logo

Genes within 1Mb (chr12:96734867:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 1.02e-01 0.0899 0.0547 0.22 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0433 0.0683 0.22 B L1
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 4.57e-01 0.0542 0.0726 0.22 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 2.05e-01 0.0836 0.0658 0.22 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 2.32e-01 0.115 0.0961 0.22 B L1
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 1.87e-01 0.06 0.0453 0.22 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 4.50e-01 0.0473 0.0625 0.22 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 9.77e-01 0.00196 0.0677 0.22 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 6.37e-02 0.109 0.0587 0.22 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 1.48e-02 -0.177 0.0719 0.22 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 2.17e-03 0.141 0.0453 0.22 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 3.66e-01 -0.045 0.0496 0.22 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 8.75e-01 0.0118 0.0749 0.22 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0475 0.0613 0.22 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0508 0.0815 0.22 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 8.87e-02 0.156 0.091 0.221 DC L1
ENSG00000084110 HAL 738502 sc-eQTL 3.93e-01 0.0891 0.104 0.221 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 5.02e-01 0.0573 0.0852 0.221 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 6.72e-01 0.0443 0.104 0.221 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0261 0.0869 0.221 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 5.67e-01 0.0639 0.111 0.221 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 709544 sc-eQTL 9.05e-02 0.17 0.1 0.221 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 7.03e-01 0.0267 0.0699 0.22 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 738502 sc-eQTL 1.66e-01 0.122 0.0877 0.22 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0516 0.0994 0.22 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 7.25e-01 0.0235 0.0668 0.22 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 7.02e-01 0.0241 0.0629 0.22 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 5.53e-04 0.33 0.094 0.22 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 709544 sc-eQTL 4.57e-02 -0.186 0.0928 0.22 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0147 0.0526 0.221 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 8.65e-01 0.0152 0.0892 0.221 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0212 0.0846 0.221 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 4.29e-01 0.0555 0.0701 0.221 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 3.60e-01 0.0814 0.0887 0.221 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0232 0.0438 0.22 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 943715 sc-eQTL 6.16e-02 0.151 0.0804 0.22 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 3.06e-01 0.0939 0.0914 0.22 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0165 0.0715 0.22 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 9.45e-01 0.00458 0.0665 0.22 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 6.71e-01 0.043 0.101 0.22 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 245296 sc-eQTL 1.08e-01 -0.168 0.104 0.22 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 9.27e-01 0.00912 0.0992 0.224 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 9.98e-01 0.000308 0.112 0.224 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0161 0.119 0.224 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0539 0.112 0.224 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 4.98e-01 0.0794 0.117 0.224 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 7.96e-02 0.152 0.0862 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 6.14e-01 0.0425 0.0841 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 3.79e-01 0.0836 0.0947 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 7.92e-01 0.0249 0.0945 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 1.74e-01 0.15 0.11 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 1.40e-01 0.126 0.0848 0.216 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 1.01e-02 0.251 0.0968 0.216 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0456 0.0967 0.216 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 1.35e-01 0.153 0.102 0.216 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 1.75e-01 -0.154 0.113 0.216 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 2.72e-01 0.0761 0.0691 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 8.02e-01 0.0182 0.0726 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 1.44e-01 0.125 0.0854 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0786 0.0833 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0427 0.107 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 5.19e-01 -0.057 0.0883 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0102 0.0838 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 5.71e-01 0.056 0.0987 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00697 0.098 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 1.23e-01 0.179 0.116 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 2.95e-01 0.0841 0.0801 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 8.25e-01 0.0251 0.113 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0553 0.115 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0259 0.0996 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 4.45e-01 0.0881 0.115 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 3.76e-01 0.0443 0.0499 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 2.61e-01 0.0813 0.0721 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 8.07e-01 0.0177 0.0723 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 1.24e-01 0.0987 0.0639 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0878 0.0789 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 1.15e-01 0.0759 0.048 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0481 0.0818 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0951 0.0803 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 8.97e-02 0.112 0.0656 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 1.22e-01 -0.139 0.0897 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 5.16e-01 0.0389 0.0597 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0607 0.0922 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000232 0.0858 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 3.15e-01 0.0903 0.0896 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0408 0.106 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 3.05e-01 0.0599 0.0582 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 5.38e-01 -0.065 0.105 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 2.91e-02 -0.208 0.0949 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0199 0.0882 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 8.45e-01 0.0193 0.0989 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 6.02e-03 0.19 0.0685 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 2.27e-01 -0.101 0.0832 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 3.30e-01 0.0861 0.0881 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0557 0.0793 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 2.21e-01 -0.116 0.0942 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 5.07e-01 0.0494 0.0743 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 4.40e-01 0.0844 0.109 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 3.12e-01 0.0936 0.0923 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0333 0.107 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 5.22e-01 0.067 0.104 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 5.90e-03 0.255 0.0917 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0172 0.114 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 3.31e-01 -0.109 0.112 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 1.68e-01 -0.144 0.104 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0259 0.113 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 6.81e-01 0.0258 0.0627 0.221 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 943715 sc-eQTL 3.88e-02 0.174 0.0837 0.221 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 9.42e-01 0.00709 0.0969 0.221 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 6.50e-01 0.0369 0.0813 0.221 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 2.98e-01 0.098 0.094 0.221 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0254 0.106 0.221 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 245296 sc-eQTL 6.82e-01 0.043 0.105 0.221 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0511 0.068 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 1.70e-01 -0.138 0.1 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 7.79e-01 0.0301 0.107 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0607 0.112 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 7.91e-01 0.03 0.113 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0465 0.0567 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 3.74e-01 0.0912 0.102 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 8.38e-01 0.0186 0.0908 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 2.52e-01 0.099 0.0862 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 1.38e-01 0.148 0.099 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0254 0.0895 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 3.51e-01 0.109 0.117 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 1.14e-01 -0.172 0.108 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0418 0.113 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 9.78e-02 0.177 0.107 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 5.42e-01 0.0379 0.062 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 1.55e-01 -0.149 0.104 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 8.04e-01 -0.025 0.101 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00175 0.0851 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0987 0.105 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 1.80e-01 0.166 0.123 0.211 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 7.99e-01 0.0278 0.109 0.211 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 7.48e-01 -0.045 0.14 0.211 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 1.27e-01 0.208 0.135 0.211 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 4.11e-01 -0.133 0.162 0.211 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 9.91e-01 0.000778 0.0683 0.222 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 943715 sc-eQTL 1.79e-01 0.103 0.0764 0.222 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0158 0.0902 0.222 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0806 0.109 0.222 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0112 0.0688 0.222 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 3.58e-01 -0.092 0.0997 0.222 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 245296 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0392 0.0808 0.222 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00627 0.0749 0.22 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 4.56e-01 0.0708 0.0948 0.22 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 5.37e-01 0.0531 0.0859 0.22 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0191 0.0996 0.22 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 1.25e-02 -0.276 0.11 0.22 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 3.42e-01 0.092 0.0965 0.215 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 738502 sc-eQTL 6.52e-01 0.0455 0.1 0.215 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0595 0.086 0.215 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 8.75e-01 -0.018 0.114 0.215 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0291 0.0952 0.215 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 4.55e-01 0.0868 0.116 0.215 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 709544 sc-eQTL 5.84e-01 0.0536 0.0977 0.215 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 9.44e-02 0.134 0.08 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 738502 sc-eQTL 5.45e-01 0.0532 0.0878 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0527 0.0948 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 3.43e-01 0.0693 0.0729 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 7.81e-01 0.021 0.0754 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 7.20e-04 0.347 0.101 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 709544 sc-eQTL 1.50e-01 -0.139 0.0964 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 3.03e-01 0.0942 0.0912 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 738502 sc-eQTL 5.24e-01 0.0655 0.103 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 6.40e-01 -0.048 0.102 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0262 0.0835 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 7.86e-01 0.0224 0.0825 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 2.62e-01 0.125 0.111 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 709544 sc-eQTL 8.05e-02 -0.183 0.104 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0257 0.0909 0.221 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 943715 sc-eQTL 2.24e-01 0.127 0.104 0.221 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 7.84e-01 0.0374 0.136 0.221 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 3.59e-01 -0.116 0.126 0.221 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 9.83e-01 0.00262 0.122 0.221 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0965 0.134 0.221 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 245296 sc-eQTL 3.15e-01 -0.118 0.117 0.221 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 8.07e-01 0.0256 0.105 0.218 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 738502 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0141 0.106 0.218 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0516 0.108 0.218 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0178 0.0966 0.218 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 1.49e-02 0.25 0.102 0.218 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 2.64e-02 0.237 0.106 0.218 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 709544 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0479 0.108 0.218 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 2.07e-01 -0.103 0.0815 0.224 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 738502 sc-eQTL 1.53e-01 0.13 0.0908 0.224 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 6.92e-01 0.0403 0.102 0.224 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 8.53e-01 0.0162 0.0874 0.224 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0252 0.0893 0.224 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 2.51e-01 0.109 0.0945 0.224 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 709544 sc-eQTL 7.72e-01 0.0313 0.108 0.224 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 8.82e-02 0.188 0.11 0.22 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 738502 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00537 0.0935 0.22 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0486 0.105 0.22 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 3.17e-01 0.128 0.128 0.22 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 9.24e-01 0.0107 0.112 0.22 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 4.23e-01 0.0989 0.123 0.22 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 709544 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0164 0.106 0.22 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 2.55e-02 0.16 0.0709 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 2.50e-01 0.0857 0.0743 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 9.94e-01 0.000644 0.0851 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 7.78e-02 0.145 0.0819 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0543 0.108 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 6.47e-01 0.0286 0.0624 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 5.40e-01 -0.043 0.07 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 6.54e-02 0.147 0.0791 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0198 0.0803 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 4.95e-01 0.0726 0.106 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 5.69e-02 0.139 0.0724 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 738502 sc-eQTL 2.45e-01 0.103 0.0882 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0794 0.097 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 7.14e-01 0.0257 0.0702 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 9.23e-01 0.00653 0.0677 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 5.96e-03 0.29 0.104 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 709544 sc-eQTL 2.00e-02 -0.228 0.0971 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0362 0.0753 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 738502 sc-eQTL 2.29e-01 0.107 0.0887 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 9.31e-01 0.00856 0.0987 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 5.12e-01 0.0479 0.073 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 2.46e-01 0.0873 0.0751 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 3.19e-02 0.206 0.0955 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 709544 sc-eQTL 9.08e-01 0.0118 0.102 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 334387 sc-eQTL 8.98e-01 0.00684 0.0531 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 691347 sc-eQTL 4.72e-01 0.0665 0.0923 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 540492 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0115 0.0845 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 875939 sc-eQTL 3.62e-01 0.066 0.0722 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 sc-eQTL 3.85e-01 0.0784 0.09 0.218 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 eQTL 3.9099999999999996e-24 0.275 0.0264 0.0 0.0 0.215
ENSG00000188596 CFAP54 245292 eQTL 1.48e-05 0.1 0.023 0.0 0.0 0.215

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139350 NEDD1 -172356 4.19e-06 3.74e-06 6.04e-07 1.9e-06 4.8e-07 8.39e-07 2.49e-06 6.18e-07 2.35e-06 1.67e-06 3.02e-06 1.74e-06 5.05e-06 1.25e-06 9.97e-07 2.23e-06 1.41e-06 2.13e-06 1.49e-06 1.41e-06 1.26e-06 3.35e-06 3.37e-06 9.71e-07 4.32e-06 1.37e-06 1.6e-06 1.69e-06 2.76e-06 2.37e-06 1.93e-06 4.73e-07 5.43e-07 1.25e-06 1.33e-06 9.71e-07 7.72e-07 4.18e-07 1.18e-06 3.47e-07 2.29e-07 4.15e-06 4.8e-07 1.3e-07 3.01e-07 3.66e-07 8.19e-07 2.33e-07 1.76e-07
ENSG00000188596 CFAP54 245292 1.86e-06 1.52e-06 2.19e-07 1.25e-06 3.6e-07 6.06e-07 1.41e-06 3.54e-07 1.78e-06 7.13e-07 2.08e-06 9.29e-07 2.62e-06 4.76e-07 3.44e-07 9.61e-07 8.82e-07 1.06e-06 6.75e-07 5.11e-07 7.96e-07 1.97e-06 1.33e-06 5.48e-07 2.39e-06 5.15e-07 1e-06 7.45e-07 1.62e-06 1.28e-06 7.84e-07 2.66e-07 3.01e-07 6.29e-07 5.39e-07 4.45e-07 6.37e-07 2.95e-07 4.52e-07 2.22e-07 3.03e-07 2.13e-06 3.77e-07 1.26e-08 2.83e-07 1.98e-07 2.3e-07 1.41e-07 2.46e-07
ENSG00000257715 \N 709544 3.02e-07 1.35e-07 5.35e-08 2.05e-07 9.16e-08 9.05e-08 1.73e-07 5.2e-08 1.45e-07 6.4e-08 1.55e-07 9.19e-08 1.69e-07 7.37e-08 5.72e-08 7.5e-08 4.17e-08 1.33e-07 6.32e-08 4.31e-08 1.21e-07 1.24e-07 1.5e-07 2.64e-08 1.55e-07 1.14e-07 1.1e-07 9.61e-08 1.2e-07 9.88e-08 9.92e-08 3.55e-08 3.96e-08 8e-08 6.34e-08 3.49e-08 5.37e-08 8.72e-08 6.86e-08 3.67e-08 5.44e-08 1.46e-07 5.27e-08 2.1e-08 3.81e-08 1.87e-08 1.19e-07 1.89e-09 4.99e-08