Genes within 1Mb (chr12:96940953:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0267 0.0549 0.207 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 4.98e-01 0.0462 0.0681 0.207 B L1
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 6.50e-01 0.033 0.0726 0.207 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0763 0.0961 0.207 B L1
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 6.71e-01 0.0193 0.0455 0.207 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 2.78e-01 0.0679 0.0624 0.207 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 3.56e-01 0.0626 0.0676 0.207 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 2.18e-01 -0.0899 0.0727 0.207 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 9.57e-01 0.00249 0.0466 0.207 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00574 0.05 0.207 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0459 0.0752 0.207 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 6.59e-01 0.0362 0.0819 0.207 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 1.32e-01 -0.13 0.0857 0.207 DC L1
ENSG00000084110 HAL 944588 sc-eQTL 3.24e-01 0.0967 0.0979 0.207 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 5.83e-02 -0.151 0.0795 0.207 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 1.16e-01 0.154 0.0976 0.207 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 8.40e-01 0.0212 0.105 0.207 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 915630 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0739 0.0946 0.207 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0599 0.0694 0.207 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 944588 sc-eQTL 5.39e-01 0.0539 0.0875 0.207 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0876 0.0987 0.207 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0721 0.0662 0.207 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 6.39e-05 -0.378 0.0926 0.207 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 915630 sc-eQTL 8.34e-01 0.0195 0.0932 0.207 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 8.47e-01 0.01 0.0517 0.208 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 3.35e-02 0.186 0.0868 0.208 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 1.99e-01 -0.107 0.0829 0.208 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0201 0.0873 0.208 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0564 0.0443 0.207 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 9.86e-02 0.153 0.0924 0.207 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00328 0.0726 0.207 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 6.36e-01 0.0487 0.103 0.207 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 451382 sc-eQTL 2.15e-02 0.243 0.105 0.207 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 5.62e-01 0.059 0.102 0.204 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00527 0.115 0.204 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 1.42e-01 0.179 0.121 0.204 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0309 0.12 0.204 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 2.19e-01 -0.104 0.084 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 4.71e-01 0.0589 0.0816 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0711 0.092 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 8.35e-02 -0.186 0.107 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 7.15e-01 0.0303 0.0829 0.207 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 5.85e-01 0.0524 0.0957 0.207 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00736 0.0941 0.207 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 1.30e-01 0.167 0.11 0.207 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0326 0.0678 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 8.22e-01 -0.016 0.071 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0794 0.0838 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 2.73e-01 0.115 0.104 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 6.71e-01 0.0365 0.0858 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 5.34e-01 0.0506 0.0813 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 2.50e-01 0.11 0.0956 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 4.27e-02 -0.229 0.112 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00271 0.0802 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 6.86e-01 0.0457 0.113 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0976 0.114 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0893 0.115 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 6.12e-01 0.0254 0.0499 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 3.41e-01 0.0687 0.0721 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 3.80e-01 0.0635 0.0721 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 2.27e-01 -0.0954 0.0788 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 6.81e-01 0.0204 0.0494 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 4.26e-01 0.0669 0.0838 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 4.65e-01 0.0603 0.0825 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 5.02e-01 0.0621 0.0924 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 7.70e-01 0.0176 0.06 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0263 0.0926 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 2.12e-01 0.107 0.0857 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 8.17e-02 -0.186 0.106 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 5.93e-01 0.0307 0.0574 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0209 0.104 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 4.57e-01 0.0702 0.0943 