logo

Genes within 1Mb (chr12:96760361:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 5.20e-01 0.0626 0.0971 0.94 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 6.19e-01 0.0602 0.121 0.94 B L1
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 2.63e-01 0.144 0.128 0.94 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 1.47e-01 0.169 0.116 0.94 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 9.18e-02 0.287 0.169 0.94 B L1
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 8.33e-01 0.0171 0.0811 0.94 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 9.08e-01 -0.013 0.111 0.94 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 2.67e-01 -0.134 0.12 0.94 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 3.89e-01 0.0908 0.105 0.94 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 7.61e-01 0.0395 0.13 0.94 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 1.84e-02 -0.192 0.081 0.94 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 9.68e-01 0.00357 0.0881 0.94 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0578 0.133 0.94 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0359 0.109 0.94 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 9.66e-01 0.00623 0.144 0.94 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 2.09e-01 -0.192 0.153 0.941 DC L1
ENSG00000084110 HAL 763996 sc-eQTL 3.32e-01 -0.169 0.174 0.941 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 1.42e-01 0.209 0.142 0.941 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 6.88e-01 0.0703 0.175 0.941 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 8.04e-01 -0.036 0.145 0.941 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 7.28e-01 0.0649 0.187 0.941 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 735038 sc-eQTL 1.16e-01 -0.264 0.167 0.941 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 2.35e-01 0.147 0.124 0.94 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 763996 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00389 0.156 0.94 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 8.71e-01 0.0286 0.176 0.94 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 3.94e-01 0.101 0.118 0.94 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0389 0.112 0.94 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 8.80e-01 -0.026 0.171 0.94 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 735038 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0396 0.166 0.94 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0193 0.0924 0.94 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0246 0.157 0.94 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 4.93e-01 0.102 0.149 0.94 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 6.92e-01 0.0489 0.123 0.94 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 3.14e-01 -0.157 0.156 0.94 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 1.28e-01 0.119 0.078 0.94 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 969209 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0763 0.145 0.94 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 1.69e-02 -0.389 0.162 0.94 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0525 0.128 0.94 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 7.32e-01 0.0407 0.119 0.94 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0341 0.181 0.94 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 270790 sc-eQTL 3.02e-01 -0.193 0.187 0.94 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 3.06e-01 0.177 0.173 0.936 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 6.03e-01 -0.102 0.196 0.936 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 9.64e-01 0.00945 0.208 0.936 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 3.92e-01 -0.168 0.195 0.936 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 4.47e-01 0.156 0.204 0.936 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0371 0.152 0.94 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 1.83e-01 -0.195 0.146 0.94 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 9.85e-01 0.00305 0.166 0.94 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 6.58e-01 0.073 0.165 0.94 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 3.66e-01 0.175 0.193 0.94 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 3.78e-01 -0.13 0.148 0.94 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 1.60e-01 0.24 0.17 0.94 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 8.46e-02 0.289 0.167 0.94 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 3.62e-01 -0.162 0.177 0.94 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 8.71e-01 -0.032 0.197 0.94 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0188 0.12 0.94 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 9.89e-01 -0.0018 0.126 0.94 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 4.52e-01 0.112 0.148 0.94 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 4.90e-01 0.1 0.144 0.94 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 1.95e-01 0.24 0.185 0.94 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 4.75e-02 0.301 0.151 0.94 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 4.16e-01 0.118 0.144 0.94 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 8.72e-01 0.0276 0.17 0.94 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 3.09e-01 0.172 0.169 0.94 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 1.14e-01 0.317 0.2 0.94 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 3.21e-01 0.142 0.142 0.939 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 1.32e-01 -0.302 0.2 0.939 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 9.28e-01 0.0183 0.204 0.939 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 6.36e-01 0.084 0.177 0.939 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 3.41e-01 0.195 0.204 0.939 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 6.87e-01 0.0358 0.0887 0.94 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0469 0.128 0.94 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 3.79e-01 -0.113 0.128 0.94 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 4.99e-01 0.0771 0.114 0.94 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 9.39e-01 0.0107 0.14 0.94 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 7.11e-01 -0.032 0.0863 0.94 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00585 0.146 0.94 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 1.63e-01 -0.201 0.143 0.94 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 4.99e-02 0.231 0.117 0.94 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 3.41e-01 -0.154 0.161 0.94 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 8.16e-01 0.0246 0.105 0.94 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 6.07e-01 0.0839 0.163 0.94 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 8.25e-01 0.0335 0.151 0.94 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 2.89e-02 -0.345 0.157 0.94 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00568 0.188 0.94 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0766 0.101 0.94 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 5.58e-01 0.108 0.183 0.94 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 4.48e-01 0.127 0.167 0.94 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 2.40e-02 -0.345 0.152 0.94 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 2.12e-01 0.215 0.172 0.94 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 3.63e-01 -0.112 0.123 0.94 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 3.63e-01 0.135 0.148 0.94 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0992 0.156 0.94 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 6.06e-01 0.0726 0.141 0.94 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0645 0.168 0.94 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00312 0.136 0.94 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 2.36e-01 0.237 0.199 0.94 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 6.70e-01 0.0724 0.169 0.94 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 5.18e-01 -0.126 0.195 0.94 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 2.34e-01 -0.227 0.19 0.94 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0899 0.167 0.943 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 4.50e-01 -0.155 0.205 0.943 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 3.92e-01 -0.173 0.201 0.943 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0755 0.187 0.943 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 9.15e-01 0.0218 0.203 0.943 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 2.44e-01 0.13 0.111 0.939 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 969209 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0829 0.15 0.939 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 3.98e-02 -0.353 0.171 0.939 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 9.55e-01 0.00813 0.145 0.939 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 4.98e-01 -0.114 0.167 0.939 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 2.13e-01 -0.234 0.187 0.939 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 270790 sc-eQTL 1.71e-01 -0.255 0.186 0.939 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 6.96e-01 0.0452 0.115 0.94 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0687 0.171 0.94 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 6.12e-01 0.0921 0.181 0.94 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 2.68e-01 -0.21 0.189 0.94 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 4.56e-01 -0.143 0.191 0.94 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 4.42e-01 0.0769 0.0998 0.94 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 9.89e-01 0.00251 0.18 0.94 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 6.77e-01 0.0667 0.16 0.94 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0726 0.152 0.94 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0166 0.175 0.94 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 9.06e-02 -0.268 0.158 0.941 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 6.40e-02 -0.385 0.207 0.941 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 5.18e-01 0.125 0.193 0.941 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 9.16e-03 0.521 0.198 0.941 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 7.10e-01 0.071 0.191 0.941 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 3.98e-01 0.0922 0.109 0.94 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 5.79e-01 -0.102 0.184 0.94 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 4.93e-01 0.121 0.176 0.94 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 7.03e-01 0.057 0.149 0.94 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 1.61e-01 -0.258 0.184 0.94 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 1.05e-01 0.312 0.191 0.93 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 1.80e-02 -0.398 0.166 0.93 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 8.82e-01 0.0325 0.218 0.93 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 1.11e-01 -0.337 0.21 0.93 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 3.18e-01 0.252 0.252 0.93 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 9.53e-03 0.312 0.119 0.939 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 969209 sc-eQTL 7.23e-01 0.0484 0.136 0.939 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 3.42e-02 -0.338 0.158 0.939 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 5.45e-01 -0.117 0.193 0.939 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 5.02e-01 -0.082 0.122 0.939 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 1.52e-01 0.254 0.176 0.939 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 270790 sc-eQTL 2.50e-01 0.165 0.143 0.939 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0239 0.134 0.94 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 9.66e-01 0.00727 0.17 0.94 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 1.32e-01 -0.232 0.153 0.94 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 7.63e-01 0.0537 0.178 0.94 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 8.01e-02 0.347 0.197 0.94 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 4.72e-01 -0.118 0.163 0.939 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 763996 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0744 0.17 0.939 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 4.09e-02 0.297 0.144 0.939 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 5.22e-01 -0.123 0.192 0.939 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 5.62e-01 0.0934 0.161 0.939 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 9.40e-01 0.0148 0.196 0.939 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 735038 sc-eQTL 3.36e-01 -0.159 0.165 0.939 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 8.97e-02 0.243 0.142 0.94 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 763996 sc-eQTL 8.24e-02 0.271 0.155 0.94 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 9.61e-01 0.00819 0.169 0.94 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 7.53e-01 0.041 0.13 0.94 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0346 0.134 0.94 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 9.08e-01 0.0213 0.185 0.94 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 735038 sc-eQTL 9.49e-01 0.0111 0.173 0.94 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 2.80e-01 0.174 0.161 0.94 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 763996 sc-eQTL 2.57e-01 -0.205 0.18 0.94 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 4.39e-01 0.14 0.18 0.94 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 6.34e-01 0.0702 0.147 0.94 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 4.17e-02 0.295 0.144 0.94 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 2.01e-01 -0.251 0.196 0.94 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 735038 sc-eQTL 7.21e-01 0.0661 0.185 0.94 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 9.96e-01 0.000811 0.159 0.939 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 969209 sc-eQTL 9.44e-01 0.0129 0.183 0.939 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 3.82e-02 -0.491 0.235 0.939 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 1.78e-01 0.296 0.219 0.939 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 4.07e-01 0.176 0.212 0.939 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 9.36e-01 -0.019 0.235 0.939 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 270790 sc-eQTL 9.68e-01 0.00836 0.206 0.939 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 4.69e-02 -0.36 0.18 0.938 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 763996 sc-eQTL 3.11e-02 -0.395 0.182 0.938 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0115 0.189 0.938 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 4.35e-01 0.131 0.168 0.938 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 2.07e-01 -0.227 0.179 0.938 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 9.40e-01 0.014 0.187 0.938 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 735038 sc-eQTL 6.03e-01 0.0977 0.188 0.938 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 7.09e-01 0.0535 0.143 0.937 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 763996 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0502 0.16 0.937 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0342 0.178 0.937 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 7.53e-01 0.0483 0.153 0.937 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 3.19e-03 -0.457 0.153 0.937 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0326 0.166 0.937 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 735038 sc-eQTL 4.97e-01 -0.129 0.189 0.937 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 5.04e-01 -0.119 0.178 0.935 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 763996 sc-eQTL 9.12e-01 0.0167 0.151 0.935 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00332 0.169 0.935 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0291 0.207 0.935 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 5.73e-01 -0.102 0.18 0.935 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 1.95e-01 0.258 0.198 0.935 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 735038 sc-eQTL 2.68e-01 -0.189 0.17 0.935 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0471 0.127 0.94 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0174 0.132 0.94 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 3.32e-01 0.146 0.15 0.94 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 9.06e-01 0.0172 0.146 0.94 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 4.97e-01 0.13 0.191 0.94 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 4.59e-01 0.0795 0.107 0.94 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 9.12e-01 0.0133 0.12 0.94 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 7.32e-01 0.047 0.137 0.94 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 3.70e-01 0.124 0.138 0.94 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 7.73e-02 0.322 0.181 0.94 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 7.82e-02 0.227 0.128 0.94 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 763996 sc-eQTL 7.30e-01 0.0541 0.156 0.94 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 7.15e-01 0.0628 0.172 0.94 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 5.89e-01 0.0671 0.124 0.94 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 5.27e-01 0.0758 0.12 0.94 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 4.91e-01 -0.129 0.188 0.94 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 735038 sc-eQTL 8.61e-01 0.0304 0.174 0.94 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0889 0.132 0.94 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 763996 sc-eQTL 3.89e-01 -0.135 0.156 0.94 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 9.79e-01 0.00456 0.173 0.94 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 6.59e-01 0.0566 0.128 0.94 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 1.44e-02 -0.321 0.13 0.94 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 8.74e-01 0.0269 0.169 0.94 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 735038 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0367 0.179 0.94 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 359881 sc-eQTL 5.65e-01 0.0543 0.0942 0.94 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 716841 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0564 0.164 0.94 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 565986 sc-eQTL 3.30e-01 0.146 0.15 0.94 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 901433 sc-eQTL 2.93e-01 0.135 0.128 0.94 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 sc-eQTL 3.33e-01 -0.155 0.16 0.94 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 eQTL 0.00886 0.119 0.0454 0.0 0.0 0.0653

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139344 \N 817030 8.48e-07 6.07e-07 6.57e-08 3.56e-07 1.02e-07 2.46e-07 5.54e-07 5.56e-08 3.62e-07 1.11e-07 3.66e-07 1.48e-07 7.93e-07 9.48e-08 1.24e-07 1.26e-07 8.74e-08 2.87e-07 8e-08 8.52e-08 1.35e-07 3.1e-07 2.48e-07 3.07e-08 5.75e-07 2e-07 1.87e-07 1.47e-07 2.57e-07 4.1e-07 2.11e-07 2.93e-08 3.46e-08 9.9e-08 1.83e-07 2.74e-08 5.65e-08 6.98e-08 4.75e-08 7.17e-08 5.44e-08 7.7e-07 2.94e-08 2.07e-08 4.7e-08 1.95e-08 1.2e-07 3.81e-09 4.81e-08
ENSG00000139350 NEDD1 -146862 1.13e-05 1.48e-05 1.22e-06 6.16e-06 1.87e-06 4.71e-06 1.09e-05 1.43e-06 1e-05 5.06e-06 1.28e-05 5.06e-06 1.56e-05 3.63e-06 3.15e-06 6.57e-06 4.99e-06 6.49e-06 2.63e-06 2.91e-06 4.8e-06 1.1e-05 7.47e-06 2.85e-06 1.93e-05 3.8e-06 5.16e-06 4.45e-06 1.09e-05 8.01e-06 6.63e-06 1.07e-06 6.67e-07 2.88e-06 4.54e-06 1.63e-06 1.2e-06 1.08e-06 1.4e-06 1.03e-06 4.72e-07 1.39e-05 1.49e-06 1.97e-07 6.85e-07 1.81e-06 9.16e-07 6.87e-07 6e-07