logo

Genes within 1Mb (chr12:96849428:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 7.25e-03 -0.17 0.0628 0.141 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0417 0.0793 0.141 B L1
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0385 0.0844 0.141 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0649 0.0766 0.141 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 1.60e-01 0.157 0.111 0.141 B L1
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0298 0.0529 0.141 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 5.50e-01 0.0435 0.0727 0.141 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 8.20e-01 0.0179 0.0787 0.141 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0383 0.0688 0.141 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 1.02e-08 0.468 0.0784 0.141 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 4.11e-02 -0.111 0.0539 0.141 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 1.84e-01 0.0776 0.0582 0.141 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 3.34e-01 0.085 0.0878 0.141 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 7.40e-01 -0.024 0.072 0.141 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 1.68e-02 0.228 0.0945 0.141 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 1.07e-01 -0.16 0.0991 0.146 DC L1
ENSG00000084110 HAL 853063 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0615 0.113 0.146 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 1.03e-02 -0.236 0.0914 0.146 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 9.44e-01 0.008 0.114 0.146 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0497 0.0945 0.146 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 7.85e-02 0.213 0.121 0.146 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 824105 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0401 0.11 0.146 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 2.54e-01 0.0929 0.0813 0.141 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 853063 sc-eQTL 1.66e-01 -0.142 0.102 0.141 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 8.97e-02 -0.196 0.115 0.141 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 2.84e-01 0.0835 0.0777 0.141 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 3.87e-01 0.0635 0.0733 0.141 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 5.77e-02 -0.213 0.112 0.141 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 824105 sc-eQTL 4.64e-02 -0.217 0.108 0.141 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 2.61e-01 -0.068 0.0603 0.139 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 1.02e-01 0.168 0.102 0.139 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0236 0.0974 0.139 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 1.00e-01 -0.133 0.0803 0.139 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 1.80e-01 -0.137 0.102 0.139 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0258 0.0508 0.141 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 3.71e-01 0.0951 0.106 0.141 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 2.14e-01 0.103 0.0827 0.141 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 1.92e-01 -0.1 0.0768 0.141 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 4.54e-01 0.088 0.117 0.141 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 359857 sc-eQTL 2.97e-01 0.127 0.121 0.141 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 9.28e-01 0.0106 0.118 0.151 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0939 0.133 0.151 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 7.72e-01 0.0409 0.141 0.151 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 7.59e-01 0.0409 0.133 0.151 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 6.79e-01 0.0577 0.139 0.151 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 2.43e-02 -0.222 0.0977 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 1.14e-01 -0.151 0.0952 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 3.19e-01 0.108 0.108 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0793 0.107 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 3.43e-01 -0.119 0.126 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 1.90e-01 -0.125 0.0946 0.14 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0605 0.11 0.14 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 5.40e-01 0.0661 0.108 0.14 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0614 0.114 0.14 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0309 0.126 0.14 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 7.76e-02 -0.139 0.0782 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 1.98e-01 -0.106 0.0822 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 7.49e-02 -0.173 0.0968 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0382 0.0948 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 3.99e-02 0.249 0.12 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 3.92e-01 -0.086 0.1 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0766 0.0951 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0577 0.112 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0494 0.111 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 9.21e-01 0.0132 0.133 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0629 0.0941 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 8.51e-02 0.228 0.132 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0599 0.134 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0935 0.117 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 6.65e-01 0.0587 0.135 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0518 0.0578 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 4.17e-01 0.0681 0.0836 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 4.35e-01 0.0654 0.0836 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0157 0.0744 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 9.60e-06 0.397 0.0875 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 9.37e-01 0.00455 0.0572 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 7.81e-02 0.171 0.0964 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 3.66e-01 0.0864 0.0953 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0209 0.0783 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 2.30e-02 0.242 0.106 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0794 0.07 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0865 0.108 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0426 0.101 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0332 0.105 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 2.10e-03 0.381 0.122 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 1.04e-01 -0.108 0.0664 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 3.02e-02 0.26 0.119 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 2.77e-02 0.241 0.109 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0934 0.101 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 1.19e-01 0.176 0.113 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0939 0.0806 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 8.76e-02 0.165 0.0962 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 2.56e-01 0.116 0.102 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 1.46e-01 -0.134 0.0916 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 7.78e-03 0.29 0.108 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 6.92e-02 -0.163 0.0894 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 4.45e-01 -0.101 0.132 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 8.51e-01 0.0211 0.112 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 5.08e-01 0.0856 0.129 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 9.62e-01 0.00607 0.127 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 2.60e-01 -0.12 0.106 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 6.08e-01 0.067 0.131 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 4.44e-01 0.0984 0.128 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 9.84e-01 0.00241 0.119 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 4.48e-01 0.0984 0.129 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 6.72e-01 0.0312 0.0736 0.141 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 4.55e-01 0.085 0.114 0.141 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 7.84e-01 0.0262 0.0954 0.141 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0965 0.11 0.141 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 4.15e-01 0.101 0.124 0.141 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 359857 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0381 0.123 0.141 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 2.12e-01 -0.094 0.075 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 6.61e-02 0.204 0.11 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 5.65e-01 -0.068 0.118 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 1.03e-03 -0.401 0.12 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 1.43e-01 -0.182 0.124 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0351 0.0656 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 5.78e-01 0.066 0.118 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0699 0.105 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0578 0.0998 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 3.71e-01 -0.103 0.115 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 8.83e-01 0.015 0.102 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 2.38e-01 0.158 0.133 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0782 0.124 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 1.93e-01 -0.168 0.129 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0872 0.122 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0621 0.0706 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 8.11e-02 0.208 0.119 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 3.08e-01 0.117 0.114 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 1.19e-01 -0.151 0.0963 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 3.39e-01 -0.115 0.12 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 6.44e-01 0.0577 0.124 0.152 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0272 0.11 0.152 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0405 0.141 0.152 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 1.05e-01 -0.221 0.136 0.152 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 8.47e-01 0.0316 0.163 0.152 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 3.92e-01 0.0678 0.0789 0.143 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 5.64e-01 0.0602 0.104 0.143 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 1.07e-01 0.203 0.126 0.143 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0665 0.0795 0.143 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 3.74e-01 0.103 0.115 0.143 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 359857 sc-eQTL 8.38e-01 0.0191 0.0936 0.143 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 2.33e-01 0.105 0.0875 0.141 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 3.39e-01 0.106 0.111 0.141 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 8.43e-02 -0.173 0.1 0.141 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0462 0.117 0.141 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 5.18e-02 0.252 0.129 0.141 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0935 0.108 0.154 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 853063 sc-eQTL 6.26e-01 0.0549 0.112 0.154 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 3.42e-02 -0.203 0.0952 0.154 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 6.08e-01 0.0654 0.127 0.154 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00798 0.106 0.154 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 2.53e-01 0.148 0.129 0.154 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 824105 sc-eQTL 1.23e-01 -0.168 0.109 0.154 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 1.69e-01 0.13 0.0943 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 853063 sc-eQTL 2.28e-01 -0.125 0.103 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 7.86e-02 -0.196 0.111 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 5.03e-01 0.0577 0.0859 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 9.40e-01 0.00671 0.0887 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0581 0.122 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 824105 sc-eQTL 1.88e-02 -0.266 0.113 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 9.60e-01 0.00523 0.105 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 853063 sc-eQTL 3.31e-01 -0.115 0.118 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 1.75e-01 -0.16 0.117 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 3.76e-01 0.085 0.0958 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 5.99e-01 0.05 0.0948 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 1.18e-01 -0.2 0.127 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 824105 sc-eQTL 6.19e-02 -0.224 0.12 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0273 0.105 0.133 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 5.97e-01 0.0833 0.157 0.133 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 2.57e-01 0.165 0.145 0.133 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 1.26e-01 -0.215 0.14 0.133 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 9.06e-01 0.0184 0.155 0.133 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 359857 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0677 0.136 0.133 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 2.55e-01 0.139 0.122 0.142 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 853063 sc-eQTL 1.56e-01 -0.175 0.123 0.142 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 4.26e-01 -0.101 0.126 0.142 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 6.54e-01 0.0506 0.113 0.142 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 3.41e-01 -0.115 0.12 0.142 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 9.81e-01 0.00298 0.125 0.142 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 824105 sc-eQTL 1.52e-01 -0.18 0.125 0.142 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 9.65e-01 0.00423 0.0958 0.147 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 853063 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0316 0.107 0.147 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 3.59e-01 -0.109 0.119 0.147 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 3.67e-01 0.0924 0.102 0.147 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 2.58e-01 0.118 0.104 0.147 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 8.06e-02 -0.194 0.11 0.147 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 824105 sc-eQTL 8.74e-02 -0.216 0.126 0.147 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 3.72e-01 -0.111 0.123 0.155 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 853063 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0204 0.104 0.155 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 8.95e-03 -0.303 0.114 0.155 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 1.08e-01 -0.229 0.142 0.155 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 4.06e-01 -0.104 0.124 0.155 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 4.28e-01 0.109 0.137 0.155 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 824105 sc-eQTL 7.93e-01 -0.031 0.118 0.155 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 9.99e-03 -0.211 0.081 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 1.46e-01 -0.124 0.085 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 1.64e-01 0.136 0.0972 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 1.27e-01 -0.144 0.0941 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 9.99e-01 8.35e-05 0.124 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 5.49e-02 -0.135 0.0699 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 1.57e-01 -0.112 0.0788 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 6.91e-02 -0.163 0.0895 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0242 0.0908 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 1.74e-01 0.163 0.12 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 3.26e-01 0.0834 0.0848 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 853063 sc-eQTL 1.90e-01 -0.135 0.103 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 1.09e-01 -0.181 0.112 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 2.66e-01 0.0909 0.0814 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 4.76e-01 0.0562 0.0787 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 2.05e-01 -0.156 0.123 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 824105 sc-eQTL 5.11e-02 -0.223 0.113 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 2.77e-01 0.0955 0.0877 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 853063 sc-eQTL 2.24e-01 -0.126 0.104 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 1.02e-01 -0.188 0.114 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 4.53e-01 0.0641 0.0851 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 4.58e-01 0.0653 0.0878 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 1.38e-01 -0.167 0.112 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 824105 sc-eQTL 2.99e-01 -0.124 0.119 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 448948 sc-eQTL 1.62e-01 -0.0858 0.0612 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 805908 sc-eQTL 8.97e-02 0.181 0.106 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 655053 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0247 0.0979 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 990500 sc-eQTL 1.49e-01 -0.121 0.0833 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 sc-eQTL 1.98e-01 -0.134 0.104 0.14 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -57795 eQTL 0.0126 -0.0827 0.0331 0.00103 0.0 0.135

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina