Genes within 1Mb (chr12:96992287:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 1.60e-01 -0.112 0.0796 0.09 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 5.08e-02 -0.193 0.0984 0.09 B L1
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 1.51e-01 -0.152 0.105 0.09 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 4.03e-01 -0.117 0.14 0.09 B L1
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 9.48e-01 0.00439 0.0668 0.09 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 2.24e-02 0.209 0.0907 0.09 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 2.19e-01 0.122 0.0991 0.09 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 3.20e-09 0.609 0.0985 0.09 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 8.75e-02 -0.117 0.0679 0.09 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 5.39e-01 0.0451 0.0734 0.09 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 5.56e-01 0.0652 0.11 0.09 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 1.10e-01 0.192 0.12 0.09 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 3.80e-01 -0.108 0.123 0.092 DC L1
ENSG00000084110 HAL 995922 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0867 0.141 0.092 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0808 0.115 0.092 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 4.75e-01 0.101 0.141 0.092 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 8.26e-02 0.261 0.149 0.092 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 966964 sc-eQTL 1.34e-01 -0.203 0.135 0.092 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 8.92e-01 0.0139 0.102 0.09 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 995922 sc-eQTL 3.31e-02 -0.274 0.128 0.09 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 1.46e-02 -0.353 0.144 0.09 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 5.32e-01 0.0611 0.0977 0.09 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 3.75e-01 -0.125 0.141 0.09 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 966964 sc-eQTL 1.46e-01 -0.199 0.137 0.09 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0243 0.0742 0.09 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 1.66e-01 0.174 0.125 0.09 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 7.60e-02 0.212 0.119 0.09 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 3.17e-01 -0.126 0.125 0.09 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 3.93e-01 0.0551 0.0643 0.09 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 9.92e-01 0.00138 0.135 0.09 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 8.33e-01 0.0221 0.105 0.09 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 7.94e-01 0.0388 0.149 0.09 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 502716 sc-eQTL 2.52e-01 0.176 0.153 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 5.50e-01 0.0835 0.139 0.097 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0243 0.158 0.097 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0287 0.167 0.097 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0395 0.165 0.097 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0593 0.122 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 6.06e-02 -0.221 0.117 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0811 0.133 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0609 0.155 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 1.71e-02 -0.279 0.116 0.091 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 1.84e-01 -0.18 0.135 0.091 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0192 0.134 0.091 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 1.70e-01 -0.214 0.156 0.091 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 1.78e-01 -0.132 0.0979 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 3.27e-02 -0.219 0.102 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 1.20e-01 -0.189 0.121 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0502 0.152 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0606 0.125 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 1.18e-02 -0.298 0.117 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 6.10e-01 0.0716 0.14 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 6.34e-01 0.0788 0.165 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 5.79e-01 0.066 0.119 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 6.49e-01 0.0765 0.167 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 1.06e-01 0.274 0.169 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 8.48e-01 0.0328 0.17 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 9.82e-01 0.00167 0.0748 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 5.72e-02 0.205 0.107 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 6.86e-01 0.0438 0.108 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 1.76e-04 0.437 0.114 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 5.42e-01 0.0447 0.0731 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 1.07e-02 0.315 0.122 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 1.78e-01 0.164 0.122 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 3.06e-03 0.402 0.134 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 6.13e-02 -0.163 0.0867 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0714 0.135 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 1.65e-02 0.299 0.124 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 5.88e-05 0.615 0.15 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0961 0.0835 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 1.97e-02 0.351 0.149 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 8.75e-02 0.235 0.137 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 8.73e-01 0.0227 0.142 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 1.08e-01 -0.171 0.106 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0232 0.127 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 1.01e-01 0.22 0.134 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 2.38e-01 0.17 0.144 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 2.27e-02 -0.259 0.113 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0254 0.168 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 2.75e-01 0.155 0.142 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0213 0.161 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 4.67e-02 -0.267 0.133 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 3.90e-01 0.142 0.164 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 5.38e-01 0.0998 0.162 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 5.06e-01 0.109 0.163 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 5.26e-01 0.0594 0.0936 0.089 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 4.37e-01 -0.113 0.145 0.089 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00706 0.122 0.089 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 5.64e-01 0.0914 0.158 0.089 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 502716 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0614 0.157 0.089 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0835 0.0924 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 1.40e-01 0.202 0.136 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 1.46e-02 0.353 0.143 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0679 0.153 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00594 0.0799 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 8.94e-01 0.0192 0.144 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 1.87e-01 0.168 0.127 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0844 0.14 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 8.26e-01 0.0274 0.124 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 7.20e-01 0.0585 0.163 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0524 0.151 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 8.22e-01 0.0337 0.149 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00851 0.0867 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 1.08e-01 0.235 0.146 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0173 0.14 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 1.19e-01 -0.229 0.146 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 5.18e-01 0.111 0.171 0.078 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 6.21e-01 0.0749 0.151 0.078 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 4.22e-01 0.156 0.193 0.078 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 9.02e-01 0.0278 0.224 0.078 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 3.62e-01 0.0908 0.0995 0.091 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 3.29e-01 0.129 0.131 0.091 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 7.84e-01 0.0436 0.159 0.091 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 5.09e-01 0.0964 0.146 0.091 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 502716 sc-eQTL 1.38e-01 0.175 0.117 0.091 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 5.61e-01 0.0632 0.109 0.09 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 4.52e-01 0.104 0.137 0.09 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0454 0.125 0.09 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 6.67e-03 0.434 0.158 0.09 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 6.08e-01 0.0698 0.136 0.1 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 995922 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0363 0.141 0.1 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 2.07e-01 -0.153 0.121 0.1 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0569 0.16 0.1 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0705 0.163 0.1 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 966964 sc-eQTL 2.45e-02 -0.307 0.136 0.1 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 4.16e-01 0.0958 0.118 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 995922 sc-eQTL 2.63e-03 -0.383 0.126 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 1.43e-02 -0.338 0.137 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 3.36e-01 0.103 0.107 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0178 0.152 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 966964 sc-eQTL 2.66e-01 -0.158 0.141 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 4.19e-01 -0.107 0.132 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 995922 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0513 0.148 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 6.90e-02 -0.269 0.147 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 7.00e-01 0.0466 0.121 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 2.01e-01 -0.206 0.16 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 966964 sc-eQTL 1.62e-02 -0.363 0.15 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 6.72e-01 0.0557 0.131 0.091 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 3.29e-01 -0.192 0.196 0.091 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 8.31e-01 0.0388 0.182 0.091 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 8.66e-01 0.0329 0.194 0.091 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 502716 sc-eQTL 8.08e-02 0.296 0.168 0.091 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 2.86e-01 0.158 0.148 0.093 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 995922 sc-eQTL 6.99e-01 0.0579 0.15 0.093 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 5.57e-03 -0.422 0.151 0.093 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 9.11e-01 0.0153 0.137 0.093 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00318 0.152 0.093 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 966964 sc-eQTL 1.69e-01 -0.21 0.152 0.093 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 5.30e-01 0.0733 0.117 0.095 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 995922 sc-eQTL 1.77e-01 -0.176 0.13 0.095 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 9.50e-02 -0.242 0.144 0.095 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 2.71e-01 0.137 0.124 0.095 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0638 0.135 0.095 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 966964 sc-eQTL 5.03e-01 -0.103 0.154 0.095 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 1.34e-01 -0.228 0.151 0.099 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 995922 sc-eQTL 6.04e-01 0.0668 0.129 0.099 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 3.31e-01 -0.14 0.144 0.099 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 8.75e-01 0.0278 0.176 0.099 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 4.98e-01 0.115 0.169 0.099 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 966964 sc-eQTL 2.39e-01 -0.171 0.145 0.099 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 9.70e-02 -0.17 0.102 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 6.59e-02 -0.196 0.106 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0906 0.122 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0904 0.155 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 2.08e-01 -0.112 0.0887 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 3.29e-02 -0.212 0.0989 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 2.15e-01 -0.141 0.113 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0408 0.152 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 7.32e-01 0.0365 0.106 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 995922 sc-eQTL 1.21e-02 -0.321 0.127 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 2.28e-02 -0.32 0.14 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 4.75e-01 0.073 0.102 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0869 0.154 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 966964 sc-eQTL 8.99e-02 -0.242 0.142 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 3.42e-01 0.103 0.108 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 995922 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0955 0.128 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 7.26e-03 -0.378 0.14 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 7.61e-01 0.032 0.105 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0375 0.139 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 966964 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0595 0.147 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 591807 sc-eQTL 6.60e-01 -0.033 0.075 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 948767 sc-eQTL 2.86e-01 0.139 0.13 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 797912 sc-eQTL 3.53e-01 0.111 0.119 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 85064 sc-eQTL 1.86e-01 -0.168 0.127 0.091 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 85064 eQTL 0.868 -0.00649 0.0389 0.00318 0.0 0.0932
ENSG00000257878 AC007298.2 995766 eQTL 0.0231 0.0429 0.0189 0.00201 0.0 0.0932


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000257878 AC007298.2 995766 2.67e-07 1.3e-07 5.03e-08 1.86e-07 9.79e-08 9.91e-08 1.61e-07 5.53e-08 1.45e-07 5.67e-08 1.55e-07 1.01e-07 1.52e-07 7.13e-08 6.12e-08 7.49e-08 4.09e-08 1.4e-07 6.07e-08 4.21e-08 1.21e-07 1.24e-07 1.45e-07 2.93e-08 1.5e-07 1.25e-07 1.1e-07 9.74e-08 1.16e-07 1.07e-07 9.92e-08 3.68e-08 3.66e-08 8.23e-08 6.67e-08 3.2e-08 5.04e-08 8.63e-08 6.37e-08 3.76e-08 5.13e-08 1.36e-07 5.2e-08 2.03e-08 4.7e-08 1.84e-08 1.21e-07 3.78e-09 5.02e-08