logo

Genes within 1Mb (chr12:96760046:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 5.20e-01 0.0626 0.0971 0.94 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 6.19e-01 0.0602 0.121 0.94 B L1
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 2.63e-01 0.144 0.128 0.94 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 1.47e-01 0.169 0.116 0.94 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 9.18e-02 0.287 0.169 0.94 B L1
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 8.33e-01 0.0171 0.0811 0.94 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 9.08e-01 -0.013 0.111 0.94 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 2.67e-01 -0.134 0.12 0.94 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 3.89e-01 0.0908 0.105 0.94 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 7.61e-01 0.0395 0.13 0.94 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 1.84e-02 -0.192 0.081 0.94 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 9.68e-01 0.00357 0.0881 0.94 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0578 0.133 0.94 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0359 0.109 0.94 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 9.66e-01 0.00623 0.144 0.94 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 2.09e-01 -0.192 0.153 0.941 DC L1
ENSG00000084110 HAL 763681 sc-eQTL 3.32e-01 -0.169 0.174 0.941 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 1.42e-01 0.209 0.142 0.941 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 6.88e-01 0.0703 0.175 0.941 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 8.04e-01 -0.036 0.145 0.941 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 7.28e-01 0.0649 0.187 0.941 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 734723 sc-eQTL 1.16e-01 -0.264 0.167 0.941 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 2.35e-01 0.147 0.124 0.94 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 763681 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00389 0.156 0.94 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 8.71e-01 0.0286 0.176 0.94 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 3.94e-01 0.101 0.118 0.94 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0389 0.112 0.94 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 8.80e-01 -0.026 0.171 0.94 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 734723 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0396 0.166 0.94 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0193 0.0924 0.94 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0246 0.157 0.94 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 4.93e-01 0.102 0.149 0.94 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 6.92e-01 0.0489 0.123 0.94 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 3.14e-01 -0.157 0.156 0.94 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 1.28e-01 0.119 0.078 0.94 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 968894 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0763 0.145 0.94 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 1.69e-02 -0.389 0.162 0.94 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0525 0.128 0.94 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 7.32e-01 0.0407 0.119 0.94 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0341 0.181 0.94 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 270475 sc-eQTL 3.02e-01 -0.193 0.187 0.94 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 3.06e-01 0.177 0.173 0.936 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 6.03e-01 -0.102 0.196 0.936 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 9.64e-01 0.00945 0.208 0.936 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 3.92e-01 -0.168 0.195 0.936 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 4.47e-01 0.156 0.204 0.936 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0371 0.152 0.94 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 1.83e-01 -0.195 0.146 0.94 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 9.85e-01 0.00305 0.166 0.94 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 6.58e-01 0.073 0.165 0.94 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 3.66e-01 0.175 0.193 0.94 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 3.78e-01 -0.13 0.148 0.94 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 1.60e-01 0.24 0.17 0.94 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 8.46e-02 0.289 0.167 0.94 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 3.62e-01 -0.162 0.177 0.94 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 8.71e-01 -0.032 0.197 0.94 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0188 0.12 0.94 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 9.89e-01 -0.0018 0.126 0.94 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 4.52e-01 0.112 0.148 0.94 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 4.90e-01 0.1 0.144 0.94 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 1.95e-01 0.24 0.185 0.94 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 4.75e-02 0.301 0.151 0.94 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 4.16e-01 0.118 0.144 0.94 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 8.72e-01 0.0276 0.17 0.94 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 3.09e-01 0.172 0.169 0.94 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 1.14e-01 0.317 0.2 0.94 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 3.21e-01 0.142 0.142 0.939 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 1.32e-01 -0.302 0.2 0.939 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 9.28e-01 0.0183 0.204 0.939 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 6.36e-01 0.084 0.177 0.939 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 3.41e-01 0.195 0.204 0.939 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 6.87e-01 0.0358 0.0887 0.94 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0469 0.128 0.94 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 3.79e-01 -0.113 0.128 0.94 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 4.99e-01 0.0771 0.114 0.94 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 9.39e-01 0.0107 0.14 0.94 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 7.11e-01 -0.032 0.0863 0.94 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00585 0.146 0.94 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 1.63e-01 -0.201 0.143 0.94 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 4.99e-02 0.231 0.117 0.94 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 3.41e-01 -0.154 0.161 0.94 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 8.16e-01 0.0246 0.105 0.94 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 6.07e-01 0.0839 0.163 0.94 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 8.25e-01 0.0335 0.151 0.94 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 2.89e-02 -0.345 0.157 0.94 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00568 0.188 0.94 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0766 0.101 0.94 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 5.58e-01 0.108 0.183 0.94 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 4.48e-01 0.127 0.167 0.94 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 2.40e-02 -0.345 0.152 0.94 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 2.12e-01 0.215 0.172 0.94 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 3.63e-01 -0.112 0.123 0.94 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 3.63e-01 0.135 0.148 0.94 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0992 0.156 0.94 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 6.06e-01 0.0726 0.141 0.94 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0645 0.168 0.94 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00312 0.136 0.94 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 2.36e-01 0.237 0.199 0.94 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 6.70e-01 0.0724 0.169 0.94 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 5.18e-01 -0.126 0.195 0.94 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 2.34e-01 -0.227 0.19 0.94 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0899 0.167 0.943 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 4.50e-01 -0.155 0.205 0.943 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 3.92e-01 -0.173 0.201 0.943 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0755 0.187 0.943 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 9.15e-01 0.0218 0.203 0.943 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 2.44e-01 0.13 0.111 0.939 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 968894 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0829 0.15 0.939 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 3.98e-02 -0.353 0.171 0.939 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 9.55e-01 0.00813 0.145 0.939 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 4.98e-01 -0.114 0.167 0.939 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 2.13e-01 -0.234 0.187 0.939 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 270475 sc-eQTL 1.71e-01 -0.255 0.186 0.939 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 6.96e-01 0.0452 0.115 0.94 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0687 0.171 0.94 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 6.12e-01 0.0921 0.181 0.94 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 2.68e-01 -0.21 0.189 0.94 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 4.56e-01 -0.143 0.191 0.94 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 4.42e-01 0.0769 0.0998 0.94 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 9.89e-01 0.00251 0.18 0.94 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 6.77e-01 0.0667 0.16 0.94 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0726 0.152 0.94 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0166 0.175 0.94 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 9.06e-02 -0.268 0.158 0.941 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 6.40e-02 -0.385 0.207 0.941 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 5.18e-01 0.125 0.193 0.941 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 9.16e-03 0.521 0.198 0.941 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 7.10e-01 0.071 0.191 0.941 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 3.98e-01 0.0922 0.109 0.94 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 5.79e-01 -0.102 0.184 0.94 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 4.93e-01 0.121 0.176 0.94 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 7.03e-01 0.057 0.149 0.94 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 1.61e-01 -0.258 0.184 0.94 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 1.05e-01 0.312 0.191 0.93 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 1.80e-02 -0.398 0.166 0.93 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 8.82e-01 0.0325 0.218 0.93 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 1.11e-01 -0.337 0.21 0.93 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 3.18e-01 0.252 0.252 0.93 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 9.53e-03 0.312 0.119 0.939 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 968894 sc-eQTL 7.23e-01 0.0484 0.136 0.939 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 3.42e-02 -0.338 0.158 0.939 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 5.45e-01 -0.117 0.193 0.939 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 5.02e-01 -0.082 0.122 0.939 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 1.52e-01 0.254 0.176 0.939 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 270475 sc-eQTL 2.50e-01 0.165 0.143 0.939 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0239 0.134 0.94 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 9.66e-01 0.00727 0.17 0.94 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 1.32e-01 -0.232 0.153 0.94 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 7.63e-01 0.0537 0.178 0.94 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 8.01e-02 0.347 0.197 0.94 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 4.72e-01 -0.118 0.163 0.939 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 763681 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0744 0.17 0.939 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 4.09e-02 0.297 0.144 0.939 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 5.22e-01 -0.123 0.192 0.939 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 5.62e-01 0.0934 0.161 0.939 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 9.40e-01 0.0148 0.196 0.939 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 734723 sc-eQTL 3.36e-01 -0.159 0.165 0.939 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 8.97e-02 0.243 0.142 0.94 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 763681 sc-eQTL 8.24e-02 0.271 0.155 0.94 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 9.61e-01 0.00819 0.169 0.94 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 7.53e-01 0.041 0.13 0.94 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0346 0.134 0.94 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 9.08e-01 0.0213 0.185 0.94 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 734723 sc-eQTL 9.49e-01 0.0111 0.173 0.94 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 2.80e-01 0.174 0.161 0.94 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 763681 sc-eQTL 2.57e-01 -0.205 0.18 0.94 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 4.39e-01 0.14 0.18 0.94 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 6.34e-01 0.0702 0.147 0.94 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 4.17e-02 0.295 0.144 0.94 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 2.01e-01 -0.251 0.196 0.94 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 734723 sc-eQTL 7.21e-01 0.0661 0.185 0.94 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 9.96e-01 0.000811 0.159 0.939 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 968894 sc-eQTL 9.44e-01 0.0129 0.183 0.939 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 3.82e-02 -0.491 0.235 0.939 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 1.78e-01 0.296 0.219 0.939 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 4.07e-01 0.176 0.212 0.939 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 9.36e-01 -0.019 0.235 0.939 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 270475 sc-eQTL 9.68e-01 0.00836 0.206 0.939 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 4.69e-02 -0.36 0.18 0.938 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 763681 sc-eQTL 3.11e-02 -0.395 0.182 0.938 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0115 0.189 0.938 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 4.35e-01 0.131 0.168 0.938 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 2.07e-01 -0.227 0.179 0.938 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 9.40e-01 0.014 0.187 0.938 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 734723 sc-eQTL 6.03e-01 0.0977 0.188 0.938 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 7.09e-01 0.0535 0.143 0.937 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 763681 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0502 0.16 0.937 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0342 0.178 0.937 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 7.53e-01 0.0483 0.153 0.937 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 3.19e-03 -0.457 0.153 0.937 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0326 0.166 0.937 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 734723 sc-eQTL 4.97e-01 -0.129 0.189 0.937 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 5.04e-01 -0.119 0.178 0.935 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 763681 sc-eQTL 9.12e-01 0.0167 0.151 0.935 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00332 0.169 0.935 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0291 0.207 0.935 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 5.73e-01 -0.102 0.18 0.935 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 1.95e-01 0.258 0.198 0.935 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 734723 sc-eQTL 2.68e-01 -0.189 0.17 0.935 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0471 0.127 0.94 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0174 0.132 0.94 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 3.32e-01 0.146 0.15 0.94 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 9.06e-01 0.0172 0.146 0.94 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 4.97e-01 0.13 0.191 0.94 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 4.59e-01 0.0795 0.107 0.94 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 9.12e-01 0.0133 0.12 0.94 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 7.32e-01 0.047 0.137 0.94 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 3.70e-01 0.124 0.138 0.94 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 7.73e-02 0.322 0.181 0.94 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 7.82e-02 0.227 0.128 0.94 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 763681 sc-eQTL 7.30e-01 0.0541 0.156 0.94 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 7.15e-01 0.0628 0.172 0.94 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 5.89e-01 0.0671 0.124 0.94 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 5.27e-01 0.0758 0.12 0.94 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 4.91e-01 -0.129 0.188 0.94 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 734723 sc-eQTL 8.61e-01 0.0304 0.174 0.94 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0889 0.132 0.94 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 763681 sc-eQTL 3.89e-01 -0.135 0.156 0.94 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 9.79e-01 0.00456 0.173 0.94 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 6.59e-01 0.0566 0.128 0.94 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 1.44e-02 -0.321 0.13 0.94 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 8.74e-01 0.0269 0.169 0.94 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 734723 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0367 0.179 0.94 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 359566 sc-eQTL 5.65e-01 0.0543 0.0942 0.94 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 716526 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0564 0.164 0.94 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 565671 sc-eQTL 3.30e-01 0.146 0.15 0.94 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 901118 sc-eQTL 2.93e-01 0.135 0.128 0.94 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 sc-eQTL 3.33e-01 -0.155 0.16 0.94 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 eQTL 0.00886 0.119 0.0454 0.0 0.0 0.0653

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139344 \N 816715 2.74e-07 1.35e-07 7e-08 2.27e-07 9.82e-08 8.85e-08 1.67e-07 5.85e-08 1.5e-07 6.75e-08 1.73e-07 1.31e-07 1.69e-07 7.37e-08 5.94e-08 7.89e-08 4.18e-08 1.56e-07 7.18e-08 5.61e-08 1.24e-07 1.26e-07 1.44e-07 2.87e-08 1.65e-07 1.23e-07 1.17e-07 1.12e-07 1.22e-07 1.07e-07 1.06e-07 5.08e-08 4.16e-08 1.03e-07 7.55e-08 3.43e-08 5.62e-08 7.75e-08 6.28e-08 7.78e-08 2.78e-08 1.46e-07 3.25e-08 1.7e-08 3.71e-08 6.53e-09 7.92e-08 2.85e-09 4.66e-08
ENSG00000139350 NEDD1 -147177 5.66e-06 9.28e-06 2.27e-06 6.2e-06 2.41e-06 4.71e-06 9.75e-06 2.18e-06 9.21e-06 5.52e-06 1.12e-05 5.88e-06 1.17e-05 3.86e-06 2.83e-06 6.73e-06 3.75e-06 7.08e-06 2.69e-06 3.04e-06 6.52e-06 8.16e-06 6.78e-06 3.29e-06 1.25e-05 3.77e-06 5.53e-06 5.24e-06 8.51e-06 6.66e-06 5.24e-06 1.27e-06 1.28e-06 3.44e-06 5.03e-06 2.77e-06 1.79e-06 2.48e-06 1.99e-06 1.89e-06 1.64e-06 9.19e-06 1.45e-06 3.33e-07 1.85e-06 2.01e-06 2.48e-06 1.4e-06 8.91e-07