logo

Genes within 1Mb (chr12:97811636:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 1.02e-01 -0.158 0.096 0.096 B L1
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00597 0.0824 0.096 B L1
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 7.75e-01 0.0317 0.111 0.096 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 3.28e-01 -0.135 0.138 0.096 B L1
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0425 0.113 0.096 B L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 9.00e-01 0.013 0.104 0.096 B L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 8.68e-01 0.0196 0.118 0.096 CD4T L1
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00958 0.0941 0.096 CD4T L1
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 3.17e-01 0.0911 0.0909 0.096 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 1.57e-01 -0.146 0.103 0.096 CD4T L1
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 2.69e-02 0.28 0.126 0.096 CD4T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 9.55e-01 0.00526 0.0932 0.096 CD4T L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0253 0.0954 0.096 CD8T L1
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 8.34e-01 0.0183 0.0874 0.096 CD8T L1
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 1.00e+00 -7.83e-06 0.106 0.096 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0701 0.116 0.096 CD8T L1
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 8.94e-01 0.0189 0.142 0.096 CD8T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 1.16e-02 0.258 0.101 0.096 CD8T L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0611 0.0971 0.097 DC L1
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0811 0.131 0.097 DC L1
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 2.80e-01 -0.118 0.109 0.097 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0754 0.148 0.097 DC L1
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 2.75e-01 0.158 0.144 0.097 DC L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 8.96e-01 0.0164 0.125 0.097 DC L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 7.34e-01 0.0281 0.0825 0.096 Mono L1
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 6.82e-01 0.0409 0.0998 0.096 Mono L1
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 1.64e-01 0.107 0.0768 0.096 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 2.24e-01 0.171 0.14 0.096 Mono L1
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 3.65e-01 0.0934 0.103 0.096 Mono L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 1.70e-01 0.145 0.106 0.096 Mono L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 3.66e-01 -0.119 0.131 0.097 NK L1
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 2.54e-01 0.127 0.111 0.097 NK L1
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 8.21e-01 0.0263 0.116 0.097 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 7.54e-01 0.0393 0.125 0.097 NK L1
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 9.97e-01 0.000519 0.121 0.097 NK L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 2.68e-02 0.256 0.115 0.097 NK L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0325 0.111 0.096 Other_T L1
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 9.36e-01 0.0053 0.0656 0.096 Other_T L1
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 6.80e-01 0.0553 0.134 0.096 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 1.45e-01 0.21 0.144 0.096 Other_T L1
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 6.21e-01 0.0571 0.115 0.096 Other_T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 3.63e-01 0.0854 0.0937 0.096 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 1.98e-01 -0.208 0.161 0.099 B_Activated L2
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0189 0.15 0.099 B_Activated L2
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 2.09e-01 0.21 0.166 0.099 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 9.77e-01 0.00471 0.16 0.099 B_Activated L2
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 5.83e-01 0.0923 0.168 0.099 B_Activated L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0413 0.148 0.099 B_Activated L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0744 0.136 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 6.80e-01 -0.046 0.111 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00468 0.143 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 3.82e-01 0.135 0.154 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0652 0.143 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0511 0.129 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 8.24e-01 0.0293 0.132 0.097 B_Memory L2
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 2.24e-01 0.162 0.133 0.097 B_Memory L2
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 4.10e-01 -0.126 0.153 0.097 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0237 0.154 0.097 B_Memory L2
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00775 0.151 0.097 B_Memory L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 8.57e-01 0.0258 0.143 0.097 B_Memory L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 1.37e-01 -0.176 0.118 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 8.22e-01 0.0207 0.0921 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 7.56e-01 0.0431 0.139 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 3.93e-01 -0.13 0.152 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 5.71e-01 -0.083 0.146 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 2.41e-01 0.153 0.13 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 1.97e-01 -0.188 0.145 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 7.06e-01 0.0464 0.123 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 5.49e-01 0.0853 0.142 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 1.67e-01 -0.222 0.16 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 7.55e-01 0.0436 0.14 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 9.44e-01 0.0094 0.134 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 1.19e-02 -0.362 0.143 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00911 0.139 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 3.51e-01 0.138 0.148 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 2.00e-01 -0.206 0.16 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 9.69e-01 0.00566 0.146 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 9.60e-01 0.00777 0.154 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0196 0.115 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 8.11e-01 -0.025 0.104 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 3.00e-01 0.114 0.11 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 2.59e-01 -0.126 0.112 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 6.39e-02 0.231 0.124 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 9.61e-01 0.0053 0.11 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 6.98e-01 0.0436 0.112 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 7.38e-01 0.0341 0.102 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 7.46e-01 0.0408 0.126 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 3.52e-01 -0.12 0.128 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 2.11e-01 0.18 0.143 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 8.83e-01 0.0161 0.109 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 7.00e-01 0.0524 0.136 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0447 0.128 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0165 0.146 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 3.02e-01 -0.156 0.151 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 3.45e-01 0.15 0.159 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 1.45e-01 0.2 0.137 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0736 0.133 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 7.72e-01 0.0359 0.124 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 3.40e-01 -0.132 0.138 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 8.27e-01 0.0301 0.138 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0475 0.148 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 1.83e-01 0.182 0.136 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 7.25e-01 0.0447 0.127 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 7.48e-01 -0.039 0.121 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00757 0.149 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 2.27e-01 -0.163 0.134 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0718 0.154 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 1.73e-01 0.173 0.127 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0204 0.159 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0847 0.133 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 1.86e-01 0.2 0.151 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 6.81e-01 0.0626 0.152 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 6.64e-01 0.0669 0.154 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 8.06e-01 -0.038 0.154 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0549 0.137 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 6.75e-02 0.256 0.139 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 2.68e-01 -0.178 0.16 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 9.97e-01 0.000561 0.163 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 3.29e-01 0.157 0.16 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 2.09e-01 0.188 0.149 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00756 0.149 0.097 MAIT L2
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 4.25e-02 0.287 0.141 0.097 MAIT L2
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 3.65e-01 -0.127 0.14 0.097 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 5.42e-01 0.093 0.152 0.097 MAIT L2
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 7.62e-01 0.0438 0.145 0.097 MAIT L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 3.91e-01 0.128 0.149 0.097 MAIT L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 8.42e-01 0.0286 0.143 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 2.74e-01 0.16 0.146 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 7.07e-01 0.0612 0.163 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 1.70e-01 0.222 0.161 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 4.73e-01 0.108 0.151 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 3.75e-01 0.145 0.163 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 4.22e-01 -0.111 0.138 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 8.24e-01 0.0268 0.12 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 3.02e-01 0.13 0.126 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0148 0.139 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 8.85e-01 0.0191 0.132 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 2.51e-02 0.298 0.132 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 7.15e-01 0.054 0.148 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 6.41e-01 0.0725 0.155 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 1.23e-01 0.238 0.153 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 2.05e-01 -0.19 0.149 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 4.57e-01 0.116 0.156 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 1.38e-01 0.217 0.146 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 1.58e-01 -0.204 0.144 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 3.69e-01 0.113 0.125 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 2.40e-01 -0.162 0.137 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 3.21e-01 0.146 0.147 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 9.33e-01 0.0123 0.147 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 6.53e-02 0.261 0.141 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 1.17e-01 -0.164 0.104 0.107 PB L2
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 8.34e-01 0.0416 0.199 0.107 PB L2
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 5.68e-01 0.106 0.185 0.107 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 1.59e-01 0.289 0.204 0.107 PB L2
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 1.05e-01 -0.224 0.137 0.107 PB L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 4.90e-01 -0.128 0.184 0.107 PB L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 7.78e-01 0.0269 0.0952 0.096 Pro_T L2
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 7.10e-01 0.0292 0.0787 0.096 Pro_T L2
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 6.45e-01 0.0726 0.157 0.096 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 2.39e-04 0.511 0.137 0.096 Pro_T L2
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 1.58e-01 -0.156 0.11 0.096 Pro_T L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 4.04e-01 0.102 0.122 0.096 Pro_T L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 6.21e-01 -0.072 0.146 0.096 Treg L2
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0186 0.127 0.096 Treg L2
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 6.24e-01 0.0768 0.156 0.096 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 2.00e-01 0.202 0.157 0.096 Treg L2
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 2.30e-01 0.181 0.15 0.096 Treg L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 7.50e-01 0.0433 0.136 0.096 Treg L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 4.11e-01 -0.096 0.116 0.1 cDC L2
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 6.99e-01 0.0563 0.145 0.1 cDC L2
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 8.62e-02 -0.198 0.115 0.1 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 6.77e-01 0.0656 0.157 0.1 cDC L2
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 4.90e-01 0.103 0.148 0.1 cDC L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 4.60e-01 0.109 0.147 0.1 cDC L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 9.63e-01 0.0036 0.0783 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 7.99e-01 0.0282 0.11 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 8.46e-02 0.145 0.0838 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 9.94e-01 0.0011 0.151 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 1.59e-02 0.274 0.113 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 2.55e-01 0.141 0.124 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 5.76e-01 0.0494 0.0883 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 4.99e-01 0.0797 0.118 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 7.33e-01 0.0359 0.105 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 2.01e-01 0.204 0.159 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 1.94e-01 -0.167 0.128 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 4.05e-01 0.105 0.126 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0985 0.163 0.103 gdT L2
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 1.47e-01 -0.25 0.172 0.103 gdT L2
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 7.29e-01 0.0643 0.186 0.103 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 5.49e-01 0.11 0.184 0.103 gdT L2
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 3.74e-01 0.161 0.181 0.103 gdT L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 3.94e-01 0.15 0.175 0.103 gdT L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 6.22e-01 0.0528 0.107 0.098 intMono L2
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 2.13e-01 0.154 0.123 0.098 intMono L2
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 8.10e-01 0.029 0.12 0.098 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 2.82e-02 0.325 0.147 0.098 intMono L2
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 8.80e-01 0.0201 0.133 0.098 intMono L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 9.08e-01 0.0175 0.151 0.098 intMono L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 8.93e-01 -0.017 0.126 0.09 ncMono L2
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00879 0.0964 0.09 ncMono L2
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 3.69e-01 0.107 0.119 0.09 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 6.08e-02 0.259 0.138 0.09 ncMono L2
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 3.24e-02 0.306 0.142 0.09 ncMono L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 4.58e-02 0.251 0.125 0.09 ncMono L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 6.57e-01 0.0535 0.12 0.105 pDC L2
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 1.65e-01 -0.214 0.153 0.105 pDC L2
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 5.10e-01 0.0939 0.142 0.105 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 2.13e-01 -0.197 0.157 0.105 pDC L2
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 2.11e-01 0.203 0.162 0.105 pDC L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0798 0.133 0.105 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0334 0.135 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 9.88e-01 -0.0015 0.101 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 5.87e-01 -0.074 0.136 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 5.63e-01 0.0886 0.153 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 6.44e-01 0.067 0.145 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0809 0.114 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 1.79e-02 -0.275 0.115 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 7.71e-01 0.0276 0.0946 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 7.16e-01 0.0483 0.133 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 2.40e-01 -0.176 0.15 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0984 0.135 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 4.61e-01 0.0883 0.119 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 7.08e-01 0.0295 0.0787 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 5.85e-01 0.059 0.108 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 1.35e-01 0.126 0.0842 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 6.38e-01 0.0723 0.153 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 3.33e-01 0.103 0.106 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 2.56e-01 0.126 0.111 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 7.37e-01 0.0357 0.106 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 4.89e-01 0.0501 0.0723 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 5.76e-01 0.0558 0.0994 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 1.23e-02 0.344 0.136 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 1.23e-01 0.201 0.129 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 5.16e-01 0.0727 0.112 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -781955 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0707 0.131 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -703876 sc-eQTL 4.24e-01 0.0917 0.114 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -833505 sc-eQTL 5.29e-01 0.0736 0.117 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 904413 sc-eQTL 9.36e-01 0.0102 0.127 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -833477 sc-eQTL 8.88e-01 0.0177 0.125 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -704786 sc-eQTL 5.19e-03 0.326 0.115 0.097 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139350 \N 904413 3.53e-07 1.76e-07 9.89e-08 2.44e-07 9.94e-08 8.63e-08 2.74e-07 5.62e-08 1.89e-07 1.15e-07 1.86e-07 1.37e-07 4.34e-07 8.42e-08 1.12e-07 9.11e-08 6.63e-08 2.04e-07 8.93e-08 7.83e-08 1.26e-07 1.81e-07 1.86e-07 3.41e-08 2.86e-07 1.51e-07 1.29e-07 1.26e-07 1.37e-07 2.59e-07 1.39e-07 6.58e-08 4.23e-08 9.98e-08 6.35e-08 4.86e-08 6.77e-08 6.11e-08 5.62e-08 5.54e-08 2.95e-08 1.63e-07 2.32e-08 1.85e-08 4.91e-08 6.98e-09 7.26e-08 2.85e-09 4.54e-08