logo

Genes within 1Mb (chr12:96841730:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 2.97e-02 -0.108 0.0493 0.256 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 5.36e-01 0.0383 0.0619 0.256 B L1
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 9.96e-01 0.000334 0.066 0.256 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0264 0.0599 0.256 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0416 0.0874 0.256 B L1
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 8.14e-01 -0.00971 0.0413 0.256 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 1.18e-02 -0.142 0.0558 0.256 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 7.97e-01 0.0158 0.0614 0.256 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0327 0.0536 0.256 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 2.66e-02 -0.146 0.0653 0.256 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 8.64e-01 -0.00726 0.0424 0.256 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 1.44e-01 0.0665 0.0453 0.256 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 9.04e-01 -0.00824 0.0685 0.256 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0466 0.056 0.256 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 4.29e-02 -0.151 0.0739 0.256 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 4.60e-01 0.058 0.0784 0.252 DC L1
ENSG00000084110 HAL 845365 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0491 0.0893 0.252 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 1.48e-01 0.106 0.0727 0.252 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00853 0.0895 0.252 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 3.69e-01 0.0669 0.0743 0.252 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 8.49e-01 0.0182 0.0956 0.252 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 816407 sc-eQTL 5.93e-01 0.0462 0.0862 0.252 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0468 0.0632 0.256 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 845365 sc-eQTL 5.59e-01 0.0466 0.0797 0.256 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 1.97e-01 0.116 0.0897 0.256 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 8.65e-01 0.0103 0.0605 0.256 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 1.81e-01 -0.0762 0.0568 0.256 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0757 0.0874 0.256 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 816407 sc-eQTL 3.75e-02 0.176 0.084 0.256 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 7.74e-02 0.0835 0.0471 0.255 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 1.71e-01 -0.11 0.0801 0.255 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 2.80e-01 0.0824 0.0761 0.255 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 3.44e-01 0.0599 0.0632 0.255 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0098 0.0801 0.255 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 9.98e-01 -7.62e-05 0.0399 0.256 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0852 0.0832 0.256 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 7.36e-01 -0.022 0.0651 0.256 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 4.52e-01 0.0455 0.0604 0.256 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0588 0.092 0.256 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 352159 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0551 0.0953 0.256 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 2.48e-01 -0.102 0.0879 0.263 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 2.43e-01 0.117 0.0995 0.263 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0863 0.106 0.263 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 3.96e-01 0.0847 0.0995 0.263 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 5.68e-01 0.0596 0.104 0.263 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0328 0.0784 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 7.73e-01 0.0219 0.0759 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0797 0.0855 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 9.68e-01 0.00343 0.0853 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 9.25e-01 0.0094 0.0999 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 1.42e-01 -0.109 0.0743 0.259 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0686 0.0861 0.259 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 8.24e-01 0.0189 0.0847 0.259 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 5.66e-01 0.0515 0.0897 0.259 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 8.65e-01 0.017 0.0994 0.259 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 3.07e-01 -0.064 0.0625 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 4.92e-01 0.0451 0.0655 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 6.30e-01 0.0374 0.0775 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 6.24e-01 0.037 0.0754 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 2.95e-01 -0.101 0.0965 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 6.96e-01 0.0306 0.0783 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 5.15e-01 0.0483 0.0741 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 4.49e-01 0.0663 0.0874 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 1.36e-01 -0.129 0.0864 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0186 0.103 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00928 0.0739 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 2.21e-01 -0.127 0.104 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 5.49e-01 0.0632 0.105 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00396 0.0917 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 7.90e-01 0.0283 0.106 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0275 0.0453 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 2.80e-02 -0.143 0.0648 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 5.09e-01 0.0433 0.0655 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0392 0.0582 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 6.76e-02 -0.131 0.0711 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 1.03e-01 -0.0716 0.0437 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 3.24e-03 -0.218 0.0731 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 9.54e-01 0.00428 0.0734 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0569 0.0601 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 7.32e-02 -0.147 0.0816 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 1.71e-01 -0.0745 0.0542 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 8.18e-01 0.0194 0.084 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0394 0.078 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0691 0.0816 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0556 0.0968 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 8.97e-01 0.00679 0.0523 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0456 0.0945 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0803 0.0859 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0353 0.0791 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 4.20e-02 -0.18 0.0879 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 9.38e-01 0.0049 0.0633 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 4.32e-01 0.0596 0.0757 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 8.91e-01 0.011 0.0802 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 9.73e-01 0.00246 0.0721 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0874 0.0856 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 5.52e-01 0.042 0.0706 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 2.32e-01 -0.124 0.103 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00166 0.0879 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 3.18e-01 -0.101 0.101 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 3.03e-01 -0.102 0.0988 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 8.67e-01 0.0142 0.0846 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 8.62e-01 0.018 0.104 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 9.93e-02 0.167 0.101 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 4.87e-01 0.0658 0.0945 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 8.55e-01 0.0187 0.103 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0449 0.0575 0.26 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 9.88e-01 0.0013 0.089 0.26 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 6.21e-01 0.037 0.0747 0.26 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0681 0.0864 0.26 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 6.14e-01 -0.049 0.0971 0.26 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 352159 sc-eQTL 8.84e-01 0.0141 0.0963 0.26 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 1.50e-01 0.0848 0.0587 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0386 0.0873 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 3.60e-01 0.0848 0.0925 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 1.07e-01 0.156 0.0963 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0338 0.0978 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 1.83e-01 0.068 0.0509 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0905 0.0921 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 3.70e-01 0.0733 0.0816 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 1.88e-01 0.102 0.0775 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 5.12e-01 0.0587 0.0895 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 4.81e-01 0.0557 0.079 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 4.18e-03 -0.294 0.102 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 2.19e-01 -0.118 0.0959 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0615 0.1 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0625 0.0948 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 8.92e-02 0.0943 0.0552 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 2.61e-01 -0.106 0.0937 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 6.25e-01 0.0441 0.09 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 4.59e-01 0.0564 0.0762 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0167 0.0943 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 3.10e-01 -0.102 0.1 0.259 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 6.85e-01 0.0361 0.0889 0.259 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 2.66e-02 -0.251 0.112 0.259 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0655 0.111 0.259 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 5.86e-01 0.0721 0.132 0.259 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 9.93e-01 0.000536 0.0621 0.254 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 2.14e-01 -0.102 0.0817 0.254 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0341 0.0992 0.254 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 7.22e-01 0.0223 0.0625 0.254 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 7.64e-01 0.0274 0.0908 0.254 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 352159 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0233 0.0735 0.254 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 8.00e-02 0.118 0.0672 0.256 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0917 0.0855 0.256 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 8.58e-02 0.133 0.0772 0.256 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 7.76e-01 0.0257 0.09 0.256 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 4.62e-01 0.074 0.1 0.256 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 2.84e-01 0.0923 0.086 0.256 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 845365 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0251 0.0896 0.256 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 7.14e-01 0.0282 0.0768 0.256 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 2.23e-01 -0.124 0.101 0.256 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 1.61e-01 0.119 0.0844 0.256 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0338 0.103 0.256 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 816407 sc-eQTL 1.92e-01 0.114 0.0868 0.256 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0391 0.0727 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 845365 sc-eQTL 3.14e-01 0.0798 0.0792 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 1.98e-01 0.11 0.0854 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 3.67e-01 0.0596 0.0659 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0724 0.0679 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 1.81e-01 -0.125 0.0934 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 816407 sc-eQTL 3.39e-01 0.0838 0.0874 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0462 0.0828 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 845365 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0105 0.0929 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 2.34e-01 0.11 0.0926 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 4.59e-01 -0.056 0.0755 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0723 0.0746 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 4.89e-01 0.0699 0.101 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 816407 sc-eQTL 5.45e-02 0.182 0.0941 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 9.46e-01 0.00558 0.0824 0.258 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 3.97e-01 -0.105 0.123 0.258 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00126 0.114 0.258 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0405 0.11 0.258 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 3.33e-01 0.118 0.121 0.258 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 352159 sc-eQTL 7.42e-01 0.0351 0.107 0.258 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 1.32e-01 -0.139 0.0919 0.258 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 845365 sc-eQTL 1.59e-01 0.131 0.093 0.258 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 6.94e-01 0.0378 0.0959 0.258 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 9.00e-01 0.0107 0.0854 0.258 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 3.92e-02 -0.188 0.0903 0.258 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 6.12e-02 -0.177 0.0941 0.258 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 816407 sc-eQTL 1.90e-02 0.223 0.0941 0.258 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 3.12e-01 0.0764 0.0754 0.251 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 845365 sc-eQTL 8.04e-01 -0.021 0.0844 0.251 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 2.32e-01 0.112 0.0937 0.251 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0569 0.0807 0.251 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 1.13e-01 0.131 0.082 0.251 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0665 0.0875 0.251 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 816407 sc-eQTL 3.12e-02 0.214 0.0988 0.251 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 7.26e-01 0.0349 0.0994 0.243 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 845365 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0618 0.0838 0.243 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 6.45e-01 0.0434 0.0939 0.243 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 3.77e-01 0.102 0.115 0.243 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0849 0.1 0.243 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 4.54e-01 0.0829 0.11 0.243 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 816407 sc-eQTL 8.88e-01 0.0134 0.0949 0.243 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0525 0.0652 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0102 0.0678 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 5.79e-01 -0.043 0.0774 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 7.44e-01 0.0245 0.0751 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 3.94e-01 0.0841 0.0983 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0431 0.0559 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 4.79e-01 0.0445 0.0627 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 5.24e-01 0.0455 0.0714 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0461 0.0719 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0972 0.095 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0416 0.0657 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 845365 sc-eQTL 5.99e-01 0.0418 0.0795 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 2.25e-01 0.106 0.0871 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 7.42e-01 0.0208 0.0631 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0701 0.0607 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0139 0.0955 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 816407 sc-eQTL 9.34e-02 0.148 0.0879 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 7.57e-01 -0.021 0.0677 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 845365 sc-eQTL 6.00e-01 0.042 0.08 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 2.65e-01 0.0988 0.0884 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0838 0.0654 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0784 0.0675 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 4.51e-02 -0.173 0.086 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 816407 sc-eQTL 1.56e-02 0.221 0.0906 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 441250 sc-eQTL 4.45e-02 0.096 0.0475 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 798210 sc-eQTL 8.85e-02 -0.142 0.0829 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 647355 sc-eQTL 5.17e-01 0.0495 0.0763 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 982802 sc-eQTL 2.31e-01 0.0781 0.0651 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 sc-eQTL 8.13e-01 0.0193 0.0815 0.256 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 eQTL 7.52e-19 -0.224 0.0247 0.0 0.0 0.268

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139350 NEDD1 -65493 7.83e-06 9.44e-06 1.11e-06 4.49e-06 2.09e-06 3.93e-06 9.6e-06 1.69e-06 6.53e-06 4.26e-06 1.04e-05 4.77e-06 1.15e-05 3.95e-06 2.22e-06 5.67e-06 3.87e-06 5.1e-06 2.38e-06 2.62e-06 4.25e-06 7.92e-06 6.82e-06 2.76e-06 1.26e-05 2.78e-06 4.48e-06 2.87e-06 7.85e-06 7.77e-06 4.35e-06 5.43e-07 7.05e-07 2.75e-06 3.31e-06 1.73e-06 1.18e-06 1.3e-06 1.32e-06 8.57e-07 7.36e-07 1.07e-05 1.28e-06 1.51e-07 6.85e-07 1.32e-06 1.12e-06 6.92e-07 5.82e-07