logo

Genes within 1Mb (chr12:96750416:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 6.50e-02 0.103 0.0557 0.203 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0463 0.0697 0.203 B L1
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 3.88e-01 0.0641 0.0742 0.203 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 2.38e-01 0.0797 0.0673 0.203 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 1.17e-01 0.154 0.0979 0.203 B L1
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 4.02e-01 0.0389 0.0464 0.203 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 4.67e-01 0.0464 0.0637 0.203 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 8.34e-01 0.0145 0.0691 0.203 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 6.78e-02 0.11 0.0599 0.203 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 1.10e-02 -0.188 0.0732 0.203 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 5.46e-02 0.0901 0.0466 0.203 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0618 0.0503 0.203 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 9.38e-01 0.00594 0.076 0.203 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0325 0.0622 0.203 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0264 0.0828 0.203 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 1.63e-01 0.129 0.0922 0.203 DC L1
ENSG00000084110 HAL 754051 sc-eQTL 2.29e-01 0.127 0.105 0.203 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 5.63e-01 0.05 0.0862 0.203 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 4.33e-01 0.0829 0.105 0.203 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0306 0.0878 0.203 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 5.25e-01 0.0718 0.113 0.203 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 725093 sc-eQTL 1.42e-01 0.149 0.101 0.203 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 9.01e-01 0.00893 0.0714 0.203 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 754051 sc-eQTL 2.10e-01 0.113 0.0896 0.203 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0281 0.102 0.203 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 9.51e-01 0.0042 0.0682 0.203 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 5.90e-01 0.0347 0.0642 0.203 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 9.47e-04 0.322 0.0962 0.203 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 725093 sc-eQTL 1.36e-01 -0.142 0.0952 0.203 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0412 0.0535 0.204 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 8.05e-01 0.0225 0.091 0.204 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00823 0.0863 0.204 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 3.53e-01 0.0665 0.0714 0.204 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 3.83e-01 0.079 0.0904 0.204 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 7.71e-01 -0.013 0.0447 0.203 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 959264 sc-eQTL 1.31e-01 0.125 0.0823 0.203 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 5.20e-01 0.0602 0.0934 0.203 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0268 0.0729 0.203 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 6.98e-01 0.0263 0.0678 0.203 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 7.67e-01 0.0305 0.103 0.203 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 260845 sc-eQTL 1.21e-01 -0.165 0.106 0.203 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 6.05e-01 0.0524 0.101 0.204 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00889 0.114 0.204 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 9.88e-01 0.00181 0.121 0.204 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0858 0.114 0.204 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 3.61e-01 0.109 0.119 0.204 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 1.46e-01 0.129 0.0883 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 9.62e-01 0.00413 0.0859 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 4.53e-01 0.0727 0.0968 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 4.15e-01 0.0787 0.0963 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 2.33e-01 0.135 0.113 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 1.54e-01 0.124 0.0866 0.198 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 5.63e-03 0.276 0.0986 0.198 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0468 0.0987 0.198 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 2.04e-01 0.133 0.104 0.198 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 1.44e-01 -0.169 0.115 0.198 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 2.10e-01 0.0884 0.0703 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 8.93e-01 0.00999 0.0739 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 1.67e-01 0.12 0.087 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0505 0.0849 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 9.51e-01 0.00674 0.109 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0458 0.0899 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 9.92e-01 0.000903 0.0852 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 4.04e-01 0.0839 0.1 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0221 0.0998 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 1.04e-01 0.192 0.118 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 1.63e-01 0.114 0.0813 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 7.58e-01 0.0355 0.115 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0188 0.117 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0194 0.101 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 3.05e-01 0.12 0.117 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 5.39e-01 0.0313 0.0509 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 2.93e-01 0.0774 0.0735 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 8.48e-01 0.0142 0.0737 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 1.41e-01 0.0962 0.0652 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 1.88e-01 -0.106 0.0803 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 3.69e-01 0.0442 0.0491 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0396 0.0835 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0929 0.0819 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 2.54e-02 0.15 0.0666 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 1.22e-01 -0.142 0.0916 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 8.80e-01 0.00921 0.0607 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0836 0.0935 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0247 0.087 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 3.29e-01 0.089 0.091 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0734 0.108 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 5.18e-01 0.0382 0.059 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 2.64e-01 -0.119 0.106 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 2.93e-02 -0.211 0.096 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 7.12e-01 -0.033 0.0892 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 3.71e-01 0.0896 0.0999 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 4.18e-02 0.144 0.0701 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 1.94e-01 -0.11 0.0845 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 3.89e-01 0.0773 0.0896 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0392 0.0806 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 2.82e-01 -0.103 0.0958 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 9.91e-01 0.000819 0.0758 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 2.70e-01 0.123 0.111 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 4.53e-01 0.0709 0.0942 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0716 0.109 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 4.42e-01 0.0818 0.106 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 2.49e-02 0.214 0.0947 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 9.45e-01 0.00816 0.118 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 2.33e-01 -0.138 0.115 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 3.39e-01 -0.103 0.107 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0526 0.116 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 6.30e-01 0.0309 0.0639 0.203 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 959264 sc-eQTL 6.40e-02 0.159 0.0854 0.203 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 9.24e-01 0.00945 0.0987 0.203 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 5.77e-01 0.0463 0.0828 0.203 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 1.76e-01 0.13 0.0956 0.203 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0524 0.108 0.203 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 260845 sc-eQTL 7.87e-01 0.0289 0.107 0.203 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0835 0.0696 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 1.12e-01 -0.164 0.103 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 9.22e-01 0.0107 0.11 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 4.13e-01 -0.094 0.114 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 6.13e-01 0.0585 0.116 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0621 0.0579 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 4.18e-01 0.085 0.105 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 8.41e-01 0.0187 0.0928 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 2.89e-01 0.0937 0.0881 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 1.45e-01 0.148 0.101 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0958 0.0916 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 5.32e-01 0.0753 0.12 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 3.58e-01 -0.103 0.112 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 8.86e-01 0.0168 0.116 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 4.88e-02 0.216 0.109 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 9.51e-01 0.0039 0.0633 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 2.41e-01 -0.125 0.107 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0129 0.102 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 8.63e-01 0.015 0.0867 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 2.23e-01 -0.131 0.107 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 1.10e-01 0.199 0.124 0.193 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0128 0.11 0.193 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0312 0.142 0.193 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 4.74e-01 0.099 0.138 0.193 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0111 0.164 0.193 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 6.12e-01 0.0353 0.0694 0.204 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 959264 sc-eQTL 2.47e-01 0.0903 0.0777 0.204 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0193 0.0917 0.204 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0783 0.111 0.204 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 9.86e-01 0.00124 0.07 0.204 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0664 0.102 0.204 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 260845 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0198 0.0822 0.204 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0246 0.0765 0.203 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 6.07e-01 0.0499 0.0968 0.203 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 6.22e-01 0.0433 0.0877 0.203 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0531 0.102 0.203 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 1.53e-02 -0.273 0.112 0.203 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 5.34e-01 0.0605 0.0971 0.198 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 754051 sc-eQTL 5.61e-01 0.0588 0.101 0.198 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0476 0.0865 0.198 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 9.30e-01 0.01 0.114 0.198 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0372 0.0956 0.198 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 3.79e-01 0.102 0.116 0.198 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 725093 sc-eQTL 4.81e-01 0.0694 0.0981 0.198 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 1.64e-01 0.114 0.0818 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 754051 sc-eQTL 3.22e-01 0.0888 0.0895 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0359 0.0968 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 4.11e-01 0.0614 0.0745 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 5.68e-01 0.044 0.0769 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 8.61e-04 0.349 0.103 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 725093 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0986 0.0987 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 4.13e-01 0.0762 0.093 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 754051 sc-eQTL 8.47e-01 0.0202 0.104 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00552 0.104 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0458 0.085 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 7.33e-01 0.0287 0.084 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 3.00e-01 0.118 0.113 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 725093 sc-eQTL 2.29e-01 -0.128 0.106 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 7.97e-01 -0.024 0.0931 0.203 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 959264 sc-eQTL 2.63e-01 0.119 0.106 0.203 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00454 0.139 0.203 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 2.97e-01 -0.134 0.128 0.203 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 6.72e-01 0.0527 0.124 0.203 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0855 0.137 0.203 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 260845 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0875 0.12 0.203 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 7.65e-01 0.0314 0.105 0.202 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 754051 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0972 0.106 0.202 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0603 0.109 0.202 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0365 0.0969 0.202 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 8.23e-03 0.272 0.102 0.202 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 7.96e-02 0.188 0.107 0.202 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 725093 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0463 0.108 0.202 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0979 0.0829 0.206 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 754051 sc-eQTL 2.38e-01 0.11 0.0926 0.206 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 5.15e-01 0.0675 0.103 0.206 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00292 0.0889 0.206 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0618 0.0907 0.206 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 2.65e-01 0.108 0.0962 0.206 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 725093 sc-eQTL 4.98e-01 0.0746 0.11 0.206 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 1.23e-01 0.173 0.111 0.198 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 754051 sc-eQTL 7.42e-01 0.0312 0.0946 0.198 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0499 0.106 0.198 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 1.80e-01 0.174 0.129 0.198 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 7.02e-01 0.0433 0.113 0.198 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 4.24e-01 0.0999 0.125 0.198 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 725093 sc-eQTL 6.27e-01 -0.052 0.107 0.198 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 4.17e-02 0.148 0.0723 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 3.26e-01 0.0745 0.0757 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0109 0.0867 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 6.22e-02 0.156 0.0833 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0624 0.11 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 5.39e-01 0.0391 0.0636 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0442 0.0714 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 4.76e-02 0.161 0.0806 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0176 0.0819 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 2.58e-01 0.123 0.108 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 1.20e-01 0.116 0.0741 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 754051 sc-eQTL 2.37e-01 0.107 0.09 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0497 0.0991 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00436 0.0716 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 7.86e-01 0.0188 0.0691 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 8.38e-03 0.284 0.107 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 725093 sc-eQTL 8.64e-02 -0.172 0.0997 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0438 0.0767 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 754051 sc-eQTL 4.42e-01 0.0698 0.0906 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 7.85e-01 0.0275 0.101 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 6.70e-01 0.0318 0.0744 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 2.29e-01 0.0923 0.0765 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 5.18e-02 0.191 0.0976 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 725093 sc-eQTL 7.20e-01 0.0374 0.104 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 349936 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0144 0.0541 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 706896 sc-eQTL 4.61e-01 0.0694 0.094 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 556041 sc-eQTL 9.36e-01 0.0069 0.0862 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 891488 sc-eQTL 2.33e-01 0.0878 0.0735 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 sc-eQTL 4.61e-01 0.0678 0.0918 0.2 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139343 SNRPF 891488 eQTL 0.0425 -0.0218 0.0107 0.0 0.0 0.196
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 eQTL 7.16e-23 0.277 0.0274 0.0 0.0 0.196
ENSG00000188596 CFAP54 260841 eQTL 2.27e-06 0.113 0.0238 0.001 0.0 0.196

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139350 NEDD1 -156807 3.64e-06 3.17e-06 6.52e-07 1.92e-06 8.63e-07 7.64e-07 2.53e-06 9.93e-07 2.51e-06 1.46e-06 3.2e-06 2.05e-06 4.84e-06 1.35e-06 9.63e-07 2.03e-06 1.56e-06 2.12e-06 1.42e-06 9.54e-07 1.81e-06 3.4e-06 3.36e-06 1.9e-06 4.09e-06 1.14e-06 1.74e-06 1.69e-06 3.55e-06 2.95e-06 1.99e-06 5.25e-07 7.53e-07 1.68e-06 1.86e-06 9.24e-07 9.24e-07 4.53e-07 1.32e-06 3.64e-07 4.03e-07 4.04e-06 5.11e-07 1.96e-07 4.29e-07 3.52e-07 7.1e-07 2.26e-07 3.03e-07
ENSG00000188596 CFAP54 260841 1.27e-06 1.08e-06 2.66e-07 1.14e-06 3.73e-07 6.06e-07 1.54e-06 4.18e-07 1.57e-06 6.05e-07 1.84e-06 8.93e-07 2.47e-06 2.77e-07 5.03e-07 9.51e-07 9.36e-07 9.1e-07 7.08e-07 4.38e-07 7.6e-07 1.89e-06 1.04e-06 5.94e-07 2.17e-06 7.81e-07 9.89e-07 9.43e-07 1.63e-06 1.16e-06 7.58e-07 2.78e-07 2.79e-07 5.73e-07 5.66e-07 5.32e-07 6.89e-07 3.07e-07 4.58e-07 2.8e-07 2.59e-07 1.58e-06 2.9e-07 6.46e-08 3e-07 2.31e-07 2.79e-07 1.44e-07 2.57e-07