logo

Genes within 1Mb (chr12:96769178:CT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 5.20e-01 0.0626 0.0971 0.94 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 6.19e-01 0.0602 0.121 0.94 B L1
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 2.63e-01 0.144 0.128 0.94 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 1.47e-01 0.169 0.116 0.94 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 9.18e-02 0.287 0.169 0.94 B L1
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 8.33e-01 0.0171 0.0811 0.94 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 9.08e-01 -0.013 0.111 0.94 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 2.67e-01 -0.134 0.12 0.94 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 3.89e-01 0.0908 0.105 0.94 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 7.61e-01 0.0395 0.13 0.94 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 1.84e-02 -0.192 0.081 0.94 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 9.68e-01 0.00357 0.0881 0.94 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0578 0.133 0.94 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0359 0.109 0.94 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 9.66e-01 0.00623 0.144 0.94 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 2.09e-01 -0.192 0.153 0.941 DC L1
ENSG00000084110 HAL 772813 sc-eQTL 3.32e-01 -0.169 0.174 0.941 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 1.42e-01 0.209 0.142 0.941 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 6.88e-01 0.0703 0.175 0.941 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 8.04e-01 -0.036 0.145 0.941 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 7.28e-01 0.0649 0.187 0.941 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 743855 sc-eQTL 1.16e-01 -0.264 0.167 0.941 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 2.35e-01 0.147 0.124 0.94 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 772813 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00389 0.156 0.94 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 8.71e-01 0.0286 0.176 0.94 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 3.94e-01 0.101 0.118 0.94 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0389 0.112 0.94 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 8.80e-01 -0.026 0.171 0.94 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 743855 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0396 0.166 0.94 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0193 0.0924 0.94 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0246 0.157 0.94 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 4.93e-01 0.102 0.149 0.94 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 6.92e-01 0.0489 0.123 0.94 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 3.14e-01 -0.157 0.156 0.94 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 1.28e-01 0.119 0.078 0.94 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 978026 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0763 0.145 0.94 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 1.69e-02 -0.389 0.162 0.94 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0525 0.128 0.94 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 7.32e-01 0.0407 0.119 0.94 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0341 0.181 0.94 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 279607 sc-eQTL 3.02e-01 -0.193 0.187 0.94 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 3.06e-01 0.177 0.173 0.936 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 6.03e-01 -0.102 0.196 0.936 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 9.64e-01 0.00945 0.208 0.936 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 3.92e-01 -0.168 0.195 0.936 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 4.47e-01 0.156 0.204 0.936 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0371 0.152 0.94 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 1.83e-01 -0.195 0.146 0.94 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 9.85e-01 0.00305 0.166 0.94 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 6.58e-01 0.073 0.165 0.94 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 3.66e-01 0.175 0.193 0.94 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 3.78e-01 -0.13 0.148 0.94 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 1.60e-01 0.24 0.17 0.94 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 8.46e-02 0.289 0.167 0.94 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 3.62e-01 -0.162 0.177 0.94 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 8.71e-01 -0.032 0.197 0.94 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0188 0.12 0.94 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 9.89e-01 -0.0018 0.126 0.94 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 4.52e-01 0.112 0.148 0.94 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 4.90e-01 0.1 0.144 0.94 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 1.95e-01 0.24 0.185 0.94 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 4.75e-02 0.301 0.151 0.94 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 4.16e-01 0.118 0.144 0.94 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 8.72e-01 0.0276 0.17 0.94 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 3.09e-01 0.172 0.169 0.94 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 1.14e-01 0.317 0.2 0.94 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 3.21e-01 0.142 0.142 0.939 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 1.32e-01 -0.302 0.2 0.939 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 9.28e-01 0.0183 0.204 0.939 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 6.36e-01 0.084 0.177 0.939 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 3.41e-01 0.195 0.204 0.939 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 6.87e-01 0.0358 0.0887 0.94 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0469 0.128 0.94 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 3.79e-01 -0.113 0.128 0.94 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 4.99e-01 0.0771 0.114 0.94 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 9.39e-01 0.0107 0.14 0.94 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 7.11e-01 -0.032 0.0863 0.94 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00585 0.146 0.94 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 1.63e-01 -0.201 0.143 0.94 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 4.99e-02 0.231 0.117 0.94 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 3.41e-01 -0.154 0.161 0.94 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 8.16e-01 0.0246 0.105 0.94 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 6.07e-01 0.0839 0.163 0.94 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 8.25e-01 0.0335 0.151 0.94 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 2.89e-02 -0.345 0.157 0.94 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00568 0.188 0.94 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0766 0.101 0.94 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 5.58e-01 0.108 0.183 0.94 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 4.48e-01 0.127 0.167 0.94 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 2.40e-02 -0.345 0.152 0.94 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 2.12e-01 0.215 0.172 0.94 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 3.63e-01 -0.112 0.123 0.94 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 3.63e-01 0.135 0.148 0.94 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0992 0.156 0.94 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 6.06e-01 0.0726 0.141 0.94 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0645 0.168 0.94 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00312 0.136 0.94 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 2.36e-01 0.237 0.199 0.94 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 6.70e-01 0.0724 0.169 0.94 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 5.18e-01 -0.126 0.195 0.94 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 2.34e-01 -0.227 0.19 0.94 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0899 0.167 0.943 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 4.50e-01 -0.155 0.205 0.943 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 3.92e-01 -0.173 0.201 0.943 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0755 0.187 0.943 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 9.15e-01 0.0218 0.203 0.943 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 2.44e-01 0.13 0.111 0.939 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 978026 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0829 0.15 0.939 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 3.98e-02 -0.353 0.171 0.939 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 9.55e-01 0.00813 0.145 0.939 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 4.98e-01 -0.114 0.167 0.939 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 2.13e-01 -0.234 0.187 0.939 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 279607 sc-eQTL 1.71e-01 -0.255 0.186 0.939 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 6.96e-01 0.0452 0.115 0.94 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0687 0.171 0.94 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 6.12e-01 0.0921 0.181 0.94 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 2.68e-01 -0.21 0.189 0.94 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 4.56e-01 -0.143 0.191 0.94 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 4.42e-01 0.0769 0.0998 0.94 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 9.89e-01 0.00251 0.18 0.94 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 6.77e-01 0.0667 0.16 0.94 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0726 0.152 0.94 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0166 0.175 0.94 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 9.06e-02 -0.268 0.158 0.941 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 6.40e-02 -0.385 0.207 0.941 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 5.18e-01 0.125 0.193 0.941 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 9.16e-03 0.521 0.198 0.941 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 7.10e-01 0.071 0.191 0.941 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 3.98e-01 0.0922 0.109 0.94 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 5.79e-01 -0.102 0.184 0.94 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 4.93e-01 0.121 0.176 0.94 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 7.03e-01 0.057 0.149 0.94 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 1.61e-01 -0.258 0.184 0.94 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 1.05e-01 0.312 0.191 0.93 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 1.80e-02 -0.398 0.166 0.93 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 8.82e-01 0.0325 0.218 0.93 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 1.11e-01 -0.337 0.21 0.93 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 3.18e-01 0.252 0.252 0.93 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 9.53e-03 0.312 0.119 0.939 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 978026 sc-eQTL 7.23e-01 0.0484 0.136 0.939 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 3.42e-02 -0.338 0.158 0.939 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 5.45e-01 -0.117 0.193 0.939 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 5.02e-01 -0.082 0.122 0.939 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 1.52e-01 0.254 0.176 0.939 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 279607 sc-eQTL 2.50e-01 0.165 0.143 0.939 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0239 0.134 0.94 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 9.66e-01 0.00727 0.17 0.94 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 1.32e-01 -0.232 0.153 0.94 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 7.63e-01 0.0537 0.178 0.94 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 8.01e-02 0.347 0.197 0.94 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 4.72e-01 -0.118 0.163 0.939 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 772813 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0744 0.17 0.939 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 4.09e-02 0.297 0.144 0.939 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 5.22e-01 -0.123 0.192 0.939 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 5.62e-01 0.0934 0.161 0.939 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 9.40e-01 0.0148 0.196 0.939 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 743855 sc-eQTL 3.36e-01 -0.159 0.165 0.939 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 8.97e-02 0.243 0.142 0.94 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 772813 sc-eQTL 8.24e-02 0.271 0.155 0.94 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 9.61e-01 0.00819 0.169 0.94 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 7.53e-01 0.041 0.13 0.94 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0346 0.134 0.94 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 9.08e-01 0.0213 0.185 0.94 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 743855 sc-eQTL 9.49e-01 0.0111 0.173 0.94 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 2.80e-01 0.174 0.161 0.94 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 772813 sc-eQTL 2.57e-01 -0.205 0.18 0.94 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 4.39e-01 0.14 0.18 0.94 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 6.34e-01 0.0702 0.147 0.94 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 4.17e-02 0.295 0.144 0.94 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 2.01e-01 -0.251 0.196 0.94 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 743855 sc-eQTL 7.21e-01 0.0661 0.185 0.94 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 9.96e-01 0.000811 0.159 0.939 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 978026 sc-eQTL 9.44e-01 0.0129 0.183 0.939 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 3.82e-02 -0.491 0.235 0.939 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 1.78e-01 0.296 0.219 0.939 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 4.07e-01 0.176 0.212 0.939 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 9.36e-01 -0.019 0.235 0.939 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 279607 sc-eQTL 9.68e-01 0.00836 0.206 0.939 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 4.69e-02 -0.36 0.18 0.938 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 772813 sc-eQTL 3.11e-02 -0.395 0.182 0.938 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0115 0.189 0.938 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 4.35e-01 0.131 0.168 0.938 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 2.07e-01 -0.227 0.179 0.938 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 9.40e-01 0.014 0.187 0.938 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 743855 sc-eQTL 6.03e-01 0.0977 0.188 0.938 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 7.09e-01 0.0535 0.143 0.937 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 772813 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0502 0.16 0.937 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0342 0.178 0.937 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 7.53e-01 0.0483 0.153 0.937 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 3.19e-03 -0.457 0.153 0.937 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0326 0.166 0.937 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 743855 sc-eQTL 4.97e-01 -0.129 0.189 0.937 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 5.04e-01 -0.119 0.178 0.935 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 772813 sc-eQTL 9.12e-01 0.0167 0.151 0.935 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00332 0.169 0.935 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0291 0.207 0.935 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 5.73e-01 -0.102 0.18 0.935 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 1.95e-01 0.258 0.198 0.935 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 743855 sc-eQTL 2.68e-01 -0.189 0.17 0.935 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0471 0.127 0.94 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0174 0.132 0.94 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 3.32e-01 0.146 0.15 0.94 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 9.06e-01 0.0172 0.146 0.94 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 4.97e-01 0.13 0.191 0.94 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 4.59e-01 0.0795 0.107 0.94 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 9.12e-01 0.0133 0.12 0.94 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 7.32e-01 0.047 0.137 0.94 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 3.70e-01 0.124 0.138 0.94 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 7.73e-02 0.322 0.181 0.94 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 7.82e-02 0.227 0.128 0.94 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 772813 sc-eQTL 7.30e-01 0.0541 0.156 0.94 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 7.15e-01 0.0628 0.172 0.94 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 5.89e-01 0.0671 0.124 0.94 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 5.27e-01 0.0758 0.12 0.94 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 4.91e-01 -0.129 0.188 0.94 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 743855 sc-eQTL 8.61e-01 0.0304 0.174 0.94 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0889 0.132 0.94 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 772813 sc-eQTL 3.89e-01 -0.135 0.156 0.94 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 9.79e-01 0.00456 0.173 0.94 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 6.59e-01 0.0566 0.128 0.94 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 1.44e-02 -0.321 0.13 0.94 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 8.74e-01 0.0269 0.169 0.94 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 743855 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0367 0.179 0.94 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 368698 sc-eQTL 5.65e-01 0.0543 0.0942 0.94 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 725658 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0564 0.164 0.94 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 574803 sc-eQTL 3.30e-01 0.146 0.15 0.94 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 910250 sc-eQTL 2.93e-01 0.135 0.128 0.94 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 sc-eQTL 3.33e-01 -0.155 0.16 0.94 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 eQTL 0.00893 0.119 0.0456 0.0 0.0 0.0653

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139344 \N 825847 1.2e-06 9.45e-07 2.79e-07 1e-06 1.01e-07 1.77e-07 6.09e-07 7.56e-08 8.29e-07 2.01e-07 1.26e-06 3.11e-07 1.73e-06 3.29e-07 4.21e-07 5.69e-07 7.73e-07 6.58e-07 1.62e-07 5.48e-08 2.48e-07 4.81e-07 7.15e-07 6.52e-08 1.86e-06 2.55e-07 2.52e-07 2.71e-07 2.78e-07 8.4e-07 4.55e-07 4.09e-08 3.56e-08 3.28e-07 3e-07 3.02e-07 7.86e-08 8.72e-08 6.5e-08 4.19e-08 4.68e-08 2.41e-06 2.8e-08 3.26e-08 5.75e-08 9.86e-09 1.18e-07 4.5e-09 5.04e-08
ENSG00000139350 NEDD1 -138045 2.62e-05 2.51e-05 4.84e-06 1.31e-05 2.39e-06 7.78e-06 2.4e-05 2.45e-06 1.76e-05 7.27e-06 2.11e-05 8.35e-06 3.8e-05 8.09e-06 5.16e-06 1.06e-05 1.3e-05 1.39e-05 3.84e-06 3.39e-06 7.89e-06 1.62e-05 1.98e-05 4.94e-06 2.93e-05 5.37e-06 8.03e-06 6.34e-06 1.86e-05 1.25e-05 1.18e-05 1.58e-06 1.81e-06 4.3e-06 7.46e-06 4.14e-06 1.87e-06 2.72e-06 3.15e-06 2.23e-06 1.12e-06 3.02e-05 3.44e-06 2.5e-07 9.12e-07 2.61e-06 2.51e-06 1.21e-06 1.01e-06