Genes within 1Mb (chr12:96991143:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 1.60e-01 -0.112 0.0796 0.09 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 5.08e-02 -0.193 0.0984 0.09 B L1
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 1.51e-01 -0.152 0.105 0.09 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 4.03e-01 -0.117 0.14 0.09 B L1
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 9.48e-01 0.00439 0.0668 0.09 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 2.24e-02 0.209 0.0907 0.09 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 2.19e-01 0.122 0.0991 0.09 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 3.20e-09 0.609 0.0985 0.09 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 8.75e-02 -0.117 0.0679 0.09 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 5.39e-01 0.0451 0.0734 0.09 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 5.56e-01 0.0652 0.11 0.09 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 1.10e-01 0.192 0.12 0.09 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 3.80e-01 -0.108 0.123 0.092 DC L1
ENSG00000084110 HAL 994778 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0867 0.141 0.092 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0808 0.115 0.092 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 4.75e-01 0.101 0.141 0.092 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 8.26e-02 0.261 0.149 0.092 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 965820 sc-eQTL 1.34e-01 -0.203 0.135 0.092 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 8.92e-01 0.0139 0.102 0.09 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 994778 sc-eQTL 3.31e-02 -0.274 0.128 0.09 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 1.46e-02 -0.353 0.144 0.09 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 5.32e-01 0.0611 0.0977 0.09 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 3.75e-01 -0.125 0.141 0.09 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 965820 sc-eQTL 1.46e-01 -0.199 0.137 0.09 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0243 0.0742 0.09 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 1.66e-01 0.174 0.125 0.09 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 7.60e-02 0.212 0.119 0.09 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 3.17e-01 -0.126 0.125 0.09 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 3.93e-01 0.0551 0.0643 0.09 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 9.92e-01 0.00138 0.135 0.09 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 8.33e-01 0.0221 0.105 0.09 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 7.94e-01 0.0388 0.149 0.09 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 501572 sc-eQTL 2.52e-01 0.176 0.153 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 5.50e-01 0.0835 0.139 0.097 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0243 0.158 0.097 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0287 0.167 0.097 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0395 0.165 0.097 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0593 0.122 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 6.06e-02 -0.221 0.117 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0811 0.133 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0609 0.155 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 1.71e-02 -0.279 0.116 0.091 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 1.84e-01 -0.18 0.135 0.091 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0192 0.134 0.091 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 1.70e-01 -0.214 0.156 0.091 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 1.78e-01 -0.132 0.0979 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 3.27e-02 -0.219 0.102 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 1.20e-01 -0.189 0.121 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0502 0.152 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0606 0.125 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 1.18e-02 -0.298 0.117 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 6.10e-01 0.0716 0.14 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 6.34e-01 0.0788 0.165 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 5.79e-01 0.066 0.119 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 6.49e-01 0.0765 0.167 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 1.06e-01 0.274 0.169 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 8.48e-01 0.0328 0.17 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 9.82e-01 0.00167 0.0748 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 5.72e-02 0.205 0.107 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 6.86e-01 0.0438 0.108 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 1.76e-04 0.437 0.114 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 5.42e-01 0.0447 0.0731 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 1.07e-02 0.315 0.122 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 1.78e-01 0.164 0.122 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 3.06e-03 0.402 0.134 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 6.13e-02 -0.163 0.0867 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0714 0.135 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 1.65e-02 0.299 0.124 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 5.88e-05 0.615 0.15 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0961 0.0835 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 1.97e-02 0.351 0.149 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 8.75e-02 0.235 0.137 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 8.73e-01 0.0227 0.142 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 1.08e-01 -0.171 0.106 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0232 0.127 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 1.01e-01 0.22 0.134 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 2.38e-01 0.17 0.144 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 2.27e-02 -0.259 0.113 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0254 0.168 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 2.75e-01 0.155 0.142 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0213 0.161 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 4.67e-02 -0.267 0.133 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 3.90e-01 0.142 0.164 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 5.38e-01 0.0998 0.162 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 5.06e-01 0.109 0.163 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 5.26e-01 0.0594 0.0936 0.089 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 4.37e-01 -0.113 0.145 0.089 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00706 0.122 0.089 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 5.64e-01 0.0914 0.158 0.089 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 501572 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0614 0.157 0.089 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0835 0.0924 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 1.40e-01 0.202 0.136 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 1.46e-02 0.353 0.143 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0679 0.153 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00594 0.0799 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 8.94e-01 0.0192 0.144 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 1.87e-01 0.168 0.127 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0844 0.14 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 8.26e-01 0.0274 0.124 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 7.20e-01 0.0585 0.163 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0524 0.151 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 8.22e-01 0.0337 0.149 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00851 0.0867 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 1.08e-01 0.235 0.146 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0173 0.14 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 1.19e-01 -0.229 0.146 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 5.18e-01 0.111 0.171 0.078 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 6.21e-01 0.0749 0.151 0.078 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 4.22e-01 0.156 0.193 0.078 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 9.02e-01 0.0278 0.224 0.078 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 3.62e-01 0.0908 0.0995 0.091 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 3.29e-01 0.129 0.131 0.091 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 7.84e-01 0.0436 0.159 0.091 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 5.09e-01 0.0964 0.146 0.091 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 501572 sc-eQTL 1.38e-01 0.175 0.117 0.091 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 5.61e-01 0.0632 0.109 0.09 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 4.52e-01 0.104 0.137 0.09 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0454 0.125 0.09 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 6.67e-03 0.434 0.158 0.09 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 6.08e-01 0.0698 0.136 0.1 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 994778 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0363 0.141 0.1 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 2.07e-01 -0.153 0.121 0.1 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0569 0.16 0.1 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0705 0.163 0.1 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 965820 sc-eQTL 2.45e-02 -0.307 0.136 0.1 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 4.16e-01 0.0958 0.118 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 994778 sc-eQTL 2.63e-03 -0.383 0.126 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 1.43e-02 -0.338 0.137 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 3.36e-01 0.103 0.107 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0178 0.152 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 965820 sc-eQTL 2.66e-01 -0.158 0.141 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 4.19e-01 -0.107 0.132 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 994778 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0513 0.148 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 6.90e-02 -0.269 0.147 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 7.00e-01 0.0466 0.121 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 2.01e-01 -0.206 0.16 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 965820 sc-eQTL 1.62e-02 -0.363 0.15 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 6.72e-01 0.0557 0.131 0.091 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 3.29e-01 -0.192 0.196 0.091 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 8.31e-01 0.0388 0.182 0.091 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 8.66e-01 0.0329 0.194 0.091 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 501572 sc-eQTL 8.08e-02 0.296 0.168 0.091 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 2.86e-01 0.158 0.148 0.093 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 994778 sc-eQTL 6.99e-01 0.0579 0.15 0.093 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 5.57e-03 -0.422 0.151 0.093 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 9.11e-01 0.0153 0.137 0.093 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00318 0.152 0.093 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 965820 sc-eQTL 1.69e-01 -0.21 0.152 0.093 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 5.30e-01 0.0733 0.117 0.095 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 994778 sc-eQTL 1.77e-01 -0.176 0.13 0.095 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 9.50e-02 -0.242 0.144 0.095 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 2.71e-01 0.137 0.124 0.095 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0638 0.135 0.095 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 965820 sc-eQTL 5.03e-01 -0.103 0.154 0.095 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 1.34e-01 -0.228 0.151 0.099 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 994778 sc-eQTL 6.04e-01 0.0668 0.129 0.099 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 3.31e-01 -0.14 0.144 0.099 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 8.75e-01 0.0278 0.176 0.099 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 4.98e-01 0.115 0.169 0.099 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 965820 sc-eQTL 2.39e-01 -0.171 0.145 0.099 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 9.70e-02 -0.17 0.102 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 6.59e-02 -0.196 0.106 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0906 0.122 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0904 0.155 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 2.08e-01 -0.112 0.0887 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 3.29e-02 -0.212 0.0989 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 2.15e-01 -0.141 0.113 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0408 0.152 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 7.32e-01 0.0365 0.106 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 994778 sc-eQTL 1.21e-02 -0.321 0.127 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 2.28e-02 -0.32 0.14 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 4.75e-01 0.073 0.102 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0869 0.154 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 965820 sc-eQTL 8.99e-02 -0.242 0.142 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 3.42e-01 0.103 0.108 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 994778 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0955 0.128 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 7.26e-03 -0.378 0.14 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 7.61e-01 0.032 0.105 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0375 0.139 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 965820 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0595 0.147 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 590663 sc-eQTL 6.60e-01 -0.033 0.075 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 947623 sc-eQTL 2.86e-01 0.139 0.13 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 796768 sc-eQTL 3.53e-01 0.111 0.119 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 83920 sc-eQTL 1.86e-01 -0.168 0.127 0.091 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 83920 eQTL 0.868 -0.00645 0.0389 0.00318 0.0 0.0932
ENSG00000257878 AC007298.2 994622 eQTL 0.0233 0.0428 0.0188 0.00199 0.0 0.0932


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000257878 AC007298.2 994622 2.67e-07 1.3e-07 4.98e-08 1.81e-07 9.79e-08 9.9e-08 1.61e-07 5.53e-08 1.45e-07 5.42e-08 1.52e-07 9.19e-08 1.52e-07 7.13e-08 5.91e-08 7.49e-08 4.09e-08 1.4e-07 5.97e-08 4.23e-08 1.21e-07 1.24e-07 1.45e-07 2.93e-08 1.5e-07 1.21e-07 1.07e-07 9.74e-08 1.16e-07 1.05e-07 1.02e-07 3.08e-08 3.96e-08 8e-08 6.67e-08 3.62e-08 4.99e-08 9.23e-08 6.55e-08 3.92e-08 5.42e-08 1.33e-07 5.2e-08 1.58e-08 3.84e-08 1.86e-08 1.18e-07 3.79e-09 5.01e-08