logo

Genes within 1Mb (chr12:96752993:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 3.36e-03 -0.189 0.0636 0.132 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0531 0.0806 0.132 B L1
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0465 0.0858 0.132 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0839 0.0778 0.132 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 3.82e-01 0.0996 0.114 0.132 B L1
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0614 0.0538 0.132 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00217 0.0741 0.132 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 8.29e-01 0.0174 0.0802 0.132 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 8.76e-01 -0.011 0.0701 0.132 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 1.29e-07 0.442 0.0808 0.132 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 3.17e-02 -0.118 0.0544 0.132 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 1.03e-01 0.0961 0.0586 0.132 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 1.18e-01 0.139 0.0883 0.132 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 8.79e-01 -0.011 0.0728 0.132 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 6.92e-02 0.175 0.096 0.132 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 5.01e-02 -0.198 0.101 0.137 DC L1
ENSG00000084110 HAL 756628 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0843 0.115 0.137 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 6.36e-03 -0.256 0.0927 0.137 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 8.67e-01 0.0194 0.116 0.137 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0842 0.0961 0.137 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 8.61e-02 0.212 0.123 0.137 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 727670 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0911 0.111 0.137 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 4.64e-01 0.0608 0.0829 0.132 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 756628 sc-eQTL 2.28e-01 -0.126 0.104 0.132 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 6.59e-02 -0.216 0.117 0.132 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 2.05e-01 0.1 0.079 0.132 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 4.28e-01 0.0593 0.0746 0.132 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 2.87e-01 -0.122 0.114 0.132 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 727670 sc-eQTL 9.65e-02 -0.184 0.11 0.132 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 1.15e-01 -0.0968 0.0611 0.131 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 6.34e-02 0.193 0.104 0.131 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 6.47e-01 0.0454 0.099 0.131 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 1.00e-01 -0.135 0.0816 0.131 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 1.49e-01 -0.15 0.103 0.131 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0181 0.0517 0.132 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 961841 sc-eQTL 1.25e-01 -0.146 0.0951 0.132 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 2.61e-01 0.121 0.108 0.132 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 2.23e-01 0.103 0.084 0.132 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0952 0.0781 0.132 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 7.59e-01 0.0367 0.119 0.132 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 263422 sc-eQTL 9.47e-02 0.206 0.123 0.132 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 6.16e-01 0.0603 0.12 0.14 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0997 0.136 0.14 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 9.94e-01 0.00109 0.144 0.14 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00344 0.136 0.14 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00139 0.142 0.14 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 1.39e-02 -0.244 0.0984 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 8.99e-02 -0.164 0.0961 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 6.75e-01 0.0458 0.109 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 1.97e-01 -0.14 0.108 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 2.21e-01 -0.155 0.127 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 1.50e-01 -0.138 0.0953 0.134 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 1.70e-01 -0.152 0.11 0.134 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 5.55e-01 0.0643 0.109 0.134 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 3.06e-01 -0.118 0.115 0.134 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0864 0.127 0.134 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 7.75e-03 -0.212 0.0789 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 2.27e-01 -0.102 0.0837 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 1.94e-02 -0.231 0.0981 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0377 0.0966 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 6.46e-02 0.228 0.123 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0578 0.103 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0709 0.0972 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 8.14e-01 -0.027 0.115 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0226 0.114 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 7.67e-01 0.0401 0.135 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0781 0.0958 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 2.02e-01 0.172 0.135 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00283 0.137 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0393 0.119 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 7.25e-01 0.0484 0.138 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 1.76e-01 -0.0804 0.0592 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 8.95e-01 0.0114 0.086 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 7.54e-01 0.027 0.086 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 9.59e-01 0.00393 0.0764 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 2.76e-05 0.387 0.0903 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0163 0.0585 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 1.14e-01 0.157 0.0987 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 1.95e-01 0.126 0.0973 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 8.16e-01 0.0187 0.0801 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 1.54e-01 0.156 0.109 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 5.09e-02 -0.137 0.07 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 3.20e-01 -0.108 0.109 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00383 0.101 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0281 0.106 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 8.91e-04 0.413 0.122 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 4.62e-02 -0.135 0.0673 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 1.28e-02 0.304 0.121 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 3.32e-03 0.325 0.109 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 2.75e-01 -0.112 0.102 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 2.34e-01 0.137 0.115 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 6.10e-02 -0.156 0.083 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 7.27e-02 0.179 0.0995 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 1.50e-01 0.153 0.105 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 9.82e-02 -0.157 0.0947 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 4.59e-02 0.226 0.112 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 9.15e-02 -0.152 0.0899 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 3.60e-01 -0.122 0.133 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 8.79e-01 0.0171 0.113 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 4.48e-01 0.0985 0.13 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0547 0.127 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 2.11e-01 -0.138 0.11 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0336 0.135 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 4.71e-01 0.0957 0.132 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 4.86e-01 0.0858 0.123 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 4.20e-01 0.108 0.133 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 4.87e-01 0.0523 0.0752 0.132 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 961841 sc-eQTL 2.90e-02 -0.221 0.1 0.132 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 4.21e-01 0.0936 0.116 0.132 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 8.69e-01 0.0162 0.0976 0.132 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 3.16e-01 -0.113 0.113 0.132 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 3.89e-01 0.109 0.127 0.132 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 263422 sc-eQTL 9.80e-01 0.00312 0.126 0.132 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 6.52e-02 -0.14 0.0757 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 2.64e-01 0.126 0.113 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0117 0.12 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 1.37e-03 -0.397 0.122 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 8.62e-02 -0.216 0.126 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0496 0.0665 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 3.49e-01 0.113 0.12 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0408 0.107 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0717 0.101 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0934 0.117 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 8.91e-01 0.014 0.102 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 4.08e-01 0.111 0.134 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 4.91e-01 -0.086 0.124 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 1.31e-01 -0.196 0.129 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0834 0.123 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 1.77e-01 -0.0967 0.0714 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 4.95e-02 0.237 0.12 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 9.61e-02 0.193 0.115 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 1.70e-01 -0.135 0.0979 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 2.33e-01 -0.145 0.121 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 2.44e-01 0.15 0.128 0.133 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0544 0.114 0.133 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 7.79e-01 -0.041 0.146 0.133 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 6.43e-02 -0.262 0.14 0.133 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 6.89e-01 0.0678 0.169 0.133 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 2.56e-01 0.0917 0.0805 0.135 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 961841 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00189 0.0907 0.135 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 7.20e-01 0.0383 0.107 0.135 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 5.12e-02 0.251 0.128 0.135 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0911 0.0811 0.135 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 9.64e-01 0.00533 0.118 0.135 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 263422 sc-eQTL 2.42e-01 0.112 0.0953 0.135 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 2.97e-01 0.0924 0.0884 0.132 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 4.59e-01 0.0831 0.112 0.132 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 1.54e-01 -0.145 0.101 0.132 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0517 0.118 0.132 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 5.15e-02 0.255 0.13 0.132 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 1.39e-01 -0.159 0.107 0.146 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 756628 sc-eQTL 8.34e-01 0.0236 0.112 0.146 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 2.75e-02 -0.211 0.0949 0.146 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 6.00e-01 0.0666 0.127 0.146 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0216 0.106 0.146 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 3.64e-01 0.118 0.129 0.146 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 727670 sc-eQTL 7.72e-02 -0.192 0.108 0.146 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 2.90e-01 0.101 0.0956 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 756628 sc-eQTL 2.64e-01 -0.117 0.104 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 4.90e-02 -0.222 0.112 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 1.08e-01 0.139 0.0865 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 7.76e-01 0.0256 0.0897 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 8.81e-01 0.0185 0.124 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 727670 sc-eQTL 5.08e-02 -0.225 0.114 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 8.71e-01 0.0173 0.107 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 756628 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0518 0.12 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 1.72e-01 -0.164 0.119 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 4.50e-01 0.0739 0.0976 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 9.67e-01 0.00404 0.0966 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 1.70e-01 -0.179 0.13 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 727670 sc-eQTL 6.90e-02 -0.223 0.122 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0196 0.105 0.133 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 961841 sc-eQTL 4.65e-02 -0.238 0.119 0.133 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 3.69e-01 0.141 0.156 0.133 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 3.08e-01 0.148 0.145 0.133 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 1.32e-01 -0.21 0.139 0.133 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00345 0.155 0.133 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 263422 sc-eQTL 9.78e-01 -0.0037 0.136 0.133 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 6.08e-01 0.0627 0.122 0.136 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 756628 sc-eQTL 1.67e-01 -0.171 0.123 0.136 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 2.86e-01 -0.135 0.126 0.136 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 8.69e-01 0.0187 0.113 0.136 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 9.81e-02 -0.199 0.12 0.136 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 6.28e-01 0.0608 0.125 0.136 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 727670 sc-eQTL 2.24e-01 -0.153 0.126 0.136 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 9.31e-01 0.00828 0.0957 0.138 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 756628 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0777 0.107 0.138 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 4.40e-01 -0.092 0.119 0.138 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 5.73e-01 0.0577 0.102 0.138 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 3.61e-01 0.0955 0.104 0.138 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 2.58e-01 -0.126 0.111 0.138 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 727670 sc-eQTL 1.87e-01 -0.167 0.126 0.138 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 2.64e-01 -0.139 0.124 0.15 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 756628 sc-eQTL 9.70e-01 0.00399 0.105 0.15 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 1.13e-02 -0.296 0.116 0.15 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 1.88e-01 -0.19 0.144 0.15 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 2.06e-01 -0.159 0.125 0.15 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 2.96e-01 0.145 0.138 0.15 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 727670 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0817 0.119 0.15 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 4.15e-03 -0.238 0.0822 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 8.48e-02 -0.15 0.0865 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 2.23e-01 0.121 0.0992 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 2.86e-02 -0.21 0.0954 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0489 0.126 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 1.14e-02 -0.181 0.0707 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 1.93e-01 -0.105 0.0803 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 5.22e-02 -0.178 0.091 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00347 0.0924 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 1.96e-01 0.158 0.122 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 4.72e-01 0.0621 0.0862 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 756628 sc-eQTL 2.77e-01 -0.114 0.104 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 8.74e-02 -0.196 0.114 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 1.64e-01 0.115 0.0826 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 4.16e-01 0.0651 0.0799 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0844 0.125 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 727670 sc-eQTL 9.59e-02 -0.193 0.116 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 5.16e-01 0.0578 0.0889 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 756628 sc-eQTL 1.28e-01 -0.16 0.105 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 1.21e-01 -0.18 0.116 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 8.66e-01 0.0146 0.0863 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 8.73e-01 0.0143 0.089 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0734 0.114 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 727670 sc-eQTL 4.61e-01 -0.089 0.121 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 352513 sc-eQTL 1.08e-01 -0.1 0.062 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 709473 sc-eQTL 4.33e-02 0.219 0.107 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 558618 sc-eQTL 7.20e-01 0.0356 0.0993 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 894065 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0932 0.0848 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 sc-eQTL 1.91e-01 -0.138 0.106 0.131 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -154230 eQTL 0.0366 -0.0724 0.0346 0.0011 0.0 0.125

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina