logo

Genes within 1Mb (chr12:96739507:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 8.11e-02 0.076 0.0433 0.534 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 1.23e-01 0.0835 0.0539 0.534 B L1
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 2.96e-01 0.0603 0.0576 0.534 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 2.79e-01 0.0568 0.0523 0.534 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0514 0.0765 0.534 B L1
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0113 0.036 0.534 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 8.04e-01 0.0123 0.0494 0.534 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0235 0.0535 0.534 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0291 0.0468 0.534 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 1.46e-01 -0.0836 0.0574 0.534 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0401 0.0369 0.534 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0151 0.0397 0.534 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 1.80e-01 -0.08 0.0595 0.534 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 7.28e-01 0.017 0.0489 0.534 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0426 0.065 0.534 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0569 0.0692 0.532 DC L1
ENSG00000084110 HAL 743142 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0555 0.0788 0.532 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 4.09e-02 0.131 0.0639 0.532 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 9.92e-01 0.000797 0.079 0.532 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 7.32e-01 0.0225 0.0657 0.532 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 1.06e-01 -0.136 0.0838 0.532 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 714184 sc-eQTL 1.32e-01 -0.115 0.0758 0.532 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 5.46e-01 -0.034 0.0561 0.534 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 743142 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0113 0.0708 0.534 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 1.07e-01 0.129 0.0794 0.534 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0376 0.0536 0.534 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0478 0.0505 0.534 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 3.56e-02 -0.163 0.0769 0.534 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 714184 sc-eQTL 3.25e-02 0.16 0.0745 0.534 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 2.52e-01 0.048 0.0418 0.536 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0797 0.0709 0.536 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 7.42e-01 0.0223 0.0674 0.536 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 4.65e-01 0.0409 0.0559 0.536 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 7.99e-01 0.0181 0.0708 0.536 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 3.68e-01 0.0313 0.0348 0.534 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 948355 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0688 0.0642 0.534 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 9.92e-02 -0.12 0.0723 0.534 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0377 0.0568 0.534 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 8.47e-01 0.0102 0.0528 0.534 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 2.00e-01 -0.103 0.0801 0.534 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 249936 sc-eQTL 5.65e-01 0.0479 0.0832 0.534 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 8.96e-01 0.0107 0.0816 0.526 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 3.30e-01 0.09 0.0921 0.526 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 5.52e-01 0.0582 0.0977 0.526 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 6.87e-01 0.0372 0.0921 0.526 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0976 0.0962 0.526 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 2.70e-01 0.0754 0.0682 0.534 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 2.22e-01 0.0809 0.066 0.534 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0476 0.0746 0.534 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 4.37e-01 0.0578 0.0743 0.534 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 3.75e-01 0.0774 0.087 0.534 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0169 0.0665 0.537 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00576 0.0768 0.537 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 3.34e-01 0.0729 0.0753 0.537 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0755 0.0798 0.537 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 2.41e-01 0.104 0.0882 0.537 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 2.14e-01 0.0681 0.0547 0.534 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 4.81e-01 0.0405 0.0575 0.534 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 3.06e-01 0.0697 0.0678 0.534 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 2.07e-01 0.0834 0.0659 0.534 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0462 0.0848 0.534 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 9.25e-02 0.117 0.0695 0.534 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 2.41e-01 0.0777 0.0661 0.534 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 5.57e-01 0.0459 0.0781 0.534 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 4.18e-01 0.0629 0.0775 0.534 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0792 0.0921 0.534 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 7.94e-01 0.0169 0.0649 0.536 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0322 0.0915 0.536 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0253 0.0926 0.536 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 3.90e-01 0.0693 0.0804 0.536 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0962 0.0929 0.536 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 8.02e-01 0.00997 0.0397 0.534 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 8.78e-01 0.00879 0.0574 0.534 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 4.75e-01 -0.041 0.0573 0.534 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0322 0.0509 0.534 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 1.15e-01 -0.0987 0.0624 0.534 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0249 0.0385 0.534 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0112 0.0654 0.534 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0492 0.0642 0.534 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0285 0.0527 0.534 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0119 0.0721 0.534 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 1.70e-01 0.066 0.0479 0.534 