.124 0.115 ncMono L2
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 4.36e-01 0.1 0.128 0.115 ncMono L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 4.43e-01 0.0864 0.113 0.115 ncMono L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0581 0.114 0.11 pDC L2
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0341 0.145 0.11 pDC L2
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 3.88e-01 -0.116 0.134 0.11 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 9.99e-01 9.44e-05 0.149 0.11 pDC L2
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 2.73e-01 0.168 0.153 0.11 pDC L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0411 0.126 0.11 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 3.56e-01 -0.115 0.124 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0455 0.0934 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0753 0.125 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0244 0.141 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 6.86e-01 0.054 0.133 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 5.51e-01 0.0629 0.105 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0481 0.106 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 4.11e-01 0.0703 0.0854 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 8.96e-01 0.0157 0.12 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0949 0.136 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 7.64e-01 0.0367 0.122 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 8.58e-01 0.0194 0.108 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0533 0.0698 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 8.25e-01 0.0212 0.0957 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0432 0.075 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 2.50e-02 0.304 0.134 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 7.68e-01 0.0279 0.0945 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 6.55e-01 0.0442 0.0986 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 1.35e-02 -0.238 0.0955 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 5.76e-01 0.037 0.066 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0433 0.0908 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 1.24e-01 -0.194 0.126 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0702 0.119 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0624 0.102 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -697573 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0356 0.118 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -619494 sc-eQTL 4.57e-01 0.0766 0.103 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -749123 sc-eQTL 4.52e-02 0.209 0.104 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 988795 sc-eQTL 5.27e-01 0.0724 0.114 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -749095 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0919 0.112 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -620404 sc-eQTL 5.85e-01 0.0578 0.106 0.116 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 988795 eQTL 0.0351 -0.0729 0.0345 0.0 0.0 0.124

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina