logo

Genes within 1Mb (chr12:96817750:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 2.93e-02 -0.112 0.051 0.237 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 2.39e-01 0.0753 0.0638 0.237 B L1
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00477 0.0682 0.237 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0366 0.0619 0.237 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0284 0.0904 0.237 B L1
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0167 0.0425 0.237 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 2.63e-02 -0.129 0.0577 0.237 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 9.16e-01 0.00667 0.0632 0.237 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0249 0.0553 0.237 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 1.80e-02 -0.16 0.0672 0.237 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0196 0.0437 0.237 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 1.09e-01 0.0751 0.0467 0.237 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 9.28e-01 0.00644 0.0707 0.237 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0364 0.0579 0.237 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 2.90e-02 -0.167 0.0761 0.237 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 4.97e-01 0.0553 0.0814 0.234 DC L1
ENSG00000084110 HAL 821385 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0521 0.0926 0.234 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 1.25e-01 0.116 0.0754 0.234 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0325 0.0928 0.234 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 5.40e-01 0.0474 0.0772 0.234 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 8.43e-01 0.0197 0.0991 0.234 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 792427 sc-eQTL 7.66e-01 0.0266 0.0895 0.234 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 9.52e-01 0.0039 0.0654 0.237 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 821385 sc-eQTL 4.44e-01 0.063 0.0822 0.237 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 1.15e-01 0.146 0.0924 0.237 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 5.45e-01 0.0378 0.0624 0.237 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 1.46e-01 -0.0855 0.0586 0.237 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 2.99e-01 -0.094 0.0902 0.237 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 792427 sc-eQTL 2.89e-02 0.191 0.0866 0.237 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 2.02e-01 0.0624 0.0487 0.236 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 1.17e-01 -0.13 0.0826 0.236 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 7.53e-01 0.0248 0.0788 0.236 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 4.31e-01 0.0515 0.0652 0.236 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 3.34e-01 -0.08 0.0825 0.236 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 9.34e-01 0.00342 0.0412 0.237 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0776 0.086 0.237 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0209 0.0672 0.237 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 6.24e-01 0.0306 0.0624 0.237 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0199 0.0951 0.237 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 328179 sc-eQTL 4.90e-01 -0.068 0.0984 0.237 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 3.94e-02 -0.189 0.091 0.242 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 4.26e-01 0.083 0.104 0.242 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0835 0.11 0.242 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 2.14e-01 0.129 0.104 0.242 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 4.23e-01 0.0874 0.109 0.242 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0127 0.0816 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 5.08e-01 0.0523 0.0789 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0597 0.089 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 9.64e-01 0.00403 0.0887 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 6.24e-01 0.0511 0.104 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 2.42e-01 -0.09 0.0767 0.239 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0252 0.0888 0.239 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 6.11e-01 0.0444 0.0873 0.239 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 5.82e-01 0.051 0.0925 0.239 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 5.74e-01 0.0576 0.102 0.239 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 1.83e-01 -0.0865 0.0647 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 2.71e-01 0.0748 0.0679 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 6.22e-01 0.0397 0.0804 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 9.32e-01 0.0067 0.0783 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 1.18e-01 -0.156 0.0998 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 7.07e-01 0.0306 0.0812 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 5.45e-01 0.0466 0.0769 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 6.64e-01 0.0395 0.0908 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 1.64e-01 -0.125 0.0897 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 8.09e-01 0.0259 0.107 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00454 0.0763 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 6.56e-02 -0.197 0.107 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 5.29e-01 0.0686 0.109 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 8.08e-01 0.0231 0.0946 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0166 0.109 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0252 0.0467 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 7.57e-02 -0.12 0.0671 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 6.14e-01 0.0342 0.0676 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0291 0.06 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 3.57e-02 -0.155 0.0732 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 4.23e-02 -0.0917 0.0449 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 7.26e-03 -0.205 0.0756 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00539 0.0757 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0612 0.0619 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 1.07e-01 -0.136 0.0843 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 1.96e-01 -0.0731 0.0563 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 8.37e-01 0.0179 0.0873 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0313 0.0811 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0789 0.0847 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0851 0.101 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 5.65e-01 0.0312 0.0541 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 9.01e-01 0.0122 0.0978 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0415 0.089 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0281 0.0818 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 1.84e-02 -0.215 0.0906 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000218 0.0654 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 4.62e-01 0.0578 0.0783 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 5.42e-01 0.0506 0.0829 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 7.33e-01 0.0254 0.0746 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0757 0.0886 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 5.55e-01 0.0432 0.073 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 3.38e-01 -0.103 0.107 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 6.93e-01 0.036 0.0909 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 2.85e-01 -0.112 0.104 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0895 0.102 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0297 0.0879 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 8.71e-01 0.0175 0.108 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 2.29e-01 0.127 0.105 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 5.58e-01 0.0577 0.0983 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 9.81e-01 0.00258 0.107 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0488 0.0594 0.24 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0143 0.0919 0.24 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 7.63e-01 0.0233 0.0771 0.24 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0792 0.0892 0.24 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0521 0.1 0.24 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 328179 sc-eQTL 8.32e-01 0.0211 0.0995 0.24 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 1.45e-01 0.0892 0.0609 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0748 0.0904 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 4.10e-01 0.0792 0.096 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 1.02e-01 0.164 0.0999 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0847 0.101 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 4.35e-01 0.0413 0.0528 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 2.25e-01 -0.116 0.0953 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 4.87e-01 0.0589 0.0845 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 2.40e-01 0.0945 0.0803 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 8.96e-01 0.0122 0.0928 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 3.93e-01 0.0701 0.0819 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 1.69e-02 -0.255 0.106 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 1.62e-01 -0.139 0.0993 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 6.87e-01 -0.042 0.104 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 3.03e-01 -0.101 0.0981 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 1.63e-01 0.0799 0.0571 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 2.26e-01 -0.117 0.0966 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0491 0.0927 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 3.72e-01 0.0702 0.0784 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0653 0.0971 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 2.39e-01 -0.121 0.102 0.241 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 5.69e-01 0.0517 0.0904 0.241 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 2.58e-02 -0.256 0.113 0.241 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0252 0.113 0.241 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 5.65e-01 0.0776 0.134 0.241 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 8.39e-01 0.0131 0.0642 0.235 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0727 0.0847 0.235 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0586 0.103 0.235 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 8.62e-01 0.0112 0.0647 0.235 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 3.81e-01 0.0823 0.0938 0.235 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 328179 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0469 0.0759 0.235 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 7.81e-02 0.123 0.0696 0.237 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0805 0.0887 0.237 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 3.79e-02 0.166 0.0797 0.237 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 6.39e-01 0.0438 0.0932 0.237 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 4.15e-01 0.0849 0.104 0.237 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 2.82e-01 0.0957 0.0887 0.237 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 821385 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0314 0.0924 0.237 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 6.15e-01 0.0399 0.0792 0.237 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0851 0.104 0.237 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 3.35e-01 0.0844 0.0873 0.237 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0166 0.107 0.237 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 792427 sc-eQTL 2.41e-01 0.105 0.0896 0.237 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 8.86e-01 0.0108 0.0753 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 821385 sc-eQTL 1.98e-01 0.106 0.0819 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 8.70e-02 0.152 0.0882 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 3.12e-01 0.0692 0.0682 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0896 0.0703 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 1.51e-01 -0.14 0.0967 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 792427 sc-eQTL 2.48e-01 0.105 0.0904 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0169 0.0858 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 821385 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0281 0.0963 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 1.82e-01 0.128 0.0958 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0458 0.0783 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0651 0.0773 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 4.12e-01 0.0858 0.104 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 792427 sc-eQTL 5.44e-02 0.189 0.0975 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00466 0.0865 0.236 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 3.50e-01 -0.121 0.129 0.236 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00669 0.12 0.236 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0552 0.115 0.236 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 1.55e-01 0.181 0.127 0.236 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 328179 sc-eQTL 9.08e-01 0.0129 0.112 0.236 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 2.24e-01 -0.116 0.0955 0.238 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 821385 sc-eQTL 1.21e-01 0.15 0.0964 0.238 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 5.75e-01 0.0557 0.0993 0.238 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 5.60e-01 0.0517 0.0885 0.238 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 6.42e-02 -0.175 0.0938 0.238 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 6.53e-02 -0.181 0.0975 0.238 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 792427 sc-eQTL 6.96e-02 0.179 0.0981 0.238 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 3.88e-01 0.0672 0.0776 0.231 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 821385 sc-eQTL 6.32e-01 0.0416 0.0868 0.231 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 4.18e-01 0.0785 0.0966 0.231 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0519 0.083 0.231 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 7.45e-02 0.151 0.0842 0.231 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 2.42e-01 -0.105 0.0899 0.231 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 792427 sc-eQTL 4.16e-02 0.209 0.102 0.231 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 8.80e-01 0.0155 0.103 0.226 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 821385 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0733 0.0866 0.226 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 5.85e-01 0.0531 0.0971 0.226 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 5.88e-01 0.0644 0.119 0.226 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0821 0.103 0.226 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 6.76e-01 0.0479 0.114 0.226 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 792427 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0198 0.0981 0.226 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0494 0.0677 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 7.27e-01 0.0246 0.0704 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0128 0.0805 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 6.91e-01 0.031 0.078 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 1.37e-01 0.152 0.102 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0581 0.0578 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 2.48e-01 0.0752 0.0649 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 6.22e-01 0.0366 0.0741 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0617 0.0745 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 2.40e-01 -0.116 0.0984 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 9.38e-01 0.00533 0.068 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 821385 sc-eQTL 5.49e-01 0.0494 0.0823 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 1.11e-01 0.144 0.0899 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 5.84e-01 0.0358 0.0653 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 1.89e-01 -0.0828 0.0628 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0151 0.0989 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 792427 sc-eQTL 5.64e-02 0.174 0.0908 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0131 0.0702 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 821385 sc-eQTL 2.78e-01 0.09 0.0827 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 3.43e-01 0.0872 0.0918 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0592 0.0679 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0636 0.07 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 3.29e-02 -0.191 0.089 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 792427 sc-eQTL 4.99e-02 0.186 0.0944 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 417270 sc-eQTL 1.42e-01 0.0726 0.0493 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 774230 sc-eQTL 6.76e-02 -0.157 0.0855 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 623375 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0112 0.0788 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 958822 sc-eQTL 2.96e-01 0.0705 0.0673 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0519 0.0841 0.237 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 eQTL 3.2e-19 -0.226 0.0246 0.0 0.0 0.255

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139350 NEDD1 -89473 4.48e-06 5.08e-06 8.15e-07 3.1e-06 1.32e-06 1.74e-06 5.03e-06 9.79e-07 4.93e-06 2.44e-06 5.25e-06 3.52e-06 7.36e-06 2.31e-06 1.35e-06 3.3e-06 2.01e-06 3.49e-06 1.45e-06 1.02e-06 2.63e-06 4.74e-06 4.58e-06 1.36e-06 6.75e-06 1.72e-06 2.55e-06 1.69e-06 4.53e-06 4.4e-06 2.83e-06 5.26e-07 6.12e-07 1.52e-06 2.2e-06 9.53e-07 9.99e-07 3.91e-07 8.5e-07 4.11e-07 5.19e-07 5.64e-06 4.34e-07 1.65e-07 3.74e-07 5.17e-07 7.92e-07 3.19e-07 3.43e-07