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 4.16e-01 0.0605 0.0742 0.534 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 1.38e-01 0.102 0.0687 0.534 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 1.84e-01 -0.096 0.072 0.534 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 1.05e-01 -0.139 0.0852 0.534 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 9.50e-01 0.00291 0.0466 0.534 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0583 0.0841 0.534 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 5.85e-01 0.0419 0.0766 0.534 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 8.10e-01 -0.017 0.0704 0.534 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0191 0.079 0.534 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 1.19e-01 -0.086 0.055 0.534 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 9.06e-01 0.00785 0.0662 0.534 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 6.36e-02 -0.13 0.0695 0.534 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 1.35e-01 0.094 0.0627 0.534 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0884 0.0748 0.534 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 7.38e-02 0.111 0.0615 0.53 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 1.36e-01 0.136 0.0906 0.53 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 4.61e-01 -0.057 0.077 0.53 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 6.28e-01 0.043 0.0888 0.53 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0632 0.0869 0.53 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0457 0.0752 0.532 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 9.11e-01 0.0103 0.0922 0.532 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 9.25e-01 0.00859 0.0907 0.532 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 8.69e-01 0.0139 0.0843 0.532 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 4.51e-01 -0.069 0.0913 0.532 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 8.06e-01 0.0123 0.05 0.532 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 948355 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0557 0.0673 0.532 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0824 0.0771 0.532 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0361 0.0648 0.532 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0604 0.0751 0.532 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0959 0.0842 0.532 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 249936 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0359 0.0836 0.532 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 3.40e-03 0.155 0.0524 0.538 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 6.31e-01 0.038 0.0791 0.538 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 7.08e-01 0.0315 0.084 0.538 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 2.22e-02 0.2 0.0867 0.538 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0181 0.0887 0.538 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 9.41e-02 0.0751 0.0447 0.539 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0583 0.0811 0.539 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 9.20e-01 0.00723 0.0719 0.539 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0756 0.0682 0.539 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0365 0.0788 0.539 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 5.60e-01 -0.041 0.0702 0.541 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 2.42e-01 -0.108 0.0918 0.541 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 2.79e-02 0.187 0.0845 0.541 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 4.90e-02 0.175 0.0882 0.541 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0451 0.0842 0.541 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 7.68e-01 0.0145 0.0492 0.539 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0655 0.0831 0.539 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0584 0.0796 0.539 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 1.29e-01 0.102 0.0671 0.539 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 1.68e-01 0.115 0.083 0.539 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 1.75e-01 -0.136 0.0997 0.541 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0466 0.0886 0.541 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 2.39e-02 0.254 0.111 0.541 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 4.27e-01 0.0881 0.111 0.541 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 7.60e-01 0.0403 0.132 0.541 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000198 0.0545 0.528 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 948355 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0702 0.061 0.528 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0143 0.072 0.528 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 2.85e-01 -0.093 0.0868 0.528 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 6.33e-01 0.0263 0.0549 0.528 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 7.36e-01 0.0269 0.0797 0.528 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 249936 sc-eQTL 4.44e-01 0.0494 0.0644 0.528 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0695 0.0598 0.534 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0486 0.076 0.534 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0623 0.0688 0.534 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 4.28e-01 0.0633 0.0797 0.534 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 6.93e-01 0.0352 0.089 0.534 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0155 0.076 0.532 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 743142 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0486 0.079 0.532 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 2.57e-03 0.202 0.0661 0.532 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 9.25e-01 0.00843 0.0894 0.532 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 7.07e-01 0.0282 0.0748 0.532 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0964 0.0909 0.532 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 714184 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0318 0.0769 0.532 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 1.36e-01 -0.0964 0.0644 0.534 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 743142 sc-eQTL 7.24e-01 0.025 0.0706 0.534 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 6.08e-02 0.143 0.0757 0.534 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 1.10e-01 -0.0938 0.0584 0.534 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0268 0.0606 0.534 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 4.12e-03 -0.238 0.0819 0.534 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 714184 sc-eQTL 3.75e-02 0.162 0.0772 0.534 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0262 0.0736 0.534 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 743142 sc-eQTL 8.16e-01 0.0192 0.0826 0.534 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 1.84e-01 0.11 0.0822 0.534 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 8.71e-01 0.011 0.0672 0.534 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 4.00e-01 0.056 0.0663 0.534 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0725 0.0895 0.534 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 714184 sc-eQTL 1.40e-02 0.206 0.0832 0.534 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 8.29e-01 0.0158 0.0732 0.53 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 948355 sc-eQTL 6.52e-01 0.0379 0.0839 0.53 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 1.61e-01 -0.153 0.109 0.53 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 6.94e-01 0.04 0.101 0.53 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 4.45e-02 0.195 0.0964 0.53 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0358 0.108 0.53 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 249936 sc-eQTL 6.69e-01 0.0405 0.0946 0.53 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 1.88e-01 -0.109 0.0822 0.531 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 743142 sc-eQTL 8.74e-01 0.0132 0.0835 0.531 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 9.91e-02 0.141 0.0851 0.531 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0222 0.0763 0.531 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0683 0.0814 0.531 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 1.31e-01 -0.128 0.0843 0.531 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 714184 sc-eQTL 6.79e-02 0.155 0.0845 0.531 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 8.95e-01 0.00868 0.066 0.52 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 743142 sc-eQTL 8.29e-01 0.0159 0.0736 0.52 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 8.31e-01 0.0176 0.0821 0.52 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 9.89e-01 0.00102 0.0705 0.52 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 2.77e-02 -0.158 0.0711 0.52 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 7.16e-01 0.0279 0.0764 0.52 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 714184 sc-eQTL 6.44e-01 0.0404 0.0872 0.52 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0827 0.0859 0.523 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 743142 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0251 0.0727 0.523 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 4.10e-02 0.166 0.0803 0.523 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 9.50e-01 0.00627 0.0996 0.523 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 4.79e-01 0.0616 0.0868 0.523 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0741 0.0957 0.523 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 714184 sc-eQTL 6.55e-01 0.0368 0.0822 0.523 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 4.96e-01 0.0389 0.0571 0.534 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 2.01e-01 0.0758 0.0591 0.534 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 9.02e-01 0.0084 0.0678 0.534 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 9.31e-01 0.00567 0.0657 0.534 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 3.69e-01 0.0774 0.086 0.534 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 5.73e-02 0.0936 0.049 0.534 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 1.62e-01 0.0774 0.0552 0.534 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 4.87e-01 0.0439 0.063 0.534 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 3.26e-01 0.0624 0.0634 0.534 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0768 0.0839 0.534 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 1.35e-01 -0.0875 0.0583 0.534 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 743142 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00826 0.0709 0.534 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 6.31e-02 0.144 0.0772 0.534 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0465 0.0562 0.534 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 8.97e-01 -0.00701 0.0543 0.534 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 2.13e-02 -0.195 0.0841 0.534 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 714184 sc-eQTL 1.12e-02 0.199 0.0777 0.534 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0522 0.0605 0.537 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 743142 sc-eQTL 7.60e-01 0.0219 0.0716 0.537 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 2.44e-01 0.0925 0.0791 0.537 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0337 0.0587 0.537 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 3.98e-02 -0.124 0.06 0.537 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0673 0.0775 0.537 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 714184 sc-eQTL 6.74e-01 0.0346 0.0822 0.537 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 339027 sc-eQTL 3.37e-01 0.0406 0.0422 0.539 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 695987 sc-eQTL 8.80e-02 -0.125 0.073 0.539 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 545132 sc-eQTL 6.84e-01 0.0274 0.0672 0.539 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 880579 sc-eQTL 7.71e-01 0.0168 0.0575 0.539 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 sc-eQTL 7.69e-01 0.0211 0.0718 0.539 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 eQTL 0.00212 -0.0711 0.0231 0.0 0.0 0.455
ENSG00000188596 CFAP54 249932 eQTL 0.00159 -0.061 0.0193 0.0 0.0 0.455

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139350 NEDD1 -167716 4.39e-06 5.05e-06 4.51e-07 2.68e-06 6.67e-07 9.88e-07 2.91e-06 7.12e-07 3.13e-06 1.46e-06 4.1e-06 1.48e-06 7.62e-06 1.25e-06 9.35e-07 1.54e-06 1.99e-06 2.03e-06 1.59e-06 1.2e-06 1.41e-06 3.74e-06 3.17e-06 1.17e-06 4.83e-06 1.06e-06 1.47e-06 1.81e-06 3.9e-06 3.06e-06 2.02e-06 4.17e-07 5.88e-07 1.31e-06 1.63e-06 8.6e-07 8.57e-07 4.4e-07 1.31e-06 4.17e-07 3.56e-07 5.76e-06 6.16e-07 1.6e-07 3.52e-07 3.42e-07 5.48e-07 2.25e-07 2.97e-07
ENSG00000188596 CFAP54 249932 1.49e-06 2.43e-06 2.28e-07 1.7e-06 3.58e-07 6.42e-07 1.27e-06 3.75e-07 1.73e-06 6.69e-07 2.02e-06 6.45e-07 3.07e-06 4.11e-07 4.81e-07 8.22e-07 1.11e-06 1.09e-06 7.14e-07 4.51e-07 8.02e-07 1.96e-06 1.19e-06 5.66e-07 2.36e-06 6.9e-07 9.09e-07 8.53e-07 1.63e-06 1.3e-06 7.35e-07 2.45e-07 1.99e-07 5.4e-07 5.3e-07 4.59e-07 7.3e-07 2.39e-07 5.08e-07 2.44e-07 2.45e-07 2.88e-06 1.14e-07 1.99e-07 1.69e-07 2.29e-07 2.36e-07 2.77e-08 1.05e-07