logo

Genes within 1Mb (chr12:96719940:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 7.92e-02 0.0983 0.0557 0.201 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0513 0.0696 0.201 B L1
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 3.51e-01 0.0693 0.0741 0.201 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 2.34e-01 0.0802 0.0672 0.201 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 1.45e-01 0.143 0.0979 0.201 B L1
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 5.35e-01 0.0289 0.0465 0.201 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 5.70e-01 0.0363 0.0638 0.201 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 7.01e-01 0.0266 0.0691 0.201 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 8.32e-02 0.104 0.06 0.201 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 1.22e-02 -0.186 0.0734 0.201 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 6.65e-02 0.0862 0.0467 0.201 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0597 0.0504 0.201 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 8.39e-01 0.0155 0.0761 0.201 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0349 0.0624 0.201 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 7.27e-01 -0.029 0.0829 0.201 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 1.32e-01 0.14 0.0923 0.2 DC L1
ENSG00000084110 HAL 723575 sc-eQTL 3.19e-01 0.105 0.105 0.2 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 6.69e-01 0.037 0.0864 0.2 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 4.16e-01 0.086 0.106 0.2 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 6.83e-01 -0.036 0.088 0.2 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 4.77e-01 0.0804 0.113 0.2 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 694617 sc-eQTL 1.60e-01 0.143 0.102 0.2 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 7.97e-01 0.0184 0.0713 0.201 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 723575 sc-eQTL 2.37e-01 0.106 0.0896 0.201 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 7.30e-01 -0.035 0.101 0.201 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 9.88e-01 0.00102 0.0682 0.201 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 6.62e-01 0.0281 0.0642 0.201 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 1.08e-03 0.319 0.0962 0.201 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 694617 sc-eQTL 1.53e-01 -0.136 0.0952 0.201 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0429 0.0535 0.202 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 8.90e-01 0.0126 0.0909 0.202 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 8.73e-01 0.0138 0.0862 0.202 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 4.41e-01 0.0551 0.0714 0.202 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 2.87e-01 0.0963 0.0903 0.202 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00112 0.0449 0.201 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 928788 sc-eQTL 1.72e-01 0.113 0.0827 0.201 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 5.90e-01 0.0507 0.0938 0.201 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0161 0.0733 0.201 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 7.16e-01 0.0248 0.0681 0.201 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 8.99e-01 0.0132 0.104 0.201 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 230369 sc-eQTL 9.16e-02 -0.181 0.107 0.201 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 5.98e-01 0.0536 0.102 0.202 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00386 0.115 0.202 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00503 0.122 0.202 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0722 0.115 0.202 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 3.76e-01 0.106 0.12 0.202 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 1.63e-01 0.124 0.0884 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00356 0.086 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 5.29e-01 0.0612 0.0969 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 3.76e-01 0.0856 0.0965 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 2.29e-01 0.136 0.113 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 1.48e-01 0.126 0.0866 0.196 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 7.73e-03 0.266 0.0988 0.196 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0461 0.0988 0.196 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 1.94e-01 0.136 0.104 0.196 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 1.10e-01 -0.185 0.115 0.196 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 2.70e-01 0.0779 0.0704 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 9.95e-01 0.000481 0.0739 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 1.25e-01 0.134 0.0869 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0408 0.0849 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00904 0.109 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0568 0.0899 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 9.67e-01 0.00349 0.0853 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 3.58e-01 0.0924 0.1 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0337 0.0998 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 1.24e-01 0.182 0.118 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 2.30e-01 0.0984 0.0816 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 8.72e-01 0.0186 0.116 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 8.53e-01 0.0216 0.117 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0273 0.102 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 2.09e-01 0.147 0.117 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 6.55e-01 0.0228 0.051 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 3.97e-01 0.0626 0.0737 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 7.23e-01 0.0262 0.0738 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 1.87e-01 0.0864 0.0653 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 1.83e-01 -0.107 0.0804 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 4.68e-01 0.0358 0.0493 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0339 0.0836 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0818 0.0821 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 2.33e-02 0.152 0.0667 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 1.20e-01 -0.143 0.0917 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000303 0.0608 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0674 0.0937 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00624 0.0872 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 2.93e-01 0.096 0.091 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0651 0.108 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 6.09e-01 0.0304 0.0593 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 2.58e-01 -0.121 0.107 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 3.19e-02 -0.208 0.0965 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0264 0.0896 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 4.07e-01 0.0835 0.1 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 5.74e-02 0.134 0.0704 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0993 0.0847 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 3.65e-01 0.0814 0.0898 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0351 0.0808 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 2.92e-01 -0.101 0.096 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00928 0.076 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 2.60e-01 0.126 0.111 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 3.77e-01 0.0837 0.0944 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0734 0.109 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 5.15e-01 0.0695 0.107 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 2.54e-02 0.214 0.0949 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 8.34e-01 0.0247 0.118 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 2.97e-01 -0.121 0.115 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0941 0.107 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 6.02e-01 -0.061 0.117 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 5.81e-01 0.0354 0.0641 0.201 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 928788 sc-eQTL 9.18e-02 0.145 0.0858 0.201 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 9.53e-01 0.00582 0.099 0.201 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 5.87e-01 0.0452 0.0831 0.201 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 2.26e-01 0.117 0.096 0.201 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0669 0.108 0.201 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 230369 sc-eQTL 9.00e-01 0.0135 0.107 0.201 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0871 0.0695 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 8.83e-02 -0.175 0.102 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 7.37e-01 0.0368 0.109 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 3.60e-01 -0.105 0.114 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 5.98e-01 0.061 0.116 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0566 0.0579 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 5.27e-01 0.0663 0.105 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 7.03e-01 0.0355 0.0928 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 3.55e-01 0.0817 0.0881 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 9.51e-02 0.169 0.101 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0958 0.0916 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 5.32e-01 0.0753 0.12 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 3.58e-01 -0.103 0.112 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 8.86e-01 0.0168 0.116 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 4.88e-02 0.216 0.109 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 9.70e-01 0.00234 0.0633 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 2.76e-01 -0.116 0.107 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00357 0.102 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 8.57e-01 0.0157 0.0867 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 2.74e-01 -0.117 0.107 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 1.10e-01 0.199 0.124 0.193 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0128 0.11 0.193 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0312 0.142 0.193 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 4.74e-01 0.099 0.138 0.193 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0111 0.164 0.193 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 5.34e-01 0.0435 0.0698 0.202 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 928788 sc-eQTL 2.17e-01 0.0968 0.0781 0.202 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0218 0.0922 0.202 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0787 0.111 0.202 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 8.72e-01 0.0114 0.0703 0.202 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 3.84e-01 -0.089 0.102 0.202 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 230369 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0208 0.0826 0.202 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0409 0.0765 0.201 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 6.18e-01 0.0484 0.0969 0.201 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 5.59e-01 0.0514 0.0878 0.201 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0449 0.102 0.201 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 1.30e-02 -0.28 0.112 0.201 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 4.47e-01 0.0741 0.0972 0.195 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 723575 sc-eQTL 7.29e-01 0.0351 0.101 0.195 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0639 0.0866 0.195 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 9.69e-01 0.00451 0.114 0.195 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0464 0.0957 0.195 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 3.71e-01 0.104 0.116 0.195 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 694617 sc-eQTL 4.98e-01 0.0667 0.0983 0.195 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 1.72e-01 0.112 0.0819 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 723575 sc-eQTL 3.68e-01 0.0808 0.0896 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0436 0.0969 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 4.40e-01 0.0577 0.0746 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 5.66e-01 0.0443 0.077 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 5.54e-04 0.362 0.103 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 694617 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0901 0.0988 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 3.91e-01 0.08 0.0931 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 723575 sc-eQTL 8.92e-01 0.0142 0.105 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 9.01e-01 -0.013 0.105 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0434 0.0851 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 8.25e-01 0.0187 0.0841 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 2.95e-01 0.119 0.113 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 694617 sc-eQTL 2.53e-01 -0.122 0.107 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 9.35e-01 0.00771 0.0941 0.2 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 928788 sc-eQTL 4.41e-01 0.0833 0.108 0.2 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0471 0.141 0.2 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0892 0.13 0.2 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 7.74e-01 0.0361 0.126 0.2 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0791 0.139 0.2 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 230369 sc-eQTL 4.70e-01 -0.088 0.121 0.2 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 6.30e-01 0.0507 0.105 0.2 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 723575 sc-eQTL 3.42e-01 -0.101 0.106 0.2 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 4.92e-01 -0.075 0.109 0.2 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0383 0.0971 0.2 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 8.90e-03 0.27 0.102 0.2 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 8.99e-02 0.183 0.107 0.2 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 694617 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0434 0.108 0.2 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0977 0.083 0.204 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 723575 sc-eQTL 2.13e-01 0.116 0.0927 0.204 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 6.66e-01 0.0448 0.104 0.204 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 9.37e-01 -0.007 0.089 0.204 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0688 0.0908 0.204 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 3.66e-01 0.0873 0.0964 0.204 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 694617 sc-eQTL 5.67e-01 0.0631 0.11 0.204 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 1.14e-01 0.177 0.111 0.195 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 723575 sc-eQTL 9.28e-01 0.0086 0.0948 0.195 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0669 0.106 0.195 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 1.36e-01 0.193 0.129 0.195 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 7.50e-01 0.0362 0.113 0.195 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 3.46e-01 0.118 0.125 0.195 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 694617 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0771 0.107 0.195 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 4.39e-02 0.147 0.0724 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 3.82e-01 0.0664 0.0758 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0132 0.0868 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 5.33e-02 0.162 0.0834 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0708 0.11 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 6.36e-01 0.0301 0.0635 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0484 0.0713 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 3.34e-02 0.172 0.0804 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 8.17e-01 -0.019 0.0818 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 3.22e-01 0.107 0.108 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 1.15e-01 0.117 0.0741 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 723575 sc-eQTL 2.61e-01 0.101 0.09 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0542 0.099 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00723 0.0716 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 8.39e-01 0.0141 0.0691 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 6.56e-03 0.292 0.106 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 694617 sc-eQTL 1.05e-01 -0.163 0.0997 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0352 0.0768 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 723575 sc-eQTL 4.26e-01 0.0723 0.0907 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 9.50e-01 0.00628 0.101 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 7.14e-01 0.0274 0.0745 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 2.57e-01 0.0871 0.0766 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 7.97e-02 0.172 0.0978 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 694617 sc-eQTL 7.60e-01 0.0319 0.104 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 319460 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0159 0.0541 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 676420 sc-eQTL 5.26e-01 0.0598 0.0941 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 525565 sc-eQTL 7.73e-01 0.0249 0.0862 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 861012 sc-eQTL 2.86e-01 0.0787 0.0735 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 sc-eQTL 3.35e-01 0.0886 0.0918 0.198 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139343 SNRPF 861012 eQTL 0.0379 -0.0222 0.0107 0.0 0.0 0.197
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 eQTL 1.5099999999999998e-23 0.28 0.0272 0.0 0.0 0.197
ENSG00000188596 CFAP54 230365 eQTL 4.43e-06 0.109 0.0237 0.0 0.0 0.197

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139350 NEDD1 -187283 3.99e-06 3.76e-06 2.79e-07 2.05e-06 4.75e-07 8.48e-07 2.16e-06 6.09e-07 1.86e-06 9.61e-07 2.55e-06 1.46e-06 3.33e-06 1.43e-06 9.53e-07 1.51e-06 1.46e-06 2.23e-06 9.64e-07 9.54e-07 6.59e-07 2.67e-06 2.28e-06 9.56e-07 4.06e-06 1.29e-06 1.34e-06 1.05e-06 1.77e-06 1.95e-06 1.84e-06 3.78e-07 3.56e-07 9.49e-07 9.89e-07 6.4e-07 6.89e-07 3.65e-07 1.23e-06 4.35e-07 2.83e-07 4.14e-06 4.34e-07 1.9e-07 3.67e-07 3.19e-07 2.46e-07 2.43e-07 2.6e-07
ENSG00000188596 CFAP54 230365 2.41e-06 2.62e-06 2.13e-07 1.42e-06 3.83e-07 6.64e-07 1.32e-06 4.39e-07 1.7e-06 7.04e-07 1.91e-06 1.25e-06 2.61e-06 8.7e-07 3.31e-07 1.01e-06 1.12e-06 1.16e-06 5.55e-07 4.5e-07 7.96e-07 1.97e-06 1.64e-06 6.22e-07 2.58e-06 7.94e-07 1.03e-06 8.91e-07 1.6e-06 1.56e-06 7.66e-07 2.46e-07 2.45e-07 5.79e-07 5.67e-07 4.75e-07 7.4e-07 1.92e-07 9.49e-07 2.57e-07 2.97e-07 3e-06 5.97e-07 1.74e-07 3.12e-07 2.15e-07 2.45e-07 9.26e-08 1.69e-07