logo

Genes within 1Mb (chr12:97878493:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 6.05e-01 0.0319 0.0615 0.261 B L1
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0483 0.0524 0.261 B L1
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0191 0.0706 0.261 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 3.72e-01 0.0788 0.0881 0.261 B L1
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 8.71e-01 0.0117 0.0719 0.261 B L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0905 0.0658 0.261 B L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 9.98e-01 -0.00017 0.0763 0.261 CD4T L1
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0547 0.0609 0.261 CD4T L1
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 1.28e-02 -0.146 0.0582 0.261 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 6.96e-02 0.121 0.0663 0.261 CD4T L1
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 2.23e-01 0.101 0.0823 0.261 CD4T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 6.06e-03 -0.165 0.0593 0.261 CD4T L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0267 0.0629 0.261 CD8T L1
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 3.63e-01 0.0525 0.0575 0.261 CD8T L1
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 1.24e-01 -0.107 0.0694 0.261 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 2.85e-02 0.166 0.0754 0.261 CD8T L1
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 3.33e-01 -0.091 0.0938 0.261 CD8T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0327 0.0678 0.261 CD8T L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 1.05e-01 0.105 0.0646 0.257 DC L1
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00434 0.0879 0.257 DC L1
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 3.24e-01 0.0719 0.0728 0.257 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 9.41e-01 0.00737 0.0988 0.257 DC L1
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 4.33e-01 0.0758 0.0965 0.257 DC L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0862 0.0837 0.257 DC L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 7.91e-01 0.0138 0.0518 0.261 Mono L1
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 1.43e-01 -0.0918 0.0624 0.261 Mono L1
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 5.83e-02 0.0915 0.0481 0.261 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 1.94e-01 0.115 0.0879 0.261 Mono L1
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00461 0.0648 0.261 Mono L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 4.89e-02 -0.131 0.066 0.261 Mono L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 8.08e-01 0.021 0.086 0.26 NK L1
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00531 0.0727 0.26 NK L1
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00796 0.0758 0.26 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 4.14e-01 0.0671 0.082 0.26 NK L1
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 9.43e-01 0.00568 0.079 0.26 NK L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 6.75e-01 0.0318 0.0759 0.26 NK L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 8.78e-01 0.0111 0.0717 0.261 Other_T L1
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0394 0.0424 0.261 Other_T L1
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 3.13e-01 0.0876 0.0865 0.261 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 9.58e-01 0.0049 0.0935 0.261 Other_T L1
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0142 0.0747 0.261 Other_T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00255 0.0608 0.261 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 2.71e-01 0.127 0.115 0.26 B_Activated L2
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 9.67e-01 0.00451 0.107 0.26 B_Activated L2
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 5.60e-01 0.0697 0.119 0.26 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 8.14e-01 -0.027 0.114 0.26 B_Activated L2
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 1.07e-01 0.193 0.119 0.26 B_Activated L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 5.15e-01 0.0691 0.106 0.26 B_Activated L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 6.48e-01 0.0404 0.0883 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 4.82e-01 0.0506 0.0719 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 7.05e-01 0.0352 0.0926 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 4.85e-01 0.0698 0.0998 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0307 0.0927 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0448 0.0836 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 5.73e-01 -0.049 0.087 0.259 B_Memory L2
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0107 0.0878 0.259 B_Memory L2
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 6.75e-01 0.0423 0.101 0.259 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 6.41e-01 0.0475 0.102 0.259 B_Memory L2
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 1.61e-01 0.14 0.0994 0.259 B_Memory L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 7.72e-01 0.0274 0.0945 0.259 B_Memory L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 7.55e-01 0.0236 0.0757 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 6.92e-01 0.0233 0.0589 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0174 0.0886 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 3.96e-01 0.0826 0.0971 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 7.17e-01 -0.034 0.0936 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0558 0.0834 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 9.53e-01 0.0055 0.0942 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0867 0.0793 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 9.98e-01 0.00025 0.0921 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 1.97e-01 -0.134 0.104 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 2.12e-01 -0.113 0.0901 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 4.00e-02 -0.178 0.0859 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 5.39e-02 -0.185 0.0955 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 7.98e-01 0.0236 0.0923 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 3.11e-01 -0.1 0.0985 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 9.58e-01 0.00569 0.107 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 3.58e-01 0.0894 0.097 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 2.90e-02 -0.222 0.101 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 5.22e-01 0.0478 0.0745 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0691 0.0672 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0696 0.071 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 5.40e-02 0.139 0.0718 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 5.64e-02 0.153 0.0799 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 1.62e-02 -0.169 0.0699 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 2.26e-01 -0.088 0.0725 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0372 0.0659 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 3.79e-03 -0.235 0.0801 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0362 0.0833 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 8.72e-01 0.015 0.0931 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0873 0.0704 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0697 0.0895 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0379 0.0847 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00259 0.0962 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 1.28e-01 0.151 0.0991 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0624 0.105 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 2.06e-01 -0.114 0.0903 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0853 0.0859 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 5.67e-01 0.0461 0.0804 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0105 0.0898 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 7.69e-01 0.0264 0.0895 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0745 0.0959 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0246 0.0886 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0697 0.0819 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 5.82e-01 0.0431 0.0781 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0293 0.096 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 2.08e-01 0.11 0.0868 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 3.13e-01 -0.1 0.0992 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0586 0.082 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 8.03e-01 -0.026 0.104 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 3.56e-01 0.0801 0.0866 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 4.86e-02 -0.194 0.0978 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 5.41e-03 0.274 0.0974 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 5.79e-02 -0.19 0.0995 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0937 0.101 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0962 0.088 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 6.67e-01 0.0389 0.0904 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 3.16e-01 -0.104 0.103 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 3.19e-01 0.104 0.105 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00972 0.103 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0421 0.0965 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 4.85e-01 0.066 0.0944 0.262 MAIT L2
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 2.24e-01 -0.11 0.09 0.262 MAIT L2
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 6.18e-01 0.0445 0.089 0.262 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 6.08e-01 0.0497 0.0967 0.262 MAIT L2
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 2.32e-01 -0.11 0.0916 0.262 MAIT L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0656 0.0946 0.262 MAIT L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 2.27e-01 -0.108 0.089 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 1.76e-01 0.123 0.0907 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 9.77e-01 0.0029 0.101 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 9.51e-02 0.168 0.1 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 6.95e-02 0.17 0.0933 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 6.21e-03 0.277 0.1 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 7.84e-01 0.0251 0.0917 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0608 0.0799 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 1.33e-01 0.126 0.0835 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0328 0.0922 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00559 0.088 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 2.82e-01 0.0957 0.0887 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0332 0.096 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0976 0.101 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 4.66e-01 0.0731 0.1 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 5.09e-01 0.0645 0.0974 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0397 0.101 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 1.50e-01 -0.137 0.0947 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0294 0.0945 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 8.20e-01 0.0187 0.0819 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 6.17e-02 -0.168 0.0892 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 7.75e-01 0.0275 0.096 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0492 0.0958 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 1.16e-01 -0.145 0.0921 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 1.51e-01 0.101 0.0701 0.259 PB L2
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 4.36e-01 -0.104 0.134 0.259 PB L2
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0353 0.125 0.259 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0629 0.139 0.259 PB L2
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 2.31e-01 -0.112 0.093 0.259 PB L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 8.90e-01 0.0173 0.124 0.259 PB L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 8.14e-01 0.0149 0.063 0.257 Pro_T L2
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0666 0.0519 0.257 Pro_T L2
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 3.49e-02 -0.219 0.103 0.257 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 5.20e-03 0.259 0.0917 0.257 Pro_T L2
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0489 0.073 0.257 Pro_T L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0473 0.0805 0.257 Pro_T L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0322 0.0943 0.261 Treg L2
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0935 0.0819 0.261 Treg L2
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00158 0.101 0.261 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 4.05e-01 0.0852 0.102 0.261 Treg L2
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 9.22e-01 0.00955 0.0978 0.261 Treg L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 2.38e-01 -0.104 0.0876 0.261 Treg L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 7.27e-02 0.139 0.0769 0.249 cDC L2
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0764 0.0966 0.249 cDC L2
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 5.88e-01 0.0417 0.0768 0.249 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0305 0.105 0.249 cDC L2
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 7.33e-01 0.0338 0.0989 0.249 cDC L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0618 0.0975 0.249 cDC L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 8.79e-01 0.00755 0.0495 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0715 0.0696 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 5.60e-01 0.0312 0.0533 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 1.46e-01 0.139 0.0951 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 1.33e-01 -0.109 0.072 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 9.75e-02 -0.13 0.078 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 7.98e-01 0.0145 0.0566 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 5.25e-02 -0.146 0.0748 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 6.20e-02 0.126 0.0669 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 6.60e-01 -0.045 0.102 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 3.55e-01 0.0763 0.0822 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0886 0.0804 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 1.50e-01 0.16 0.11 0.264 gdT L2
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 9.07e-01 0.0137 0.117 0.264 gdT L2
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 6.08e-01 0.0648 0.126 0.264 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 3.45e-01 -0.118 0.125 0.264 gdT L2
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 6.47e-01 0.0564 0.123 0.264 gdT L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 1.46e-01 -0.173 0.118 0.264 gdT L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 1.65e-01 -0.096 0.0689 0.264 intMono L2
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0689 0.0798 0.264 intMono L2
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 7.00e-01 -0.03 0.0779 0.264 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 9.44e-01 0.00672 0.0962 0.264 intMono L2
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 9.25e-01 0.00814 0.086 0.264 intMono L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 1.71e-01 -0.133 0.0971 0.264 intMono L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 6.32e-02 0.146 0.0784 0.26 ncMono L2
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 1.47e-01 -0.0879 0.0603 0.26 ncMono L2
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0167 0.0752 0.26 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 5.08e-03 0.243 0.0856 0.26 ncMono L2
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 6.95e-01 0.0356 0.0905 0.26 ncMono L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 1.72e-01 -0.109 0.0791 0.26 ncMono L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 7.19e-01 0.0293 0.0814 0.274 pDC L2
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 8.37e-01 0.0214 0.104 0.274 pDC L2
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 2.13e-01 0.12 0.0961 0.274 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 1.73e-01 0.145 0.106 0.274 pDC L2
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 6.70e-01 0.0469 0.11 0.274 pDC L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 2.34e-02 -0.203 0.0887 0.274 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0287 0.0864 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 5.37e-01 0.0401 0.065 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00651 0.0872 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 1.79e-01 0.132 0.0978 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00646 0.0927 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 9.78e-01 0.00198 0.0733 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0072 0.0751 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 8.95e-01 -0.00803 0.0608 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0232 0.0852 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 9.96e-01 0.000432 0.0965 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0585 0.0866 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0985 0.0765 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 5.67e-01 0.0285 0.0498 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 2.24e-01 -0.083 0.068 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 5.31e-02 0.103 0.053 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 4.80e-01 0.0685 0.0969 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0203 0.0674 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 4.65e-02 -0.139 0.0696 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 7.06e-01 0.0255 0.0675 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 3.55e-02 -0.0963 0.0455 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 6.47e-01 -0.029 0.0632 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 6.68e-02 0.161 0.0873 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 5.20e-01 0.0532 0.0826 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 3.70e-02 -0.148 0.0704 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -715098 sc-eQTL 8.29e-01 0.0187 0.0861 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -637019 sc-eQTL 9.14e-01 0.00814 0.0751 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -766648 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00145 0.0765 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 971270 sc-eQTL 8.97e-01 0.0108 0.0835 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -766620 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0288 0.0817 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00443 0.0771 0.259 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -637929 eQTL 0.0554 -0.058 0.0303 0.00105 0.0 0.224

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina