logo

Genes within 1Mb (chr12:97889490:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 2.90e-01 -0.094 0.0886 0.113 B L1
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0152 0.0758 0.113 B L1
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 9.92e-01 0.00099 0.102 0.113 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0762 0.127 0.113 B L1
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 7.11e-01 0.0385 0.104 0.113 B L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0311 0.0954 0.113 B L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 8.28e-01 -0.023 0.106 0.113 CD4T L1
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 8.66e-01 0.0143 0.0846 0.113 CD4T L1
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 6.89e-01 0.0328 0.0819 0.113 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 1.22e-01 0.143 0.0921 0.113 CD4T L1
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00847 0.115 0.113 CD4T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 6.08e-02 0.157 0.0831 0.113 CD4T L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 2.71e-01 -0.095 0.0861 0.113 CD8T L1
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0744 0.079 0.113 CD8T L1
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 1.70e-01 -0.131 0.0953 0.113 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000341 0.105 0.113 CD8T L1
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 3.04e-01 0.133 0.129 0.113 CD8T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0167 0.0931 0.113 CD8T L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 1.22e-01 -0.139 0.0892 0.113 DC L1
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 4.48e-01 0.0921 0.121 0.113 DC L1
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 1.18e-01 -0.157 0.0999 0.113 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 3.35e-01 0.131 0.136 0.113 DC L1
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 6.20e-01 0.0661 0.133 0.113 DC L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 3.04e-01 0.119 0.115 0.113 DC L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0883 0.0732 0.113 Mono L1
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 8.09e-01 0.0215 0.0888 0.113 Mono L1
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0512 0.0686 0.113 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 1.55e-01 0.178 0.124 0.113 Mono L1
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0293 0.0917 0.113 Mono L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 9.41e-01 0.00701 0.0944 0.113 Mono L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 8.53e-01 0.0218 0.118 0.114 NK L1
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 7.45e-01 0.0325 0.0996 0.114 NK L1
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 3.89e-02 0.214 0.103 0.114 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 4.91e-01 0.0777 0.112 0.114 NK L1
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0836 0.108 0.114 NK L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 9.20e-01 0.0104 0.104 0.114 NK L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0431 0.101 0.113 Other_T L1
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 5.65e-01 0.0343 0.0595 0.113 Other_T L1
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 9.90e-01 0.00156 0.122 0.113 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 1.42e-01 -0.192 0.13 0.113 Other_T L1
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0898 0.105 0.113 Other_T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 1.94e-01 -0.111 0.0849 0.113 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0186 0.145 0.13 B_Activated L2
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 1.06e-01 0.217 0.134 0.13 B_Activated L2
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 7.57e-01 0.0464 0.15 0.13 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 5.67e-01 0.0824 0.144 0.13 B_Activated L2
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 1.91e-01 0.197 0.15 0.13 B_Activated L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 9.40e-01 0.01 0.133 0.13 B_Activated L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0119 0.125 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 8.78e-02 -0.173 0.101 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0908 0.131 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 3.44e-01 0.134 0.141 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 3.52e-01 -0.122 0.131 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 3.14e-01 0.119 0.118 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 3.17e-01 -0.122 0.122 0.112 B_Memory L2
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0599 0.123 0.112 B_Memory L2
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 2.77e-01 -0.154 0.141 0.112 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0245 0.143 0.112 B_Memory L2
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 3.26e-01 0.138 0.14 0.112 B_Memory L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0845 0.133 0.112 B_Memory L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0512 0.107 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00234 0.0832 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0588 0.125 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 2.03e-01 -0.175 0.137 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0154 0.132 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 8.59e-01 -0.021 0.118 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00436 0.132 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 4.25e-01 0.0891 0.111 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 3.20e-01 0.129 0.129 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 6.27e-01 0.0712 0.146 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 5.70e-01 0.0722 0.127 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 2.05e-01 0.154 0.121 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 4.39e-01 0.102 0.131 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 3.41e-01 -0.12 0.126 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 9.37e-01 0.0107 0.135 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 9.95e-01 0.000905 0.146 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0795 0.133 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0293 0.139 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0922 0.103 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 9.80e-01 0.00233 0.0936 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 9.14e-01 0.0107 0.0989 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 1.27e-01 0.153 0.1 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0537 0.112 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 4.58e-02 0.196 0.0975 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 8.69e-01 0.0168 0.101 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0063 0.0919 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 1.67e-01 0.157 0.113 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 9.62e-02 0.193 0.115 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 3.67e-01 0.117 0.13 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 5.40e-01 0.0605 0.0985 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0363 0.124 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 4.43e-01 0.0899 0.117 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 6.74e-01 0.056 0.133 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 5.18e-01 0.0892 0.138 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0145 0.146 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 6.22e-01 0.062 0.125 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0806 0.121 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0198 0.113 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 3.79e-01 -0.111 0.126 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00891 0.126 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 7.46e-01 0.0438 0.135 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0618 0.125 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 3.22e-01 -0.113 0.113 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0323 0.108 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 2.96e-01 -0.139 0.133 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 4.46e-01 0.0918 0.12 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 6.40e-01 0.0643 0.137 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0922 0.113 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 6.81e-03 -0.384 0.14 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0316 0.119 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 5.08e-01 -0.09 0.136 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 2.94e-01 -0.143 0.136 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 2.87e-01 0.147 0.138 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 2.54e-01 0.158 0.138 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 9.55e-01 0.00687 0.123 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 9.86e-01 -0.0022 0.126 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 1.57e-01 -0.204 0.143 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 5.70e-01 0.0829 0.146 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 4.81e-01 0.101 0.143 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0994 0.134 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 5.16e-02 -0.26 0.133 0.115 MAIT L2
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 2.68e-01 -0.141 0.127 0.115 MAIT L2
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0582 0.126 0.115 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 1.66e-01 -0.19 0.136 0.115 MAIT L2
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 5.86e-01 0.0709 0.13 0.115 MAIT L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 2.38e-01 -0.158 0.134 0.115 MAIT L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 3.12e-01 -0.127 0.126 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 2.58e-01 -0.145 0.128 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0294 0.143 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 9.19e-01 0.0145 0.142 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 9.76e-01 0.00402 0.133 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 2.43e-01 -0.168 0.144 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 5.21e-01 0.0813 0.126 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 3.58e-01 0.102 0.11 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 3.61e-02 0.242 0.115 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 7.62e-01 0.0386 0.127 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0594 0.121 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 6.93e-01 0.0485 0.123 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 7.78e-01 0.0392 0.139 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 1.27e-01 0.223 0.145 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 5.07e-01 0.0964 0.145 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 3.36e-02 -0.299 0.14 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 5.41e-01 0.0898 0.147 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 3.06e-01 -0.141 0.138 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0838 0.133 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 5.30e-01 0.0728 0.116 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 5.70e-01 0.0724 0.127 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 5.23e-01 0.0867 0.136 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0164 0.136 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 2.77e-01 0.142 0.131 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 5.36e-01 -0.057 0.0919 0.119 PB L2
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 5.73e-02 0.33 0.172 0.119 PB L2
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000169 0.163 0.119 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 8.75e-01 0.0285 0.18 0.119 PB L2
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00589 0.122 0.119 PB L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 7.49e-02 0.287 0.16 0.119 PB L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 2.44e-01 -0.103 0.088 0.113 Pro_T L2
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0164 0.0729 0.113 Pro_T L2
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0203 0.146 0.113 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0729 0.131 0.113 Pro_T L2
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 9.52e-01 0.00621 0.102 0.113 Pro_T L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 1.19e-01 -0.176 0.112 0.113 Pro_T L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0358 0.131 0.113 Treg L2
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 7.02e-01 0.0437 0.114 0.113 Treg L2
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 9.87e-02 -0.232 0.14 0.113 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 4.27e-01 0.113 0.142 0.113 Treg L2
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 7.61e-01 0.0414 0.136 0.113 Treg L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 4.81e-01 0.0861 0.122 0.113 Treg L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 1.89e-01 -0.14 0.106 0.115 cDC L2
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 2.32e-01 0.159 0.132 0.115 cDC L2
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 5.23e-02 -0.204 0.105 0.115 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 6.00e-01 0.0756 0.144 0.115 cDC L2
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 4.13e-01 0.111 0.136 0.115 cDC L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 1.83e-01 0.179 0.134 0.115 cDC L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 1.56e-02 -0.168 0.069 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0136 0.0985 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 3.01e-01 -0.078 0.0752 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 9.07e-01 0.0157 0.135 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 8.42e-01 0.0204 0.102 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 5.02e-01 0.0745 0.111 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0064 0.0792 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 4.23e-01 0.0847 0.105 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0355 0.0943 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 8.72e-04 0.47 0.139 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0918 0.115 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0836 0.113 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 3.14e-01 -0.17 0.168 0.091 gdT L2
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 3.31e-02 0.377 0.175 0.091 gdT L2
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 4.51e-01 0.144 0.191 0.091 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 9.50e-01 -0.012 0.19 0.091 gdT L2
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 8.91e-01 0.0256 0.187 0.091 gdT L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 5.04e-01 0.121 0.18 0.091 gdT L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 3.91e-02 -0.203 0.0978 0.113 intMono L2
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 9.06e-01 0.0136 0.114 0.113 intMono L2
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 8.86e-01 -0.016 0.111 0.113 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 6.73e-02 -0.251 0.136 0.113 intMono L2
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 3.78e-01 -0.108 0.123 0.113 intMono L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0878 0.139 0.113 intMono L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 1.31e-01 -0.17 0.112 0.113 ncMono L2
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 1.37e-01 0.128 0.086 0.113 ncMono L2
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0712 0.107 0.113 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 4.46e-01 -0.095 0.124 0.113 ncMono L2
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 5.49e-01 0.0774 0.129 0.113 ncMono L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 5.89e-01 0.0614 0.113 0.113 ncMono L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0683 0.115 0.107 pDC L2
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0481 0.147 0.107 pDC L2
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 2.68e-01 -0.15 0.135 0.107 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0247 0.15 0.107 pDC L2
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 3.40e-01 0.148 0.154 0.107 pDC L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0573 0.127 0.107 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 2.79e-01 -0.135 0.124 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0644 0.0938 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0519 0.126 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0187 0.142 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 5.80e-01 0.0741 0.134 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 6.83e-01 0.0432 0.106 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0564 0.106 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 5.25e-01 0.0547 0.0859 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 8.65e-01 0.0206 0.121 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0998 0.136 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 8.30e-01 0.0264 0.123 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 9.39e-01 0.00827 0.109 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0741 0.07 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 7.59e-01 0.0295 0.0961 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0291 0.0754 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 3.32e-02 0.29 0.135 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 9.65e-01 0.00421 0.0949 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 7.72e-01 0.0287 0.099 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 6.75e-03 -0.262 0.0957 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 5.62e-01 0.0385 0.0663 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0395 0.0913 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 9.65e-02 -0.211 0.126 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0819 0.119 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0824 0.102 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -704101 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0518 0.119 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -626022 sc-eQTL 4.21e-01 0.0832 0.103 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -755651 sc-eQTL 4.48e-02 0.211 0.104 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 982267 sc-eQTL 5.61e-01 0.0669 0.115 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -755623 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0952 0.112 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -626932 sc-eQTL 7.12e-01 0.0393 0.106 0.114 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 982267 eQTL 0.0418 -0.0703 0.0345 0.0 0.0 0.125

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina