logo

Genes within 1Mb (chr12:96716804:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 5.75e-03 -0.182 0.0652 0.13 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0709 0.0824 0.13 B L1
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0662 0.0877 0.13 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0895 0.0795 0.13 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 4.66e-01 0.085 0.116 0.13 B L1
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0552 0.0551 0.13 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 9.10e-01 0.00862 0.0759 0.13 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 9.46e-01 0.00557 0.0822 0.13 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00714 0.0719 0.13 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 2.19e-07 0.445 0.083 0.13 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 3.90e-02 -0.116 0.0558 0.13 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 8.35e-02 0.104 0.0601 0.13 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 1.49e-01 0.131 0.0906 0.13 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 7.89e-01 -0.02 0.0746 0.13 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 7.80e-02 0.174 0.0985 0.13 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 6.85e-02 -0.189 0.103 0.135 DC L1
ENSG00000084110 HAL 720439 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0721 0.118 0.135 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 5.43e-03 -0.267 0.0951 0.135 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 8.34e-01 0.0249 0.119 0.135 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0848 0.0986 0.135 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 6.07e-02 0.237 0.126 0.135 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 691481 sc-eQTL 2.39e-01 -0.135 0.114 0.135 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 4.67e-01 0.062 0.085 0.13 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 720439 sc-eQTL 2.14e-01 -0.133 0.107 0.13 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 5.98e-02 -0.227 0.12 0.13 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 1.77e-01 0.11 0.0809 0.13 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 5.06e-01 0.051 0.0765 0.13 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 3.45e-01 -0.111 0.117 0.13 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 691481 sc-eQTL 1.10e-01 -0.182 0.113 0.13 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 1.04e-01 -0.102 0.0625 0.129 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 4.06e-02 0.218 0.106 0.129 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 6.50e-01 0.046 0.101 0.129 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 9.30e-02 -0.141 0.0834 0.129 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 1.74e-01 -0.144 0.106 0.129 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0192 0.0529 0.13 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 925652 sc-eQTL 8.55e-02 -0.168 0.0972 0.13 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 2.90e-01 0.117 0.11 0.13 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 2.65e-01 0.0962 0.0861 0.13 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 2.12e-01 -0.1 0.08 0.13 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 7.27e-01 0.0427 0.122 0.13 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 227233 sc-eQTL 1.19e-01 0.197 0.126 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 6.16e-01 0.0603 0.12 0.14 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0997 0.136 0.14 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 9.94e-01 0.00109 0.144 0.14 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00344 0.136 0.14 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00139 0.142 0.14 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 1.52e-02 -0.248 0.101 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 6.56e-02 -0.183 0.0986 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 6.11e-01 0.057 0.112 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 2.05e-01 -0.141 0.111 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 2.20e-01 -0.16 0.13 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 1.60e-01 -0.138 0.0977 0.131 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 1.72e-01 -0.155 0.113 0.131 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 7.61e-01 0.0339 0.111 0.131 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 2.64e-01 -0.132 0.118 0.131 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 3.20e-01 -0.13 0.13 0.131 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 1.03e-02 -0.209 0.0808 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 1.69e-01 -0.118 0.0856 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 1.80e-02 -0.239 0.1 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0363 0.0988 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 7.98e-02 0.221 0.126 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0485 0.105 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 3.07e-01 -0.102 0.0992 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0671 0.117 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 9.57e-01 0.00636 0.116 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 6.07e-01 0.0713 0.138 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0744 0.0984 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 2.09e-01 0.175 0.138 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 9.89e-01 0.00199 0.141 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0249 0.122 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 7.44e-01 0.0462 0.141 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 1.86e-01 -0.0806 0.0607 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 7.56e-01 0.0275 0.0882 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 8.72e-01 0.0142 0.0882 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 8.73e-01 0.0125 0.0784 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 2.27e-05 0.401 0.0925 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0114 0.0599 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 1.29e-01 0.154 0.101 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 2.77e-01 0.109 0.0998 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 8.78e-01 0.0126 0.0821 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 1.53e-01 0.16 0.112 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 5.84e-02 -0.136 0.0716 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 3.33e-01 -0.108 0.111 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 9.89e-01 0.00139 0.104 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 7.89e-01 -0.029 0.109 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 1.28e-03 0.41 0.126 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 4.18e-02 -0.141 0.069 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 1.19e-02 0.314 0.124 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 4.70e-03 0.321 0.112 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 2.43e-01 -0.123 0.105 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 2.10e-01 0.148 0.118 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 7.12e-02 -0.155 0.0854 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 8.35e-02 0.178 0.102 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 1.51e-01 0.156 0.109 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 8.26e-02 -0.17 0.0973 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 7.75e-02 0.206 0.116 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 7.65e-02 -0.165 0.0924 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 4.28e-01 -0.109 0.137 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 8.84e-01 0.0169 0.116 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 4.34e-01 0.105 0.133 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0629 0.131 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 1.95e-01 -0.146 0.112 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0194 0.138 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 5.30e-01 0.0851 0.135 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 4.82e-01 0.0886 0.126 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 3.99e-01 0.115 0.136 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 5.49e-01 0.0464 0.0773 0.13 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 925652 sc-eQTL 1.85e-02 -0.244 0.103 0.13 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 5.13e-01 0.0782 0.119 0.13 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00962 0.1 0.13 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 3.02e-01 -0.12 0.116 0.13 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 3.55e-01 0.121 0.13 0.13 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 227233 sc-eQTL 9.33e-01 0.0109 0.129 0.13 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 5.26e-02 -0.151 0.0773 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 2.22e-01 0.141 0.115 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 9.83e-01 0.00255 0.122 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 2.37e-03 -0.385 0.125 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 8.40e-02 -0.223 0.128 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0526 0.068 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 2.29e-01 0.148 0.123 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0285 0.109 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0777 0.104 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0885 0.119 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 8.63e-01 0.0182 0.105 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 4.93e-01 0.0946 0.138 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0863 0.128 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 1.68e-01 -0.184 0.133 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0958 0.126 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0958 0.0731 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 4.78e-02 0.245 0.123 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 1.55e-01 0.169 0.118 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 1.56e-01 -0.142 0.1 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 2.61e-01 -0.14 0.124 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 1.89e-01 0.175 0.133 0.13 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0655 0.118 0.13 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0602 0.151 0.13 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 5.59e-02 -0.28 0.145 0.13 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 6.74e-01 0.074 0.175 0.13 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 2.92e-01 0.087 0.0823 0.133 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 925652 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000363 0.0926 0.133 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 6.84e-01 0.0444 0.109 0.133 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 4.83e-02 0.259 0.131 0.133 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 2.53e-01 -0.095 0.0828 0.133 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 9.92e-01 0.00114 0.121 0.133 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 227233 sc-eQTL 2.63e-01 0.109 0.0973 0.133 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 2.88e-01 0.0967 0.0907 0.13 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 4.20e-01 0.093 0.115 0.13 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 1.63e-01 -0.145 0.104 0.13 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0252 0.121 0.13 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 6.60e-02 0.247 0.134 0.13 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 1.97e-01 -0.143 0.11 0.144 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 720439 sc-eQTL 7.33e-01 0.0392 0.115 0.144 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 1.95e-02 -0.229 0.0971 0.144 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 5.84e-01 0.0714 0.13 0.144 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0216 0.109 0.144 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 3.13e-01 0.134 0.132 0.144 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 691481 sc-eQTL 3.82e-02 -0.231 0.111 0.144 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 2.88e-01 0.104 0.098 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 720439 sc-eQTL 2.02e-01 -0.137 0.107 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 4.58e-02 -0.23 0.115 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 1.24e-01 0.137 0.0887 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 8.14e-01 0.0217 0.092 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 8.19e-01 0.0291 0.127 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 691481 sc-eQTL 6.84e-02 -0.215 0.117 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 9.53e-01 0.00648 0.11 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 720439 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0411 0.123 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 1.65e-01 -0.171 0.123 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 3.69e-01 0.0901 0.1 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00974 0.0991 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 2.06e-01 -0.169 0.133 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 691481 sc-eQTL 7.09e-02 -0.227 0.125 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0259 0.109 0.13 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 925652 sc-eQTL 2.45e-02 -0.279 0.123 0.13 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 4.29e-01 0.129 0.163 0.13 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 3.00e-01 0.156 0.15 0.13 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 1.73e-01 -0.198 0.145 0.13 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 8.72e-01 -0.026 0.161 0.13 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 227233 sc-eQTL 9.51e-01 0.00866 0.141 0.13 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 5.83e-01 0.069 0.125 0.133 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 720439 sc-eQTL 1.38e-01 -0.188 0.126 0.133 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 2.39e-01 -0.153 0.13 0.133 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 8.52e-01 0.0217 0.116 0.133 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 1.32e-01 -0.186 0.123 0.133 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 6.17e-01 0.0645 0.129 0.133 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 691481 sc-eQTL 2.84e-01 -0.139 0.129 0.133 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 8.16e-01 0.0229 0.0983 0.136 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 720439 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0736 0.11 0.136 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 3.71e-01 -0.11 0.122 0.136 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 5.31e-01 0.0659 0.105 0.136 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 4.05e-01 0.0894 0.107 0.136 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 2.92e-01 -0.12 0.114 0.136 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 691481 sc-eQTL 1.45e-01 -0.19 0.129 0.136 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 3.02e-01 -0.133 0.129 0.147 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 720439 sc-eQTL 9.43e-01 0.00779 0.109 0.147 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 7.75e-03 -0.322 0.119 0.147 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 1.73e-01 -0.203 0.148 0.147 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 1.99e-01 -0.167 0.13 0.147 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 2.55e-01 0.164 0.143 0.147 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 691481 sc-eQTL 2.96e-01 -0.129 0.123 0.147 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 3.67e-03 -0.248 0.0845 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 6.13e-02 -0.167 0.0888 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 3.39e-01 0.0977 0.102 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 2.66e-02 -0.219 0.098 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 4.14e-01 -0.106 0.13 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 1.62e-02 -0.176 0.0725 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 1.40e-01 -0.122 0.0821 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 3.73e-02 -0.195 0.093 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 9.29e-01 0.00843 0.0946 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 1.78e-01 0.168 0.125 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 5.03e-01 0.0594 0.0884 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 720439 sc-eQTL 2.42e-01 -0.125 0.107 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 8.48e-02 -0.202 0.117 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 1.49e-01 0.122 0.0846 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 4.87e-01 0.057 0.0819 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0729 0.129 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 691481 sc-eQTL 1.15e-01 -0.188 0.118 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 4.53e-01 0.0685 0.0911 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 720439 sc-eQTL 1.14e-01 -0.17 0.107 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 9.19e-02 -0.201 0.119 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 8.20e-01 0.0201 0.0884 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 8.44e-01 0.0179 0.0912 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0695 0.117 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 691481 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0902 0.124 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 316324 sc-eQTL 1.15e-01 -0.1 0.0634 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 673284 sc-eQTL 2.85e-02 0.242 0.11 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 522429 sc-eQTL 7.11e-01 0.0377 0.102 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 857876 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0983 0.0866 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 sc-eQTL 2.23e-01 -0.132 0.108 0.129 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -190419 eQTL 0.0142 -0.0869 0.0354 0.00119 0.0 0.121
ENSG00000257878 AC007298.2 720283 eQTL 0.0549 0.0331 0.0172 0.00144 0.0 0.121

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina