logo

Genes within 1Mb (chr12:97769914:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0868 0.0914 0.1 B L1
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0298 0.0781 0.1 B L1
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 1.72e-01 0.143 0.104 0.1 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 1.81e-01 -0.175 0.131 0.1 B L1
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 1.59e-01 -0.15 0.106 0.1 B L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0231 0.0983 0.1 B L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 6.94e-01 0.0447 0.113 0.1 CD4T L1
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0753 0.0905 0.1 CD4T L1
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00325 0.0877 0.1 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 2.53e-01 -0.113 0.0989 0.1 CD4T L1
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 6.80e-01 0.0506 0.123 0.1 CD4T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 9.98e-02 -0.147 0.0892 0.1 CD4T L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 7.28e-01 -0.032 0.092 0.1 CD8T L1
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00572 0.0842 0.1 CD8T L1
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 8.80e-01 0.0154 0.102 0.1 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0717 0.111 0.1 CD8T L1
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 2.25e-01 -0.166 0.137 0.1 CD8T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 3.93e-01 0.0847 0.099 0.1 CD8T L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0251 0.0947 0.099 DC L1
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 3.64e-01 -0.116 0.128 0.099 DC L1
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 2.90e-01 -0.112 0.106 0.099 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00285 0.144 0.099 DC L1
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0742 0.141 0.099 DC L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0903 0.122 0.099 DC L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0421 0.0779 0.1 Mono L1
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0187 0.0944 0.1 Mono L1
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 4.09e-01 0.0602 0.0728 0.1 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 5.48e-01 0.0798 0.133 0.1 Mono L1
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 7.40e-01 0.0324 0.0974 0.1 Mono L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 6.60e-01 0.0441 0.1 0.1 Mono L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0582 0.124 0.101 NK L1
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 2.10e-01 0.131 0.104 0.101 NK L1
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 8.83e-01 0.016 0.109 0.101 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 5.90e-01 0.0639 0.118 0.101 NK L1
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0554 0.114 0.101 NK L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 3.01e-01 0.113 0.109 0.101 NK L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0154 0.107 0.1 Other_T L1
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 7.50e-01 0.0201 0.0631 0.1 Other_T L1
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 6.79e-01 0.0534 0.129 0.1 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 7.46e-01 0.045 0.139 0.1 Other_T L1
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 8.42e-01 0.0221 0.111 0.1 Other_T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 9.99e-01 0.000119 0.0903 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 7.47e-01 -0.051 0.158 0.099 B_Activated L2
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 8.33e-01 -0.031 0.147 0.099 B_Activated L2
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 2.22e-01 0.199 0.162 0.099 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 5.01e-01 0.105 0.156 0.099 B_Activated L2
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 1.45e-01 0.239 0.163 0.099 B_Activated L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 5.73e-01 0.0818 0.145 0.099 B_Activated L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0283 0.131 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0113 0.107 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 4.36e-01 0.107 0.137 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 5.55e-01 0.0875 0.148 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 4.09e-01 -0.113 0.137 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 5.46e-01 -0.075 0.124 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0501 0.129 0.101 B_Memory L2
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 4.77e-01 0.0924 0.13 0.101 B_Memory L2
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 7.99e-01 0.0379 0.149 0.101 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 3.14e-01 -0.151 0.15 0.101 B_Memory L2
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 9.36e-01 0.0118 0.148 0.101 B_Memory L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 3.19e-01 -0.139 0.139 0.101 B_Memory L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 1.83e-01 -0.15 0.112 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 9.65e-01 0.00383 0.0878 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0637 0.132 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 9.82e-02 -0.239 0.144 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 7.39e-02 -0.249 0.138 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 3.98e-01 0.105 0.124 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0285 0.14 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 6.48e-01 0.054 0.118 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 1.48e-01 0.198 0.136 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 3.67e-01 -0.14 0.155 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0485 0.134 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0679 0.129 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 1.48e-01 -0.204 0.141 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0712 0.135 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 4.64e-01 0.106 0.144 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 4.33e-01 -0.123 0.156 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 4.41e-01 0.11 0.142 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 9.56e-01 -0.0082 0.15 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0124 0.111 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 4.73e-01 -0.072 0.1 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 8.12e-01 0.0252 0.106 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 2.91e-01 -0.114 0.108 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 2.67e-01 0.133 0.12 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 1.84e-01 -0.14 0.105 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 8.12e-01 0.0257 0.108 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0141 0.0976 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0596 0.121 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 1.74e-01 -0.168 0.123 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 3.72e-01 -0.123 0.138 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 2.96e-01 -0.109 0.104 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 5.74e-01 0.0734 0.13 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 9.74e-01 0.0041 0.123 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0846 0.14 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 1.15e-01 -0.228 0.144 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 8.99e-01 0.0194 0.153 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 8.93e-01 0.0178 0.132 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 7.54e-01 0.04 0.127 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 7.09e-01 0.0445 0.119 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 5.08e-01 0.088 0.133 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0712 0.132 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 3.52e-01 -0.132 0.142 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 1.66e-01 0.181 0.131 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 9.34e-01 0.0101 0.121 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 2.22e-01 -0.141 0.115 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0548 0.142 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 2.84e-01 -0.138 0.129 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 5.22e-02 -0.285 0.146 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 4.91e-01 0.0838 0.121 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 7.94e-01 -0.04 0.153 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0985 0.128 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 1.38e-01 0.216 0.145 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 1.14e-01 0.231 0.145 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 8.19e-01 0.0339 0.148 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 4.72e-01 -0.107 0.148 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 6.16e-01 0.067 0.133 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 1.54e-01 0.195 0.136 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 3.16e-01 -0.157 0.156 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 4.97e-01 0.108 0.158 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 8.11e-01 0.0374 0.156 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00228 0.146 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 5.11e-01 0.0949 0.144 0.1 MAIT L2
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 4.55e-02 0.275 0.137 0.1 MAIT L2
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 2.25e-01 -0.165 0.136 0.1 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 1.67e-01 0.204 0.147 0.1 MAIT L2
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0746 0.14 0.1 MAIT L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0279 0.145 0.1 MAIT L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 9.82e-01 -0.003 0.133 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 3.36e-01 0.131 0.136 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 6.64e-01 0.0656 0.151 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 1.74e-01 0.204 0.15 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0509 0.14 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 3.99e-01 0.128 0.152 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0563 0.13 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 8.25e-01 0.0251 0.114 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 7.63e-01 0.0361 0.119 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0219 0.131 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 3.45e-01 -0.118 0.125 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 3.51e-01 0.118 0.126 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 9.41e-01 0.0102 0.139 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00343 0.146 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00381 0.145 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 9.18e-01 0.0145 0.141 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 3.86e-01 0.127 0.146 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 3.57e-02 0.287 0.136 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0951 0.137 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 4.44e-01 0.0911 0.119 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 4.38e-01 -0.102 0.131 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 4.20e-01 0.113 0.139 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 4.73e-01 0.1 0.139 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 2.70e-01 0.149 0.134 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 1.49e-01 -0.138 0.0949 0.119 PB L2
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 4.26e-01 -0.145 0.181 0.119 PB L2
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 5.59e-01 0.0988 0.169 0.119 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 3.92e-02 0.384 0.184 0.119 PB L2
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 5.49e-03 -0.347 0.122 0.119 PB L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 7.99e-01 0.043 0.168 0.119 PB L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 5.47e-01 0.0558 0.0924 0.1 Pro_T L2
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0187 0.0764 0.1 Pro_T L2
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 6.56e-01 0.0681 0.153 0.1 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 6.02e-03 0.374 0.135 0.1 Pro_T L2
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 3.35e-02 -0.227 0.106 0.1 Pro_T L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 8.25e-01 0.0261 0.118 0.1 Pro_T L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00493 0.14 0.1 Treg L2
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 5.37e-01 0.0752 0.121 0.1 Treg L2
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 7.35e-01 0.0508 0.15 0.1 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 1.22e-01 0.233 0.15 0.1 Treg L2
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0923 0.145 0.1 Treg L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0305 0.13 0.1 Treg L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0593 0.112 0.1 cDC L2
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 9.81e-01 0.00339 0.14 0.1 cDC L2
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 1.18e-01 -0.174 0.11 0.1 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 5.80e-01 0.0838 0.151 0.1 cDC L2
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 3.15e-01 -0.144 0.143 0.1 cDC L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 3.61e-01 0.129 0.141 0.1 cDC L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0701 0.0739 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 9.87e-01 0.00176 0.104 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 3.99e-01 0.0673 0.0798 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 4.48e-01 -0.109 0.143 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 3.38e-01 0.104 0.108 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 7.20e-01 0.0422 0.117 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 8.68e-01 0.014 0.0843 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 9.69e-01 0.00439 0.112 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 3.41e-01 0.0957 0.1 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 2.97e-01 0.159 0.152 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0128 0.123 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0124 0.12 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0878 0.157 0.1 gdT L2
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 2.49e-01 -0.192 0.166 0.1 gdT L2
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 3.77e-01 0.158 0.178 0.1 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 9.79e-01 0.00456 0.177 0.1 gdT L2
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 2.68e-01 0.193 0.174 0.1 gdT L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 7.39e-01 0.0563 0.168 0.1 gdT L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 9.40e-01 0.00776 0.104 0.1 intMono L2
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 7.40e-01 0.0398 0.12 0.1 intMono L2
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0548 0.117 0.1 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 4.66e-02 0.286 0.143 0.1 intMono L2
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0836 0.129 0.1 intMono L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0579 0.146 0.1 intMono L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 7.33e-01 0.0409 0.12 0.095 ncMono L2
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0442 0.0918 0.095 ncMono L2
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00234 0.114 0.095 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 3.65e-02 0.275 0.131 0.095 ncMono L2
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 4.87e-01 0.0954 0.137 0.095 ncMono L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 2.37e-01 0.142 0.12 0.095 ncMono L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0155 0.117 0.11 pDC L2
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 3.76e-01 -0.132 0.149 0.11 pDC L2
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 8.62e-02 0.236 0.137 0.11 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 4.10e-01 -0.126 0.153 0.11 pDC L2
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 4.47e-01 0.12 0.157 0.11 pDC L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 3.22e-01 -0.128 0.129 0.11 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0348 0.13 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 7.42e-01 0.0323 0.0981 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 3.78e-01 0.116 0.131 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 8.07e-01 0.0363 0.148 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 8.89e-01 0.0195 0.14 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 2.52e-01 -0.126 0.11 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 1.43e-01 -0.163 0.111 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 8.62e-01 0.0157 0.09 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 7.90e-01 0.0337 0.126 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 1.07e-01 -0.23 0.142 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 7.19e-02 -0.23 0.127 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 6.86e-01 0.046 0.114 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0352 0.0746 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 8.77e-01 0.0159 0.102 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 3.49e-01 0.0751 0.08 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0286 0.145 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 6.08e-01 0.0519 0.101 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 8.47e-01 0.0203 0.105 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0115 0.101 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0241 0.0691 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0409 0.0951 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 6.45e-03 0.358 0.13 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 6.15e-01 0.0626 0.124 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00764 0.107 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -823677 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0267 0.124 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -745598 sc-eQTL 2.76e-01 0.118 0.108 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -875227 sc-eQTL 8.46e-01 0.0214 0.11 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 862691 sc-eQTL 7.05e-01 0.0454 0.12 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -875199 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0446 0.117 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -746508 sc-eQTL 1.41e-01 0.163 0.11 0.101 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139350 \N 862691 2.69e-07 1.3e-07 4.47e-08 1.81e-07 9.24e-08 9.91e-08 1.53e-07 5.43e-08 1.45e-07 5.42e-08 1.62e-07 9e-08 1.45e-07 7.13e-08 5.91e-08 7.3e-08 4.17e-08 1.26e-07 5.75e-08 4.3e-08 1.19e-07 1.28e-07 1.44e-07 3.03e-08 1.46e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.61e-08 1.09e-07 1.03e-07 9.64e-08 3.54e-08 3.96e-08 8.25e-08 6.34e-08 3.2e-08 5.45e-08 9.17e-08 6.86e-08 3.8e-08 5.44e-08 1.35e-07 5.2e-08 1.25e-08 3.83e-08 1.87e-08 1.2e-07 1.92e-09 5.01e-08