Genes within 1Mb (chr12:97866809:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 3.77e-02 -0.146 0.0698 0.171 B L1
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 5.06e-01 0.0401 0.0601 0.171 B L1
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 9.50e-01 0.00508 0.0809 0.171 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 2.72e-01 -0.111 0.101 0.171 B L1
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 8.41e-01 0.0165 0.0824 0.171 B L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0305 0.0757 0.171 B L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 7.91e-02 -0.151 0.0856 0.171 CD4T L1
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 6.10e-01 0.0352 0.0689 0.171 CD4T L1
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 6.72e-01 0.0283 0.0667 0.171 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 6.58e-01 0.0334 0.0755 0.171 CD4T L1
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 5.27e-01 -0.059 0.0932 0.171 CD4T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 7.77e-02 0.12 0.0678 0.171 CD4T L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 3.67e-02 -0.146 0.0693 0.171 CD8T L1
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0396 0.0641 0.171 CD8T L1
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 4.66e-02 -0.154 0.0769 0.171 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00275 0.0848 0.171 CD8T L1
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 5.42e-01 0.0639 0.104 0.171 CD8T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 5.28e-01 0.0477 0.0754 0.171 CD8T L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 1.63e-01 -0.0992 0.0708 0.173 DC L1
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 4.94e-02 0.188 0.0952 0.173 DC L1
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 6.33e-02 -0.148 0.0791 0.173 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0703 0.108 0.173 DC L1
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00463 0.106 0.173 DC L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 1.72e-01 0.125 0.0913 0.173 DC L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 2.62e-02 -0.132 0.059 0.171 Mono L1
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 8.34e-01 0.0151 0.0722 0.171 Mono L1
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0609 0.0557 0.171 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 4.08e-01 0.0841 0.101 0.171 Mono L1
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0507 0.0745 0.171 Mono L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 8.56e-01 0.014 0.0767 0.171 Mono L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 1.84e-01 -0.129 0.097 0.172 NK L1
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 8.27e-01 0.018 0.0823 0.172 NK L1
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 1.84e-01 0.114 0.0855 0.172 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0103 0.093 0.172 NK L1
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00674 0.0894 0.172 NK L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 3.27e-01 0.0842 0.0858 0.172 NK L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 1.19e-01 -0.126 0.0806 0.171 Other_T L1
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 9.65e-02 0.0796 0.0477 0.171 Other_T L1
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0207 0.0981 0.171 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 3.44e-01 -0.1 0.105 0.171 Other_T L1
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0362 0.0845 0.171 Other_T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0604 0.0686 0.171 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 8.04e-01 0.0299 0.12 0.191 B_Activated L2
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 1.15e-01 0.175 0.111 0.191 B_Activated L2
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 8.70e-01 0.0204 0.124 0.191 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 1.86e-01 0.157 0.118 0.191 B_Activated L2
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 1.67e-01 0.172 0.124 0.191 B_Activated L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0573 0.11 0.191 B_Activated L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 3.08e-01 -0.104 0.101 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0683 0.0827 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 9.08e-01 0.0123 0.107 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 6.28e-01 0.0558 0.115 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 3.41e-01 -0.102 0.106 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 6.80e-02 0.175 0.0955 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 9.58e-02 -0.162 0.0969 0.17 B_Memory L2
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0502 0.0983 0.17 B_Memory L2
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0317 0.113 0.17 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 9.15e-01 0.0122 0.114 0.17 B_Memory L2
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 3.56e-01 0.103 0.112 0.17 B_Memory L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0166 0.106 0.17 B_Memory L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 2.07e-01 -0.11 0.0868 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 4.36e-01 0.0528 0.0677 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 1.73e-01 -0.139 0.101 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 1.48e-01 -0.162 0.111 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0147 0.108 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0386 0.096 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 1.83e-01 -0.142 0.106 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 5.49e-01 0.0541 0.0902 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 3.62e-01 0.0953 0.104 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 5.66e-01 0.0678 0.118 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 7.93e-01 0.0269 0.103 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 2.19e-01 0.121 0.0981 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0528 0.107 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 2.27e-01 -0.124 0.102 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0266 0.11 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 9.87e-01 0.00194 0.119 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 2.46e-01 -0.125 0.108 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 2.01e-01 -0.145 0.113 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 1.89e-02 -0.196 0.083 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 7.88e-01 0.0204 0.0759 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0145 0.0802 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 5.92e-01 0.0438 0.0816 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0902 0.0906 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 6.25e-02 0.148 0.0792 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0625 0.0833 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 8.06e-01 0.0186 0.0756 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 6.08e-02 0.175 0.0929 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 1.95e-01 0.124 0.0952 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 2.96e-01 0.112 0.106 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 3.58e-01 0.0745 0.0809 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0284 0.101 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 1.70e-01 0.131 0.095 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00278 0.108 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0108 0.112 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 3.76e-01 -0.105 0.118 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 9.30e-01 0.00901 0.102 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 7.48e-02 -0.175 0.0978 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0955 0.0918 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0985 0.102 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 6.26e-01 0.05 0.102 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 3.90e-01 0.0945 0.11 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 7.48e-01 0.0326 0.101 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 7.74e-02 -0.161 0.0909 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 8.48e-01 0.0167 0.0872 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 2.35e-01 -0.127 0.107 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 3.50e-01 0.0907 0.097 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 8.57e-01 -0.02 0.111 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 9.57e-01 -0.0049 0.0915 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 4.44e-03 -0.321 0.112 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0733 0.0951 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 2.85e-01 -0.116 0.108 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 5.13e-02 -0.212 0.108 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 1.75e-01 0.149 0.11 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 3.89e-01 0.0953 0.11 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 1.39e-01 -0.153 0.103 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 1.30e-01 -0.161 0.106 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 4.27e-02 -0.246 0.121 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0469 0.123 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 4.99e-01 0.0821 0.121 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0329 0.113 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 1.72e-02 -0.257 0.107 0.173 MAIT L2
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0315 0.104 0.173 MAIT L2
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 2.70e-01 -0.113 0.102 0.173 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 1.69e-01 -0.153 0.111 0.173 MAIT L2
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 5.32e-01 0.0659 0.105 0.173 MAIT L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 6.24e-01 0.0533 0.109 0.173 MAIT L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 7.43e-02 -0.184 0.103 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0218 0.106 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0334 0.118 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 6.78e-01 0.0487 0.117 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 2.25e-01 -0.132 0.109 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0219 0.119 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0424 0.104 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 6.82e-01 0.0371 0.0904 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 1.93e-01 0.124 0.0945 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 9.39e-01 0.00801 0.104 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0223 0.0995 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 2.57e-01 0.114 0.1 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 3.28e-01 -0.112 0.114 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 1.62e-01 0.167 0.119 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 8.39e-01 0.0243 0.119 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 7.26e-02 -0.208 0.115 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 1.04e-01 0.196 0.12 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 6.84e-02 -0.206 0.112 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 1.08e-01 -0.177 0.11 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 4.58e-01 0.0711 0.0956 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 7.42e-01 0.0346 0.105 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0446 0.112 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 4.33e-01 0.0879 0.112 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 4.43e-02 0.217 0.107 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 8.33e-01 -0.017 0.0802 0.17 PB L2
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 3.46e-02 0.319 0.149 0.17 PB L2
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 7.15e-01 0.0518 0.142 0.17 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0556 0.157 0.17 PB L2
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 3.04e-01 0.109 0.106 0.17 PB L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 7.20e-02 0.253 0.139 0.17 PB L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 1.46e-01 -0.102 0.0701 0.172 Pro_T L2
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 4.29e-01 0.0461 0.0582 0.172 Pro_T L2
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0887 0.116 0.172 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0612 0.104 0.172 Pro_T L2
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 6.03e-01 0.0426 0.0817 0.172 Pro_T L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 1.68e-01 -0.124 0.0897 0.172 Pro_T L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0198 0.107 0.171 Treg L2
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 5.09e-01 0.0618 0.0934 0.171 Treg L2
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 1.37e-01 -0.171 0.115 0.171 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 8.06e-01 0.0286 0.116 0.171 Treg L2
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 7.30e-01 0.0384 0.111 0.171 Treg L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 2.13e-01 0.124 0.0996 0.171 Treg L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0388 0.0844 0.178 cDC L2
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 1.62e-02 0.251 0.104 0.178 cDC L2
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 2.34e-02 -0.188 0.0824 0.178 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0407 0.114 0.178 cDC L2
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 6.28e-01 0.0521 0.107 0.178 cDC L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 2.67e-01 0.118 0.106 0.178 cDC L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 4.31e-03 -0.16 0.0553 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00325 0.0794 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0693 0.0606 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 6.59e-01 0.0482 0.109 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00209 0.0824 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 4.09e-01 0.0738 0.0893 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 2.92e-01 -0.068 0.0644 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 6.94e-01 0.0339 0.086 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0745 0.0767 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 9.53e-03 0.3 0.115 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 2.49e-01 -0.108 0.0936 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0155 0.0919 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 2.00e-02 -0.293 0.125 0.148 gdT L2
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 4.92e-02 0.263 0.132 0.148 gdT L2
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 1.36e-01 0.214 0.143 0.148 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0479 0.143 0.148 gdT L2
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 4.55e-01 0.105 0.14 0.148 gdT L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 5.76e-01 0.0761 0.136 0.148 gdT L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 1.21e-02 -0.197 0.0778 0.173 intMono L2
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 9.04e-01 0.011 0.0914 0.173 intMono L2
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 2.65e-01 0.0991 0.0887 0.173 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 6.39e-02 -0.203 0.109 0.173 intMono L2
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0383 0.0981 0.173 intMono L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 8.57e-01 0.0201 0.111 0.173 intMono L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 1.50e-02 -0.216 0.088 0.174 ncMono L2
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 3.41e-01 0.0653 0.0684 0.174 ncMono L2
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 6.84e-01 0.0346 0.085 0.174 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 7.33e-02 -0.176 0.0979 0.174 ncMono L2
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 4.87e-01 0.0711 0.102 0.174 ncMono L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0631 0.0898 0.174 ncMono L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 1.68e-01 -0.122 0.088 0.169 pDC L2
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0153 0.113 0.169 pDC L2
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 1.88e-01 -0.138 0.104 0.169 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 1.23e-01 -0.179 0.115 0.169 pDC L2
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 5.86e-01 0.0653 0.12 0.169 pDC L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 6.95e-01 0.0385 0.0981 0.169 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 5.06e-02 -0.194 0.0988 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00547 0.075 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 6.02e-01 0.0525 0.101 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0255 0.113 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 2.99e-01 0.111 0.107 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 2.61e-01 0.0951 0.0843 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 1.95e-01 -0.111 0.0857 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 4.29e-01 0.0552 0.0696 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0495 0.0976 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 3.63e-01 -0.1 0.11 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00686 0.0994 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0159 0.088 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 5.45e-02 -0.109 0.0564 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 8.32e-01 0.0165 0.0779 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0558 0.061 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 6.12e-02 0.207 0.11 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0254 0.0769 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 5.29e-01 0.0506 0.0802 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 1.55e-03 -0.244 0.076 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 4.84e-01 0.0372 0.053 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 3.35e-01 0.0704 0.0729 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 2.59e-02 -0.225 0.1 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 8.35e-01 -0.02 0.0955 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0761 0.0819 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -726782 sc-eQTL 1.11e-01 -0.156 0.0975 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -648703 sc-eQTL 7.15e-01 0.0312 0.0855 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -778332 sc-eQTL 2.81e-01 0.0939 0.0868 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 959586 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0199 0.0951 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -778304 sc-eQTL 9.75e-01 0.00288 0.093 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -649613 sc-eQTL 2.07e-01 0.111 0.0874 0.172 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000166130 IKBIP -778304 eQTL 0.0112 0.0427 0.0168 0.0 0.0 0.187
ENSG00000227825 SLC9A7P1 -590336 eQTL 0.0179 0.0615 0.0259 0.0 0.0 0.187


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000166130 IKBIP -778304 3.27e-07 1.56e-07 6.57e-08 2.15e-07 1.05e-07 7.75e-08 2.5e-07 6.72e-08 1.96e-07 1.11e-07 1.86e-07 1.59e-07 2.38e-07 8.15e-08 6.12e-08 1.01e-07 5.57e-08 2.21e-07 7.11e-08 5.61e-08 1.33e-07 1.9e-07 1.75e-07 3.68e-08 2.28e-07 1.86e-07 1.25e-07 1.26e-07 1.34e-07 1.24e-07 1.26e-07 4.32e-08 3.65e-08 1.03e-07 3.97e-08 3.57e-08 4.84e-08 7.63e-08 6.33e-08 5.45e-08 5.94e-08 1.59e-07 3.55e-08 1.07e-08 3.07e-08 6.39e-09 7.26e-08 2.1e-09 4.67e-08
ENSG00000245017 \N -637046 5.59e-07 2.5e-07 9.16e-08 2.41e-07 1.07e-07 1.32e-07 3.57e-07 9.69e-08 2.81e-07 1.78e-07 3.25e-07 2.49e-07 4.11e-07 9.15e-08 1.07e-07 1.61e-07 1.17e-07 3.02e-07 1.5e-07 7.29e-08 1.61e-07 2.63e-07 2.48e-07 6.65e-08 3.7e-07 2.4e-07 1.85e-07 1.7e-07 2.11e-07 2.02e-07 1.71e-07 5.46e-08 4.96e-08 1.17e-07 1.22e-07 6.85e-08 7.97e-08 6e-08 4.78e-08 7.9e-08 3.6e-08 2.5e-07 3.09e-08 1.11e-08 4.99e-08 8.76e-09 1.03e-07 2.71e-09 5.16e-08