logo

Genes within 1Mb (chr12:96790131:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 4.47e-03 -0.182 0.0634 0.135 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0499 0.0803 0.135 B L1
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0526 0.0854 0.135 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0699 0.0775 0.135 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 1.95e-01 0.147 0.113 0.135 B L1
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0582 0.0531 0.135 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 8.86e-01 0.0105 0.0732 0.135 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 8.71e-01 0.0129 0.0793 0.135 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 8.74e-01 -0.011 0.0693 0.135 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 7.04e-08 0.445 0.0797 0.135 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 3.95e-02 -0.112 0.0539 0.135 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 2.65e-01 0.0651 0.0582 0.135 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 1.75e-01 0.119 0.0875 0.135 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00515 0.072 0.135 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 2.94e-02 0.208 0.0947 0.135 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 5.84e-02 -0.191 0.1 0.14 DC L1
ENSG00000084110 HAL 793766 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0898 0.115 0.14 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 5.92e-03 -0.257 0.0923 0.14 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0249 0.115 0.14 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0397 0.0958 0.14 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 1.02e-01 0.2 0.122 0.14 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 764808 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0679 0.111 0.14 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 3.78e-01 0.0727 0.0823 0.135 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 793766 sc-eQTL 1.15e-01 -0.163 0.103 0.135 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 5.84e-02 -0.221 0.116 0.135 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 2.02e-01 0.1 0.0784 0.135 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 5.35e-01 0.0461 0.0742 0.135 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 1.68e-01 -0.157 0.113 0.135 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 764808 sc-eQTL 4.99e-02 -0.216 0.109 0.135 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 1.42e-01 -0.0894 0.0606 0.133 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 6.67e-02 0.189 0.103 0.133 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 6.59e-01 0.0433 0.098 0.133 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 1.49e-01 -0.117 0.0809 0.133 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 1.31e-01 -0.155 0.102 0.133 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0271 0.0514 0.135 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 998979 sc-eQTL 1.34e-01 -0.142 0.0946 0.135 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 2.16e-01 0.133 0.107 0.135 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 1.88e-01 0.11 0.0835 0.135 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 1.70e-01 -0.107 0.0776 0.135 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 5.87e-01 0.0646 0.119 0.135 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 300560 sc-eQTL 1.57e-01 0.174 0.122 0.135 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 7.75e-01 0.0344 0.12 0.143 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 4.26e-01 -0.108 0.136 0.143 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 9.42e-01 0.0106 0.144 0.143 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 9.68e-01 0.00551 0.136 0.143 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 7.92e-01 0.0375 0.142 0.143 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 1.93e-02 -0.232 0.0984 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 9.21e-02 -0.162 0.0958 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 5.98e-01 0.0574 0.109 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 3.33e-01 -0.105 0.108 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 3.78e-01 -0.112 0.127 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 1.44e-01 -0.14 0.0953 0.136 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 2.41e-01 -0.13 0.11 0.136 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 7.27e-01 0.038 0.109 0.136 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0734 0.115 0.136 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0575 0.127 0.136 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 3.30e-02 -0.169 0.0789 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0943 0.0833 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 2.09e-02 -0.227 0.0975 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0157 0.096 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 5.29e-02 0.238 0.122 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0773 0.102 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0707 0.0963 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0614 0.114 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0276 0.113 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 7.11e-01 0.0498 0.134 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 2.44e-01 -0.112 0.0955 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 1.37e-01 0.201 0.134 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0409 0.137 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0282 0.119 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 7.94e-01 0.0359 0.138 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 1.67e-01 -0.0812 0.0585 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 8.49e-01 0.0162 0.085 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 6.41e-01 0.0397 0.085 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 9.87e-01 0.0012 0.0756 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 2.70e-05 0.383 0.0892 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 9.62e-01 0.00272 0.0577 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 7.69e-02 0.173 0.0972 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 1.99e-01 0.124 0.096 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 8.88e-01 0.0111 0.079 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 8.69e-02 0.184 0.107 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 1.00e-01 -0.115 0.0697 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0797 0.108 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0191 0.101 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 9.50e-01 0.00665 0.105 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 8.77e-04 0.411 0.122 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 5.66e-02 -0.128 0.0669 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 3.15e-02 0.261 0.12 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 1.11e-02 0.28 0.109 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0929 0.102 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 2.33e-01 0.136 0.114 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 1.52e-01 -0.119 0.0828 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 1.95e-01 0.129 0.0993 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 1.71e-01 0.144 0.105 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 2.14e-01 -0.118 0.0945 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 2.25e-02 0.256 0.112 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 5.29e-02 -0.174 0.0895 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0921 0.133 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 8.67e-01 0.0189 0.112 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 5.47e-01 0.0781 0.129 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0268 0.127 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 2.35e-01 -0.128 0.108 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0162 0.132 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 4.76e-01 0.0929 0.13 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 7.66e-01 0.036 0.121 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 2.84e-01 0.141 0.131 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 7.32e-01 0.0257 0.075 0.134 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 998979 sc-eQTL 2.72e-02 -0.222 0.1 0.134 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 2.39e-01 0.136 0.116 0.134 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 8.01e-01 0.0246 0.0973 0.134 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 2.90e-01 -0.119 0.112 0.134 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 2.59e-01 0.143 0.126 0.134 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 300560 sc-eQTL 9.89e-01 0.00178 0.125 0.134 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 6.38e-02 -0.14 0.0754 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 1.37e-01 0.167 0.112 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 9.07e-01 -0.014 0.119 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 1.98e-03 -0.382 0.122 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 1.30e-01 -0.191 0.125 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0475 0.0658 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 5.54e-01 0.0705 0.119 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0338 0.105 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0545 0.1 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 3.33e-01 -0.112 0.115 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 8.09e-01 0.0247 0.102 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 3.38e-01 0.129 0.134 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0756 0.124 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 1.44e-01 -0.189 0.129 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0599 0.123 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0718 0.0711 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 3.69e-02 0.251 0.119 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 1.28e-01 0.175 0.115 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 1.87e-01 -0.129 0.0973 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 1.86e-01 -0.16 0.12 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 3.12e-01 0.13 0.128 0.137 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0503 0.113 0.137 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0319 0.145 0.137 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 6.52e-02 -0.259 0.139 0.137 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 6.47e-01 0.0771 0.168 0.137 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 2.09e-01 0.101 0.0801 0.137 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 998979 sc-eQTL 5.69e-01 0.0514 0.0902 0.137 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 7.56e-01 0.0331 0.106 0.137 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 9.10e-02 0.217 0.128 0.137 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0916 0.0807 0.137 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 8.06e-01 0.0289 0.118 0.137 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 300560 sc-eQTL 5.44e-01 0.0578 0.0951 0.137 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 3.45e-01 0.0831 0.0879 0.135 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 6.45e-01 0.0514 0.111 0.135 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 1.07e-01 -0.163 0.1 0.135 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0195 0.117 0.135 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 3.79e-02 0.27 0.129 0.135 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 1.87e-01 -0.143 0.108 0.146 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 793766 sc-eQTL 7.75e-01 0.0323 0.113 0.146 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 3.43e-02 -0.203 0.0954 0.146 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 7.53e-01 0.0401 0.128 0.146 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 8.31e-01 0.0228 0.107 0.146 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 3.83e-01 0.114 0.13 0.146 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 764808 sc-eQTL 1.28e-01 -0.167 0.109 0.146 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 3.00e-01 0.0988 0.0952 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 793766 sc-eQTL 1.72e-01 -0.142 0.104 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 4.87e-02 -0.221 0.111 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 2.83e-01 0.093 0.0864 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 9.13e-01 0.00983 0.0894 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 9.80e-01 0.0031 0.123 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 764808 sc-eQTL 4.26e-02 -0.232 0.114 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 8.67e-01 0.0178 0.106 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 793766 sc-eQTL 3.88e-01 -0.103 0.119 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 1.67e-01 -0.165 0.119 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 3.17e-01 0.0971 0.0969 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 8.21e-01 0.0218 0.096 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 1.28e-01 -0.197 0.129 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 764808 sc-eQTL 4.24e-02 -0.247 0.121 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0224 0.105 0.133 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 998979 sc-eQTL 8.99e-02 -0.204 0.119 0.133 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 4.09e-01 0.13 0.157 0.133 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 1.79e-01 0.195 0.145 0.133 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 1.31e-01 -0.211 0.139 0.133 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0265 0.155 0.133 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 300560 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0113 0.136 0.133 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 6.43e-01 0.0569 0.123 0.136 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 793766 sc-eQTL 1.59e-01 -0.175 0.123 0.136 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 2.67e-01 -0.141 0.127 0.136 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00342 0.113 0.136 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 1.21e-01 -0.187 0.12 0.136 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 6.79e-01 0.0522 0.126 0.136 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 764808 sc-eQTL 2.34e-01 -0.15 0.126 0.136 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 9.93e-01 0.000877 0.0953 0.14 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 793766 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0906 0.106 0.14 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 3.52e-01 -0.11 0.118 0.14 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 4.70e-01 0.0737 0.102 0.14 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 3.00e-01 0.108 0.104 0.14 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 1.54e-01 -0.157 0.11 0.14 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 764808 sc-eQTL 1.82e-01 -0.168 0.126 0.14 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 2.51e-01 -0.144 0.125 0.153 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 793766 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0189 0.106 0.153 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 8.33e-03 -0.309 0.116 0.153 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 8.25e-02 -0.25 0.143 0.153 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 2.75e-01 -0.138 0.126 0.153 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 4.61e-01 0.103 0.139 0.153 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 764808 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0682 0.119 0.153 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 4.63e-03 -0.235 0.0821 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 9.24e-02 -0.146 0.0863 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 2.33e-01 0.118 0.099 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 7.44e-02 -0.171 0.0956 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 9.47e-01 0.00844 0.126 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 3.59e-02 -0.149 0.0707 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0992 0.0799 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 3.06e-02 -0.197 0.0903 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 9.16e-01 0.00968 0.0919 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 1.44e-01 0.178 0.121 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 4.53e-01 0.0646 0.0858 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 793766 sc-eQTL 1.53e-01 -0.148 0.104 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 8.75e-02 -0.195 0.113 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 1.55e-01 0.117 0.0822 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 4.98e-01 0.054 0.0796 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 3.71e-01 -0.112 0.125 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 764808 sc-eQTL 5.61e-02 -0.22 0.115 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 5.52e-01 0.0526 0.0883 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 793766 sc-eQTL 1.01e-01 -0.171 0.104 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 7.93e-02 -0.203 0.115 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 8.07e-01 0.0209 0.0857 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 8.78e-01 0.0136 0.0884 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 3.46e-01 -0.107 0.113 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 764808 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0961 0.12 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 389651 sc-eQTL 1.48e-01 -0.0892 0.0614 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 746611 sc-eQTL 6.14e-02 0.2 0.107 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 595756 sc-eQTL 7.00e-01 0.038 0.0983 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 931203 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0764 0.0839 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 sc-eQTL 1.44e-01 -0.153 0.104 0.134 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -117092 eQTL 0.0279 -0.0765 0.0347 0.0 0.0 0.123
ENSG00000257878 AC007298.2 793610 eQTL 0.0508 0.033 0.0169 0.00108 0.0 0.123

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina