logo

Genes within 1Mb (chr12:96790011:CT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 2.93e-02 -0.112 0.051 0.237 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 2.39e-01 0.0753 0.0638 0.237 B L1
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00477 0.0682 0.237 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0366 0.0619 0.237 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0284 0.0904 0.237 B L1
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0167 0.0425 0.237 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 2.63e-02 -0.129 0.0577 0.237 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 9.16e-01 0.00667 0.0632 0.237 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0249 0.0553 0.237 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 1.80e-02 -0.16 0.0672 0.237 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0196 0.0437 0.237 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 1.09e-01 0.0751 0.0467 0.237 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 9.28e-01 0.00644 0.0707 0.237 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0364 0.0579 0.237 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 2.90e-02 -0.167 0.0761 0.237 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 4.97e-01 0.0553 0.0814 0.234 DC L1
ENSG00000084110 HAL 793646 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0521 0.0926 0.234 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 1.25e-01 0.116 0.0754 0.234 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0325 0.0928 0.234 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 5.40e-01 0.0474 0.0772 0.234 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 8.43e-01 0.0197 0.0991 0.234 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 764688 sc-eQTL 7.66e-01 0.0266 0.0895 0.234 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 9.52e-01 0.0039 0.0654 0.237 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 793646 sc-eQTL 4.44e-01 0.063 0.0822 0.237 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 1.15e-01 0.146 0.0924 0.237 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 5.45e-01 0.0378 0.0624 0.237 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 1.46e-01 -0.0855 0.0586 0.237 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 2.99e-01 -0.094 0.0902 0.237 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 764688 sc-eQTL 2.89e-02 0.191 0.0866 0.237 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 2.02e-01 0.0624 0.0487 0.236 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 1.17e-01 -0.13 0.0826 0.236 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 7.53e-01 0.0248 0.0788 0.236 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 4.31e-01 0.0515 0.0652 0.236 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 3.34e-01 -0.08 0.0825 0.236 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 9.34e-01 0.00342 0.0412 0.237 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 998859 sc-eQTL 1.85e-01 0.101 0.0759 0.237 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0776 0.086 0.237 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0209 0.0672 0.237 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 6.24e-01 0.0306 0.0624 0.237 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0199 0.0951 0.237 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 300440 sc-eQTL 4.90e-01 -0.068 0.0984 0.237 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 3.94e-02 -0.189 0.091 0.242 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 4.26e-01 0.083 0.104 0.242 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0835 0.11 0.242 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 2.14e-01 0.129 0.104 0.242 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 4.23e-01 0.0874 0.109 0.242 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0127 0.0816 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 5.08e-01 0.0523 0.0789 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0597 0.089 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 9.64e-01 0.00403 0.0887 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 6.24e-01 0.0511 0.104 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 2.42e-01 -0.09 0.0767 0.239 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0252 0.0888 0.239 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 6.11e-01 0.0444 0.0873 0.239 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 5.82e-01 0.051 0.0925 0.239 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 5.74e-01 0.0576 0.102 0.239 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 1.83e-01 -0.0865 0.0647 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 2.71e-01 0.0748 0.0679 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 6.22e-01 0.0397 0.0804 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 9.32e-01 0.0067 0.0783 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 1.18e-01 -0.156 0.0998 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 7.07e-01 0.0306 0.0812 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 5.45e-01 0.0466 0.0769 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 6.64e-01 0.0395 0.0908 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 1.64e-01 -0.125 0.0897 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 8.09e-01 0.0259 0.107 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00454 0.0763 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 6.56e-02 -0.197 0.107 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 5.29e-01 0.0686 0.109 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 8.08e-01 0.0231 0.0946 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0166 0.109 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0252 0.0467 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 7.57e-02 -0.12 0.0671 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 6.14e-01 0.0342 0.0676 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0291 0.06 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 3.57e-02 -0.155 0.0732 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 4.23e-02 -0.0917 0.0449 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 7.26e-03 -0.205 0.0756 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00539 0.0757 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0612 0.0619 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 1.07e-01 -0.136 0.0843 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 1.96e-01 -0.0731 0.0563 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 8.37e-01 0.0179 0.0873 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0313 0.0811 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0789 0.0847 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0851 0.101 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 5.65e-01 0.0312 0.0541 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 9.01e-01 0.0122 0.0978 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0415 0.089 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0281 0.0818 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 1.84e-02 -0.215 0.0906 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000218 0.0654 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 4.62e-01 0.0578 0.0783 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 5.42e-01 0.0506 0.0829 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 7.33e-01 0.0254 0.0746 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0757 0.0886 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 5.55e-01 0.0432 0.073 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 3.38e-01 -0.103 0.107 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 6.93e-01 0.036 0.0909 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 2.85e-01 -0.112 0.104 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0895 0.102 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0297 0.0879 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 8.71e-01 0.0175 0.108 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 2.29e-01 0.127 0.105 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 5.58e-01 0.0577 0.0983 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 9.81e-01 0.00258 0.107 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0488 0.0594 0.24 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 998859 sc-eQTL 1.19e-01 0.125 0.0797 0.24 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0143 0.0919 0.24 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 7.63e-01 0.0233 0.0771 0.24 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0792 0.0892 0.24 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0521 0.1 0.24 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 300440 sc-eQTL 8.32e-01 0.0211 0.0995 0.24 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 1.45e-01 0.0892 0.0609 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0748 0.0904 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 4.10e-01 0.0792 0.096 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 1.02e-01 0.164 0.0999 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0847 0.101 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 4.35e-01 0.0413 0.0528 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 2.25e-01 -0.116 0.0953 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 4.87e-01 0.0589 0.0845 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 2.40e-01 0.0945 0.0803 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 8.96e-01 0.0122 0.0928 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 3.93e-01 0.0701 0.0819 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 1.69e-02 -0.255 0.106 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 1.62e-01 -0.139 0.0993 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 6.87e-01 -0.042 0.104 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 3.03e-01 -0.101 0.0981 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 1.63e-01 0.0799 0.0571 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 2.26e-01 -0.117 0.0966 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0491 0.0927 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 3.72e-01 0.0702 0.0784 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0653 0.0971 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 2.39e-01 -0.121 0.102 0.241 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 5.69e-01 0.0517 0.0904 0.241 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 2.58e-02 -0.256 0.113 0.241 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0252 0.113 0.241 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 5.65e-01 0.0776 0.134 0.241 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 8.39e-01 0.0131 0.0642 0.235 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 998859 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0699 0.072 0.235 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0727 0.0847 0.235 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0586 0.103 0.235 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 8.62e-01 0.0112 0.0647 0.235 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 3.81e-01 0.0823 0.0938 0.235 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 300440 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0469 0.0759 0.235 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 7.81e-02 0.123 0.0696 0.237 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0805 0.0887 0.237 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 3.79e-02 0.166 0.0797 0.237 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 6.39e-01 0.0438 0.0932 0.237 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 4.15e-01 0.0849 0.104 0.237 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 2.82e-01 0.0957 0.0887 0.237 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 793646 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0314 0.0924 0.237 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 6.15e-01 0.0399 0.0792 0.237 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0851 0.104 0.237 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 3.35e-01 0.0844 0.0873 0.237 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0166 0.107 0.237 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 764688 sc-eQTL 2.41e-01 0.105 0.0896 0.237 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 8.86e-01 0.0108 0.0753 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 793646 sc-eQTL 1.98e-01 0.106 0.0819 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 8.70e-02 0.152 0.0882 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 3.12e-01 0.0692 0.0682 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0896 0.0703 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 1.51e-01 -0.14 0.0967 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 764688 sc-eQTL 2.48e-01 0.105 0.0904 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0169 0.0858 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 793646 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0281 0.0963 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 1.82e-01 0.128 0.0958 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0458 0.0783 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0651 0.0773 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 4.12e-01 0.0858 0.104 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 764688 sc-eQTL 5.44e-02 0.189 0.0975 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00466 0.0865 0.236 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 998859 sc-eQTL 3.36e-01 0.0955 0.0989 0.236 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 3.50e-01 -0.121 0.129 0.236 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00669 0.12 0.236 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0552 0.115 0.236 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 1.55e-01 0.181 0.127 0.236 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 300440 sc-eQTL 9.08e-01 0.0129 0.112 0.236 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 2.24e-01 -0.116 0.0955 0.238 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 793646 sc-eQTL 1.21e-01 0.15 0.0964 0.238 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 5.75e-01 0.0557 0.0993 0.238 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 5.60e-01 0.0517 0.0885 0.238 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 6.42e-02 -0.175 0.0938 0.238 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 6.53e-02 -0.181 0.0975 0.238 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 764688 sc-eQTL 6.96e-02 0.179 0.0981 0.238 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 3.88e-01 0.0672 0.0776 0.231 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 793646 sc-eQTL 6.32e-01 0.0416 0.0868 0.231 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 4.18e-01 0.0785 0.0966 0.231 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0519 0.083 0.231 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 7.45e-02 0.151 0.0842 0.231 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 2.42e-01 -0.105 0.0899 0.231 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 764688 sc-eQTL 4.16e-02 0.209 0.102 0.231 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 8.80e-01 0.0155 0.103 0.226 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 793646 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0733 0.0866 0.226 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 5.85e-01 0.0531 0.0971 0.226 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 5.88e-01 0.0644 0.119 0.226 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0821 0.103 0.226 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 6.76e-01 0.0479 0.114 0.226 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 764688 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0198 0.0981 0.226 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0494 0.0677 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 7.27e-01 0.0246 0.0704 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0128 0.0805 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 6.91e-01 0.031 0.078 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 1.37e-01 0.152 0.102 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0581 0.0578 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 2.48e-01 0.0752 0.0649 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 6.22e-01 0.0366 0.0741 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0617 0.0745 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 2.40e-01 -0.116 0.0984 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 9.38e-01 0.00533 0.068 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 793646 sc-eQTL 5.49e-01 0.0494 0.0823 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 1.11e-01 0.144 0.0899 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 5.84e-01 0.0358 0.0653 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 1.89e-01 -0.0828 0.0628 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0151 0.0989 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 764688 sc-eQTL 5.64e-02 0.174 0.0908 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0131 0.0702 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 793646 sc-eQTL 2.78e-01 0.09 0.0827 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 3.43e-01 0.0872 0.0918 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0592 0.0679 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0636 0.07 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 3.29e-02 -0.191 0.089 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 764688 sc-eQTL 4.99e-02 0.186 0.0944 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 389531 sc-eQTL 1.42e-01 0.0726 0.0493 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 746491 sc-eQTL 6.76e-02 -0.157 0.0855 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 595636 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0112 0.0788 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 931083 sc-eQTL 2.96e-01 0.0705 0.0673 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0519 0.0841 0.237 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 eQTL 4.42e-19 -0.226 0.0247 0.0 0.0 0.254

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139350 NEDD1 -117212 2.31e-05 2.51e-05 7.74e-06 7.65e-06 3.92e-06 9.27e-06 2.99e-05 2.16e-06 1.59e-05 7.27e-06 2.68e-05 7.98e-06 3.74e-05 8.04e-06 6.5e-06 1.03e-05 1.7e-05 1.18e-05 5.37e-06 4.51e-06 9.2e-06 2.59e-05 2.61e-05 4.69e-06 2.84e-05 6.06e-06 8.01e-06 6.54e-06 3.01e-05 2.35e-05 1.18e-05 9.9e-07 8.43e-07 3.64e-06 5.77e-06 3.86e-06 2.6e-06 1.83e-06 3.64e-06 9.82e-07 1.67e-06 3.49e-05 3.24e-06 5.88e-07 3e-06 2.77e-06 1.72e-06 7.8e-07 4.73e-07