logo

Genes within 1Mb (chr12:96726941:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 5.75e-03 -0.182 0.0652 0.13 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0709 0.0824 0.13 B L1
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0662 0.0877 0.13 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0895 0.0795 0.13 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 4.66e-01 0.085 0.116 0.13 B L1
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0552 0.0551 0.13 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 9.10e-01 0.00862 0.0759 0.13 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 9.46e-01 0.00557 0.0822 0.13 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00714 0.0719 0.13 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 2.19e-07 0.445 0.083 0.13 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 3.90e-02 -0.116 0.0558 0.13 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 8.35e-02 0.104 0.0601 0.13 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 1.49e-01 0.131 0.0906 0.13 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 7.89e-01 -0.02 0.0746 0.13 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 7.80e-02 0.174 0.0985 0.13 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 6.85e-02 -0.189 0.103 0.135 DC L1
ENSG00000084110 HAL 730576 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0721 0.118 0.135 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 5.43e-03 -0.267 0.0951 0.135 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 8.34e-01 0.0249 0.119 0.135 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0848 0.0986 0.135 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 6.07e-02 0.237 0.126 0.135 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 701618 sc-eQTL 2.39e-01 -0.135 0.114 0.135 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 4.67e-01 0.062 0.085 0.13 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 730576 sc-eQTL 2.14e-01 -0.133 0.107 0.13 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 5.98e-02 -0.227 0.12 0.13 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 1.77e-01 0.11 0.0809 0.13 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 5.06e-01 0.051 0.0765 0.13 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 3.45e-01 -0.111 0.117 0.13 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 701618 sc-eQTL 1.10e-01 -0.182 0.113 0.13 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 1.04e-01 -0.102 0.0625 0.129 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 4.06e-02 0.218 0.106 0.129 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 6.50e-01 0.046 0.101 0.129 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 9.30e-02 -0.141 0.0834 0.129 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 1.74e-01 -0.144 0.106 0.129 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0192 0.0529 0.13 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 935789 sc-eQTL 8.55e-02 -0.168 0.0972 0.13 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 2.90e-01 0.117 0.11 0.13 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 2.65e-01 0.0962 0.0861 0.13 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 2.12e-01 -0.1 0.08 0.13 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 7.27e-01 0.0427 0.122 0.13 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 237370 sc-eQTL 1.19e-01 0.197 0.126 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 6.16e-01 0.0603 0.12 0.14 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0997 0.136 0.14 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 9.94e-01 0.00109 0.144 0.14 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00344 0.136 0.14 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00139 0.142 0.14 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 1.52e-02 -0.248 0.101 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 6.56e-02 -0.183 0.0986 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 6.11e-01 0.057 0.112 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 2.05e-01 -0.141 0.111 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 2.20e-01 -0.16 0.13 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 1.60e-01 -0.138 0.0977 0.131 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 1.72e-01 -0.155 0.113 0.131 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 7.61e-01 0.0339 0.111 0.131 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 2.64e-01 -0.132 0.118 0.131 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 3.20e-01 -0.13 0.13 0.131 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 1.03e-02 -0.209 0.0808 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 1.69e-01 -0.118 0.0856 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 1.80e-02 -0.239 0.1 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0363 0.0988 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 7.98e-02 0.221 0.126 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0485 0.105 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 3.07e-01 -0.102 0.0992 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0671 0.117 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 9.57e-01 0.00636 0.116 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 6.07e-01 0.0713 0.138 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0744 0.0984 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 2.09e-01 0.175 0.138 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 9.89e-01 0.00199 0.141 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0249 0.122 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 7.44e-01 0.0462 0.141 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 1.86e-01 -0.0806 0.0607 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 7.56e-01 0.0275 0.0882 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 8.72e-01 0.0142 0.0882 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 8.73e-01 0.0125 0.0784 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 2.27e-05 0.401 0.0925 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0114 0.0599 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 1.29e-01 0.154 0.101 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 2.77e-01 0.109 0.0998 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 8.78e-01 0.0126 0.0821 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 1.53e-01 0.16 0.112 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 5.84e-02 -0.136 0.0716 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 3.33e-01 -0.108 0.111 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 9.89e-01 0.00139 0.104 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 7.89e-01 -0.029 0.109 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 1.28e-03 0.41 0.126 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 4.18e-02 -0.141 0.069 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 1.19e-02 0.314 0.124 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 4.70e-03 0.321 0.112 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 2.43e-01 -0.123 0.105 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 2.10e-01 0.148 0.118 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 7.12e-02 -0.155 0.0854 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 8.35e-02 0.178 0.102 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 1.51e-01 0.156 0.109 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 8.26e-02 -0.17 0.0973 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 7.75e-02 0.206 0.116 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 7.65e-02 -0.165 0.0924 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 4.28e-01 -0.109 0.137 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 8.84e-01 0.0169 0.116 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 4.34e-01 0.105 0.133 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0629 0.131 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 1.95e-01 -0.146 0.112 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0194 0.138 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 5.30e-01 0.0851 0.135 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 4.82e-01 0.0886 0.126 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 3.99e-01 0.115 0.136 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 5.49e-01 0.0464 0.0773 0.13 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 935789 sc-eQTL 1.85e-02 -0.244 0.103 0.13 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 5.13e-01 0.0782 0.119 0.13 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00962 0.1 0.13 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 3.02e-01 -0.12 0.116 0.13 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 3.55e-01 0.121 0.13 0.13 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 237370 sc-eQTL 9.33e-01 0.0109 0.129 0.13 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 5.26e-02 -0.151 0.0773 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 2.22e-01 0.141 0.115 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 9.83e-01 0.00255 0.122 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 2.37e-03 -0.385 0.125 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 8.40e-02 -0.223 0.128 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0526 0.068 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 2.29e-01 0.148 0.123 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0285 0.109 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0777 0.104 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0885 0.119 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 8.63e-01 0.0182 0.105 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 4.93e-01 0.0946 0.138 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0863 0.128 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 1.68e-01 -0.184 0.133 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0958 0.126 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0958 0.0731 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 4.78e-02 0.245 0.123 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 1.55e-01 0.169 0.118 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 1.56e-01 -0.142 0.1 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 2.61e-01 -0.14 0.124 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 1.89e-01 0.175 0.133 0.13 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0655 0.118 0.13 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0602 0.151 0.13 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 5.59e-02 -0.28 0.145 0.13 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 6.74e-01 0.074 0.175 0.13 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 2.92e-01 0.087 0.0823 0.133 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 935789 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000363 0.0926 0.133 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 6.84e-01 0.0444 0.109 0.133 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 4.83e-02 0.259 0.131 0.133 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 2.53e-01 -0.095 0.0828 0.133 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 9.92e-01 0.00114 0.121 0.133 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 237370 sc-eQTL 2.63e-01 0.109 0.0973 0.133 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 2.88e-01 0.0967 0.0907 0.13 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 4.20e-01 0.093 0.115 0.13 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 1.63e-01 -0.145 0.104 0.13 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0252 0.121 0.13 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 6.60e-02 0.247 0.134 0.13 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 1.97e-01 -0.143 0.11 0.144 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 730576 sc-eQTL 7.33e-01 0.0392 0.115 0.144 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 1.95e-02 -0.229 0.0971 0.144 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 5.84e-01 0.0714 0.13 0.144 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0216 0.109 0.144 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 3.13e-01 0.134 0.132 0.144 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 701618 sc-eQTL 3.82e-02 -0.231 0.111 0.144 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 2.88e-01 0.104 0.098 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 730576 sc-eQTL 2.02e-01 -0.137 0.107 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 4.58e-02 -0.23 0.115 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 1.24e-01 0.137 0.0887 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 8.14e-01 0.0217 0.092 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 8.19e-01 0.0291 0.127 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 701618 sc-eQTL 6.84e-02 -0.215 0.117 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 9.53e-01 0.00648 0.11 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 730576 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0411 0.123 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 1.65e-01 -0.171 0.123 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 3.69e-01 0.0901 0.1 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00974 0.0991 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 2.06e-01 -0.169 0.133 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 701618 sc-eQTL 7.09e-02 -0.227 0.125 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0259 0.109 0.13 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 935789 sc-eQTL 2.45e-02 -0.279 0.123 0.13 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 4.29e-01 0.129 0.163 0.13 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 3.00e-01 0.156 0.15 0.13 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 1.73e-01 -0.198 0.145 0.13 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 8.72e-01 -0.026 0.161 0.13 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 237370 sc-eQTL 9.51e-01 0.00866 0.141 0.13 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 5.83e-01 0.069 0.125 0.133 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 730576 sc-eQTL 1.38e-01 -0.188 0.126 0.133 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 2.39e-01 -0.153 0.13 0.133 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 8.52e-01 0.0217 0.116 0.133 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 1.32e-01 -0.186 0.123 0.133 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 6.17e-01 0.0645 0.129 0.133 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 701618 sc-eQTL 2.84e-01 -0.139 0.129 0.133 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 8.16e-01 0.0229 0.0983 0.136 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 730576 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0736 0.11 0.136 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 3.71e-01 -0.11 0.122 0.136 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 5.31e-01 0.0659 0.105 0.136 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 4.05e-01 0.0894 0.107 0.136 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 2.92e-01 -0.12 0.114 0.136 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 701618 sc-eQTL 1.45e-01 -0.19 0.129 0.136 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 3.02e-01 -0.133 0.129 0.147 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 730576 sc-eQTL 9.43e-01 0.00779 0.109 0.147 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 7.75e-03 -0.322 0.119 0.147 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 1.73e-01 -0.203 0.148 0.147 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 1.99e-01 -0.167 0.13 0.147 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 2.55e-01 0.164 0.143 0.147 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 701618 sc-eQTL 2.96e-01 -0.129 0.123 0.147 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 3.67e-03 -0.248 0.0845 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 6.13e-02 -0.167 0.0888 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 3.39e-01 0.0977 0.102 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 2.66e-02 -0.219 0.098 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 4.14e-01 -0.106 0.13 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 1.62e-02 -0.176 0.0725 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 1.40e-01 -0.122 0.0821 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 3.73e-02 -0.195 0.093 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 9.29e-01 0.00843 0.0946 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 1.78e-01 0.168 0.125 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 5.03e-01 0.0594 0.0884 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 730576 sc-eQTL 2.42e-01 -0.125 0.107 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 8.48e-02 -0.202 0.117 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 1.49e-01 0.122 0.0846 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 4.87e-01 0.057 0.0819 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0729 0.129 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 701618 sc-eQTL 1.15e-01 -0.188 0.118 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 4.53e-01 0.0685 0.0911 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 730576 sc-eQTL 1.14e-01 -0.17 0.107 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 9.19e-02 -0.201 0.119 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 8.20e-01 0.0201 0.0884 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 8.44e-01 0.0179 0.0912 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0695 0.117 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 701618 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0902 0.124 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 326461 sc-eQTL 1.15e-01 -0.1 0.0634 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 683421 sc-eQTL 2.85e-02 0.242 0.11 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 532566 sc-eQTL 7.11e-01 0.0377 0.102 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 868013 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0983 0.0866 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 sc-eQTL 2.23e-01 -0.132 0.108 0.129 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -180282 eQTL 0.0117 -0.0895 0.0354 0.0 0.0 0.121
ENSG00000257878 AC007298.2 730420 eQTL 0.0649 0.0319 0.0172 0.00123 0.0 0.121

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina