logo

Genes within 1Mb (chr12:96712136:A:AT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 4.66e-01 0.0629 0.0861 0.071 B L1
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 1.62e-01 -0.15 0.107 0.071 B L1
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 4.60e-01 0.0843 0.114 0.071 B L1
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 5.67e-01 0.0593 0.103 0.071 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 5.34e-01 0.0941 0.151 0.071 B L1
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 8.73e-01 0.0116 0.0721 0.071 CD4T L1
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 7.71e-01 0.0289 0.099 0.071 CD4T L1
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 8.88e-01 0.0152 0.107 0.071 CD4T L1
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 5.77e-01 0.0524 0.0937 0.071 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 3.08e-01 -0.118 0.115 0.071 CD4T L1
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 7.44e-01 0.0242 0.0741 0.071 CD8T L1
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0159 0.0795 0.071 CD8T L1
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 6.15e-01 0.0603 0.12 0.071 CD8T L1
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 8.91e-01 0.0135 0.0981 0.071 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 8.72e-01 -0.021 0.13 0.071 CD8T L1
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 9.78e-02 0.228 0.137 0.07 DC L1
ENSG00000084110 HAL 715771 sc-eQTL 5.15e-01 0.102 0.157 0.07 DC L1
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0359 0.129 0.07 DC L1
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 8.09e-01 -0.038 0.157 0.07 DC L1
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0811 0.131 0.07 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 8.70e-01 0.0275 0.168 0.07 DC L1
ENSG00000257715 AC007298.1 686813 sc-eQTL 2.11e-01 0.19 0.151 0.07 DC L1
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 1.05e-01 0.179 0.11 0.071 Mono L1
ENSG00000084110 HAL 715771 sc-eQTL 4.95e-01 0.0949 0.139 0.071 Mono L1
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 1.94e-01 -0.204 0.156 0.071 Mono L1
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0375 0.105 0.071 Mono L1
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000955 0.0994 0.071 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 9.66e-03 0.392 0.15 0.071 Mono L1
ENSG00000257715 AC007298.1 686813 sc-eQTL 1.89e-01 -0.194 0.147 0.071 Mono L1
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 5.32e-02 -0.159 0.082 0.071 NK L1
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 4.51e-01 0.106 0.14 0.071 NK L1
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 3.19e-02 -0.285 0.132 0.071 NK L1
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0299 0.11 0.071 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 9.37e-01 -0.011 0.14 0.071 NK L1
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0558 0.0695 0.071 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 920984 sc-eQTL 1.27e-01 0.196 0.128 0.071 Other_T L1
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 2.43e-02 0.326 0.144 0.071 Other_T L1
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0364 0.113 0.071 Other_T L1
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 4.83e-01 -0.074 0.105 0.071 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 2.43e-01 0.187 0.16 0.071 Other_T L1
ENSG00000188596 CFAP54 222565 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0839 0.166 0.071 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0968 0.154 0.069 B_Activated L2
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0946 0.175 0.069 B_Activated L2
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 7.59e-01 0.057 0.185 0.069 B_Activated L2
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 3.08e-01 -0.178 0.174 0.069 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0889 0.183 0.069 B_Activated L2
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 2.41e-01 0.158 0.134 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0887 0.13 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 3.92e-01 0.126 0.147 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 5.16e-01 0.0951 0.146 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0265 0.172 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 6.46e-01 0.0606 0.132 0.069 B_Memory L2
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 1.29e-01 0.231 0.151 0.069 B_Memory L2
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 4.70e-01 0.108 0.15 0.069 B_Memory L2
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 4.03e-01 0.133 0.158 0.069 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 1.01e-01 0.287 0.174 0.069 B_Memory L2
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 8.66e-01 0.0184 0.109 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 9.39e-02 -0.191 0.113 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 3.67e-01 0.122 0.135 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0315 0.131 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 7.22e-02 -0.302 0.167 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 4.37e-01 -0.107 0.137 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 1.39e-01 -0.192 0.129 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 9.84e-01 0.00305 0.153 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 3.73e-01 -0.136 0.152 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 1.02e-01 0.296 0.18 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 3.63e-01 0.114 0.125 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 9.50e-01 0.011 0.177 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 5.05e-01 0.119 0.179 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0657 0.156 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 7.33e-02 0.321 0.178 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 9.08e-01 0.00923 0.0795 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 3.44e-01 0.109 0.115 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0705 0.115 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 9.02e-01 0.0125 0.102 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 3.19e-01 -0.125 0.125 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 8.94e-01 0.0102 0.0767 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 4.29e-01 0.103 0.13 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00363 0.128 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 2.11e-01 0.131 0.105 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 4.26e-01 -0.114 0.143 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0438 0.0954 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 3.14e-02 -0.316 0.146 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0405 0.137 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 6.95e-01 0.0563 0.143 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 5.14e-01 0.111 0.17 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 6.74e-01 0.0382 0.0907 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 6.61e-01 0.072 0.164 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 2.08e-01 -0.188 0.149 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 7.07e-01 0.0516 0.137 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 3.89e-01 -0.133 0.153 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 7.05e-01 0.0429 0.113 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 1.15e-01 -0.213 0.135 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 1.89e-01 0.188 0.143 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 3.79e-01 -0.114 0.129 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 5.91e-01 0.0824 0.153 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 5.62e-01 0.0702 0.121 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 8.36e-01 0.0369 0.178 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 4.08e-01 0.125 0.15 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 8.93e-01 0.0234 0.173 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 8.97e-02 0.287 0.168 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 4.74e-01 0.103 0.144 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0328 0.176 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 5.19e-01 -0.112 0.173 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0806 0.161 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 5.95e-01 -0.093 0.175 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0539 0.0992 0.071 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 920984 sc-eQTL 6.72e-02 0.244 0.133 0.071 MAIT L2
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 1.68e-01 0.211 0.153 0.071 MAIT L2
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0173 0.129 0.071 MAIT L2
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 1.92e-01 -0.194 0.149 0.071 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 7.63e-01 0.0504 0.167 0.071 MAIT L2
ENSG00000188596 CFAP54 222565 sc-eQTL 7.10e-01 0.0618 0.166 0.071 MAIT L2
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 1.91e-01 -0.136 0.104 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 8.40e-03 -0.404 0.152 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 1.21e-02 -0.409 0.161 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0989 0.171 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 3.48e-01 -0.162 0.173 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 4.13e-02 -0.18 0.0877 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 7.88e-01 0.0431 0.16 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 9.99e-02 -0.233 0.141 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 4.59e-01 -0.1 0.135 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 4.40e-01 0.12 0.155 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00606 0.14 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 1.66e-01 0.255 0.183 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0233 0.171 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0869 0.178 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 1.45e-01 0.245 0.168 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 2.52e-01 -0.113 0.0983 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 6.45e-01 0.0769 0.167 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 4.27e-01 -0.127 0.159 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000563 0.135 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 2.39e-01 -0.197 0.167 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 4.21e-01 0.165 0.204 0.059 PB L2
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 3.52e-01 0.168 0.18 0.059 PB L2
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 4.50e-01 -0.175 0.231 0.059 PB L2
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0478 0.225 0.059 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 6.87e-01 0.108 0.268 0.059 PB L2
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0764 0.108 0.07 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 920984 sc-eQTL 6.17e-01 0.0605 0.121 0.07 Pro_T L2
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 7.36e-01 0.0481 0.142 0.07 Pro_T L2
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 8.62e-01 0.03 0.172 0.07 Pro_T L2
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 2.74e-01 0.119 0.108 0.07 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0119 0.158 0.07 Pro_T L2
ENSG00000188596 CFAP54 222565 sc-eQTL 9.24e-01 0.0121 0.127 0.07 Pro_T L2
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0138 0.119 0.071 Treg L2
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 9.42e-01 0.0109 0.15 0.071 Treg L2
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 2.70e-01 0.15 0.136 0.071 Treg L2
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 4.87e-01 -0.11 0.158 0.071 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 2.12e-01 -0.22 0.175 0.071 Treg L2
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 8.60e-01 0.026 0.147 0.071 cDC L2
ENSG00000084110 HAL 715771 sc-eQTL 6.07e-01 0.0787 0.153 0.071 cDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 8.53e-01 0.0243 0.131 0.071 cDC L2
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00127 0.173 0.071 cDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 4.46e-01 -0.11 0.145 0.071 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0766 0.176 0.071 cDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 686813 sc-eQTL 2.99e-01 0.155 0.148 0.071 cDC L2
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 9.68e-03 0.325 0.124 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000084110 HAL 715771 sc-eQTL 1.01e-01 0.226 0.137 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 2.76e-01 -0.162 0.149 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 5.53e-01 0.0681 0.115 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0614 0.118 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 6.03e-03 0.444 0.16 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000257715 AC007298.1 686813 sc-eQTL 4.01e-01 -0.128 0.152 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 5.30e-01 0.0904 0.144 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000084110 HAL 715771 sc-eQTL 4.34e-01 -0.126 0.161 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 3.22e-01 -0.16 0.161 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0685 0.131 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0751 0.13 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 4.25e-01 0.14 0.175 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000257715 AC007298.1 686813 sc-eQTL 1.40e-01 -0.243 0.164 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0361 0.138 0.076 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 920984 sc-eQTL 1.53e-01 0.226 0.158 0.076 gdT L2
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 2.00e-01 0.265 0.206 0.076 gdT L2
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 1.12e-01 -0.304 0.19 0.076 gdT L2
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 4.27e-01 -0.147 0.184 0.076 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 2.92e-01 -0.215 0.203 0.076 gdT L2
ENSG00000188596 CFAP54 222565 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0623 0.179 0.076 gdT L2
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 6.76e-01 0.0664 0.159 0.073 intMono L2
ENSG00000084110 HAL 715771 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0795 0.16 0.073 intMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 7.04e-02 -0.297 0.163 0.073 intMono L2
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 8.52e-01 0.0274 0.147 0.073 intMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 3.47e-02 0.33 0.155 0.073 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 1.38e-01 0.241 0.162 0.073 intMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 686813 sc-eQTL 3.60e-02 -0.342 0.162 0.073 intMono L2
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0333 0.128 0.075 ncMono L2
ENSG00000084110 HAL 715771 sc-eQTL 3.71e-01 0.128 0.143 0.075 ncMono L2
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 9.15e-02 -0.269 0.158 0.075 ncMono L2
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 4.54e-01 -0.103 0.137 0.075 ncMono L2
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 4.50e-01 -0.106 0.14 0.075 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 3.36e-01 0.143 0.148 0.075 ncMono L2
ENSG00000257715 AC007298.1 686813 sc-eQTL 8.97e-01 -0.022 0.17 0.075 ncMono L2
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 8.05e-02 0.29 0.165 0.068 pDC L2
ENSG00000084110 HAL 715771 sc-eQTL 3.60e-01 -0.129 0.14 0.068 pDC L2
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 2.38e-01 -0.186 0.156 0.068 pDC L2
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 3.81e-01 0.168 0.192 0.068 pDC L2
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 5.67e-01 0.0963 0.168 0.068 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 3.60e-01 0.169 0.185 0.068 pDC L2
ENSG00000257715 AC007298.1 686813 sc-eQTL 2.33e-01 -0.189 0.158 0.068 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 3.43e-01 0.106 0.112 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 8.83e-01 0.0171 0.117 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 3.43e-01 0.126 0.133 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 1.94e-01 0.168 0.129 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 7.08e-01 0.0634 0.169 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 8.69e-01 0.0159 0.0968 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 8.29e-02 -0.188 0.108 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 3.39e-01 0.118 0.123 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0861 0.124 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00764 0.165 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 1.42e-02 0.278 0.112 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 715771 sc-eQTL 3.55e-01 0.128 0.138 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 2.66e-01 -0.169 0.151 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0106 0.11 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0551 0.106 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 2.41e-02 0.372 0.164 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 686813 sc-eQTL 2.23e-01 -0.187 0.153 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 6.80e-01 0.0487 0.118 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000084110 HAL 715771 sc-eQTL 7.46e-01 0.0451 0.139 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 1.15e-01 -0.243 0.154 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 8.66e-01 0.0193 0.114 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 2.49e-01 0.136 0.118 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 1.83e-01 0.201 0.151 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257715 AC007298.1 686813 sc-eQTL 4.39e-01 -0.124 0.16 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000059758 CDK17 311656 sc-eQTL 1.34e-01 -0.126 0.0835 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111144 LTA4H 668616 sc-eQTL 2.56e-01 0.166 0.146 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111145 ELK3 517761 sc-eQTL 1.26e-01 -0.204 0.133 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139343 SNRPF 853208 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0398 0.114 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 sc-eQTL 8.41e-01 0.0287 0.143 0.069 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139350 NEDD1 -195087 eQTL 0.000202 0.186 0.0499 0.0 0.0 0.0545
ENSG00000188596 CFAP54 222561 eQTL 0.0138 0.103 0.0418 0.0 0.0 0.0545

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina