logo

Genes within 1Mb (chr12:96726384:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 1.21e-01 0.0851 0.0547 0.218 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0481 0.0682 0.218 B L1
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 4.16e-01 0.0591 0.0726 0.218 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 2.02e-01 0.0842 0.0658 0.218 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 2.75e-01 0.105 0.0961 0.218 B L1
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 2.68e-01 0.0505 0.0455 0.218 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 5.49e-01 0.0376 0.0626 0.218 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 8.42e-01 0.0136 0.0678 0.218 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 7.80e-02 0.104 0.0589 0.218 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 1.63e-02 -0.174 0.072 0.218 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 2.86e-03 0.137 0.0455 0.218 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 3.89e-01 -0.043 0.0498 0.218 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 7.79e-01 0.0211 0.075 0.218 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 4.16e-01 -0.05 0.0614 0.218 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0535 0.0816 0.218 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 6.98e-02 0.166 0.091 0.218 DC L1
ENSG00000084110 HAL 730019 sc-eQTL 5.17e-01 0.0677 0.104 0.218 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 6.02e-01 0.0446 0.0854 0.218 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 6.53e-01 0.0471 0.105 0.218 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0313 0.087 0.218 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 5.18e-01 0.0722 0.112 0.218 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 701061 sc-eQTL 1.03e-01 0.164 0.1 0.218 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 6.10e-01 0.0357 0.0698 0.218 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 730019 sc-eQTL 1.88e-01 0.116 0.0876 0.218 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0582 0.0993 0.218 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 7.60e-01 0.0204 0.0667 0.218 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 7.78e-01 0.0178 0.0629 0.218 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 6.39e-04 0.326 0.0939 0.218 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 701061 sc-eQTL 5.30e-02 -0.18 0.0928 0.218 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0164 0.0525 0.219 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 9.49e-01 0.00576 0.0892 0.219 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 1.00e+00 3.91e-05 0.0846 0.219 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 5.25e-01 0.0446 0.0701 0.219 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 2.69e-01 0.0981 0.0885 0.219 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0118 0.044 0.218 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 935232 sc-eQTL 8.44e-02 0.14 0.0809 0.218 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 3.56e-01 0.085 0.0918 0.218 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00603 0.0718 0.218 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 9.65e-01 0.00296 0.0667 0.218 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 7.95e-01 0.0264 0.102 0.218 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 236813 sc-eQTL 8.15e-02 -0.183 0.105 0.218 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 9.22e-01 0.00982 0.0996 0.222 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 9.63e-01 0.00523 0.113 0.222 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0228 0.119 0.222 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0405 0.113 0.222 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 5.18e-01 0.0762 0.118 0.222 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 9.04e-02 0.147 0.0864 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 6.76e-01 0.0352 0.0842 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 4.45e-01 0.0725 0.0948 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 7.40e-01 0.0314 0.0946 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 1.71e-01 0.152 0.11 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 1.35e-01 0.127 0.0848 0.213 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 1.36e-02 0.241 0.0969 0.213 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0449 0.0967 0.213 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 1.28e-01 0.156 0.102 0.213 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 1.37e-01 -0.168 0.113 0.213 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 3.41e-01 0.0659 0.0691 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 9.01e-01 0.009 0.0726 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 1.07e-01 0.138 0.0852 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0692 0.0833 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0578 0.107 0.218 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0676 0.0882 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00773 0.0837 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 5.17e-01 0.064 0.0986 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0182 0.098 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 1.46e-01 0.169 0.116 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 3.93e-01 0.0688 0.0803 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 9.39e-01 0.00871 0.113 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0164 0.115 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0335 0.0998 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 3.23e-01 0.114 0.115 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 4.70e-01 0.0362 0.05 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 3.55e-01 0.0671 0.0723 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 6.87e-01 0.0292 0.0724 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 1.65e-01 0.0893 0.0641 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 2.61e-01 -0.089 0.079 0.218 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 1.59e-01 0.0679 0.0481 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0427 0.0819 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0844 0.0805 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 8.37e-02 0.114 0.0657 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 1.21e-01 -0.14 0.0899 0.218 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 6.20e-01 0.0297 0.0598 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 6.27e-01 -0.045 0.0924 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 8.37e-01 0.0177 0.0859 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 2.81e-01 0.097 0.0897 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0326 0.107 0.218 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 3.72e-01 0.0523 0.0584 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0664 0.106 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 3.17e-02 -0.206 0.0952 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0134 0.0885 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 8.98e-01 0.0128 0.0992 0.218 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 8.98e-03 0.181 0.0687 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0902 0.0835 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 3.09e-01 0.0902 0.0883 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0518 0.0795 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 2.29e-01 -0.114 0.0944 0.218 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 5.93e-01 0.0399 0.0745 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 4.27e-01 0.087 0.109 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 2.54e-01 0.106 0.0925 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0347 0.107 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 5.99e-01 0.055 0.105 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 6.06e-03 0.255 0.0918 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00157 0.115 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0931 0.112 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 1.94e-01 -0.136 0.104 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0337 0.114 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 6.32e-01 0.0301 0.0629 0.219 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 935232 sc-eQTL 5.72e-02 0.161 0.0841 0.219 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 9.71e-01 0.00357 0.0972 0.219 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 6.61e-01 0.0358 0.0815 0.219 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 3.68e-01 0.085 0.0943 0.219 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0392 0.106 0.219 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 236813 sc-eQTL 7.89e-01 0.0282 0.105 0.219 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0545 0.0679 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 1.37e-01 -0.149 0.1 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 6.08e-01 0.0549 0.107 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0711 0.112 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 7.74e-01 0.0324 0.113 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0413 0.0567 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 4.75e-01 0.0733 0.102 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 7.03e-01 0.0347 0.0908 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 3.11e-01 0.0875 0.0862 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 9.09e-02 0.168 0.0988 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0254 0.0895 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 3.51e-01 0.109 0.117 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 1.14e-01 -0.172 0.108 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0418 0.113 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 9.78e-02 0.177 0.107 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 5.58e-01 0.0364 0.0621 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 1.81e-01 -0.14 0.105 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 8.74e-01 -0.016 0.101 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00111 0.0852 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0858 0.105 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 1.80e-01 0.166 0.123 0.211 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 7.99e-01 0.0278 0.109 0.211 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 7.48e-01 -0.045 0.14 0.211 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 1.27e-01 0.208 0.135 0.211 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 4.11e-01 -0.133 0.162 0.211 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 9.03e-01 0.00836 0.0686 0.22 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 935232 sc-eQTL 1.56e-01 0.109 0.0767 0.22 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0182 0.0906 0.22 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0808 0.109 0.22 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00155 0.0691 0.22 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 2.56e-01 -0.114 0.1 0.22 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 236813 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0403 0.0811 0.22 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0219 0.075 0.218 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 4.65e-01 0.0694 0.0949 0.218 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 4.80e-01 0.0609 0.086 0.218 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0111 0.0997 0.218 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 1.06e-02 -0.282 0.11 0.218 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 2.76e-01 0.105 0.0965 0.212 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 730019 sc-eQTL 8.28e-01 0.0219 0.101 0.212 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0756 0.086 0.212 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0235 0.114 0.212 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 6.90e-01 -0.038 0.0952 0.212 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 4.46e-01 0.0886 0.116 0.212 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 701061 sc-eQTL 6.04e-01 0.0508 0.0978 0.212 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 9.99e-02 0.132 0.08 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 730019 sc-eQTL 6.06e-01 0.0454 0.0878 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0601 0.0948 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 3.69e-01 0.0657 0.073 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 7.79e-01 0.0212 0.0754 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 4.68e-04 0.359 0.101 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 701061 sc-eQTL 1.76e-01 -0.131 0.0965 0.218 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 2.85e-01 0.0977 0.0912 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 730019 sc-eQTL 5.62e-01 0.0596 0.103 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0552 0.102 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0238 0.0835 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 8.77e-01 0.0127 0.0825 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 2.58e-01 0.126 0.111 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 701061 sc-eQTL 9.14e-02 -0.177 0.104 0.218 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 9.61e-01 0.00447 0.0918 0.218 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 935232 sc-eQTL 3.80e-01 0.0925 0.105 0.218 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00224 0.137 0.218 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0719 0.127 0.218 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0142 0.123 0.218 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0905 0.135 0.218 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 236813 sc-eQTL 3.15e-01 -0.119 0.118 0.218 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 6.70e-01 0.0446 0.105 0.216 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 730019 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0176 0.106 0.216 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0661 0.109 0.216 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0195 0.0967 0.216 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 1.61e-02 0.247 0.102 0.216 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 3.05e-02 0.231 0.106 0.216 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 701061 sc-eQTL 6.78e-01 -0.045 0.108 0.216 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 2.09e-01 -0.103 0.0815 0.222 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 730019 sc-eQTL 1.35e-01 0.136 0.0908 0.222 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 8.57e-01 0.0183 0.102 0.222 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 8.88e-01 0.0123 0.0874 0.222 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0318 0.0893 0.222 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 3.48e-01 0.0891 0.0946 0.222 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 701061 sc-eQTL 8.53e-01 0.0201 0.108 0.222 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 8.18e-02 0.192 0.11 0.218 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 730019 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0275 0.0935 0.218 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0651 0.105 0.218 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 2.51e-01 0.147 0.128 0.218 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 9.74e-01 0.00366 0.112 0.218 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 3.46e-01 0.116 0.123 0.218 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 701061 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0408 0.106 0.218 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 2.69e-02 0.158 0.071 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 2.97e-01 0.0778 0.0744 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00158 0.0852 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 6.74e-02 0.151 0.082 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0623 0.108 0.218 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 7.49e-01 0.0199 0.0623 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0469 0.0699 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 4.72e-02 0.157 0.0789 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0211 0.0802 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 5.85e-01 0.0579 0.106 0.218 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 5.43e-02 0.14 0.0723 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 730019 sc-eQTL 2.68e-01 0.0978 0.0881 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0836 0.0969 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 7.44e-01 0.0229 0.0701 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 9.77e-01 0.00199 0.0677 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 4.67e-03 0.298 0.104 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 701061 sc-eQTL 2.55e-02 -0.219 0.0971 0.218 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0279 0.0753 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 730019 sc-eQTL 2.19e-01 0.109 0.0887 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0119 0.0987 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 5.50e-01 0.0436 0.073 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 2.75e-01 0.0822 0.0751 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 5.06e-02 0.188 0.0957 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 701061 sc-eQTL 9.49e-01 0.00649 0.102 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 325904 sc-eQTL 9.19e-01 0.00538 0.0531 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 682864 sc-eQTL 5.36e-01 0.0573 0.0923 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 532009 sc-eQTL 9.45e-01 0.0058 0.0846 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 867456 sc-eQTL 4.30e-01 0.0572 0.0722 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 sc-eQTL 2.75e-01 0.0984 0.09 0.216 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 eQTL 1.8899999999999998e-24 0.277 0.0264 0.0 0.0 0.215
ENSG00000188596 CFAP54 236809 eQTL 1.12e-05 0.102 0.023 0.0 0.0 0.215

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139350 NEDD1 -180839 4.48e-06 5.07e-06 1.23e-06 3.37e-06 1.9e-06 1.61e-06 5.64e-06 1.8e-06 4.79e-06 3.49e-06 6.49e-06 3.23e-06 7.57e-06 1.76e-06 1.02e-06 4.63e-06 3.02e-06 3.95e-06 2.19e-06 2.56e-06 3.53e-06 6.71e-06 4.74e-06 2.15e-06 7.25e-06 2.43e-06 3.74e-06 1.76e-06 5.6e-06 4.34e-06 2.59e-06 1.11e-06 8.85e-07 2.71e-06 2.1e-06 2.11e-06 1.63e-06 1.85e-06 1.26e-06 9.52e-07 9.78e-07 5.69e-06 1.26e-06 1.58e-07 6.82e-07 1.13e-06 1.3e-06 6.85e-07 4.95e-07
ENSG00000188596 CFAP54 236809 3.24e-06 3.65e-06 6.07e-07 1.86e-06 1.47e-06 1.03e-06 2.56e-06 1.05e-06 3.98e-06 2.22e-06 3.27e-06 3.39e-06 5.21e-06 1.24e-06 1.37e-06 2.92e-06 2.04e-06 2.38e-06 1.36e-06 1.16e-06 2.9e-06 4.19e-06 3.37e-06 1.56e-06 4.02e-06 1.65e-06 2.6e-06 1.48e-06 3.76e-06 2.81e-06 2.01e-06 4.97e-07 5.68e-07 1.71e-06 1.94e-06 1.16e-06 1.08e-06 4.72e-07 9.31e-07 4.07e-07 6.55e-07 3.37e-06 4.73e-07 1.63e-07 6.37e-07 7.26e-07 1.17e-06 7.43e-07 5.97e-07
ENSG00000257715 \N 701061 4.89e-07 2.56e-07 1.27e-07 2.61e-07 1.1e-07 1.57e-07 3.7e-07 1.31e-07 2.81e-07 2.12e-07 2.98e-07 3.11e-07 4.27e-07 9.18e-08 1.26e-07 1.75e-07 2.25e-07 3.02e-07 1.7e-07 1.24e-07 1.92e-07 2.76e-07 2.63e-07 1.06e-07 3.41e-07 2.42e-07 2.24e-07 1.67e-07 2.19e-07 2.89e-07 1.78e-07 6.49e-08 5.77e-08 1.19e-07 1.83e-07 1.18e-07 1.14e-07 1.11e-07 4.23e-08 6.07e-08 4.4e-08 2e-07 4.41e-08 1.14e-08 8.68e-08 1.84e-08 9.95e-08 2.25e-08 5.86e-08