logo

Genes within 1Mb (chr12:96853648:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 7.25e-03 -0.17 0.0628 0.141 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0417 0.0793 0.141 B L1
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0385 0.0844 0.141 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0649 0.0766 0.141 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 1.60e-01 0.157 0.111 0.141 B L1
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0298 0.0529 0.141 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 5.50e-01 0.0435 0.0727 0.141 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 8.20e-01 0.0179 0.0787 0.141 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0383 0.0688 0.141 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 1.02e-08 0.468 0.0784 0.141 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 4.11e-02 -0.111 0.0539 0.141 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 1.84e-01 0.0776 0.0582 0.141 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 3.34e-01 0.085 0.0878 0.141 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 7.40e-01 -0.024 0.072 0.141 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 1.68e-02 0.228 0.0945 0.141 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 1.07e-01 -0.16 0.0991 0.146 DC L1
ENSG00000084110 HAL 857283 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0615 0.113 0.146 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 1.03e-02 -0.236 0.0914 0.146 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 9.44e-01 0.008 0.114 0.146 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0497 0.0945 0.146 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 7.85e-02 0.213 0.121 0.146 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 828325 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0401 0.11 0.146 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 2.54e-01 0.0929 0.0813 0.141 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 857283 sc-eQTL 1.66e-01 -0.142 0.102 0.141 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 8.97e-02 -0.196 0.115 0.141 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 2.84e-01 0.0835 0.0777 0.141 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 3.87e-01 0.0635 0.0733 0.141 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 5.77e-02 -0.213 0.112 0.141 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 828325 sc-eQTL 4.64e-02 -0.217 0.108 0.141 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 2.61e-01 -0.068 0.0603 0.139 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 1.02e-01 0.168 0.102 0.139 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0236 0.0974 0.139 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 1.00e-01 -0.133 0.0803 0.139 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 1.80e-01 -0.137 0.102 0.139 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0258 0.0508 0.141 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 3.71e-01 0.0951 0.106 0.141 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 2.14e-01 0.103 0.0827 0.141 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 1.92e-01 -0.1 0.0768 0.141 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 4.54e-01 0.088 0.117 0.141 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 364077 sc-eQTL 2.97e-01 0.127 0.121 0.141 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 9.28e-01 0.0106 0.118 0.151 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0939 0.133 0.151 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 7.72e-01 0.0409 0.141 0.151 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 7.59e-01 0.0409 0.133 0.151 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 6.79e-01 0.0577 0.139 0.151 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 2.43e-02 -0.222 0.0977 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 1.14e-01 -0.151 0.0952 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 3.19e-01 0.108 0.108 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0793 0.107 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 3.43e-01 -0.119 0.126 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 1.90e-01 -0.125 0.0946 0.14 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0605 0.11 0.14 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 5.40e-01 0.0661 0.108 0.14 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0614 0.114 0.14 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0309 0.126 0.14 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 7.76e-02 -0.139 0.0782 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 1.98e-01 -0.106 0.0822 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 7.49e-02 -0.173 0.0968 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0382 0.0948 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 3.99e-02 0.249 0.12 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 3.92e-01 -0.086 0.1 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0766 0.0951 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0577 0.112 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0494 0.111 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 9.21e-01 0.0132 0.133 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0629 0.0941 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 8.51e-02 0.228 0.132 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0599 0.134 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0935 0.117 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 6.65e-01 0.0587 0.135 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0518 0.0578 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 4.17e-01 0.0681 0.0836 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 4.35e-01 0.0654 0.0836 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0157 0.0744 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 9.60e-06 0.397 0.0875 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 9.37e-01 0.00455 0.0572 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 7.81e-02 0.171 0.0964 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 3.66e-01 0.0864 0.0953 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0209 0.0783 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 2.30e-02 0.242 0.106 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0794 0.07 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0865 0.108 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0426 0.101 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0332 0.105 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 2.10e-03 0.381 0.122 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 1.04e-01 -0.108 0.0664 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 3.02e-02 0.26 0.119 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 2.77e-02 0.241 0.109 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0934 0.101 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 1.19e-01 0.176 0.113 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0939 0.0806 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 8.76e-02 0.165 0.0962 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 2.56e-01 0.116 0.102 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 1.46e-01 -0.134 0.0916 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 7.78e-03 0.29 0.108 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 6.92e-02 -0.163 0.0894 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 4.45e-01 -0.101 0.132 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 8.51e-01 0.0211 0.112 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 5.08e-01 0.0856 0.129 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 9.62e-01 0.00607 0.127 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 2.60e-01 -0.12 0.106 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 6.08e-01 0.067 0.131 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 4.44e-01 0.0984 0.128 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 9.84e-01 0.00241 0.119 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 4.48e-01 0.0984 0.129 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 6.72e-01 0.0312 0.0736 0.141 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 4.55e-01 0.085 0.114 0.141 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 7.84e-01 0.0262 0.0954 0.141 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0965 0.11 0.141 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 4.15e-01 0.101 0.124 0.141 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 364077 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0381 0.123 0.141 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 2.12e-01 -0.094 0.075 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 6.61e-02 0.204 0.11 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 5.65e-01 -0.068 0.118 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 1.03e-03 -0.401 0.12 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 1.43e-01 -0.182 0.124 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0351 0.0656 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 5.78e-01 0.066 0.118 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0699 0.105 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0578 0.0998 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 3.71e-01 -0.103 0.115 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 8.83e-01 0.015 0.102 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 2.38e-01 0.158 0.133 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0782 0.124 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 1.93e-01 -0.168 0.129 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0872 0.122 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0621 0.0706 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 8.11e-02 0.208 0.119 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 3.08e-01 0.117 0.114 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 1.19e-01 -0.151 0.0963 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 3.39e-01 -0.115 0.12 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 6.44e-01 0.0577 0.124 0.152 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0272 0.11 0.152 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0405 0.141 0.152 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 1.05e-01 -0.221 0.136 0.152 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 8.47e-01 0.0316 0.163 0.152 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 3.92e-01 0.0678 0.0789 0.143 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 5.64e-01 0.0602 0.104 0.143 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 1.07e-01 0.203 0.126 0.143 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0665 0.0795 0.143 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 3.74e-01 0.103 0.115 0.143 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 364077 sc-eQTL 8.38e-01 0.0191 0.0936 0.143 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 2.33e-01 0.105 0.0875 0.141 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 3.39e-01 0.106 0.111 0.141 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 8.43e-02 -0.173 0.1 0.141 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0462 0.117 0.141 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 5.18e-02 0.252 0.129 0.141 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0935 0.108 0.154 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 857283 sc-eQTL 6.26e-01 0.0549 0.112 0.154 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 3.42e-02 -0.203 0.0952 0.154 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 6.08e-01 0.0654 0.127 0.154 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00798 0.106 0.154 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 2.53e-01 0.148 0.129 0.154 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 828325 sc-eQTL 1.23e-01 -0.168 0.109 0.154 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 1.69e-01 0.13 0.0943 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 857283 sc-eQTL 2.28e-01 -0.125 0.103 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 7.86e-02 -0.196 0.111 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 5.03e-01 0.0577 0.0859 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 9.40e-01 0.00671 0.0887 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0581 0.122 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 828325 sc-eQTL 1.88e-02 -0.266 0.113 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 9.60e-01 0.00523 0.105 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 857283 sc-eQTL 3.31e-01 -0.115 0.118 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 1.75e-01 -0.16 0.117 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 3.76e-01 0.085 0.0958 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 5.99e-01 0.05 0.0948 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 1.18e-01 -0.2 0.127 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 828325 sc-eQTL 6.19e-02 -0.224 0.12 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0273 0.105 0.133 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 5.97e-01 0.0833 0.157 0.133 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 2.57e-01 0.165 0.145 0.133 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 1.26e-01 -0.215 0.14 0.133 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 9.06e-01 0.0184 0.155 0.133 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 364077 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0677 0.136 0.133 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 2.55e-01 0.139 0.122 0.142 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 857283 sc-eQTL 1.56e-01 -0.175 0.123 0.142 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 4.26e-01 -0.101 0.126 0.142 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 6.54e-01 0.0506 0.113 0.142 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 3.41e-01 -0.115 0.12 0.142 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 9.81e-01 0.00298 0.125 0.142 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 828325 sc-eQTL 1.52e-01 -0.18 0.125 0.142 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 9.65e-01 0.00423 0.0958 0.147 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 857283 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0316 0.107 0.147 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 3.59e-01 -0.109 0.119 0.147 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 3.67e-01 0.0924 0.102 0.147 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 2.58e-01 0.118 0.104 0.147 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 8.06e-02 -0.194 0.11 0.147 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 828325 sc-eQTL 8.74e-02 -0.216 0.126 0.147 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 3.72e-01 -0.111 0.123 0.155 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 857283 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0204 0.104 0.155 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 8.95e-03 -0.303 0.114 0.155 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 1.08e-01 -0.229 0.142 0.155 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 4.06e-01 -0.104 0.124 0.155 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 4.28e-01 0.109 0.137 0.155 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 828325 sc-eQTL 7.93e-01 -0.031 0.118 0.155 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 9.99e-03 -0.211 0.081 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 1.46e-01 -0.124 0.085 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 1.64e-01 0.136 0.0972 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 1.27e-01 -0.144 0.0941 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 9.99e-01 8.35e-05 0.124 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 5.49e-02 -0.135 0.0699 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 1.57e-01 -0.112 0.0788 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 6.91e-02 -0.163 0.0895 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0242 0.0908 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 1.74e-01 0.163 0.12 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 3.26e-01 0.0834 0.0848 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 857283 sc-eQTL 1.90e-01 -0.135 0.103 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 1.09e-01 -0.181 0.112 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 2.66e-01 0.0909 0.0814 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 4.76e-01 0.0562 0.0787 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 2.05e-01 -0.156 0.123 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 828325 sc-eQTL 5.11e-02 -0.223 0.113 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 2.77e-01 0.0955 0.0877 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 857283 sc-eQTL 2.24e-01 -0.126 0.104 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 1.02e-01 -0.188 0.114 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 4.53e-01 0.0641 0.0851 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 4.58e-01 0.0653 0.0878 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 1.38e-01 -0.167 0.112 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 828325 sc-eQTL 2.99e-01 -0.124 0.119 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 453168 sc-eQTL 1.62e-01 -0.0858 0.0612 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 810128 sc-eQTL 8.97e-02 0.181 0.106 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 659273 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0247 0.0979 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 994720 sc-eQTL 1.49e-01 -0.121 0.0833 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 sc-eQTL 1.98e-01 -0.134 0.104 0.14 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -53575 eQTL 0.0125 -0.0828 0.0331 0.00104 0.0 0.135

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina