logo

Genes within 1Mb (chr12:96843349:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 7.25e-03 -0.17 0.0628 0.141 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0417 0.0793 0.141 B L1
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0385 0.0844 0.141 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0649 0.0766 0.141 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 1.60e-01 0.157 0.111 0.141 B L1
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0298 0.0529 0.141 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 5.50e-01 0.0435 0.0727 0.141 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 8.20e-01 0.0179 0.0787 0.141 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0383 0.0688 0.141 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 1.02e-08 0.468 0.0784 0.141 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 4.11e-02 -0.111 0.0539 0.141 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 1.84e-01 0.0776 0.0582 0.141 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 3.34e-01 0.085 0.0878 0.141 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 7.40e-01 -0.024 0.072 0.141 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 1.68e-02 0.228 0.0945 0.141 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 1.07e-01 -0.16 0.0991 0.146 DC L1
ENSG00000084110 HAL 846984 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0615 0.113 0.146 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 1.03e-02 -0.236 0.0914 0.146 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 9.44e-01 0.008 0.114 0.146 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0497 0.0945 0.146 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 7.85e-02 0.213 0.121 0.146 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 818026 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0401 0.11 0.146 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 2.54e-01 0.0929 0.0813 0.141 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 846984 sc-eQTL 1.66e-01 -0.142 0.102 0.141 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 8.97e-02 -0.196 0.115 0.141 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 2.84e-01 0.0835 0.0777 0.141 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 3.87e-01 0.0635 0.0733 0.141 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 5.77e-02 -0.213 0.112 0.141 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 818026 sc-eQTL 4.64e-02 -0.217 0.108 0.141 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 2.61e-01 -0.068 0.0603 0.139 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 1.02e-01 0.168 0.102 0.139 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0236 0.0974 0.139 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 1.00e-01 -0.133 0.0803 0.139 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 1.80e-01 -0.137 0.102 0.139 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0258 0.0508 0.141 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 3.71e-01 0.0951 0.106 0.141 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 2.14e-01 0.103 0.0827 0.141 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 1.92e-01 -0.1 0.0768 0.141 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 4.54e-01 0.088 0.117 0.141 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 353778 sc-eQTL 2.97e-01 0.127 0.121 0.141 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 9.28e-01 0.0106 0.118 0.151 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0939 0.133 0.151 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 7.72e-01 0.0409 0.141 0.151 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 7.59e-01 0.0409 0.133 0.151 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 6.79e-01 0.0577 0.139 0.151 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 2.43e-02 -0.222 0.0977 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 1.14e-01 -0.151 0.0952 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 3.19e-01 0.108 0.108 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0793 0.107 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 3.43e-01 -0.119 0.126 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 1.90e-01 -0.125 0.0946 0.14 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0605 0.11 0.14 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 5.40e-01 0.0661 0.108 0.14 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0614 0.114 0.14 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0309 0.126 0.14 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 7.76e-02 -0.139 0.0782 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 1.98e-01 -0.106 0.0822 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 7.49e-02 -0.173 0.0968 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0382 0.0948 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 3.99e-02 0.249 0.12 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 3.92e-01 -0.086 0.1 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0766 0.0951 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0577 0.112 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0494 0.111 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 9.21e-01 0.0132 0.133 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0629 0.0941 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 8.51e-02 0.228 0.132 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0599 0.134 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0935 0.117 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 6.65e-01 0.0587 0.135 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0518 0.0578 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 4.17e-01 0.0681 0.0836 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 4.35e-01 0.0654 0.0836 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0157 0.0744 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 9.60e-06 0.397 0.0875 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 9.37e-01 0.00455 0.0572 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 7.81e-02 0.171 0.0964 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 3.66e-01 0.0864 0.0953 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0209 0.0783 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 2.30e-02 0.242 0.106 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0794 0.07 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0865 0.108 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0426 0.101 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0332 0.105 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 2.10e-03 0.381 0.122 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 1.04e-01 -0.108 0.0664 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 3.02e-02 0.26 0.119 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 2.77e-02 0.241 0.109 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0934 0.101 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 1.19e-01 0.176 0.113 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0939 0.0806 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 8.76e-02 0.165 0.0962 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 2.56e-01 0.116 0.102 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 1.46e-01 -0.134 0.0916 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 7.78e-03 0.29 0.108 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 6.92e-02 -0.163 0.0894 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 4.45e-01 -0.101 0.132 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 8.51e-01 0.0211 0.112 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 5.08e-01 0.0856 0.129 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 9.62e-01 0.00607 0.127 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 2.60e-01 -0.12 0.106 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 6.08e-01 0.067 0.131 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 4.44e-01 0.0984 0.128 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 9.84e-01 0.00241 0.119 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 4.48e-01 0.0984 0.129 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 6.72e-01 0.0312 0.0736 0.141 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 4.55e-01 0.085 0.114 0.141 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 7.84e-01 0.0262 0.0954 0.141 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0965 0.11 0.141 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 4.15e-01 0.101 0.124 0.141 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 353778 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0381 0.123 0.141 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 2.12e-01 -0.094 0.075 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 6.61e-02 0.204 0.11 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 5.65e-01 -0.068 0.118 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 1.03e-03 -0.401 0.12 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 1.43e-01 -0.182 0.124 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0351 0.0656 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 5.78e-01 0.066 0.118 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0699 0.105 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0578 0.0998 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 3.71e-01 -0.103 0.115 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 8.83e-01 0.015 0.102 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 2.38e-01 0.158 0.133 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0782 0.124 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 1.93e-01 -0.168 0.129 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0872 0.122 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0621 0.0706 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 8.11e-02 0.208 0.119 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 3.08e-01 0.117 0.114 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 1.19e-01 -0.151 0.0963 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 3.39e-01 -0.115 0.12 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 6.44e-01 0.0577 0.124 0.152 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0272 0.11 0.152 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0405 0.141 0.152 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 1.05e-01 -0.221 0.136 0.152 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 8.47e-01 0.0316 0.163 0.152 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 3.92e-01 0.0678 0.0789 0.143 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 5.64e-01 0.0602 0.104 0.143 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 1.07e-01 0.203 0.126 0.143 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0665 0.0795 0.143 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 3.74e-01 0.103 0.115 0.143 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 353778 sc-eQTL 8.38e-01 0.0191 0.0936 0.143 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 2.33e-01 0.105 0.0875 0.141 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 3.39e-01 0.106 0.111 0.141 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 8.43e-02 -0.173 0.1 0.141 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0462 0.117 0.141 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 5.18e-02 0.252 0.129 0.141 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0935 0.108 0.154 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 846984 sc-eQTL 6.26e-01 0.0549 0.112 0.154 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 3.42e-02 -0.203 0.0952 0.154 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 6.08e-01 0.0654 0.127 0.154 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00798 0.106 0.154 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 2.53e-01 0.148 0.129 0.154 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 818026 sc-eQTL 1.23e-01 -0.168 0.109 0.154 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 1.69e-01 0.13 0.0943 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 846984 sc-eQTL 2.28e-01 -0.125 0.103 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 7.86e-02 -0.196 0.111 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 5.03e-01 0.0577 0.0859 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 9.40e-01 0.00671 0.0887 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0581 0.122 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 818026 sc-eQTL 1.88e-02 -0.266 0.113 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 9.60e-01 0.00523 0.105 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 846984 sc-eQTL 3.31e-01 -0.115 0.118 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 1.75e-01 -0.16 0.117 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 3.76e-01 0.085 0.0958 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 5.99e-01 0.05 0.0948 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 1.18e-01 -0.2 0.127 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 818026 sc-eQTL 6.19e-02 -0.224 0.12 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0273 0.105 0.133 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 5.97e-01 0.0833 0.157 0.133 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 2.57e-01 0.165 0.145 0.133 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 1.26e-01 -0.215 0.14 0.133 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 9.06e-01 0.0184 0.155 0.133 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 353778 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0677 0.136 0.133 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 2.55e-01 0.139 0.122 0.142 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 846984 sc-eQTL 1.56e-01 -0.175 0.123 0.142 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 4.26e-01 -0.101 0.126 0.142 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 6.54e-01 0.0506 0.113 0.142 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 3.41e-01 -0.115 0.12 0.142 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 9.81e-01 0.00298 0.125 0.142 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 818026 sc-eQTL 1.52e-01 -0.18 0.125 0.142 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 9.65e-01 0.00423 0.0958 0.147 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 846984 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0316 0.107 0.147 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 3.59e-01 -0.109 0.119 0.147 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 3.67e-01 0.0924 0.102 0.147 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 2.58e-01 0.118 0.104 0.147 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 8.06e-02 -0.194 0.11 0.147 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 818026 sc-eQTL 8.74e-02 -0.216 0.126 0.147 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 3.72e-01 -0.111 0.123 0.155 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 846984 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0204 0.104 0.155 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 8.95e-03 -0.303 0.114 0.155 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 1.08e-01 -0.229 0.142 0.155 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 4.06e-01 -0.104 0.124 0.155 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 4.28e-01 0.109 0.137 0.155 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 818026 sc-eQTL 7.93e-01 -0.031 0.118 0.155 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 9.99e-03 -0.211 0.081 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 1.46e-01 -0.124 0.085 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 1.64e-01 0.136 0.0972 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 1.27e-01 -0.144 0.0941 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 9.99e-01 8.35e-05 0.124 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 5.49e-02 -0.135 0.0699 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 1.57e-01 -0.112 0.0788 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 6.91e-02 -0.163 0.0895 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0242 0.0908 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 1.74e-01 0.163 0.12 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 3.26e-01 0.0834 0.0848 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 846984 sc-eQTL 1.90e-01 -0.135 0.103 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 1.09e-01 -0.181 0.112 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 2.66e-01 0.0909 0.0814 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 4.76e-01 0.0562 0.0787 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 2.05e-01 -0.156 0.123 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 818026 sc-eQTL 5.11e-02 -0.223 0.113 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 2.77e-01 0.0955 0.0877 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 846984 sc-eQTL 2.24e-01 -0.126 0.104 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 1.02e-01 -0.188 0.114 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 4.53e-01 0.0641 0.0851 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 4.58e-01 0.0653 0.0878 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 1.38e-01 -0.167 0.112 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 818026 sc-eQTL 2.99e-01 -0.124 0.119 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 442869 sc-eQTL 1.62e-01 -0.0858 0.0612 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 799829 sc-eQTL 8.97e-02 0.181 0.106 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 648974 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0247 0.0979 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 984421 sc-eQTL 1.49e-01 -0.121 0.0833 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 sc-eQTL 1.98e-01 -0.134 0.104 0.14 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -63874 eQTL 0.0125 -0.0828 0.0331 0.00103 0.0 0.135

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina