logo

Genes within 1Mb (chr12:97854290:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 6.07e-02 -0.152 0.0806 0.13 B L1
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 8.31e-01 0.0148 0.0694 0.13 B L1
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0155 0.0932 0.13 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0293 0.116 0.13 B L1
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 3.98e-01 0.0802 0.0948 0.13 B L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0227 0.0873 0.13 B L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 3.48e-01 -0.092 0.0977 0.13 CD4T L1
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0279 0.0783 0.13 CD4T L1
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 4.16e-01 0.0617 0.0757 0.13 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 3.92e-01 0.0733 0.0856 0.13 CD4T L1
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0414 0.106 0.13 CD4T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 1.09e-01 0.124 0.0771 0.13 CD4T L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 7.18e-02 -0.143 0.0793 0.13 CD8T L1
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 1.14e-01 -0.115 0.0727 0.13 CD8T L1
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 1.08e-01 -0.142 0.088 0.13 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0289 0.0968 0.13 CD8T L1
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 4.82e-01 0.0839 0.119 0.13 CD8T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 9.20e-01 0.00863 0.0861 0.13 CD8T L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 1.60e-01 -0.114 0.0811 0.131 DC L1
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 2.80e-01 0.119 0.11 0.131 DC L1
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 4.57e-02 -0.182 0.0905 0.131 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 4.81e-01 0.0874 0.124 0.131 DC L1
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 7.90e-01 0.0323 0.121 0.131 DC L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 1.85e-01 0.139 0.105 0.131 DC L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 5.87e-02 -0.128 0.0671 0.13 Mono L1
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0106 0.0819 0.13 Mono L1
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0689 0.0632 0.13 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 2.16e-01 0.143 0.115 0.13 Mono L1
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000193 0.0846 0.13 Mono L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00336 0.087 0.13 Mono L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 6.82e-01 -0.045 0.11 0.131 NK L1
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 9.18e-01 0.00955 0.0927 0.131 NK L1
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 9.37e-02 0.162 0.0961 0.131 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0106 0.105 0.131 NK L1
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 7.43e-01 -0.033 0.101 0.131 NK L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 6.60e-01 0.0426 0.0968 0.131 NK L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 2.08e-01 -0.115 0.091 0.13 Other_T L1
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 5.94e-01 0.0288 0.0541 0.13 Other_T L1
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0258 0.111 0.13 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0939 0.119 0.13 Other_T L1
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0416 0.0952 0.13 Other_T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 2.55e-01 -0.088 0.0772 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 7.02e-01 -0.053 0.138 0.151 B_Activated L2
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 8.69e-02 0.219 0.127 0.151 B_Activated L2
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 7.56e-01 0.0444 0.143 0.151 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 8.25e-01 0.0302 0.137 0.151 B_Activated L2
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 1.60e-01 0.201 0.143 0.151 B_Activated L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00175 0.127 0.151 B_Activated L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0723 0.116 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 7.83e-02 -0.166 0.0936 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0552 0.121 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 4.37e-01 0.102 0.131 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 9.34e-01 0.01 0.121 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 1.28e-01 0.166 0.109 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0943 0.111 0.129 B_Memory L2
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0636 0.112 0.129 B_Memory L2
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 4.39e-01 -0.1 0.129 0.129 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 9.85e-01 0.00253 0.13 0.129 B_Memory L2
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 3.13e-01 0.129 0.128 0.129 B_Memory L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0655 0.121 0.129 B_Memory L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0837 0.0992 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 6.01e-01 0.0404 0.0772 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 2.07e-01 -0.147 0.116 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 3.68e-01 -0.115 0.127 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 9.35e-01 0.0101 0.123 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0506 0.109 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 2.25e-01 -0.148 0.121 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 8.07e-01 0.0252 0.103 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 4.96e-01 0.0811 0.119 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 1.61e-01 0.189 0.134 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 5.06e-01 0.0779 0.117 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 2.01e-01 0.144 0.112 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 8.56e-01 0.022 0.121 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 1.35e-01 -0.173 0.115 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0216 0.124 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0939 0.134 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 2.98e-01 -0.127 0.122 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 3.82e-01 -0.112 0.128 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 1.22e-01 -0.148 0.0955 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0484 0.0866 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 7.63e-01 0.0276 0.0915 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 3.79e-01 0.0821 0.0931 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0935 0.104 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 1.22e-01 0.141 0.0907 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 7.76e-01 0.0267 0.0936 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0332 0.0849 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 4.84e-02 0.207 0.104 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 2.00e-01 0.138 0.107 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 1.92e-01 0.156 0.119 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 1.96e-01 0.117 0.0907 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0685 0.115 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 6.63e-01 0.0477 0.109 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 8.49e-01 0.0237 0.124 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 7.38e-01 0.0431 0.129 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0378 0.136 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0315 0.117 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 2.71e-01 -0.124 0.112 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0821 0.105 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 3.84e-01 -0.102 0.117 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 5.94e-01 0.0624 0.117 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 6.20e-01 0.0622 0.125 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0317 0.116 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 1.14e-01 -0.164 0.104 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 2.95e-01 -0.104 0.099 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 2.63e-01 -0.137 0.122 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 5.57e-01 0.065 0.111 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 8.37e-01 -0.026 0.126 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0886 0.104 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 2.99e-03 -0.386 0.128 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0866 0.11 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 5.87e-01 -0.068 0.125 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 7.01e-02 -0.227 0.125 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 3.82e-01 0.111 0.127 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 3.97e-01 0.108 0.127 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0476 0.115 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0337 0.118 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 4.63e-02 -0.269 0.134 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 6.71e-01 0.0582 0.137 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 3.87e-01 0.117 0.134 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0251 0.126 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 3.98e-02 -0.253 0.122 0.132 MAIT L2
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 2.23e-01 -0.143 0.117 0.132 MAIT L2
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0252 0.116 0.132 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 1.75e-01 -0.171 0.126 0.132 MAIT L2
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 3.72e-01 0.107 0.12 0.132 MAIT L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 2.68e-01 -0.137 0.123 0.132 MAIT L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 1.85e-01 -0.153 0.115 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0829 0.118 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0205 0.131 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0349 0.131 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0448 0.122 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 4.15e-01 -0.108 0.132 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 9.57e-01 0.00629 0.118 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 4.75e-01 0.0735 0.103 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 4.31e-02 0.217 0.107 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0194 0.118 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0497 0.113 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 4.62e-01 0.0841 0.114 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0108 0.127 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 3.24e-01 0.132 0.133 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 9.58e-01 0.00696 0.133 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 3.65e-02 -0.269 0.128 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 2.05e-01 0.17 0.134 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 3.10e-01 -0.128 0.126 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 2.60e-01 -0.14 0.124 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 6.43e-01 0.0499 0.107 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00278 0.118 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0385 0.126 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 8.22e-01 0.0284 0.126 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 2.20e-01 0.149 0.121 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0136 0.0895 0.133 PB L2
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 1.44e-02 0.41 0.165 0.133 PB L2
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 8.05e-01 0.0391 0.158 0.133 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 9.16e-01 0.0185 0.175 0.133 PB L2
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 9.19e-01 0.012 0.118 0.133 PB L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 5.33e-02 0.302 0.155 0.133 PB L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 1.22e-01 -0.123 0.0795 0.13 Pro_T L2
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00492 0.0661 0.13 Pro_T L2
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 6.45e-01 -0.061 0.132 0.13 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 7.23e-01 -0.042 0.119 0.13 Pro_T L2
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 4.25e-01 0.074 0.0927 0.13 Pro_T L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 1.49e-01 -0.147 0.102 0.13 Pro_T L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0814 0.121 0.13 Treg L2
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0404 0.106 0.13 Treg L2
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 8.08e-02 -0.227 0.129 0.13 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 5.26e-01 0.0834 0.131 0.13 Treg L2
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0542 0.126 0.13 Treg L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 6.79e-01 0.0468 0.113 0.13 Treg L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0899 0.0979 0.134 cDC L2
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 8.86e-02 0.208 0.121 0.134 cDC L2
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 1.79e-02 -0.229 0.0957 0.134 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 6.41e-01 0.0618 0.132 0.134 cDC L2
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 3.78e-01 0.11 0.125 0.134 cDC L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 3.15e-01 0.124 0.123 0.134 cDC L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 4.85e-03 -0.179 0.0628 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0218 0.0901 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0836 0.0688 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 9.08e-01 0.0143 0.124 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 6.45e-01 0.0431 0.0935 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 6.40e-01 0.0475 0.101 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0412 0.0729 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 6.90e-01 0.0388 0.0971 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0742 0.0867 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 9.14e-04 0.431 0.128 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0681 0.106 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0761 0.104 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 7.01e-02 -0.269 0.147 0.109 gdT L2
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 6.64e-02 0.288 0.156 0.109 gdT L2
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 2.42e-01 0.198 0.168 0.109 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 6.66e-01 0.0724 0.167 0.109 gdT L2
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 7.17e-01 0.0598 0.165 0.109 gdT L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 6.00e-01 0.0837 0.159 0.109 gdT L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 4.89e-02 -0.177 0.0895 0.131 intMono L2
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0467 0.104 0.131 intMono L2
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 5.25e-01 0.0646 0.102 0.131 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 4.75e-02 -0.248 0.124 0.131 intMono L2
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 9.98e-01 0.000239 0.112 0.131 intMono L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0571 0.127 0.131 intMono L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 1.35e-02 -0.25 0.1 0.131 ncMono L2
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 7.13e-01 0.0288 0.0782 0.131 ncMono L2
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 8.57e-01 0.0175 0.097 0.131 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 2.19e-01 -0.138 0.112 0.131 ncMono L2
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 5.76e-01 0.0652 0.117 0.131 ncMono L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0342 0.102 0.131 ncMono L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0694 0.103 0.127 pDC L2
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0479 0.132 0.127 pDC L2
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 1.35e-01 -0.182 0.121 0.127 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0454 0.135 0.127 pDC L2
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 6.15e-01 0.0699 0.139 0.127 pDC L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0297 0.114 0.127 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 1.59e-01 -0.161 0.114 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0582 0.086 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00402 0.115 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0369 0.13 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 1.29e-01 0.186 0.122 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 3.36e-01 0.0934 0.0968 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 2.08e-01 -0.124 0.0981 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 5.26e-01 0.0506 0.0797 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0525 0.112 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 9.24e-01 -0.012 0.126 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 7.21e-01 0.0406 0.114 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0319 0.101 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 1.09e-01 -0.103 0.064 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 9.89e-01 0.00119 0.0883 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0569 0.0691 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 3.89e-02 0.258 0.124 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 7.70e-01 0.0255 0.0872 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 8.46e-01 0.0177 0.0909 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 5.10e-04 -0.305 0.0863 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 7.79e-01 -0.017 0.0605 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 5.36e-01 0.0515 0.0832 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 5.57e-02 -0.221 0.115 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 8.91e-01 -0.015 0.109 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 2.61e-01 -0.105 0.0933 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -739301 sc-eQTL 3.43e-01 -0.105 0.11 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -661222 sc-eQTL 7.12e-01 0.0356 0.0962 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -790851 sc-eQTL 1.12e-01 0.156 0.0975 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 947067 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0148 0.107 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -790823 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0356 0.105 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -662132 sc-eQTL 4.55e-01 0.0738 0.0987 0.131 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000245017 \N -649565 2.8e-07 1.35e-07 5.14e-08 1.97e-07 9.24e-08 9.91e-08 1.73e-07 5.48e-08 1.47e-07 5.67e-08 1.57e-07 1.08e-07 1.71e-07 7.37e-08 6.25e-08 7.49e-08 4.01e-08 1.4e-07 5.97e-08 4.78e-08 1.19e-07 1.24e-07 1.5e-07 2.79e-08 1.65e-07 1.21e-07 1.1e-07 9.74e-08 1.23e-07 9.88e-08 1.08e-07 2.99e-08 3.96e-08 8.23e-08 3.46e-08 3.28e-08 5.04e-08 8.61e-08 6.43e-08 3.86e-08 5.41e-08 1.46e-07 5.27e-08 1.11e-08 3.84e-08 1.86e-08 1.18e-07 1.89e-09 5.04e-08