logo

Genes within 1Mb (chr12:97866937:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 8.66e-02 -0.139 0.081 0.13 B L1
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 9.17e-01 0.00725 0.0696 0.13 B L1
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0414 0.0934 0.13 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0445 0.117 0.13 B L1
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 4.81e-01 0.0671 0.0951 0.13 B L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0359 0.0875 0.13 B L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0928 0.0982 0.13 CD4T L1
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0209 0.0787 0.13 CD4T L1
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 5.21e-01 0.0489 0.0761 0.13 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 3.82e-01 0.0753 0.086 0.13 CD4T L1
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0511 0.106 0.13 CD4T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 8.07e-02 0.136 0.0773 0.13 CD4T L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 7.32e-02 -0.143 0.0794 0.13 CD8T L1
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 1.82e-01 -0.0978 0.073 0.13 CD8T L1
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 1.58e-01 -0.125 0.0883 0.13 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 7.26e-01 -0.034 0.0969 0.13 CD8T L1
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 4.95e-01 0.0816 0.119 0.13 CD8T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 9.75e-01 0.00271 0.0863 0.13 CD8T L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 1.07e-01 -0.132 0.0812 0.131 DC L1
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 3.27e-01 0.108 0.11 0.131 DC L1
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 7.19e-02 -0.164 0.0909 0.131 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 4.39e-01 0.0962 0.124 0.131 DC L1
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 8.13e-01 0.0288 0.121 0.131 DC L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 1.61e-01 0.147 0.105 0.131 DC L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 3.64e-02 -0.142 0.0673 0.13 Mono L1
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00246 0.0823 0.13 Mono L1
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 2.22e-01 -0.0778 0.0634 0.13 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 2.31e-01 0.139 0.116 0.13 Mono L1
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0171 0.085 0.13 Mono L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 9.72e-01 0.00311 0.0875 0.13 Mono L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0331 0.11 0.131 NK L1
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 9.35e-01 0.00765 0.0932 0.131 NK L1
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 9.79e-02 0.161 0.0966 0.131 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 9.67e-01 0.00441 0.105 0.131 NK L1
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0547 0.101 0.131 NK L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 6.96e-01 0.0381 0.0973 0.131 NK L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 1.45e-01 -0.133 0.0911 0.13 Other_T L1
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 3.95e-01 0.0462 0.0542 0.13 Other_T L1
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0461 0.111 0.13 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0995 0.119 0.13 Other_T L1
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0523 0.0954 0.13 Other_T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0897 0.0774 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 9.66e-01 0.00592 0.138 0.151 B_Activated L2
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 7.61e-02 0.226 0.127 0.151 B_Activated L2
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 9.51e-01 0.0087 0.142 0.151 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 8.29e-01 0.0296 0.137 0.151 B_Activated L2
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 2.49e-01 0.165 0.143 0.151 B_Activated L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 7.08e-01 0.0475 0.126 0.151 B_Activated L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0625 0.116 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 9.69e-02 -0.156 0.0938 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0821 0.121 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 5.61e-01 0.0763 0.131 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0166 0.122 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 1.42e-01 0.161 0.109 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0798 0.112 0.129 B_Memory L2
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0688 0.113 0.129 B_Memory L2
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 3.88e-01 -0.112 0.129 0.129 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 8.43e-01 0.026 0.131 0.129 B_Memory L2
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 2.72e-01 0.141 0.128 0.129 B_Memory L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0359 0.122 0.129 B_Memory L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0742 0.0995 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 7.71e-01 0.0225 0.0775 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 2.03e-01 -0.148 0.116 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 2.70e-01 -0.141 0.128 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 9.35e-01 0.0101 0.123 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0721 0.11 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 2.03e-01 -0.155 0.121 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 7.48e-01 0.0331 0.103 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 4.71e-01 0.086 0.119 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 2.02e-01 0.172 0.134 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 5.33e-01 0.0729 0.117 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 1.88e-01 0.148 0.112 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 8.37e-01 0.025 0.122 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 2.55e-01 -0.132 0.116 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0502 0.125 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0833 0.135 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 2.71e-01 -0.135 0.122 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0785 0.129 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 1.24e-01 -0.148 0.0959 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0372 0.087 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 8.78e-01 0.0141 0.0919 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 4.23e-01 0.075 0.0935 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 3.07e-01 -0.106 0.104 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 9.95e-02 0.151 0.091 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 7.69e-01 0.0276 0.0939 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0306 0.0851 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 6.61e-02 0.193 0.105 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 1.56e-01 0.153 0.107 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 1.89e-01 0.158 0.12 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 2.10e-01 0.114 0.0909 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0623 0.116 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 6.13e-01 0.0554 0.109 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 7.15e-01 0.0454 0.124 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 8.05e-01 0.0318 0.129 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0473 0.136 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0214 0.117 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 2.75e-01 -0.123 0.112 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0667 0.105 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0825 0.117 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 6.32e-01 0.0562 0.117 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 7.16e-01 0.0458 0.126 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0481 0.116 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 1.08e-01 -0.167 0.104 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 3.40e-01 -0.095 0.0992 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 2.12e-01 -0.153 0.122 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 4.49e-01 0.0839 0.111 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 7.82e-01 -0.035 0.126 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0753 0.104 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 2.42e-03 -0.393 0.128 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0732 0.11 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 7.13e-01 -0.046 0.125 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 6.17e-02 -0.234 0.124 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 2.67e-01 0.141 0.126 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 4.41e-01 0.0982 0.127 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0629 0.115 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0281 0.118 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 7.46e-02 -0.24 0.134 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 8.90e-01 0.0189 0.137 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 4.00e-01 0.113 0.134 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0508 0.126 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 1.80e-02 -0.29 0.121 0.132 MAIT L2
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 3.19e-01 -0.117 0.117 0.132 MAIT L2
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0572 0.116 0.132 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 1.92e-01 -0.165 0.126 0.132 MAIT L2
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 4.29e-01 0.0949 0.12 0.132 MAIT L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 3.68e-01 -0.111 0.123 0.132 MAIT L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 1.79e-01 -0.155 0.115 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0829 0.118 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0161 0.131 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0465 0.131 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0799 0.122 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0964 0.132 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 9.12e-01 0.0131 0.118 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 4.88e-01 0.0716 0.103 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 4.60e-02 0.216 0.107 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 9.40e-01 0.00891 0.119 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0496 0.114 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 5.37e-01 0.071 0.115 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0262 0.128 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 2.93e-01 0.141 0.134 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 8.92e-01 0.0181 0.133 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 8.82e-02 -0.22 0.129 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 3.82e-01 0.118 0.134 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0991 0.126 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 3.30e-01 -0.121 0.124 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 5.40e-01 0.0662 0.108 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00539 0.119 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0485 0.126 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 8.76e-01 0.0197 0.126 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 2.07e-01 0.154 0.122 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0136 0.0895 0.133 PB L2
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 1.44e-02 0.41 0.165 0.133 PB L2
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 8.05e-01 0.0391 0.158 0.133 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 9.16e-01 0.0185 0.175 0.133 PB L2
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 9.19e-01 0.012 0.118 0.133 PB L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 5.33e-02 0.302 0.155 0.133 PB L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 1.18e-01 -0.125 0.0798 0.13 Pro_T L2
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0073 0.0663 0.13 Pro_T L2
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0661 0.133 0.13 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0555 0.119 0.13 Pro_T L2
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 5.05e-01 0.0622 0.093 0.13 Pro_T L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 7.77e-02 -0.181 0.102 0.13 Pro_T L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0866 0.122 0.13 Treg L2
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0229 0.106 0.13 Treg L2
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 9.89e-02 -0.215 0.13 0.13 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 5.20e-01 0.0849 0.132 0.13 Treg L2
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0377 0.126 0.13 Treg L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 5.29e-01 0.0714 0.113 0.13 Treg L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 2.51e-01 -0.112 0.0976 0.134 cDC L2
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 1.18e-01 0.19 0.121 0.134 cDC L2
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 2.62e-02 -0.215 0.0957 0.134 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 6.33e-01 0.0632 0.132 0.134 cDC L2
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 3.98e-01 0.106 0.125 0.134 cDC L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 2.50e-01 0.142 0.123 0.134 cDC L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 4.10e-03 -0.183 0.063 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00745 0.0904 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 1.81e-01 -0.0924 0.0689 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 8.99e-01 0.0158 0.124 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 7.67e-01 0.0278 0.0938 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 5.51e-01 0.0607 0.102 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0548 0.0731 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 6.93e-01 0.0386 0.0975 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0633 0.0871 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 7.37e-04 0.44 0.129 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0805 0.106 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0661 0.104 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 7.67e-02 -0.262 0.147 0.109 gdT L2
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 5.56e-02 0.299 0.155 0.109 gdT L2
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 1.97e-01 0.217 0.167 0.109 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 8.09e-01 0.0405 0.167 0.109 gdT L2
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 6.50e-01 0.0747 0.164 0.109 gdT L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 6.60e-01 0.07 0.159 0.109 gdT L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 2.61e-02 -0.201 0.0896 0.131 intMono L2
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0462 0.105 0.131 intMono L2
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 5.67e-01 0.0586 0.102 0.131 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 3.23e-02 -0.269 0.125 0.131 intMono L2
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0175 0.113 0.131 intMono L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0628 0.128 0.131 intMono L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 1.98e-02 -0.237 0.101 0.131 ncMono L2
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 5.42e-01 0.0478 0.0783 0.131 ncMono L2
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 6.61e-01 0.0427 0.0971 0.131 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 1.33e-01 -0.169 0.112 0.131 ncMono L2
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 5.12e-01 0.0768 0.117 0.131 ncMono L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 9.15e-01 -0.011 0.103 0.131 ncMono L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0847 0.104 0.124 pDC L2
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 7.52e-01 -0.042 0.133 0.124 pDC L2
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 1.46e-01 -0.178 0.122 0.124 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0704 0.136 0.124 pDC L2
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 5.90e-01 0.0756 0.14 0.124 pDC L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0246 0.115 0.124 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 2.26e-01 -0.139 0.114 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0597 0.0862 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0391 0.116 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0404 0.13 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 1.68e-01 0.169 0.122 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 2.80e-01 0.105 0.097 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 2.59e-01 -0.111 0.0985 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 5.97e-01 0.0423 0.0799 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0569 0.112 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0319 0.127 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 7.66e-01 0.034 0.114 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 6.71e-01 -0.043 0.101 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 8.47e-02 -0.111 0.0642 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 8.75e-01 0.014 0.0886 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 3.65e-01 -0.063 0.0693 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 3.70e-02 0.262 0.125 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 9.05e-01 0.0105 0.0875 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 7.83e-01 0.0251 0.0912 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 3.75e-04 -0.313 0.0864 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00523 0.0607 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 4.85e-01 0.0584 0.0834 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 3.23e-02 -0.248 0.115 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0188 0.109 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0898 0.0937 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -726654 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0927 0.111 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -648575 sc-eQTL 7.09e-01 0.0362 0.0968 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -778204 sc-eQTL 1.13e-01 0.156 0.098 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 959714 sc-eQTL 9.76e-01 0.00329 0.108 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -778176 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0473 0.105 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649485 sc-eQTL 5.07e-01 0.066 0.0993 0.131 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000245017 \N -636918 3.77e-07 1.78e-07 7.16e-08 2.26e-07 1.07e-07 9.31e-08 2.86e-07 7.12e-08 2.04e-07 1.21e-07 2.18e-07 1.72e-07 3.18e-07 8.66e-08 7.79e-08 1.14e-07 6.63e-08 2.56e-07 7.76e-08 7.83e-08 1.39e-07 2.09e-07 1.86e-07 3.83e-08 2.74e-07 1.82e-07 1.37e-07 1.48e-07 1.47e-07 1.69e-07 1.39e-07 4.43e-08 4.74e-08 9.98e-08 6.87e-08 4.6e-08 5.1e-08 6.98e-08 5.59e-08 7.78e-08 4.46e-08 1.68e-07 3.08e-08 1.43e-08 4.91e-08 9.65e-09 8.21e-08 2.2e-09 4.55e-08