logo

Genes within 1Mb (chr12:96856675:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 3.69e-02 -0.104 0.0493 0.248 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 2.88e-01 0.0658 0.0617 0.248 B L1
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 8.84e-01 0.00963 0.0658 0.248 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0351 0.0598 0.248 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0318 0.0873 0.248 B L1
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 7.15e-01 -0.015 0.041 0.248 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 3.06e-02 -0.121 0.0557 0.248 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 7.41e-01 0.0202 0.061 0.248 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0189 0.0533 0.248 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 2.41e-02 -0.147 0.0649 0.248 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0226 0.0422 0.248 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 2.06e-01 0.0573 0.0452 0.248 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 8.39e-01 0.0139 0.0683 0.248 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0386 0.0559 0.248 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 2.09e-02 -0.171 0.0734 0.248 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 5.11e-01 0.0515 0.0783 0.245 DC L1
ENSG00000084110 HAL 860310 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0594 0.0891 0.245 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 1.94e-01 0.0947 0.0727 0.245 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0177 0.0893 0.245 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 4.17e-01 0.0604 0.0742 0.245 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 9.36e-01 0.00764 0.0954 0.245 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 831352 sc-eQTL 6.01e-01 0.045 0.0861 0.245 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0174 0.063 0.248 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 860310 sc-eQTL 5.61e-01 0.0462 0.0794 0.248 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 2.04e-01 0.114 0.0893 0.248 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 7.65e-01 0.018 0.0602 0.248 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0569 0.0566 0.248 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 2.46e-01 -0.101 0.0869 0.248 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 831352 sc-eQTL 3.80e-02 0.175 0.0836 0.248 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 1.42e-01 0.0691 0.0469 0.247 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 9.81e-02 -0.132 0.0795 0.247 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 3.36e-01 0.0731 0.0758 0.247 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 4.58e-01 0.0468 0.0629 0.247 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0262 0.0797 0.247 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 9.44e-01 0.00278 0.0399 0.248 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0776 0.0831 0.248 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0303 0.065 0.248 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 4.96e-01 0.0412 0.0604 0.248 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0658 0.0919 0.248 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 367104 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0434 0.0952 0.248 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 1.76e-01 -0.12 0.088 0.253 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 5.16e-01 0.0651 0.1 0.253 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0795 0.106 0.253 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 4.28e-01 0.0792 0.0998 0.253 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 5.74e-01 0.0588 0.105 0.253 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0472 0.0785 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 7.30e-01 0.0263 0.076 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0667 0.0856 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 9.41e-01 0.0063 0.0854 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 6.44e-01 0.0462 0.1 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 1.76e-01 -0.101 0.0742 0.25 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0518 0.0859 0.25 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 6.85e-01 0.0343 0.0845 0.25 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 4.50e-01 0.0677 0.0895 0.25 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 5.65e-01 0.0571 0.099 0.25 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0684 0.0624 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 3.31e-01 0.0637 0.0654 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 4.01e-01 0.0651 0.0773 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 9.87e-01 0.00127 0.0754 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 1.41e-01 -0.142 0.0962 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 6.30e-01 0.0377 0.0781 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 3.69e-01 0.0666 0.0739 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 5.20e-01 0.0563 0.0873 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 1.66e-01 -0.12 0.0863 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 7.23e-01 0.0365 0.103 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 6.92e-01 0.0291 0.0735 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 8.58e-02 -0.178 0.103 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 4.53e-01 0.0787 0.105 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 6.62e-01 0.0399 0.0912 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0137 0.105 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0198 0.045 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 8.97e-02 -0.11 0.0647 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 4.31e-01 0.0513 0.065 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0198 0.0578 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 6.17e-02 -0.133 0.0707 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 5.77e-02 -0.0827 0.0434 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 3.64e-03 -0.214 0.0727 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 9.34e-01 0.00609 0.073 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0524 0.0598 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 1.10e-01 -0.131 0.0813 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0672 0.0546 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 7.42e-01 0.0278 0.0845 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0157 0.0785 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0815 0.0821 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0723 0.0974 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 7.50e-01 0.0167 0.0522 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0295 0.0943 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0416 0.0859 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0455 0.0789 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 1.60e-02 -0.212 0.0874 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0155 0.063 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 6.31e-01 0.0363 0.0755 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 7.74e-01 0.023 0.0799 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 7.31e-01 0.0247 0.0718 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0834 0.0853 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 7.18e-01 0.0253 0.07 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0815 0.103 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 5.90e-01 0.0471 0.0871 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0901 0.1 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0894 0.0981 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 9.73e-01 0.00286 0.0846 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 9.65e-01 0.00455 0.104 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 1.12e-01 0.162 0.101 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 6.68e-01 0.0406 0.0946 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 7.45e-01 0.0335 0.103 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0481 0.0574 0.251 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 9.64e-01 0.00403 0.0888 0.251 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 7.94e-01 0.0194 0.0745 0.251 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0746 0.0862 0.251 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0657 0.0968 0.251 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 367104 sc-eQTL 8.50e-01 0.0182 0.0961 0.251 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 2.69e-01 0.0648 0.0585 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0684 0.0867 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 2.35e-01 0.109 0.0918 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 8.14e-02 0.167 0.0956 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00815 0.0972 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 3.47e-01 0.0478 0.0507 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0988 0.0915 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 3.53e-01 0.0755 0.0811 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 3.29e-01 0.0755 0.0771 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 7.81e-01 0.0248 0.089 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 5.49e-01 0.0472 0.0785 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 1.64e-02 -0.246 0.102 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 2.31e-01 -0.115 0.0953 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0403 0.0996 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 5.18e-01 -0.061 0.0942 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 1.17e-01 0.0864 0.0549 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 2.20e-01 -0.115 0.093 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 7.93e-01 0.0235 0.0894 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 3.20e-01 0.0754 0.0756 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0179 0.0936 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0856 0.1 0.252 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 5.72e-01 0.0503 0.0888 0.252 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 2.40e-02 -0.255 0.111 0.252 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 7.60e-01 -0.034 0.111 0.252 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 5.94e-01 0.0705 0.132 0.252 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 8.72e-01 0.01 0.062 0.246 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0811 0.0817 0.246 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0533 0.099 0.246 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 8.33e-01 0.0132 0.0625 0.246 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 7.18e-01 0.0329 0.0907 0.246 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 367104 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0285 0.0734 0.246 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 9.02e-02 0.114 0.0673 0.248 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 3.51e-01 -0.08 0.0856 0.248 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 7.02e-02 0.14 0.0771 0.248 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 6.40e-01 0.0422 0.09 0.248 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 6.79e-01 0.0415 0.1 0.248 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 2.61e-01 0.0948 0.0842 0.249 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 860310 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0412 0.0877 0.249 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 7.08e-01 0.0282 0.0752 0.249 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 2.32e-01 -0.119 0.0989 0.249 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 1.86e-01 0.11 0.0827 0.249 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0236 0.101 0.249 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 831352 sc-eQTL 1.73e-01 0.116 0.085 0.249 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0183 0.0726 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 860310 sc-eQTL 2.64e-01 0.0884 0.079 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 1.91e-01 0.112 0.0852 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 5.48e-01 0.0396 0.0659 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0464 0.0679 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 1.84e-01 -0.124 0.0933 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 831352 sc-eQTL 2.94e-01 0.0917 0.0872 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0179 0.0827 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 860310 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0288 0.0928 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 2.29e-01 0.112 0.0925 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0482 0.0755 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0594 0.0746 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 4.89e-01 0.0697 0.101 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 831352 sc-eQTL 5.31e-02 0.183 0.094 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 9.64e-01 0.00374 0.0826 0.245 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 3.15e-01 -0.124 0.123 0.245 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 8.80e-01 0.0173 0.114 0.245 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0594 0.11 0.245 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 2.50e-01 0.14 0.121 0.245 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 367104 sc-eQTL 9.60e-01 0.00541 0.107 0.245 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 1.73e-01 -0.126 0.0918 0.249 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 860310 sc-eQTL 2.82e-01 0.1 0.093 0.249 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 7.59e-01 0.0294 0.0956 0.249 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 7.18e-01 0.0308 0.0852 0.249 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 8.44e-02 -0.157 0.0904 0.249 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 1.60e-02 -0.227 0.0933 0.249 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 831352 sc-eQTL 1.54e-02 0.229 0.0938 0.249 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 3.53e-01 0.0699 0.0751 0.242 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 860310 sc-eQTL 9.59e-01 0.00433 0.084 0.242 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 2.87e-01 0.0997 0.0934 0.242 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 4.26e-01 -0.064 0.0803 0.242 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 1.19e-01 0.128 0.0816 0.242 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0618 0.0871 0.242 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 831352 sc-eQTL 4.67e-02 0.197 0.0985 0.242 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 8.66e-01 0.0168 0.0996 0.234 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 860310 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0503 0.084 0.234 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 5.75e-01 0.0528 0.094 0.234 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 5.83e-01 0.0632 0.115 0.234 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 5.98e-01 -0.053 0.1 0.234 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 7.27e-01 0.0387 0.111 0.234 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 831352 sc-eQTL 8.94e-01 0.0127 0.095 0.234 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0627 0.0651 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00271 0.0678 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0163 0.0775 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 6.61e-01 0.0329 0.075 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 2.07e-01 0.124 0.0981 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0431 0.0558 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 2.70e-01 0.0691 0.0625 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 4.40e-01 0.0551 0.0713 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0661 0.0717 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 2.84e-01 -0.102 0.0949 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0159 0.0656 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 860310 sc-eQTL 5.87e-01 0.0432 0.0794 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 2.07e-01 0.11 0.0869 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 7.85e-01 0.0172 0.063 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0512 0.0607 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0217 0.0953 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 831352 sc-eQTL 6.94e-02 0.16 0.0876 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0181 0.0675 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 860310 sc-eQTL 6.38e-01 0.0376 0.0797 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 2.84e-01 0.0947 0.0882 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0689 0.0652 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0682 0.0673 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 2.79e-02 -0.189 0.0855 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 831352 sc-eQTL 1.91e-02 0.213 0.0904 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 456195 sc-eQTL 8.85e-02 0.0811 0.0474 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 813155 sc-eQTL 6.18e-02 -0.155 0.0823 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 662300 sc-eQTL 6.00e-01 0.0399 0.0759 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 997747 sc-eQTL 3.30e-01 0.0632 0.0648 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00753 0.081 0.248 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -50548 eQTL 1.06e-20 -0.234 0.0245 0.0 0.0 0.261

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina