logo

Genes within 1Mb (chr12:96760685:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 7.96e-02 0.0764 0.0434 0.538 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 1.45e-01 0.0791 0.054 0.538 B L1
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 3.44e-01 0.0547 0.0577 0.538 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 3.58e-01 0.0483 0.0524 0.538 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0631 0.0765 0.538 B L1
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 6.98e-01 -0.014 0.036 0.538 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 8.35e-01 0.0104 0.0495 0.538 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0267 0.0536 0.538 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0413 0.0468 0.538 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 1.62e-01 -0.0807 0.0574 0.538 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0383 0.0369 0.538 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0127 0.0397 0.538 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 1.41e-01 -0.0879 0.0595 0.538 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 9.47e-01 0.00326 0.049 0.538 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0411 0.0651 0.538 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0496 0.0693 0.536 DC L1
ENSG00000084110 HAL 764320 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0676 0.0788 0.536 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 4.87e-02 0.127 0.0639 0.536 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 9.85e-01 0.00151 0.0791 0.536 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 8.83e-01 0.00966 0.0658 0.536 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 9.77e-02 -0.14 0.0838 0.536 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 735362 sc-eQTL 1.40e-01 -0.112 0.0758 0.536 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0402 0.0561 0.538 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 764320 sc-eQTL 8.88e-01 -0.01 0.0708 0.538 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 9.12e-02 0.135 0.0794 0.538 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0354 0.0536 0.538 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0613 0.0504 0.538 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 4.38e-02 -0.156 0.077 0.538 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 735362 sc-eQTL 2.34e-02 0.17 0.0744 0.538 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 3.38e-01 0.0401 0.0418 0.541 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0738 0.0709 0.541 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 8.20e-01 0.0154 0.0674 0.541 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 5.97e-01 0.0295 0.0558 0.541 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 6.95e-01 0.0278 0.0707 0.541 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 3.54e-01 0.0323 0.0348 0.538 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 969533 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0683 0.0644 0.538 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 1.41e-01 -0.107 0.0726 0.538 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0399 0.0568 0.538 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 7.10e-01 0.0197 0.0529 0.538 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 2.11e-01 -0.101 0.0802 0.538 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 271114 sc-eQTL 6.71e-01 0.0355 0.0834 0.538 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 9.51e-01 0.00502 0.082 0.531 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 2.88e-01 0.0987 0.0926 0.531 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 6.01e-01 0.0515 0.0983 0.531 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 6.68e-01 0.0398 0.0927 0.531 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0986 0.0967 0.531 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 2.34e-01 0.0817 0.0684 0.539 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 1.90e-01 0.087 0.0662 0.539 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0513 0.0748 0.539 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 4.92e-01 0.0513 0.0745 0.539 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 4.08e-01 0.0724 0.0872 0.539 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0206 0.0668 0.541 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0173 0.0771 0.541 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 3.70e-01 0.0679 0.0756 0.541 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0842 0.0801 0.541 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 2.59e-01 0.1 0.0886 0.541 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 2.50e-01 0.0633 0.0549 0.538 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 5.19e-01 0.0373 0.0576 0.538 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 3.55e-01 0.0631 0.068 0.538 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 2.49e-01 0.0764 0.0661 0.538 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0569 0.085 0.538 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 5.98e-02 0.132 0.0695 0.539 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 2.81e-01 0.0716 0.0663 0.539 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 5.89e-01 0.0423 0.0783 0.539 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 5.46e-01 0.047 0.0777 0.539 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0801 0.0923 0.539 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 9.00e-01 0.00815 0.0651 0.541 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0165 0.0918 0.541 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0224 0.0929 0.541 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 4.50e-01 0.061 0.0807 0.541 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0727 0.0933 0.541 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 8.37e-01 0.0082 0.0397 0.538 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 8.86e-01 0.00821 0.0574 0.538 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0471 0.0573 0.538 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0452 0.0509 0.538 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 1.35e-01 -0.0936 0.0625 0.538 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0284 0.0385 0.538 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0162 0.0654 0.538 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0571 0.0643 0.538 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 4.49e-01 -0.04 0.0527 0.538 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 8.68e-01 -0.012 0.0722 0.538 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 1.96e-01 0.0623 0.048 0.538 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 4.11e-01 0.0612 0.0743 0.538 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 1.19e-01 0.108 0.0687 0.538 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 1.55e-01 -0.103 0.072 0.538 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 9.69e-02 -0.142 0.0853 0.538 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 9.42e-01 0.00339 0.0466 0.538 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 5.14e-01 -0.055 0.0841 0.538 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 6.41e-01 0.0358 0.0766 0.538 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0329 0.0704 0.538 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0205 0.079 0.538 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 1.25e-01 -0.0848 0.0551 0.538 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 8.60e-01 0.0118 0.0664 0.538 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 4.45e-02 -0.141 0.0695 0.538 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 2.38e-01 0.0744 0.0629 0.538 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0846 0.0749 0.538 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 8.68e-02 0.106 0.0617 0.535 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 1.46e-01 0.133 0.0909 0.535 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0595 0.0773 0.535 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 5.90e-01 0.0481 0.089 0.535 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0509 0.0872 0.535 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0553 0.0747 0.537 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 9.56e-01 0.00511 0.0916 0.537 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000324 0.0901 0.537 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 8.08e-01 0.0204 0.0837 0.537 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0706 0.0908 0.537 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 7.62e-01 0.0152 0.0502 0.537 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 969533 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0549 0.0675 0.537 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0798 0.0773 0.537 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0412 0.065 0.537 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 4.66e-01 -0.055 0.0753 0.537 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0859 0.0844 0.537 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 271114 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0506 0.0838 0.537 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 5.16e-03 0.148 0.0525 0.542 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 5.45e-01 0.048 0.0791 0.542 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 7.59e-01 0.0258 0.084 0.542 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 2.86e-02 0.191 0.0869 0.542 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 7.27e-01 -0.031 0.0887 0.542 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 1.18e-01 0.0701 0.0447 0.543 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0514 0.0812 0.543 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00254 0.0719 0.543 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 2.25e-01 -0.0829 0.0682 0.543 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0202 0.0788 0.543 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0449 0.0703 0.546 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 1.85e-01 -0.122 0.0918 0.546 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 3.59e-02 0.179 0.0846 0.546 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 5.98e-02 0.167 0.0883 0.546 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0506 0.0843 0.546 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 9.41e-01 0.00364 0.0492 0.543 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0671 0.083 0.543 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0571 0.0795 0.543 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 1.92e-01 0.0878 0.0672 0.543 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 1.35e-01 0.124 0.0829 0.543 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 1.18e-01 -0.156 0.0989 0.544 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0559 0.088 0.544 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 4.05e-02 0.23 0.111 0.544 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 4.96e-01 0.0752 0.11 0.544 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 7.13e-01 0.0484 0.131 0.544 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 9.68e-01 -0.0022 0.0546 0.533 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 969533 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0745 0.0611 0.533 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0051 0.0721 0.533 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0717 0.087 0.533 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 4.68e-01 0.0399 0.0549 0.533 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 6.65e-01 0.0346 0.0798 0.533 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 271114 sc-eQTL 3.61e-01 0.059 0.0644 0.533 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0736 0.0598 0.538 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0505 0.076 0.538 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0609 0.0688 0.538 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 5.40e-01 0.0489 0.0797 0.538 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 6.56e-01 0.0397 0.089 0.538 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0129 0.076 0.537 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 764320 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0636 0.0789 0.537 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 3.58e-03 0.195 0.0662 0.537 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 9.04e-01 0.0108 0.0894 0.537 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 8.71e-01 0.0121 0.0749 0.537 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 2.11e-01 -0.114 0.0908 0.537 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 735362 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0289 0.0769 0.537 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 1.33e-01 -0.0973 0.0645 0.538 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 764320 sc-eQTL 7.44e-01 0.0231 0.0707 0.538 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 5.01e-02 0.149 0.0757 0.538 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 1.41e-01 -0.0864 0.0585 0.538 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 5.42e-01 -0.037 0.0606 0.538 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 5.63e-03 -0.23 0.0821 0.538 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 735362 sc-eQTL 2.53e-02 0.174 0.0771 0.538 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0371 0.0736 0.538 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 764320 sc-eQTL 7.38e-01 0.0276 0.0826 0.538 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 1.49e-01 0.119 0.0821 0.538 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 8.12e-01 0.016 0.0672 0.538 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 5.40e-01 0.0408 0.0664 0.538 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0754 0.0895 0.538 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 735362 sc-eQTL 1.44e-02 0.205 0.0832 0.538 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 7.45e-01 0.024 0.0735 0.536 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 969533 sc-eQTL 6.84e-01 0.0345 0.0844 0.536 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 2.14e-01 -0.137 0.109 0.536 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 7.61e-01 0.0311 0.102 0.536 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 4.12e-02 0.2 0.0968 0.536 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0404 0.108 0.536 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 271114 sc-eQTL 7.28e-01 0.0331 0.0951 0.536 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 1.64e-01 -0.115 0.0822 0.536 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 764320 sc-eQTL 9.47e-01 0.00556 0.0836 0.536 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 1.00e-01 0.141 0.0851 0.536 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00483 0.0763 0.536 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 3.52e-01 -0.076 0.0814 0.536 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 1.44e-01 -0.124 0.0843 0.536 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 735362 sc-eQTL 9.40e-02 0.142 0.0847 0.536 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 8.66e-01 0.0111 0.0661 0.525 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 764320 sc-eQTL 8.92e-01 0.01 0.0737 0.525 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 8.68e-01 0.0137 0.0822 0.525 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00629 0.0706 0.525 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 2.33e-02 -0.163 0.0712 0.525 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 6.88e-01 0.0308 0.0765 0.525 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 735362 sc-eQTL 6.16e-01 0.0438 0.0873 0.525 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0678 0.0862 0.528 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 764320 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0231 0.0729 0.528 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 4.63e-02 0.162 0.0806 0.528 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 9.58e-01 0.00523 0.0998 0.528 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 5.17e-01 0.0566 0.087 0.528 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 5.61e-01 -0.056 0.096 0.528 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 735362 sc-eQTL 6.83e-01 0.0337 0.0824 0.528 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 4.68e-01 0.0416 0.0572 0.538 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 2.04e-01 0.0755 0.0593 0.538 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 9.77e-01 0.00196 0.068 0.538 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000214 0.0659 0.538 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 4.07e-01 0.0717 0.0863 0.538 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 5.79e-02 0.0934 0.049 0.538 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 2.08e-01 0.0698 0.0553 0.538 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 5.38e-01 0.039 0.0631 0.538 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 4.17e-01 0.0516 0.0635 0.538 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0882 0.084 0.538 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 1.12e-01 -0.0929 0.0582 0.538 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 764320 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00526 0.0709 0.538 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 5.22e-02 0.151 0.0772 0.538 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0425 0.0562 0.538 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0201 0.0543 0.538 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 2.45e-02 -0.191 0.0842 0.538 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 735362 sc-eQTL 7.64e-03 0.209 0.0776 0.538 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0535 0.0606 0.541 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 764320 sc-eQTL 8.34e-01 0.0151 0.0717 0.541 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 2.44e-01 0.0926 0.0793 0.541 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0321 0.0588 0.541 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 2.54e-02 -0.135 0.06 0.541 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0629 0.0777 0.541 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 735362 sc-eQTL 6.78e-01 0.0343 0.0823 0.541 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 360205 sc-eQTL 4.40e-01 0.0326 0.0422 0.543 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 717165 sc-eQTL 9.92e-02 -0.121 0.073 0.543 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 566310 sc-eQTL 7.59e-01 0.0207 0.0672 0.543 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 901757 sc-eQTL 9.02e-01 0.00707 0.0575 0.543 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 sc-eQTL 6.09e-01 0.0367 0.0717 0.543 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 eQTL 0.00235 -0.0704 0.0231 0.0 0.0 0.456
ENSG00000188596 CFAP54 271110 eQTL 0.00218 -0.0592 0.0193 0.0 0.0 0.456

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139350 NEDD1 -146538 5.03e-06 5.76e-06 1.21e-06 3.5e-06 2.26e-06 1.91e-06 8.29e-06 2.19e-06 6.61e-06 4.2e-06 8.18e-06 4.15e-06 1e-05 2.5e-06 1.57e-06 5.95e-06 3.62e-06 3.86e-06 2.62e-06 2.74e-06 4.6e-06 7.66e-06 5.59e-06 2.8e-06 9.02e-06 3.86e-06 4.55e-06 2.51e-06 6.99e-06 4.93e-06 3.29e-06 1.01e-06 1.09e-06 3.29e-06 2.42e-06 2.66e-06 1.79e-06 1.75e-06 1.68e-06 9.96e-07 1.01e-06 7e-06 1.04e-06 1.59e-07 8.13e-07 1.57e-06 1.4e-06 7.37e-07 4.43e-07
ENSG00000188596 CFAP54 271110 1.99e-06 2.43e-06 5.82e-07 1.53e-06 6.22e-07 7.82e-07 1.53e-06 1.03e-06 2.27e-06 1.31e-06 2.12e-06 1.46e-06 3.27e-06 1.16e-06 9.5e-07 1.95e-06 1.15e-06 2.22e-06 1.47e-06 1.51e-06 1.57e-06 3.09e-06 2.32e-06 1.1e-06 2.62e-06 1.29e-06 1.47e-06 1.64e-06 1.98e-06 1.56e-06 1.08e-06 4.71e-07 5.04e-07 1.49e-06 9.09e-07 9.01e-07 9.21e-07 4.2e-07 1.21e-06 3.79e-07 2.11e-07 2.48e-06 5.55e-07 1.32e-07 2.74e-07 3.47e-07 8.55e-07 2.22e-07 1.94e-07