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 2.59e-02 0.216 0.0961 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 6.74e-01 0.0291 0.069 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 1.56e-01 0.117 0.0823 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0258 0.0875 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0645 0.0935 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 4.72e-01 0.0564 0.0784 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0364 0.115 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 1.09e-01 -0.156 0.097 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 2.05e-01 -0.139 0.11 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0786 0.0955 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 9.26e-01 0.0108 0.117 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 3.67e-01 0.104 0.115 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0324 0.116 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0705 0.0629 0.203 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 2.57e-01 0.11 0.0972 0.203 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 8.53e-01 0.0152 0.0818 0.203 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 1.27e-01 0.162 0.106 0.203 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 451382 sc-eQTL 1.65e-01 0.146 0.105 0.203 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0174 0.0652 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 3.74e-04 0.338 0.0935 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 2.38e-02 -0.23 0.101 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0361 0.108 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 5.58e-01 0.0325 0.0553 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 2.34e-02 0.226 0.0988 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0923 0.0883 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0107 0.0971 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 9.42e-01 0.00619 0.0854 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 5.18e-02 0.217 0.111 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 2.22e-01 0.127 0.103 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0454 0.102 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0693 0.0601 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 2.48e-01 0.118 0.102 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 9.92e-01 0.000955 0.0976 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0851 0.102 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 2.17e-01 -0.133 0.107 0.23 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 2.95e-01 0.0996 0.0946 0.23 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 7.35e-01 0.0413 0.122 0.23 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 3.69e-01 -0.127 0.141 0.23 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 1.58e-03 -0.212 0.0663 0.211 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 4.01e-02 0.183 0.0887 0.211 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0513 0.108 0.211 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 8.58e-02 -0.17 0.0986 0.211 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 451382 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0335 0.0803 0.211 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0588 0.0761 0.207 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 8.88e-01 0.0135 0.0965 0.207 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0859 0.0873 0.207 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0828 0.113 0.207 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 3.56e-01 -0.085 0.0919 0.215 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 944588 sc-eQTL 1.09e-01 0.153 0.0951 0.215 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 8.94e-01 -0.011 0.0821 0.215 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 5.85e-03 0.296 0.106 0.215 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 2.87e-01 0.118 0.11 0.215 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 915630 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0269 0.0931 0.215 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0738 0.0796 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 944588 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0153 0.0871 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 2.53e-01 -0.107 0.0937 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0565 0.0723 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 6.47e-04 -0.347 0.1 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 915630 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0801 0.0959 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00334 0.0912 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 944588 sc-eQTL 7.79e-01 0.0287 0.102 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 6.17e-02 -0.19 0.101 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0494 0.0832 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 6.94e-02 -0.201 0.11 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 915630 sc-eQTL 5.26e-01 0.0664 0.104 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 7.81e-01 0.0244 0.0874 0.206 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 5.10e-01 0.0863 0.131 0.206 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0274 0.121 0.206 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0423 0.129 0.206 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 451382 sc-eQTL 5.80e-01 0.0626 0.113 0.206 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 2.18e-01 0.122 0.0988 0.207 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 944588 sc-eQTL 1.68e-01 0.138 0.0998 0.207 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 7.17e-01 0.0374 0.103 0.207 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0135 0.0916 0.207 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 2.28e-01 -0.123 0.101 0.207 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 915630 sc-eQTL 5.95e-01 0.0544 0.102 0.207 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0204 0.082 0.213 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 944588 sc-eQTL 2.36e-01 0.108 0.0912 0.213 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 8.47e-01 0.0197 0.102 0.213 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 1.70e-01 -0.12 0.0872 0.213 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0714 0.0949 0.213 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 915630 sc-eQTL 7.36e-02 -0.194 0.108 0.213 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0528 0.105 0.218 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 944588 sc-eQTL 4.65e-01 0.065 0.0888 0.218 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00519 0.0995 0.218 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0216 0.122 0.218 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 3.87e-01 -0.101 0.117 0.218 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 915630 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0996 0.1 0.218 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0917 0.0713 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 3.27e-01 0.0728 0.0742 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00916 0.0849 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0583 0.108 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 9.64e-01 0.00281 0.0613 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 4.99e-01 0.0466 0.0688 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 9.73e-01 0.00269 0.0784 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0367 0.104 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0591 0.0718 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 944588 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0287 0.0871 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 2.00e-01 -0.122 0.0953 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0502 0.069 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 5.24e-04 -0.358 0.102 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 915630 sc-eQTL 9.96e-01 0.000497 0.0969 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000569 0.0737 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 944588 sc-eQTL 2.02e-01 0.111 0.0868 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 9.43e-01 0.00689 0.0966 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 3.34e-01 -0.069 0.0713 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 1.93e-01 -0.123 0.0942 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 915630 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0539 0.1 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 540473 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0204 0.0526 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 897433 sc-eQTL 7.39e-02 0.163 0.0908 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 746578 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0877 0.0835 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 33730 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0234 0.0893 0.209 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 33730 eQTL 2.23e-26 -0.284 0.0259 0.0 0.0 0.222
ENSG00000257715 AC007298.1 915630 eQTL 0.0409 0.0449 0.0219 0.0 0.0 0.222
ENSG00000257878 AC007298.2 944432 eQTL 0.044 0.0269 0.0133 0.0 0.0 0.222


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111144 \N 897433 2.74e-07 1.3e-07 4.48e-08 1.81e-07 9.24e-08 9.9e-08 1.53e-07 5.53e-08 1.45e-07 5.42e-08 1.54e-07 9e-08 1.47e-07 6.76e-08 6.02e-08 7.53e-08 4.17e-08 1.27e-07 5.97e-08 4.16e-08 1.21e-07 1.27e-07 1.44e-07 3.03e-08 1.46e-07 1.21e-07 1.07e-07 9.65e-08 1.09e-07 1.07e-07 9.92e-08 2.93e-08 3.66e-08 8.25e-08 8.21e-08 3.53e-08 5.61e-08 8.61e-08 6.86e-08 3.87e-08 3.89e-08 1.35e-07 5.24e-08 1.3e-08 4.67e-08 1.84e-08 1.22e-07 1.88e-09 4.99e-08
ENSG00000139350 NEDD1 33730 1.29e-05 1.46e-05 2.55e-06 8.87e-06 2.55e-06 6.22e-06 2.04e-05 2.78e-06 1.45e-05 6.99e-06 1.84e-05 7.21e-06 2.53e-05 5.79e-06 4.38e-06 9.08e-06 8.14e-06 1.21e-05 4.19e-06 4.08e-06 7.26e-06 1.36e-05 1.37e-05 4.71e-06 2.42e-05 5.22e-06 7.67e-06 6.24e-06 1.58e-05 1.48e-05 1.05e-05 1.03e-06 1.38e-06 3.99e-06 6.33e-06 3.74e-06 1.79e-06 2.6e-06 2.65e-06 1.88e-06 1.19e-06 1.85e-05 2.48e-06 2.52e-07 1.55e-06 2.34e-06 2.4e-06 8.47e-07 6.66e-07
ENSG00000257715 AC007298.1 915630 2.69e-07 1.3e-07 4.47e-08 1.86e-07 9.25e-08 9.76e-08 1.49e-07 5.53e-08 1.44e-07 4.94e-08 1.57e-07 8.68e-08 1.45e-07 6.76e-08 6.17e-08 7.53e-08 4.17e-08 1.26e-07 5.75e-08 4.16e-08 1.19e-07 1.27e-07 1.39e-07 2.95e-08 1.4e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.65e-08 1.08e-07 1.07e-07 9.92e-08 3.1e-08 3.61e-08 8.25e-08 8.38e-08 3.49e-08 5.3e-08 8.71e-08 6.63e-08 4.02e-08 3.92e-08 1.35e-07 5.21e-08 1.86e-08 4.7e-08 1.84e-08 1.21e-07 1.88e-09 5e-08
ENSG00000257878 AC007298.2 944432 2.69e-07 1.25e-07 4.08e-08 1.84e-07 9.25e-08 9.8e-08 1.49e-07 5.48e-08 1.44e-07 4.94e-08 1.62e-07 8.55e-08 1.41e-07 6.76e-08 5.99e-08 7.3e-08 3.93e-08 1.26e-07 5.82e-08 4.04e-08 1.13e-07 1.28e-07 1.39e-07 3.23e-08 1.4e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.57e-08 1.08e-07 1.03e-07 9.7e-08 3.08e-08 3.56e-08 8.34e-08 8.74e-08 3.65e-08 5.29e-08 8.93e-08 6.37e-08 3.98e-08 4.02e-08 1.33e-07 5.2e-08 1.58e-08 4.92e-08 1.83e-08 1.21e-07 3.78e-09 5.01e-08