Genes within 1Mb (chr12:96990960:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 1.60e-01 -0.112 0.0796 0.09 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 5.08e-02 -0.193 0.0984 0.09 B L1
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 1.51e-01 -0.152 0.105 0.09 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 4.03e-01 -0.117 0.14 0.09 B L1
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 9.48e-01 0.00439 0.0668 0.09 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 2.24e-02 0.209 0.0907 0.09 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 2.19e-01 0.122 0.0991 0.09 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 3.20e-09 0.609 0.0985 0.09 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 8.75e-02 -0.117 0.0679 0.09 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 5.39e-01 0.0451 0.0734 0.09 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 5.56e-01 0.0652 0.11 0.09 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 1.10e-01 0.192 0.12 0.09 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 3.80e-01 -0.108 0.123 0.092 DC L1
ENSG00000084110 HAL 994595 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0867 0.141 0.092 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0808 0.115 0.092 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 4.75e-01 0.101 0.141 0.092 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 8.26e-02 0.261 0.149 0.092 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 965637 sc-eQTL 1.34e-01 -0.203 0.135 0.092 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 8.92e-01 0.0139 0.102 0.09 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 994595 sc-eQTL 3.31e-02 -0.274 0.128 0.09 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 1.46e-02 -0.353 0.144 0.09 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 5.32e-01 0.0611 0.0977 0.09 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 3.75e-01 -0.125 0.141 0.09 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 965637 sc-eQTL 1.46e-01 -0.199 0.137 0.09 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0243 0.0742 0.09 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 1.66e-01 0.174 0.125 0.09 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 7.60e-02 0.212 0.119 0.09 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 3.17e-01 -0.126 0.125 0.09 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 3.93e-01 0.0551 0.0643 0.09 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 9.92e-01 0.00138 0.135 0.09 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 8.33e-01 0.0221 0.105 0.09 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 7.94e-01 0.0388 0.149 0.09 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 501389 sc-eQTL 2.52e-01 0.176 0.153 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 5.50e-01 0.0835 0.139 0.097 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0243 0.158 0.097 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0287 0.167 0.097 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0395 0.165 0.097 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0593 0.122 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 6.06e-02 -0.221 0.117 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0811 0.133 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0609 0.155 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 1.71e-02 -0.279 0.116 0.091 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 1.84e-01 -0.18 0.135 0.091 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0192 0.134 0.091 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 1.70e-01 -0.214 0.156 0.091 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 1.78e-01 -0.132 0.0979 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 3.27e-02 -0.219 0.102 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 1.20e-01 -0.189 0.121 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0502 0.152 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0606 0.125 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 1.18e-02 -0.298 0.117 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 6.10e-01 0.0716 0.14 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 6.34e-01 0.0788 0.165 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 5.79e-01 0.066 0.119 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 6.49e-01 0.0765 0.167 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 1.06e-01 0.274 0.169 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 8.48e-01 0.0328 0.17 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 9.82e-01 0.00167 0.0748 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 5.72e-02 0.205 0.107 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 6.86e-01 0.0438 0.108 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 1.76e-04 0.437 0.114 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 5.42e-01 0.0447 0.0731 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 1.07e-02 0.315 0.122 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 1.78e-01 0.164 0.122 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 3.06e-03 0.402 0.134 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 6.13e-02 -0.163 0.0867 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0714 0.135 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 1.65e-02 0.299 0.124 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 5.88e-05 0.615 0.15 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0961 0.0835 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 1.97e-02 0.351 0.149 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 8.75e-02 0.235 0.137 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 8.73e-01 0.0227 0.142 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 1.08e-01 -0.171 0.106 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0232 0.127 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 1.01e-01 0.22 0.134 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 2.38e-01 0.17 0.144 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 2.27e-02 -0.259 0.113 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0254 0.168 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 2.75e-01 0.155 0.142 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0213 0.161 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 4.67e-02 -0.267 0.133 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 3.90e-01 0.142 0.164 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 5.38e-01 0.0998 0.162 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 5.06e-01 0.109 0.163 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 5.26e-01 0.0594 0.0936 0.089 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 4.37e-01 -0.113 0.145 0.089 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00706 0.122 0.089 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 5.64e-01 0.0914 0.158 0.089 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 501389 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0614 0.157 0.089 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0835 0.0924 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 1.40e-01 0.202 0.136 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 1.46e-02 0.353 0.143 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0679 0.153 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00594 0.0799 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 8.94e-01 0.0192 0.144 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 1.87e-01 0.168 0.127 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0844 0.14 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 8.26e-01 0.0274 0.124 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 7.20e-01 0.0585 0.163 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0524 0.151 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 8.22e-01 0.0337 0.149 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00851 0.0867 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 1.08e-01 0.235 0.146 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0173 0.14 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 1.19e-01 -0.229 0.146 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 5.18e-01 0.111 0.171 0.078 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 6.21e-01 0.0749 0.151 0.078 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 4.22e-01 0.156 0.193 0.078 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 9.02e-01 0.0278 0.224 0.078 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 3.62e-01 0.0908 0.0995 0.091 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 3.29e-01 0.129 0.131 0.091 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 7.84e-01 0.0436 0.159 0.091 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 5.09e-01 0.0964 0.146 0.091 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 501389 sc-eQTL 1.38e-01 0.175 0.117 0.091 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 5.61e-01 0.0632 0.109 0.09 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 4.52e-01 0.104 0.137 0.09 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0454 0.125 0.09 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 6.67e-03 0.434 0.158 0.09 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 6.08e-01 0.0698 0.136 0.1 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 994595 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0363 0.141 0.1 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 2.07e-01 -0.153 0.121 0.1 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0569 0.16 0.1 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0705 0.163 0.1 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 965637 sc-eQTL 2.45e-02 -0.307 0.136 0.1 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 4.16e-01 0.0958 0.118 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 994595 sc-eQTL 2.63e-03 -0.383 0.126 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 1.43e-02 -0.338 0.137 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 3.36e-01 0.103 0.107 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0178 0.152 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 965637 sc-eQTL 2.66e-01 -0.158 0.141 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 4.19e-01 -0.107 0.132 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 994595 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0513 0.148 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 6.90e-02 -0.269 0.147 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 7.00e-01 0.0466 0.121 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 2.01e-01 -0.206 0.16 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 965637 sc-eQTL 1.62e-02 -0.363 0.15 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 6.72e-01 0.0557 0.131 0.091 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 3.29e-01 -0.192 0.196 0.091 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 8.31e-01 0.0388 0.182 0.091 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 8.66e-01 0.0329 0.194 0.091 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 501389 sc-eQTL 8.08e-02 0.296 0.168 0.091 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 2.86e-01 0.158 0.148 0.093 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 994595 sc-eQTL 6.99e-01 0.0579 0.15 0.093 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 5.57e-03 -0.422 0.151 0.093 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 9.11e-01 0.0153 0.137 0.093 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00318 0.152 0.093 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 965637 sc-eQTL 1.69e-01 -0.21 0.152 0.093 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 5.30e-01 0.0733 0.117 0.095 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 994595 sc-eQTL 1.77e-01 -0.176 0.13 0.095 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 9.50e-02 -0.242 0.144 0.095 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 2.71e-01 0.137 0.124 0.095 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0638 0.135 0.095 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 965637 sc-eQTL 5.03e-01 -0.103 0.154 0.095 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 1.34e-01 -0.228 0.151 0.099 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 994595 sc-eQTL 6.04e-01 0.0668 0.129 0.099 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 3.31e-01 -0.14 0.144 0.099 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 8.75e-01 0.0278 0.176 0.099 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 4.98e-01 0.115 0.169 0.099 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 965637 sc-eQTL 2.39e-01 -0.171 0.145 0.099 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 9.70e-02 -0.17 0.102 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 6.59e-02 -0.196 0.106 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0906 0.122 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0904 0.155 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 2.08e-01 -0.112 0.0887 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 3.29e-02 -0.212 0.0989 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 2.15e-01 -0.141 0.113 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0408 0.152 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 7.32e-01 0.0365 0.106 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 994595 sc-eQTL 1.21e-02 -0.321 0.127 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 2.28e-02 -0.32 0.14 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 4.75e-01 0.073 0.102 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0869 0.154 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 965637 sc-eQTL 8.99e-02 -0.242 0.142 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 3.42e-01 0.103 0.108 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 994595 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0955 0.128 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 7.26e-03 -0.378 0.14 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 7.61e-01 0.032 0.105 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0375 0.139 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 965637 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0595 0.147 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 590480 sc-eQTL 6.60e-01 -0.033 0.075 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 947440 sc-eQTL 2.86e-01 0.139 0.13 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 796585 sc-eQTL 3.53e-01 0.111 0.119 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 83737 sc-eQTL 1.86e-01 -0.168 0.127 0.091 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 83737 eQTL 0.87 -0.00637 0.0389 0.00319 0.0 0.0932
ENSG00000257878 AC007298.2 994439 eQTL 0.023 0.0429 0.0189 0.002 0.0 0.0932


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000257878 AC007298.2 994439 2.67e-07 1.25e-07 3.88e-08 1.9e-07 9.79e-08 9.76e-08 1.44e-07 5.4e-08 1.44e-07 4.74e-08 1.6e-07 8.14e-08 1.41e-07 6.56e-08 6e-08 7.37e-08 3.98e-08 1.26e-07 5.97e-08 4e-08 1.21e-07 1.23e-07 1.32e-07 3.42e-08 1.37e-07 1.14e-07 1.06e-07 9.57e-08 1.05e-07 1.02e-07 9.64e-08 3.66e-08 3.3e-08 8e-08 8.21e-08 2.99e-08 5.45e-08 9.23e-08 6.55e-08 3.86e-08 4.36e-08 1.33e-07 5.22e-08 1.43e-08 4.92e-08 1.87e-08 1.19e-07 3.81e-09 4.99e-08